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Heatmap: Cluster_36 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.27 - - 0.75 - - - 2.34 -
- - - - - - - - 3.43 - - - - - 3.29 - - - - - 2.45 - - - - -
- 1.11 1.53 -0.1 - 0.19 0.39 - - - -0.05 - - 1.92 - - -0.09 1.24 1.66 - 1.09 1.27 0.87 - - -
- - - - - - - 3.86 - 3.53 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.03 - - - 2.09 - - - 2.43 - - - -
- - - - 1.7 1.91 - - - 2.13 0.24 - 2.25 - - - 0.2 - - - - -0.03 - - 1.61 1.81
1.11 - - - - 2.03 1.18 1.1 0.02 1.49 1.5 - - 2.44 - 0.96 - -0.57 - - - - - - - -0.6
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.12 1.52 1.18 - - -0.22 0.95 - - - 0.29 - - - 0.98 0.91 2.53 0.57 1.52 - -0.48 - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 2.78 - - - - 3.0 - 2.55 - - - - - 2.4 - - - -
- - - - - - - - - - - 3.95 - - - 2.75 - - - - 1.92 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.96 - 2.28 - 1.49 1.75 - 0.49 - 0.8 - - 2.03
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
-1.51 0.5 -2.36 - 0.45 0.74 -0.58 0.53 -0.99 -1.42 -2.39 1.2 0.14 0.91 -0.01 1.7 0.44 0.86 -0.39 -0.38 -1.02 -0.9 0.59 - -1.21 -0.65
- - - - - - - - 3.21 - - - - - - - - 4.06 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.91 - - - - - - - - - - 3.46 -
- - - - - - 3.93 - - - - - 2.62 - - - - 2.19 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - 1.72 - - 1.98 - - - - - - 2.41 3.44 - - - - - - 1.37 - - - -
- - - 2.3 - - 0.64 2.24 - - 1.6 - 1.07 3.27 - - - - - - - - - - - -
- - - 2.65 - - - - - - - - - - 4.04 1.71 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.49 2.4 - - - - 3.46 - - - - 2.04 -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- 0.2 0.19 - - - - 0.17 - -0.09 - - - - - 1.43 1.05 3.85 - - - - - - 1.28 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.74 - - - 3.66 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 2.27 - - - 4.4 - - - - - - - - - - - -
- - 1.86 - - - - 1.75 - - - - - 3.69 2.61 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.35 - - 4.21 - - - - - - - 2.31 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.57 - - - 3.58 - - - - - - 1.12 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.25 - - - - 2.06 - 1.48 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - -0.28 - 0.92 1.01 - 1.68 2.2 1.43 1.94 -1.0 2.09 -0.78 - -0.8 - - -1.02 -0.91
- - - - - - - - - - 2.49 - - 2.36 - 2.42 - - 2.45 - - - 2.15 - - -
- - - - - - 2.82 - - - - 2.46 - - - - 2.34 - - - - 2.12 2.0 - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.05 - - - - - 3.25 - - - - - -
- - - - 1.76 - - - - - - - - 3.58 - - 1.29 - 1.99 - - 0.66 1.4 - - -
- - 1.3 - - 1.32 - 1.52 - - - - - 3.65 - - - 1.88 0.95 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.49 - - 1.85 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.14 2.36 - - - - 1.71 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 3.92 - - - - - - - - - 3.44 - - - -
-0.64 0.56 - - -0.73 - -0.43 1.73 1.43 1.3 0.88 - 1.42 2.07 - -0.49 0.58 - 1.36 -0.72 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 3.88 - - - - - - 2.44 - - 2.54 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.16 - 2.64 - - 2.03 3.49 - - - - - - - - - - - -
- - 2.1 - - - - - - - - - - 1.71 - - 2.07 2.71 - - - - 1.49 - - 2.29
- - - - - - - - - - - - - 4.18 - - - - 2.99 - - - - - - -
-0.61 - - - -2.19 -1.88 -1.68 - - - -1.96 - - 4.09 -1.98 - -1.92 -0.44 -0.66 - - -0.56 0.26 0.01 -2.5 1.21
- - -0.41 - - 1.81 - - - - - - - 4.14 0.5 - - - - 1.44 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.18 - - 2.97 - - - - - - - -
- - - - - - - - - 2.17 - 2.34 - 2.6 - - - 1.71 - - - 2.0 - - 1.64 -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- 1.92 1.76 0.05 - - - - - 1.01 1.02 1.19 - 0.44 - - - -0.45 - 0.01 - 1.8 - - 1.77 0.55
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
0.27 -0.09 -2.54 0.57 0.1 0.11 -0.25 0.18 0.6 -0.45 -0.56 -0.86 0.01 1.97 -0.37 -0.05 -1.45 -0.94 0.08 -1.01 -1.29 0.12 -0.44 -2.94 0.84 0.44
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.06 - - - - - 3.22 - - - - -
- - - 0.88 -0.55 0.39 0.92 0.15 0.89 - 0.22 0.94 - -1.33 0.17 1.34 1.05 - -0.09 1.0 -0.18 - -1.4 1.16 -0.39 -0.16
- - - - - - - - - - - 3.57 - 3.82 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.11 - - - 3.09 - 3.15 - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.28 - - 3.33 - - - - - 2.64 - - - - - - - -
- - - 2.13 - - - - - - - - - 3.4 - 2.19 - - 1.98 - - - - - 1.37 -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - 3.52 - - - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - 2.96 - - - - - - - - 3.05 - 3.31 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 3.41 - 3.15 - - - - - - - - - - 2.7 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 3.01 - 2.75 - - - 3.49 - - - - - - - -
- - 1.6 - - 1.62 - 1.49 1.73 - 1.53 - - 2.76 1.35 - - - - - 0.62 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - 2.89 - - - - 3.6 - - - - 2.69 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.67 - 3.73 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.18 - - - - - - - - - - 2.99 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- 0.59 - 2.64 - - - 1.03 - 0.97 - - 1.45 2.36 - - - 1.26 2.0 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.7 - 2.85 - - - 2.54 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.65 - - - - 3.75 - - - - - - -
- 2.08 - - - 1.08 - - - 0.75 - 0.94 1.23 2.18 - - 0.81 - 2.37 - - - - - 1.16 -
- - - - - - - - - - - 3.82 - 3.57 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.88 - - - 3.11 2.88 - - 1.65 1.67 - - -
0.44 1.38 0.28 - 1.0 - -0.84 - -0.72 - - 2.95 2.69 -1.43 - - - -1.43 - -1.22 -1.78 -1.1 - -0.24 -0.49 -
- - - - 2.18 - - - - 1.16 - - - 2.92 1.19 2.26 - - 2.2 - - - - - - -
1.2 - -0.18 - - - 1.15 - -0.14 - - 1.91 - - 0.73 1.44 - 0.23 2.61 0.5 1.18 - - - -0.8 -
- - - - - - - - - - - - - 2.66 - 2.71 - - 2.75 - - - 2.68 - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.03 - - - - - - - - 4.48 0.74 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - 3.26 - 2.93 - 3.14 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.25 - - - - - - 0.44 - - 0.1 1.41 - 4.13 1.18 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.96 - - - 3.38 - - - - - - - -
- 2.42 - - 2.74 - - - - - - - - 3.19 - - - - - - - - - - - 2.27
- - - - - - - - - - - - - 3.66 3.74 - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.