Heatmap: Cluster_75 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.0 0.97 0.81 0.58 0.23 0.13 0.2 0.4 0.26 0.22 0.26 0.33 0.71 0.26 0.26 0.23 0.3 0.3 0.4 0.38 0.11 0.33 0.08 0.15 0.57 0.45
0.8 0.72 0.68 0.97 0.77 0.57 0.66 0.79 0.55 0.67 0.73 0.78 0.89 0.57 0.28 0.38 0.24 0.38 0.41 0.36 0.03 0.33 0.37 0.41 1.0 0.84
1.0 0.84 0.74 0.55 0.3 0.23 0.27 0.4 0.34 0.34 0.34 0.4 0.8 0.2 0.26 0.23 0.24 0.35 0.34 0.41 0.09 0.49 0.39 0.47 0.82 0.55
0.88 0.76 0.97 1.0 0.56 0.17 0.18 0.4 0.1 0.03 0.06 0.1 0.73 0.02 0.04 0.02 0.08 0.05 0.05 0.18 0.01 0.03 0.01 0.03 0.46 0.72
0.98 0.47 0.55 0.66 0.36 0.27 0.35 0.54 0.32 0.33 0.41 0.46 1.0 0.1 0.12 0.11 0.12 0.27 0.16 0.23 0.03 0.19 0.13 0.12 0.57 0.49
1.0 0.48 0.4 0.95 0.59 0.25 0.43 0.68 0.32 0.38 0.46 0.42 0.89 0.17 0.1 0.23 0.05 0.1 0.08 0.12 0.17 0.56 0.11 0.2 0.88 0.81
0.76 0.54 0.55 0.81 0.53 0.35 0.46 0.62 0.36 0.38 0.44 0.49 1.0 0.19 0.19 0.18 0.18 0.25 0.19 0.25 0.06 0.39 0.13 0.21 0.54 0.51
1.0 0.79 0.89 0.94 0.67 0.44 0.51 0.74 0.37 0.32 0.36 0.37 0.82 0.21 0.21 0.19 0.23 0.29 0.25 0.35 0.06 0.26 0.23 0.2 0.71 0.61
1.0 0.75 0.7 0.66 0.31 0.17 0.22 0.4 0.29 0.27 0.35 0.47 0.84 0.14 0.1 0.15 0.15 0.19 0.17 0.27 0.01 0.38 0.33 0.13 0.54 0.44
0.9 1.0 0.9 0.81 0.55 0.25 0.27 0.36 0.23 0.3 0.38 0.46 0.77 0.15 0.17 0.14 0.35 0.3 0.23 0.47 0.02 0.41 0.08 0.28 0.43 0.48
0.75 0.43 0.55 0.52 0.16 0.06 0.15 0.29 0.03 0.05 0.07 0.11 1.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.05 0.05 0.11 0.03 0.0 0.01 0.02 0.26 0.25
0.88 0.72 0.77 0.83 0.42 0.21 0.27 0.46 0.3 0.32 0.43 0.52 1.0 0.1 0.12 0.09 0.16 0.21 0.18 0.34 0.0 0.13 0.07 0.21 0.56 0.58
1.0 0.34 0.33 0.49 0.3 0.39 0.39 0.5 0.23 0.33 0.38 0.26 0.91 0.06 0.08 0.07 0.12 0.26 0.18 0.17 0.04 0.24 0.24 0.1 0.38 0.35
0.83 0.72 0.85 1.0 0.69 0.42 0.53 0.69 0.35 0.38 0.45 0.5 1.0 0.17 0.15 0.16 0.51 0.24 0.18 0.28 0.04 0.25 0.22 0.23 0.84 0.55
0.61 0.34 0.42 0.87 0.65 0.45 0.63 0.78 0.43 0.46 0.52 0.39 0.7 0.35 0.2 0.29 0.17 0.19 0.25 0.29 0.08 0.36 0.39 0.5 1.0 0.87
0.69 0.59 0.56 0.92 0.68 0.36 0.64 0.77 0.55 0.72 0.67 0.52 0.48 0.27 0.13 0.2 0.21 0.26 0.17 0.35 0.05 0.12 0.42 0.39 1.0 0.76
0.75 0.75 0.83 1.0 0.72 0.39 0.37 0.46 0.2 0.22 0.25 0.29 0.71 0.22 0.05 0.19 0.09 0.09 0.08 0.12 0.0 0.07 0.01 0.04 0.41 0.38
1.0 0.75 0.77 0.8 0.54 0.32 0.39 0.51 0.31 0.4 0.51 0.57 0.94 0.13 0.18 0.27 0.17 0.27 0.19 0.32 0.01 0.12 0.24 0.2 0.61 0.64
0.88 0.41 0.58 0.81 0.55 0.37 0.48 0.76 0.52 0.42 0.43 0.36 0.59 0.38 0.21 0.26 0.16 0.25 0.29 0.24 0.12 0.31 0.43 0.21 0.83 1.0
0.88 0.61 0.55 0.76 0.68 0.52 0.57 0.64 0.46 0.41 0.47 0.46 1.0 0.27 0.2 0.25 0.21 0.29 0.19 0.24 0.08 0.29 0.39 0.42 0.87 0.83
1.0 0.41 0.5 0.61 0.33 0.32 0.5 0.87 0.4 0.39 0.47 0.4 0.77 0.14 0.13 0.09 0.16 0.25 0.3 0.23 0.04 0.33 0.16 0.27 0.8 0.74
0.91 0.46 0.54 0.9 0.59 0.48 0.54 0.81 0.48 0.48 0.53 0.5 0.8 0.34 0.17 0.35 0.18 0.41 0.36 0.38 0.08 0.39 0.17 0.35 0.81 1.0
1.0 0.84 0.64 0.56 0.35 0.29 0.34 0.48 0.29 0.34 0.42 0.46 0.79 0.29 0.25 0.23 0.32 0.32 0.29 0.37 0.06 0.53 0.27 0.58 0.73 0.72
1.0 0.48 0.34 0.68 0.34 0.2 0.35 0.63 0.33 0.28 0.43 0.31 0.65 0.15 0.14 0.13 0.16 0.21 0.16 0.21 0.02 0.45 0.41 0.24 0.58 0.66
0.88 0.87 0.83 0.83 0.37 0.11 0.19 0.37 0.07 0.15 0.19 0.26 1.0 0.02 0.03 0.02 0.05 0.12 0.09 0.28 0.02 0.09 0.02 0.05 0.32 0.33
1.0 0.95 0.88 0.71 0.44 0.3 0.34 0.47 0.29 0.29 0.33 0.37 0.93 0.18 0.19 0.17 0.23 0.3 0.26 0.36 0.03 0.23 0.18 0.23 0.49 0.4
0.64 0.69 0.82 1.0 0.41 0.1 0.2 0.49 0.04 0.02 0.03 0.05 0.63 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.18 0.08 0.04 0.0 0.03 0.51 0.61
0.84 0.72 0.71 1.0 0.85 0.51 0.7 0.89 0.5 0.59 0.67 0.67 1.0 0.35 0.28 0.29 0.18 0.41 0.32 0.29 0.09 0.09 0.2 0.24 0.94 0.76
1.0 0.79 0.61 0.55 0.27 0.13 0.15 0.24 0.11 0.11 0.14 0.19 0.84 0.08 0.09 0.08 0.14 0.23 0.15 0.22 0.02 0.27 0.04 0.13 0.42 0.32
0.89 0.71 0.61 0.7 0.37 0.14 0.21 0.34 0.08 0.15 0.21 0.24 1.0 0.05 0.04 0.04 0.07 0.13 0.09 0.25 0.08 0.17 0.04 0.1 0.33 0.32
1.0 0.58 0.62 0.77 0.43 0.33 0.43 0.73 0.37 0.25 0.33 0.31 0.85 0.26 0.14 0.22 0.18 0.28 0.19 0.24 0.02 0.21 0.18 0.21 0.55 0.53
0.71 0.51 0.38 0.89 0.64 0.39 0.51 0.58 0.52 0.51 0.58 0.71 0.84 0.39 0.29 0.2 0.12 0.22 0.09 0.12 0.0 0.29 0.22 0.33 1.0 0.69
0.77 0.72 0.78 1.0 0.8 0.43 0.5 0.54 0.27 0.39 0.49 0.54 0.78 0.4 0.26 0.38 0.34 0.3 0.28 0.36 0.3 0.59 0.49 0.76 0.95 0.95
1.0 0.65 0.74 0.98 0.68 0.44 0.43 0.65 0.29 0.41 0.53 0.46 0.81 0.2 0.1 0.2 0.04 0.11 0.12 0.14 0.08 0.03 0.11 0.17 0.28 0.6
0.96 1.0 0.71 0.53 0.24 0.17 0.19 0.42 0.4 0.37 0.44 0.66 0.96 0.26 0.36 0.24 0.23 0.27 0.25 0.37 0.09 0.43 0.15 0.31 0.62 0.65
0.73 0.52 0.46 0.6 0.45 0.21 0.34 0.53 0.26 0.25 0.46 0.35 0.6 0.1 0.01 0.09 0.07 0.01 0.04 0.12 0.11 0.61 0.27 0.24 1.0 0.53
0.92 0.73 0.81 0.88 0.64 0.46 0.51 0.68 0.45 0.39 0.47 0.62 1.0 0.1 0.03 0.1 0.06 0.03 0.04 0.18 0.1 0.25 0.32 0.18 0.61 0.59
0.79 0.63 0.58 0.8 0.55 0.29 0.42 0.58 0.38 0.32 0.49 0.49 0.71 0.09 0.02 0.09 0.06 0.02 0.03 0.15 0.15 0.37 0.37 0.22 1.0 0.66
0.78 0.68 0.76 1.0 0.63 0.33 0.57 0.85 0.43 0.52 0.61 0.53 0.67 0.27 0.23 0.31 0.29 0.35 0.37 0.44 0.2 0.31 0.23 0.34 0.91 0.86
1.0 0.85 0.91 0.95 0.58 0.32 0.46 0.57 0.25 0.23 0.26 0.26 0.95 0.09 0.15 0.13 0.58 0.29 0.27 0.29 0.03 0.09 0.12 0.14 0.86 0.55
1.0 0.51 0.45 0.53 0.28 0.21 0.4 0.68 0.28 0.26 0.31 0.24 0.9 0.04 0.05 0.04 0.08 0.18 0.11 0.21 0.0 0.14 0.08 0.13 0.37 0.39
0.9 1.0 1.0 0.81 0.36 0.13 0.18 0.42 0.23 0.17 0.24 0.33 0.9 0.12 0.18 0.12 0.21 0.26 0.22 0.41 0.06 0.11 0.07 0.15 0.42 0.53
0.95 0.68 0.78 0.64 0.2 0.06 0.14 0.31 0.02 0.02 0.03 0.06 1.0 0.01 0.03 0.01 0.02 0.04 0.04 0.17 0.02 0.01 0.0 0.02 0.33 0.46
0.9 0.6 0.56 0.49 0.28 0.11 0.25 0.36 0.12 0.18 0.22 0.32 1.0 0.04 0.04 0.06 0.05 0.11 0.08 0.14 0.0 0.01 0.05 0.12 0.36 0.35
0.76 0.7 0.74 1.0 0.48 0.15 0.21 0.41 0.02 0.04 0.06 0.11 0.78 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.04 0.15 0.15 0.19 0.04 0.13 0.6 0.65
1.0 0.73 0.59 0.55 0.25 0.18 0.31 0.5 0.24 0.22 0.27 0.31 0.91 0.13 0.14 0.1 0.13 0.25 0.22 0.22 0.05 0.17 0.36 0.12 0.39 0.35
0.57 0.55 0.85 1.0 0.57 0.27 0.34 0.45 0.04 0.07 0.09 0.13 0.65 0.09 0.05 0.07 0.06 0.07 0.09 0.24 0.16 0.42 0.05 0.1 0.63 0.67
0.6 0.35 0.47 0.83 0.62 0.39 0.55 0.75 0.46 0.44 0.6 0.59 0.64 0.3 0.14 0.23 0.2 0.23 0.17 0.35 0.14 0.16 0.33 0.57 1.0 0.8
0.93 0.66 0.53 0.53 0.3 0.29 0.44 0.54 0.26 0.24 0.33 0.37 1.0 0.11 0.08 0.11 0.15 0.14 0.15 0.23 0.0 0.03 0.01 0.03 0.34 0.28
1.0 0.52 0.57 0.6 0.33 0.19 0.21 0.39 0.16 0.15 0.22 0.26 0.86 0.08 0.11 0.07 0.08 0.1 0.11 0.16 0.03 0.24 0.09 0.12 0.51 0.49
1.0 0.61 0.52 0.49 0.36 0.39 0.48 0.62 0.35 0.27 0.3 0.31 0.85 0.13 0.15 0.13 0.19 0.24 0.21 0.29 0.0 0.16 0.12 0.09 0.5 0.38
0.8 0.91 1.0 0.86 0.41 0.22 0.25 0.41 0.32 0.22 0.29 0.32 0.76 0.32 0.28 0.24 0.23 0.18 0.26 0.24 0.0 0.07 0.09 0.08 0.5 0.49
1.0 0.95 0.8 0.77 0.41 0.15 0.16 0.22 0.16 0.15 0.25 0.4 0.9 0.2 0.33 0.23 0.3 0.3 0.22 0.28 0.02 0.63 0.1 0.14 0.46 0.36
0.95 1.0 0.94 0.78 0.38 0.13 0.18 0.21 0.13 0.19 0.27 0.4 0.92 0.29 0.35 0.25 0.34 0.4 0.22 0.39 0.01 0.61 0.11 0.11 0.39 0.35
0.89 0.68 0.73 0.68 0.45 0.36 0.48 0.61 0.36 0.37 0.43 0.49 1.0 0.23 0.24 0.22 0.26 0.22 0.21 0.28 0.04 0.24 0.25 0.24 0.61 0.41
0.95 0.64 0.59 0.63 0.17 0.06 0.12 0.33 0.08 0.04 0.08 0.14 1.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.03 0.12 0.03 0.06 0.01 0.04 0.31 0.4
1.0 0.52 0.72 0.66 0.21 0.12 0.16 0.4 0.09 0.02 0.03 0.05 0.83 0.15 0.08 0.12 0.07 0.09 0.08 0.18 0.03 0.02 0.04 0.04 0.36 0.66
0.52 0.64 0.65 0.88 0.48 0.22 0.4 0.59 0.14 0.25 0.45 0.42 0.77 0.21 0.08 0.12 0.34 0.13 0.15 0.22 0.03 0.04 0.11 0.22 1.0 0.94
1.0 0.6 0.88 0.85 0.39 0.22 0.32 0.67 0.23 0.24 0.36 0.35 0.75 0.21 0.24 0.23 0.17 0.24 0.3 0.39 0.02 0.05 0.07 0.18 0.69 0.78
0.85 0.64 0.68 0.67 0.52 0.43 0.47 0.53 0.31 0.38 0.43 0.53 1.0 0.2 0.16 0.17 0.27 0.27 0.24 0.43 0.09 0.32 0.18 0.28 0.45 0.63
1.0 0.78 0.73 0.58 0.29 0.13 0.15 0.3 0.17 0.19 0.26 0.4 0.92 0.11 0.14 0.11 0.16 0.3 0.26 0.4 0.02 0.09 0.07 0.14 0.51 0.57
0.9 0.94 0.58 0.64 0.41 0.25 0.38 0.44 0.27 0.38 0.52 0.5 1.0 0.06 0.11 0.08 0.14 0.22 0.22 0.38 0.06 0.03 0.19 0.13 0.48 0.46
0.74 0.42 0.52 0.89 0.73 0.61 0.9 1.0 0.77 0.62 0.63 0.54 0.5 0.31 0.26 0.29 0.24 0.27 0.29 0.34 0.0 0.38 0.31 0.41 0.84 0.75
1.0 0.61 0.7 0.6 0.36 0.25 0.27 0.37 0.16 0.24 0.26 0.26 0.67 0.14 0.13 0.12 0.18 0.24 0.22 0.28 0.01 0.06 0.09 0.11 0.58 0.5
0.86 0.48 0.46 0.78 0.55 0.21 0.33 0.55 0.21 0.23 0.33 0.36 1.0 0.08 0.07 0.07 0.06 0.09 0.05 0.13 0.05 0.2 0.11 0.17 0.6 0.56
0.92 0.36 0.59 1.0 0.46 0.25 0.3 0.74 0.24 0.6 0.62 0.5 0.98 0.05 0.28 0.06 0.1 0.05 0.13 0.22 0.01 0.05 0.26 0.05 0.72 0.74
0.92 0.38 0.52 0.64 0.45 0.16 0.27 0.64 0.23 0.37 0.47 0.38 0.72 0.13 0.32 0.04 0.16 0.17 0.12 0.18 0.02 0.1 0.3 0.11 0.93 1.0
0.47 0.51 0.77 1.0 0.67 0.39 0.3 0.41 0.12 0.13 0.14 0.19 0.51 0.04 0.04 0.05 0.06 0.07 0.05 0.18 0.09 0.25 0.06 0.13 0.55 0.74
0.76 0.5 0.59 0.79 0.7 0.46 0.47 0.52 0.31 0.26 0.35 0.43 1.0 0.25 0.17 0.24 0.11 0.23 0.15 0.2 0.13 0.28 0.5 0.4 0.83 0.89
0.69 0.38 0.47 0.73 0.74 0.45 0.5 0.63 0.4 0.5 0.69 0.7 0.68 0.3 0.15 0.22 0.23 0.35 0.26 0.49 0.02 0.06 0.39 0.35 0.63 1.0
0.78 0.72 0.92 1.0 0.71 0.43 0.59 0.76 0.32 0.31 0.43 0.56 0.76 0.2 0.24 0.3 0.34 0.3 0.36 0.32 0.1 0.28 0.06 0.14 0.81 0.45
0.69 0.47 0.51 0.86 0.6 0.42 0.55 0.63 0.38 0.5 0.6 0.71 1.0 0.26 0.17 0.24 0.16 0.18 0.16 0.22 0.24 0.54 0.33 0.41 0.64 0.75
0.92 0.6 0.67 0.86 0.36 0.13 0.25 0.54 0.04 0.03 0.04 0.07 1.0 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.04 0.17 0.02 0.03 0.0 0.02 0.31 0.33
0.8 0.68 0.8 1.0 0.41 0.14 0.25 0.56 0.08 0.02 0.04 0.06 0.74 0.01 0.02 0.02 0.02 0.06 0.04 0.22 0.04 0.04 0.01 0.04 0.56 0.62
1.0 0.34 0.33 0.44 0.21 0.12 0.3 0.56 0.22 0.21 0.3 0.2 0.55 0.33 0.13 0.22 0.06 0.12 0.1 0.1 0.03 0.04 0.16 0.04 0.75 0.54
0.91 0.7 0.68 0.57 0.31 0.18 0.31 0.5 0.18 0.22 0.29 0.35 1.0 0.07 0.1 0.06 0.15 0.14 0.12 0.28 0.04 0.11 0.04 0.12 0.44 0.43
0.83 0.64 0.79 0.67 0.22 0.08 0.14 0.25 0.04 0.06 0.1 0.19 1.0 0.03 0.03 0.03 0.04 0.07 0.06 0.2 0.09 0.09 0.04 0.08 0.32 0.45
0.82 0.99 1.0 0.84 0.45 0.25 0.31 0.5 0.24 0.25 0.35 0.48 0.87 0.04 0.06 0.05 0.11 0.23 0.16 0.44 0.08 0.28 0.08 0.25 0.5 0.64
0.74 0.44 0.27 0.44 0.29 0.22 0.36 0.38 0.22 0.11 0.05 0.03 1.0 0.05 0.0 0.07 0.01 0.12 0.05 0.11 0.0 0.16 0.0 0.07 0.52 0.44
1.0 0.62 0.52 0.45 0.19 0.14 0.3 0.47 0.13 0.17 0.19 0.2 0.83 0.05 0.07 0.03 0.09 0.13 0.12 0.19 0.02 0.15 0.12 0.15 0.54 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)