Heatmap: Cluster_179 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.09 0.06 0.08 0.09 0.08 0.11 0.12 0.18 0.22 0.19 0.19 0.15 0.09 0.17 0.52 0.69 0.16 1.0 0.63 0.36 0.2 0.25 0.34 0.15 0.15 0.15
0.27 0.25 0.42 0.35 0.47 0.27 0.62 0.64 0.36 0.73 0.62 0.43 0.26 0.74 0.43 0.96 0.78 1.0 0.64 0.51 0.27 0.31 0.51 0.34 0.65 0.43
0.21 0.19 0.23 0.26 0.24 0.18 0.37 0.43 0.26 0.49 0.37 0.28 0.12 0.66 0.55 0.9 0.76 1.0 0.51 0.5 0.29 0.13 0.54 0.24 0.58 0.32
0.09 0.24 0.3 0.4 0.49 0.63 0.55 0.72 1.0 0.82 0.72 0.54 0.07 0.88 0.94 0.97 0.71 0.74 0.8 0.61 0.18 0.58 0.92 0.52 0.64 0.64
0.21 0.16 0.27 0.31 0.42 0.26 0.5 0.5 0.38 0.62 0.47 0.35 0.15 0.67 0.44 0.95 0.72 1.0 0.65 0.48 0.27 0.49 0.75 0.63 0.59 0.39
0.19 0.21 0.25 0.4 0.45 0.45 0.71 0.74 0.86 0.79 0.57 0.54 0.26 0.98 0.59 1.0 0.61 0.82 0.54 0.51 0.31 0.4 0.74 0.52 0.33 0.41
0.3 0.41 0.62 0.61 0.68 0.6 0.77 0.7 0.69 0.64 0.65 0.52 0.36 0.74 1.0 0.84 0.63 0.83 0.77 0.58 0.22 0.41 0.45 0.44 0.37 0.38
0.37 0.26 0.33 0.38 0.43 0.36 0.56 0.58 0.37 0.65 0.66 0.55 0.31 1.0 0.49 1.0 0.72 0.69 0.56 0.47 0.22 0.54 0.78 0.44 0.58 0.49
0.12 0.16 0.23 0.35 0.43 0.4 0.53 0.54 0.65 0.65 0.48 0.35 0.13 0.91 0.55 1.0 0.47 0.7 0.43 0.4 0.13 0.22 0.54 0.38 0.37 0.4
0.2 0.2 0.27 0.32 0.31 0.28 0.54 0.59 0.4 0.56 0.47 0.35 0.19 0.77 0.47 1.0 0.77 0.89 0.56 0.56 0.22 0.62 0.57 0.35 0.59 0.39
0.04 0.06 0.08 0.07 0.05 0.02 0.03 0.04 0.04 0.05 0.08 0.06 0.02 0.18 0.36 1.0 0.09 0.81 0.28 0.32 0.04 0.04 0.02 0.01 0.03 0.06
0.05 0.09 0.08 0.08 0.05 0.03 0.02 0.04 0.08 0.06 0.11 0.09 0.04 0.16 0.35 1.0 0.09 0.51 0.29 0.33 0.03 0.04 0.01 0.02 0.04 0.05
0.06 0.01 0.05 0.05 0.03 0.01 0.02 0.04 0.1 0.1 0.12 0.11 0.04 0.17 0.35 1.0 0.12 0.57 0.41 0.24 0.1 0.05 0.03 0.13 0.09 0.1
0.26 0.17 0.15 0.19 0.26 0.28 0.44 0.36 0.31 0.46 0.57 0.56 0.36 0.91 0.65 1.0 0.83 0.66 0.8 0.55 0.03 0.17 0.03 0.12 0.2 0.14
0.24 0.17 0.09 0.16 0.27 0.22 0.35 0.35 0.27 0.35 0.64 0.47 0.35 0.91 0.54 1.0 0.85 0.65 0.76 0.48 0.04 0.15 0.02 0.05 0.3 0.18
0.18 0.08 0.07 0.07 0.15 0.14 0.17 0.18 0.14 0.23 0.31 0.26 0.2 0.8 0.62 1.0 0.88 0.87 0.77 0.4 0.05 0.18 0.05 0.14 0.32 0.21
0.1 0.07 0.05 0.06 0.09 0.11 0.12 0.13 0.08 0.17 0.18 0.17 0.1 0.68 0.51 0.88 0.82 1.0 0.67 0.35 0.06 0.31 0.04 0.08 0.26 0.17
0.06 0.06 0.06 0.06 0.07 0.08 0.09 0.1 0.15 0.27 0.29 0.24 0.1 0.49 0.84 0.54 0.98 1.0 0.63 0.56 0.1 0.14 0.14 0.47 0.17 0.19
0.02 0.04 0.06 0.08 0.16 0.28 0.37 0.39 0.8 0.83 0.86 0.66 0.07 0.56 0.7 0.83 0.42 0.43 0.62 1.0 0.14 0.07 0.25 0.59 0.41 0.41
0.2 0.25 0.36 0.44 0.48 0.4 0.6 0.67 0.52 0.67 0.66 0.52 0.15 0.71 0.5 1.0 0.71 0.77 0.55 0.67 0.12 0.35 0.99 0.52 0.54 0.41
0.36 0.31 0.32 0.39 0.42 0.4 0.63 0.51 0.41 0.62 0.54 0.45 0.35 0.92 0.64 1.0 0.74 0.72 0.57 0.55 0.58 0.78 0.78 0.4 0.52 0.51
0.39 0.32 0.32 0.42 0.38 0.35 0.63 0.69 0.59 0.62 0.72 0.5 0.43 0.71 0.71 0.88 0.64 1.0 0.59 0.46 0.12 0.42 0.65 0.46 0.4 0.35
0.2 0.21 0.34 0.41 0.47 0.44 0.54 0.57 0.71 0.79 0.76 0.68 0.27 0.93 0.62 1.0 0.53 0.6 0.56 0.55 0.25 0.44 0.49 0.62 0.4 0.5
0.14 0.22 0.23 0.38 0.57 0.44 0.62 0.59 0.81 0.73 0.65 0.53 0.13 0.97 0.68 1.0 0.57 0.65 0.5 0.55 0.26 0.55 0.78 0.76 0.41 0.59
0.05 0.1 0.15 0.23 0.32 0.35 0.6 0.54 0.62 0.66 0.53 0.37 0.06 0.72 0.6 0.95 0.72 1.0 0.83 0.53 0.05 0.46 0.38 0.4 0.44 0.32
0.13 0.26 0.37 0.42 0.55 0.63 0.63 0.57 0.75 0.68 0.52 0.43 0.22 0.91 0.71 1.0 0.61 0.74 0.59 0.62 0.23 0.46 0.76 0.48 0.41 0.43
0.09 0.13 0.29 0.32 0.24 0.35 0.67 0.72 0.95 0.91 0.69 0.58 0.12 0.76 0.58 0.93 0.5 1.0 0.56 0.58 0.28 0.38 0.52 0.47 0.53 0.63
0.19 0.23 0.34 0.43 0.44 0.5 0.66 0.82 0.66 0.51 0.4 0.39 0.18 0.83 0.84 1.0 0.69 0.95 0.56 0.77 0.22 0.54 0.51 0.26 0.42 0.52
0.05 0.05 0.12 0.12 0.22 0.33 0.63 0.54 0.88 0.79 0.57 0.43 0.07 1.0 0.94 0.98 0.55 0.85 0.51 0.36 0.24 0.09 0.6 0.49 0.34 0.32
0.23 0.27 0.43 0.54 0.51 0.55 0.81 0.83 0.85 0.7 0.53 0.49 0.27 0.85 0.67 1.0 0.62 0.89 0.6 0.69 0.25 0.5 0.67 0.43 0.57 0.61
0.01 0.01 0.03 0.06 0.09 0.13 0.3 0.27 0.3 0.43 0.39 0.23 0.03 0.62 0.78 0.98 0.66 1.0 0.5 0.19 0.13 0.17 0.39 0.18 0.2 0.19
0.02 0.02 0.04 0.07 0.12 0.17 0.4 0.34 0.44 0.49 0.45 0.33 0.03 0.64 0.81 0.93 0.6 1.0 0.55 0.21 0.15 0.14 0.52 0.19 0.25 0.23
0.02 0.03 0.05 0.09 0.19 0.27 0.53 0.44 0.64 0.69 0.6 0.46 0.06 0.65 1.0 0.9 0.61 0.76 0.59 0.2 0.1 0.1 0.3 0.18 0.14 0.18
0.06 0.08 0.12 0.04 0.06 0.1 0.04 0.07 0.09 0.19 0.26 0.3 0.12 0.72 0.4 1.0 0.24 0.79 0.39 0.32 0.09 0.03 0.05 0.17 0.15 0.21
0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.03 0.03 0.1 0.11 0.08 0.03 0.53 0.4 1.0 0.14 0.96 0.39 0.26 0.02 0.05 0.02 0.13 0.1 0.16
0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.03 0.02 0.02 0.01 0.24 0.45 0.98 0.14 1.0 0.33 0.1 0.43 0.01 0.11 0.32 0.07 0.16
0.25 0.28 0.31 0.49 0.68 0.53 0.54 0.51 0.81 0.68 0.71 0.66 0.18 1.0 0.62 0.86 0.39 0.77 0.68 0.42 0.25 0.33 0.63 0.83 0.49 0.55
0.07 0.27 0.37 0.46 0.49 0.37 0.58 0.61 0.54 0.54 0.48 0.36 0.08 0.86 0.55 0.92 0.82 1.0 0.57 0.62 0.05 0.33 0.26 0.23 0.31 0.35
0.02 0.07 0.12 0.15 0.18 0.08 0.16 0.11 0.17 0.17 0.21 0.14 0.04 0.42 0.39 0.57 0.67 1.0 0.54 0.46 0.07 0.11 0.16 0.12 0.36 0.2
0.15 0.07 0.06 0.09 0.11 0.07 0.15 0.15 0.17 0.38 0.39 0.39 0.21 1.0 0.83 0.78 0.53 0.63 0.42 0.55 0.05 0.02 0.21 0.28 0.25 0.21
0.49 0.25 0.18 0.17 0.19 0.21 0.29 0.3 0.26 0.2 0.21 0.16 0.46 0.64 0.43 0.97 0.33 1.0 0.57 0.3 0.0 0.04 0.03 0.06 0.12 0.08
0.07 0.14 0.32 0.49 0.48 0.48 0.95 0.91 0.81 0.75 0.49 0.38 0.09 1.0 0.64 1.0 0.84 0.94 0.55 0.7 0.21 0.42 0.45 0.37 0.66 0.49
0.11 0.22 0.33 0.41 0.53 0.62 0.67 0.72 1.0 0.75 0.77 0.58 0.16 0.95 0.64 0.96 0.5 0.72 0.56 0.54 0.24 0.44 0.99 0.68 0.47 0.5
0.29 0.17 0.17 0.2 0.19 0.18 0.33 0.4 0.41 0.46 0.5 0.45 0.33 1.0 0.57 1.0 0.37 0.73 0.49 0.32 0.04 0.21 0.2 0.17 0.25 0.21
0.09 0.28 0.25 0.41 0.58 0.76 0.51 0.48 1.0 0.92 0.9 0.71 0.13 0.66 0.64 0.87 0.55 0.62 0.7 0.53 0.08 0.77 0.87 0.67 0.57 0.76
0.26 0.28 0.36 0.44 0.43 0.39 0.68 0.61 0.56 0.69 0.52 0.46 0.29 0.89 0.69 1.0 0.74 0.76 0.75 0.66 0.17 0.36 0.55 0.32 0.5 0.45
0.19 0.21 0.26 0.3 0.32 0.22 0.48 0.47 0.31 0.57 0.42 0.32 0.19 0.84 0.55 1.0 0.74 0.94 0.64 0.54 0.22 0.4 0.62 0.28 0.55 0.44

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)