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Heatmap: Cluster_183 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.19 0.4 0.53 0.86 1.0 0.88 0.92 0.96 0.91 0.85 0.73 0.65 0.24 0.6 0.54 0.78 0.65 0.91 0.76 0.63 0.13 0.85 0.5 0.52 0.63 0.57
0.39 0.66 0.68 0.87 0.86 0.98 1.0 0.89 0.88 0.82 0.83 0.83 0.46 0.53 0.58 0.66 0.43 0.54 0.7 0.5 0.06 0.77 0.51 0.38 0.44 0.51
0.61 0.71 0.64 0.64 0.6 0.66 1.0 0.96 0.63 0.6 0.58 0.56 0.48 0.59 0.63 0.64 0.62 0.88 0.94 0.73 0.06 0.53 0.52 0.56 0.78 0.66
0.02 0.22 0.51 0.66 0.74 0.77 0.61 0.6 0.88 0.61 0.8 0.64 0.05 0.57 0.62 0.59 0.47 0.7 0.53 0.44 0.11 0.5 0.67 0.57 1.0 0.62
0.07 0.54 0.73 0.69 1.0 0.89 0.76 0.57 0.71 0.75 0.55 0.48 0.14 0.58 0.66 0.63 0.68 0.77 0.79 0.74 0.13 0.75 0.52 0.39 0.64 0.57
0.6 0.67 0.74 0.79 0.82 0.65 0.94 1.0 0.85 0.89 0.76 0.62 0.53 0.53 0.68 0.73 0.75 1.0 0.69 0.76 0.08 0.94 0.62 0.47 0.68 0.52
0.19 0.41 0.6 0.86 0.91 0.68 0.79 0.73 1.0 0.73 0.75 0.64 0.16 0.64 0.64 0.65 0.45 0.71 0.66 0.49 0.18 0.55 0.76 0.57 0.84 0.66
0.23 0.45 0.6 0.68 0.81 0.87 0.77 0.83 0.83 0.69 0.62 0.47 0.14 0.59 0.86 0.44 0.41 0.88 0.53 0.33 0.05 0.61 0.43 0.12 1.0 0.61
0.34 0.75 0.69 0.67 0.64 0.52 0.7 0.84 0.76 1.0 0.8 0.5 0.36 0.08 0.25 0.13 0.39 0.7 0.59 0.41 0.02 0.31 0.17 0.27 0.54 0.14
0.22 0.82 0.83 0.98 1.0 0.91 0.87 0.93 0.83 0.74 0.69 0.66 0.25 0.53 0.59 0.64 0.49 0.97 0.72 0.5 0.03 0.47 0.51 0.42 0.8 0.62
0.57 0.55 0.67 0.84 0.93 0.82 1.0 0.96 0.8 0.81 0.82 0.74 0.55 0.57 0.58 0.64 0.61 0.69 0.65 0.61 0.09 0.65 0.53 0.51 0.86 0.65
0.79 0.5 0.53 0.75 0.94 0.78 0.88 0.92 1.0 0.82 0.76 0.63 0.58 0.47 0.54 0.45 0.76 0.85 0.61 0.6 0.06 0.59 0.64 0.74 0.99 0.66
0.39 0.51 0.69 1.0 0.96 0.7 0.93 0.97 0.81 0.74 0.77 0.62 0.29 0.48 0.51 0.56 0.58 0.7 0.61 0.56 0.01 0.28 0.41 0.38 0.74 0.62
0.1 0.44 0.58 0.76 0.96 1.0 0.86 0.76 0.77 0.65 0.67 0.66 0.1 0.44 0.61 0.69 0.64 0.97 0.75 0.69 0.04 0.93 0.62 0.58 0.76 0.56
0.21 0.53 0.68 0.79 0.84 0.67 0.84 0.79 1.0 0.85 0.9 0.94 0.26 0.7 0.57 0.7 0.49 0.66 0.56 0.48 0.04 0.53 0.6 0.48 0.64 0.58
0.48 0.51 0.47 0.64 0.85 0.79 0.93 0.88 1.0 0.76 0.82 0.65 0.4 0.36 0.35 0.32 0.39 0.69 0.64 0.5 0.03 0.39 0.6 0.34 0.8 0.39
0.08 0.4 0.55 0.61 0.63 0.53 0.67 0.61 0.59 0.58 0.48 0.41 0.09 0.46 0.68 0.51 0.65 1.0 0.77 0.62 0.06 0.3 0.42 0.3 0.46 0.42
0.46 0.58 0.64 0.78 0.9 0.95 0.99 0.95 1.0 0.92 0.86 0.82 0.51 0.74 0.73 0.81 0.66 0.99 0.72 0.59 0.12 0.91 0.77 0.68 0.75 0.67
0.22 0.48 0.43 0.64 0.87 1.0 0.86 0.7 0.76 0.64 0.48 0.37 0.22 0.54 0.53 0.63 0.6 0.77 0.57 0.56 0.03 0.24 0.57 0.47 0.94 0.58
0.55 0.54 0.6 0.78 0.94 0.86 0.97 0.94 1.0 0.82 0.89 0.71 0.42 0.59 0.74 0.57 0.58 0.86 0.73 0.71 0.04 0.73 0.73 0.4 0.7 0.5
0.56 0.62 0.74 0.75 0.83 0.75 0.85 0.81 0.9 0.77 0.66 0.57 0.43 0.88 0.6 0.8 0.6 1.0 0.66 0.56 0.15 0.71 0.58 0.41 0.64 0.62
0.18 0.34 0.41 0.77 1.0 0.69 0.72 0.64 0.72 0.59 0.56 0.47 0.16 0.49 0.54 0.49 0.48 0.74 0.47 0.43 0.02 0.4 0.64 0.51 0.52 0.39
0.59 0.88 0.88 0.76 0.8 0.82 1.0 0.98 0.76 0.69 0.67 0.66 0.52 0.71 0.63 0.71 0.64 0.91 0.78 0.69 0.0 0.6 0.53 0.36 0.74 0.63
0.47 0.54 0.41 0.78 1.0 0.81 0.92 0.99 0.72 0.72 0.69 0.51 0.24 0.43 0.47 0.58 0.6 0.8 0.68 0.73 0.0 0.34 0.61 0.75 0.88 0.69
0.54 0.43 0.51 0.63 0.66 0.75 1.0 0.96 0.9 0.65 0.57 0.53 0.57 0.73 0.64 0.77 0.56 0.72 0.62 0.61 0.13 0.22 0.63 0.33 0.67 0.61
0.34 0.42 0.53 0.66 0.65 0.58 0.91 0.85 0.84 0.77 0.68 0.57 0.36 0.79 0.61 0.83 0.71 1.0 0.66 0.62 0.17 0.86 0.77 0.5 0.78 0.56
0.66 0.5 0.48 0.56 0.71 0.7 0.94 1.0 0.79 0.9 0.78 0.66 0.55 0.29 0.35 0.32 0.47 0.79 0.62 0.56 0.01 0.42 0.43 0.32 0.47 0.28
0.6 0.62 0.57 0.86 1.0 0.86 0.93 0.83 0.82 0.96 0.94 0.76 0.47 0.42 0.49 0.4 0.61 0.77 0.69 0.74 0.03 0.42 0.38 0.49 0.66 0.53
0.38 0.78 0.82 0.82 0.95 0.84 0.86 0.84 0.71 0.77 0.72 0.63 0.36 0.7 0.81 0.8 0.83 1.0 0.87 0.77 0.06 0.64 0.56 0.46 0.82 0.56
0.54 0.56 0.63 0.76 0.71 0.67 0.93 1.0 0.93 0.81 0.93 0.73 0.3 0.48 0.5 0.49 0.5 0.83 0.69 0.57 0.1 0.59 0.63 0.73 0.86 0.61
0.53 0.72 0.82 0.9 0.98 0.92 1.0 0.87 0.93 0.99 0.97 0.83 0.5 0.56 0.56 0.63 0.74 0.89 0.77 0.86 0.04 0.49 0.48 0.42 0.54 0.54
0.24 0.63 0.76 0.85 0.84 0.69 0.83 0.87 0.78 0.69 0.62 0.5 0.22 0.57 0.83 0.75 0.66 1.0 0.77 0.63 0.09 0.6 0.62 0.39 0.73 0.5
0.21 0.56 0.62 0.91 0.94 0.7 0.6 0.62 0.6 0.57 0.58 0.52 0.19 0.51 0.64 0.63 0.85 1.0 0.87 0.66 0.1 0.96 0.73 0.55 0.6 0.5
0.1 0.54 0.64 0.94 1.0 0.91 0.89 0.9 0.86 0.64 0.55 0.46 0.05 0.43 0.53 0.5 0.49 0.72 0.52 0.47 0.02 0.45 0.54 0.39 0.69 0.48
0.44 0.83 0.96 0.87 0.81 0.56 0.82 0.9 0.83 0.86 0.79 0.61 0.52 0.5 0.65 0.63 0.8 1.0 0.76 0.9 0.03 0.64 0.57 0.35 0.57 0.48
0.48 0.58 0.39 1.0 0.71 0.71 0.73 0.68 0.7 0.79 0.6 0.41 0.32 0.22 0.24 0.2 0.35 0.59 0.59 0.7 0.01 0.35 0.21 0.27 0.57 0.26
0.24 0.52 0.53 0.87 1.0 0.85 0.86 0.78 0.73 0.59 0.53 0.39 0.13 0.24 0.28 0.29 0.41 0.52 0.47 0.41 0.02 0.38 0.42 0.21 0.71 0.34
0.25 0.68 0.6 0.74 0.91 1.0 0.85 0.76 0.83 0.67 0.78 0.63 0.21 0.57 0.6 0.68 0.52 0.66 0.64 0.62 0.03 0.86 0.51 0.65 0.61 0.48
0.18 0.59 0.54 0.69 0.79 0.7 1.0 0.75 0.71 0.81 0.68 0.71 0.17 0.63 0.64 0.76 0.63 1.0 0.72 0.65 0.03 0.76 0.75 0.48 0.85 0.58
0.71 0.8 0.89 0.83 0.95 0.72 0.83 0.95 0.76 0.88 0.73 0.63 0.59 0.53 0.67 0.6 0.88 1.0 0.81 0.77 0.02 0.98 0.4 0.46 0.58 0.58
0.53 0.57 0.72 0.75 0.72 0.62 1.0 0.85 0.65 0.6 0.49 0.46 0.48 0.39 0.34 0.45 0.52 0.89 0.62 0.73 0.05 0.76 0.44 0.3 0.48 0.46
0.6 0.66 0.65 0.84 0.94 0.93 1.0 0.98 0.85 0.82 0.8 0.65 0.44 0.45 0.59 0.46 0.6 0.84 0.78 0.68 0.07 0.63 0.61 0.38 0.72 0.53
0.72 0.94 0.84 0.82 0.95 0.8 0.94 0.91 0.76 0.68 0.54 0.52 0.67 0.52 0.68 0.58 0.6 1.0 0.82 0.83 0.04 0.44 0.64 0.55 0.92 0.65
0.11 0.47 0.53 0.85 0.93 0.8 0.91 0.9 0.89 0.75 0.73 0.57 0.08 0.46 0.58 0.59 0.63 1.0 0.8 0.65 0.06 0.56 0.53 0.43 0.7 0.48
0.14 0.37 0.58 0.76 0.81 0.73 0.91 0.85 0.79 0.68 0.62 0.53 0.16 0.67 0.68 1.0 0.78 0.9 0.75 0.56 0.13 0.65 0.46 0.43 0.7 0.52
0.34 0.69 0.77 0.86 0.82 0.67 0.76 0.85 0.79 0.72 0.68 0.66 0.31 0.59 0.7 0.68 0.64 1.0 0.67 0.72 0.02 0.45 0.38 0.24 0.55 0.42
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0.34 0.55 0.6 0.98 0.92 0.77 0.92 0.91 0.76 0.77 0.61 0.6 0.21 0.32 0.35 0.32 0.29 0.66 0.46 0.52 0.0 0.48 0.44 0.31 1.0 0.44
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0.3 0.71 0.73 0.91 0.9 0.81 1.0 0.97 0.83 0.83 0.75 0.6 0.32 0.84 0.74 0.96 0.72 0.99 0.7 0.71 0.14 0.65 0.74 0.66 0.8 0.84
0.42 0.46 0.43 0.64 0.8 1.0 0.87 0.69 0.61 0.52 0.47 0.33 0.21 0.58 0.39 0.73 0.48 0.8 0.6 0.67 0.05 0.41 0.59 0.47 0.6 0.55
0.42 0.73 0.77 0.76 0.93 0.9 0.91 0.83 0.88 0.8 0.82 0.7 0.51 0.77 1.0 0.8 0.68 0.9 0.72 0.57 0.06 0.6 0.66 0.64 0.85 0.55
0.27 0.65 0.54 0.66 0.77 0.76 0.8 0.81 0.87 0.78 0.85 0.71 0.29 0.71 0.69 0.73 0.68 0.77 0.77 0.65 0.05 0.63 0.67 0.43 1.0 0.71
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0.23 0.6 0.6 0.64 0.8 1.0 0.78 0.77 0.75 0.61 0.56 0.55 0.13 0.49 0.69 0.69 0.56 0.84 0.68 0.53 0.08 0.46 0.62 0.61 0.75 0.55
0.27 0.55 0.65 0.79 0.86 0.78 0.92 0.88 0.95 0.78 0.7 0.68 0.27 0.83 0.78 0.74 0.68 1.0 0.76 0.64 0.08 0.79 0.8 0.55 0.9 0.81
0.24 0.49 0.62 0.72 0.8 0.71 0.86 0.85 0.89 0.98 1.0 0.83 0.18 0.49 1.0 0.58 0.6 0.71 0.61 0.45 0.13 0.66 0.74 0.58 0.87 0.57
0.53 0.61 0.7 0.84 0.83 0.64 0.92 0.86 0.92 0.87 0.86 0.71 0.59 0.76 0.79 0.78 0.73 0.98 0.64 0.66 0.05 0.81 0.6 0.36 1.0 0.66
0.07 0.39 0.52 0.78 0.92 1.0 0.77 0.73 0.68 0.65 0.47 0.46 0.07 0.36 0.59 0.7 0.45 0.89 0.52 0.58 0.06 0.1 0.54 0.2 0.37 0.51
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0.14 0.39 0.58 0.78 0.82 0.72 1.0 0.73 0.75 0.62 0.52 0.43 0.13 0.94 0.72 0.91 0.68 0.94 0.72 0.61 0.15 0.55 0.57 0.68 0.79 0.87
0.36 0.45 0.51 0.71 0.86 0.94 1.0 0.73 0.94 0.9 0.66 0.61 0.38 0.66 0.42 0.62 0.38 0.54 0.57 0.61 0.02 0.53 0.58 0.65 0.62 0.47
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0.41 0.53 0.61 0.74 0.7 0.66 0.9 0.85 0.79 0.67 0.59 0.48 0.37 0.65 0.67 0.85 0.66 1.0 0.77 0.62 0.16 0.82 0.67 0.47 0.65 0.54
0.29 0.58 0.61 0.68 0.73 0.71 0.76 0.71 0.7 0.67 0.56 0.49 0.23 0.43 0.72 0.52 0.58 1.0 0.79 0.69 0.01 0.3 0.51 0.58 0.49 0.42
0.67 0.47 0.37 0.55 0.78 0.72 0.92 1.0 0.97 0.8 0.73 0.48 0.53 0.1 0.25 0.12 0.43 0.74 0.59 0.6 0.01 0.08 0.51 0.27 0.69 0.4

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)