1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_33 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - -0.99 2.1 - - - - - - - - 0.18 - - - - - - - - 4.27 - -0.31
1.38 - 2.69 - - - - - - - - - 2.12 - - - - - 1.33 - - - - 2.98 - 1.11
- - - - - 2.11 2.41 - - 1.92 - - - - - 0.97 - - 0.98 - - 0.73 - 2.81 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.87 3.5 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 0.13 - - - 1.32 - - 2.94 -0.1 0.15 3.22 - 1.75
- - - 0.27 0.9 - - - - - - 0.29 - - 2.75 0.18 0.39 - 3.19 0.87 - - - - - 0.69
- - - - - - - - - - - - - - - 2.91 - - 1.76 - -0.22 - 0.39 3.37 - 1.35
- - - - - - - - - -0.12 -0.04 1.41 - - - - - -0.75 -0.35 - - 1.74 - 4.06 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.69 - 1.71 - - 1.41 - - - - - 1.39 - - - - - - - 3.1 1.86 1.0
-0.14 -1.26 - 0.24 -0.94 - - - - - - -0.73 - -0.43 -0.93 1.39 1.61 1.33 1.91 - 1.07 -0.24 0.88 -0.94 0.52 1.27
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.48 - - 1.91 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 2.25 - - - 4.41 - - - - - - -
0.55 -1.39 -1.34 -1.72 -3.06 -2.52 -0.81 -0.67 0.49 0.84 1.56 0.67 -0.22 -0.12 -0.68 0.19 -1.02 0.86 0.23 0.04 -3.11 -3.92 -0.42 1.56 -0.1 0.43
- - - - - - 2.19 1.95 - - - - - - - - - 0.45 3.77 0.61 0.05 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 2.61 - - - 4.31 - - - - - - -
- - - - - - - - 1.97 1.87 - - - - - 1.88 - - 3.56 - 1.54 - - - - -
-1.55 -2.15 -3.49 0.48 -0.1 -0.54 -0.65 -1.78 -0.22 0.47 -0.17 -1.3 -0.79 -1.45 1.89 0.92 -0.62 0.64 1.59 0.16 0.28 0.48 -0.57 -0.06 -1.11 -1.84
- -2.27 -2.17 -2.45 -2.21 - - - 0.37 - - - - -2.99 - -2.51 - - - -1.49 0.1 0.93 - 3.86 2.35 -0.61
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - 3.71 - - - - - - - - - 3.69 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.82 - - 3.57 - - - -
2.76 - - - - - - - - 1.43 - - - - - - - - 3.05 1.1 2.12 - - - 0.8 -
-0.28 -0.69 0.85 -0.31 1.57 - - -0.25 2.4 0.67 - -0.16 - - - - - 0.07 2.05 -0.35 - - - 1.95 -0.94 -
- - - 2.61 - - - - - - - - - - - - - - 3.97 - - - - - - 2.08
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- 1.99 - - - - - - - - - - - - - 1.89 - - 4.2 - - - - - - -
- - - - 2.66 - - 2.68 - - 2.43 - - - - - - 1.88 - - - 2.07 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - 0.83 -0.1 - 0.07 - - - 1.33 0.81 0.92 - -0.34 -0.26 -0.19 0.06 0.49 1.85 1.09 - - - 2.43 - -
- - - - - - - - - - - - - - 2.91 - - 1.93 3.48 - - - - - 1.82 -
-1.27 0.07 -0.28 -0.39 -1.5 -1.39 0.41 - 0.86 2.03 -0.46 2.06 -1.01 -1.99 - - - - 2.72 - 0.64 - -0.78 -0.8 - -
0.33 - 1.78 0.28 0.9 1.81 - - - - - - - - -0.05 - - 0.05 0.12 - 0.83 -0.06 - 3.15 - -
- - - - - - 1.22 - - 0.09 1.22 - - - - 0.1 - 0.06 1.68 -0.11 -0.73 - 1.99 2.67 - 1.63
- - - - - -0.29 - - - - - - - - - - -0.33 - - 0.96 2.83 - -0.96 3.89 - -
-0.92 0.56 1.52 0.03 0.38 -2.09 -0.74 0.0 -0.41 0.74 -1.04 -1.9 0.2 -0.49 -0.2 0.58 - 0.84 0.83 -1.07 0.1 0.53 0.33 -1.38 -2.6 0.29
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.03 - - - 3.27 - - - - - - -
0.07 0.34 0.4 -1.59 -0.2 -1.34 0.42 0.23 0.8 0.31 0.67 0.75 -1.8 1.32 -0.26 -0.82 -0.05 0.14 0.7 -2.02 -2.87 - -2.7 0.92 -0.8 0.15
-1.7 -1.44 - 2.2 1.39 -0.8 0.3 -0.81 0.69 0.84 0.83 0.4 0.34 -2.98 -2.49 - 0.84 1.49 -2.75 -1.72 -1.21 -1.18 -0.56 -1.79 -2.01 -0.87
-0.46 -0.37 1.61 -1.79 0.9 -0.49 0.37 1.54 -0.72 -1.86 -0.21 -0.64 0.11 -0.06 - -0.68 - -0.39 -0.27 -0.94 -0.41 - -1.12 2.13 0.3 -1.28
- - - - - - - - - - - - - - 2.06 2.96 - -0.12 3.45 - 0.18 - - - - 0.05
-1.4 - - -1.01 - - - 1.29 -1.1 -1.21 0.71 -0.98 - 0.84 -0.02 1.49 0.63 1.3 1.29 -1.41 0.63 0.46 -1.75 0.83 -1.71 0.93
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.09 - 3.16 - - - - -
- - - 1.69 - - -0.76 - -0.84 - - -0.86 - - - - - 1.19 4.23 - - - - - - -
- - - 2.16 - - - - - - - 2.17 - - - 2.06 - - - - - - - 3.68 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.7 - - 4.29 - -
- - - 2.02 - - - - -0.39 - -0.37 - - -0.97 -0.63 - -0.18 -1.13 2.67 - -0.07 - - 2.81 -1.0 1.63
- 1.66 1.52 1.6 - 1.43 - - - - - - - 0.94 - 1.51 - - 2.35 - - - - 2.13 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - 2.99 - - - - - 2.81 - - - - 1.78 - - - - - 2.4 - - - 1.22
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.21 - 3.28 2.82 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 2.46 - 2.03 4.04 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - 3.81 - - - - - - - - - - - - - - - 3.58 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.29 - 2.79 - 1.27 3.83 - -
1.75 0.48 1.9 0.85 - - 1.35 0.78 - - - 0.99 - - - - - - 0.54 - 1.73 - - 1.79 - 0.32
- -0.56 -0.14 - - -0.13 - 0.75 0.98 - - - - 1.6 0.69 -0.16 -0.17 1.62 2.43 0.54 - - -0.52 -0.24 - 0.97
- 1.84 1.59 - - - - 1.48 - - - - 1.48 - - 1.48 - 1.05 - - - 2.34 0.93 - - 1.01
- -0.6 0.38 -0.78 2.16 2.02 - 0.38 -0.69 - - 0.36 - - -0.99 - - 1.48 -1.09 0.18 1.62 -0.99 0.29 - -1.35 0.69
- - 1.79 - - - - - - - - 1.9 - 1.62 - - - - - - - - - 3.98 - -
- - 1.02 2.37 - - - 1.81 0.83 - 0.75 - - 1.2 0.69 - - - 2.37 - - 1.47 - - - -
1.35 0.9 - 1.73 - - 1.1 - - 1.6 - - 1.09 - 0.56 - 0.88 - 1.64 - -0.29 1.89 - - - -
- - - - - 2.99 - - - - - - - - - - - - 3.74 - - - - - - 2.24
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.98 -0.72 -0.3 -0.34 - - - - -0.31 -0.38 0.67 -0.21 - -0.89 1.15 0.72 - -0.89 1.17 -0.38 -1.29 - -0.67 2.58 0.06 0.81
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - - - 2.88 - - - - - - - - - - - - - 2.24 - - 3.28 2.06 -
- - - 1.51 - - - - - - - - - - 1.35 - - - - 2.11 1.99 - - 3.62 - -
- - - 2.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.34 - 3.15
- - - - - - - - - - - - - 0.69 - - - - 0.93 0.96 2.74 0.89 2.2 2.89 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.9 - - - - - 1.52 - - 2.21 3.88 - - - - - - -
- 2.31 - - - - - - 1.85 - - - - - - - - 2.37 3.2 - - - - 1.63 - -
- - 1.76 - 2.81 2.01 - - - - - - - - - - - - - - 2.09 - 1.1 2.37 - -
- - - - 1.01 - - - - - - 1.93 - 2.43 - - - - - - 1.42 0.42 2.23 1.42 1.14 0.24
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
0.72 0.31 - - - - 0.94 - - 0.62 1.74 - - - 0.65 0.71 - 1.73 - - - - 0.07 2.92 - 0.23
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
-1.32 -1.56 - - -1.51 - - - -1.66 - -1.74 - -1.03 -1.09 -0.5 -0.43 -2.5 0.28 0.47 -2.08 2.16 -1.46 1.56 3.0 -2.32 1.53
-1.59 -0.7 0.84 -1.21 0.07 1.16 -0.17 -0.4 -1.3 -0.35 0.68 1.13 0.88 - -1.54 -1.14 - 0.51 1.51 - 0.56 - 1.7 -1.39 - -0.15
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- 0.47 - - - - - - - - - - 0.28 - -0.21 - - - - - 2.73 - - 3.81 -0.73 0.31
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.2 0.06 -1.13 0.89 - 0.94 -0.68 -1.11 0.95 - -1.12 -0.04 - 0.25 - -1.24 -0.9 -1.88 -1.21 - 0.31 -1.53 0.08 2.68 -0.2 0.29
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.21 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.07 - - - - - - -
- - - - - 1.76 - - - - - - - - - - - - 1.51 - 1.42 - 1.72 3.79 - -
-0.24 - - - - - - - - - - -0.29 - - - - - - 4.57 - - - -0.75 - - -
1.03 -1.25 -0.73 -0.16 -0.64 0.03 0.96 -0.02 0.72 0.17 0.23 0.22 -0.27 0.29 -0.63 0.37 -0.61 -0.42 -2.4 - -1.46 -0.37 -1.27 1.54 -0.09 0.43
- - - 2.51 2.62 - - - - - 2.39 - - - - - - 1.84 2.42 - - - - - - -
- -0.91 - - - 0.74 - - - -1.21 -1.2 - -1.27 -1.33 -1.25 1.38 -0.93 0.09 2.51 - 1.59 0.84 0.18 -0.56 -1.78 2.3
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.57 - - - - - 2.35 2.48 1.28 0.8 - - - - 1.37 - 1.39 - - - - -
- 0.31 2.31 0.68 - 0.63 - 0.75 - - - - - 0.57 - 2.3 - 1.19 - 0.41 1.36 - 0.35 - - 0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.