Heatmap: Cluster_194 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.06 0.16 0.21 0.33 0.23 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.04 0.02 0.09 0.01 1.0 0.34 0.08 0.04
0.15 0.07 0.05 0.04 0.04 0.03 0.09 0.19 0.24 0.27 0.37 0.33 0.13 0.07 0.06 0.09 0.07 0.13 0.13 0.06 0.07 0.09 1.0 0.34 0.42 0.3
0.24 0.25 0.15 0.21 0.1 0.05 0.16 0.16 0.17 0.14 0.22 0.22 0.16 0.08 0.06 0.06 0.14 0.12 0.13 0.07 0.07 0.31 1.0 0.42 0.39 0.24
0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.12 0.05 0.28 0.19 0.11 0.08 0.0 0.22 0.1 0.16 0.07 0.06 0.01 0.04 0.13 0.02 1.0 0.23 0.12 0.28
0.42 0.3 0.26 0.29 0.27 0.19 0.22 0.24 0.29 0.29 0.46 0.46 0.39 0.18 0.13 0.18 0.17 0.24 0.2 0.19 0.19 0.43 1.0 0.77 0.39 0.27
0.25 0.15 0.11 0.13 0.08 0.07 0.11 0.2 0.24 0.47 0.48 0.4 0.26 0.19 0.12 0.14 0.08 0.15 0.14 0.11 0.11 0.22 1.0 0.32 0.53 0.26
0.24 0.22 0.26 0.27 0.23 0.28 0.41 0.39 0.38 0.36 0.39 0.46 0.27 0.25 0.24 0.23 0.3 0.28 0.29 0.29 0.46 0.28 1.0 0.79 0.37 0.4
0.1 0.08 0.09 0.11 0.11 0.23 0.22 0.14 0.3 0.38 0.46 0.38 0.11 0.21 0.16 0.14 0.23 0.3 0.35 0.35 0.39 0.2 1.0 0.86 0.26 0.38
0.17 0.16 0.16 0.17 0.18 0.18 0.19 0.19 0.28 0.34 0.38 0.46 0.26 0.2 0.26 0.16 0.21 0.26 0.3 0.25 0.27 0.18 1.0 0.6 0.2 0.37
0.35 0.39 0.35 0.37 0.34 0.31 0.36 0.36 0.36 0.32 0.32 0.37 0.29 0.21 0.23 0.15 0.34 0.3 0.3 0.31 0.26 0.43 1.0 0.59 0.32 0.41
0.23 0.0 0.0 0.08 0.06 0.0 0.06 0.07 0.1 0.09 0.13 0.02 0.08 0.05 0.02 0.02 0.02 0.06 0.0 0.0 0.22 0.19 1.0 0.13 0.04 0.17
0.48 0.24 0.2 0.24 0.31 0.29 0.32 0.28 0.32 0.27 0.29 0.25 0.43 0.24 0.26 0.2 0.2 0.17 0.2 0.16 0.07 0.12 1.0 0.21 0.26 0.2
0.18 0.14 0.13 0.13 0.16 0.23 0.26 0.24 0.31 0.32 0.39 0.4 0.2 0.2 0.16 0.18 0.17 0.29 0.26 0.21 0.4 0.16 1.0 0.59 0.25 0.33
0.07 0.11 0.1 0.1 0.18 0.26 0.26 0.25 0.39 0.44 0.37 0.29 0.07 0.2 0.29 0.26 0.24 0.42 0.49 0.34 0.5 0.12 1.0 0.62 0.36 0.32
0.21 0.15 0.12 0.15 0.06 0.06 0.15 0.23 0.27 0.32 0.44 0.39 0.14 0.11 0.09 0.05 0.12 0.25 0.17 0.15 0.19 0.08 1.0 0.61 0.52 0.27
0.09 0.1 0.1 0.13 0.19 0.19 0.19 0.19 0.27 0.27 0.33 0.33 0.1 0.11 0.13 0.1 0.11 0.14 0.16 0.13 0.28 0.1 1.0 0.53 0.25 0.17
0.19 0.01 0.02 0.02 0.03 0.1 0.26 0.23 0.45 0.57 0.55 0.56 0.25 0.01 0.03 0.01 0.04 0.18 0.09 0.1 0.06 0.04 1.0 0.59 0.56 0.19
0.51 0.32 0.19 0.18 0.17 0.18 0.31 0.41 0.22 0.32 0.31 0.21 0.34 0.1 0.06 0.3 0.14 0.21 0.18 0.16 0.01 0.06 1.0 0.16 0.35 0.16
0.35 0.22 0.2 0.23 0.27 0.22 0.33 0.25 0.25 0.29 0.33 0.43 0.42 0.12 0.17 0.15 0.1 0.17 0.22 0.13 0.05 0.1 1.0 0.19 0.38 0.28
0.25 0.07 0.06 0.06 0.04 0.02 0.07 0.09 0.14 0.4 0.43 0.4 0.21 0.13 0.09 0.13 0.07 0.05 0.07 0.08 0.12 0.09 1.0 0.27 0.32 0.22
0.11 0.08 0.05 0.1 0.17 0.23 0.18 0.16 0.24 0.32 0.35 0.35 0.12 0.03 0.09 0.06 0.05 0.08 0.09 0.1 0.2 0.09 1.0 0.35 0.16 0.16
0.21 0.16 0.12 0.12 0.06 0.06 0.08 0.16 0.26 0.29 0.45 0.43 0.23 0.11 0.15 0.18 0.17 0.18 0.2 0.18 0.14 0.22 1.0 0.84 0.37 0.3
0.13 0.08 0.06 0.08 0.1 0.21 0.2 0.17 0.26 0.26 0.29 0.33 0.14 0.12 0.15 0.23 0.14 0.12 0.14 0.1 0.13 0.22 1.0 0.4 0.21 0.13
0.14 0.09 0.12 0.2 0.23 0.52 0.41 0.32 0.44 0.52 0.49 0.52 0.17 0.25 0.24 0.33 0.28 0.33 0.5 0.43 0.47 0.38 1.0 0.77 0.27 0.46
0.56 0.21 0.08 0.07 0.12 0.15 0.19 0.2 0.26 0.24 0.32 0.28 0.36 0.18 0.16 0.13 0.15 0.16 0.07 0.09 0.03 0.13 1.0 0.25 0.38 0.21
0.16 0.05 0.06 0.08 0.07 0.07 0.06 0.08 0.11 0.16 0.25 0.37 0.13 0.08 0.05 0.03 0.02 0.06 0.04 0.03 0.08 0.05 1.0 0.67 0.11 0.12
0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.05 0.03 0.18 0.34 0.29 0.21 0.04 0.03 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.03 0.15 0.01 1.0 0.61 0.12 0.13
0.08 0.05 0.05 0.07 0.16 0.29 0.32 0.22 0.33 0.39 0.35 0.31 0.09 0.58 0.18 0.38 0.31 0.32 0.27 0.31 0.32 0.18 1.0 0.63 0.32 0.34
0.07 0.04 0.02 0.03 0.06 0.02 0.06 0.09 0.21 0.34 0.29 0.22 0.12 0.03 0.11 0.01 0.05 0.19 0.05 0.0 0.01 0.03 1.0 0.07 0.06 0.21
0.11 0.02 0.02 0.04 0.04 0.05 0.14 0.2 0.23 0.35 0.39 0.34 0.07 0.02 0.03 0.03 0.04 0.13 0.09 0.11 0.05 0.05 1.0 0.26 0.12 0.18
0.19 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.11
0.19 0.27 0.25 0.39 0.3 0.21 0.25 0.32 0.28 0.23 0.22 0.2 0.18 0.1 0.15 0.07 0.15 0.26 0.21 0.18 0.01 0.14 1.0 0.37 0.49 0.41
0.2 0.2 0.22 0.31 0.29 0.28 0.26 0.24 0.28 0.31 0.34 0.34 0.17 0.23 0.2 0.23 0.19 0.23 0.3 0.21 0.33 0.28 1.0 0.61 0.35 0.44
0.25 0.3 0.27 0.21 0.2 0.13 0.2 0.2 0.26 0.33 0.36 0.35 0.25 0.16 0.23 0.36 0.23 0.31 0.32 0.2 0.09 0.12 1.0 0.52 0.68 0.38
0.06 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.02 0.11 0.02 0.27 0.17 0.19 0.11 0.09 0.24 0.02 0.06 0.03 0.0 0.02 0.12 0.03 1.0 0.1 0.45 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.02 0.08 0.18 0.15 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.21 0.01 0.03 0.0 0.01 1.0 0.23 0.03 0.05
0.08 0.03 0.06 0.09 0.1 0.08 0.14 0.17 0.26 0.36 0.47 0.45 0.13 0.19 0.11 0.14 0.12 0.2 0.13 0.13 0.41 0.17 1.0 0.73 0.31 0.37
0.14 0.05 0.02 0.03 0.07 0.13 0.27 0.23 0.23 0.32 0.27 0.21 0.13 0.39 0.12 0.19 0.2 0.3 0.26 0.2 0.32 0.04 1.0 0.47 0.23 0.31
0.37 0.34 0.29 0.25 0.2 0.19 0.3 0.28 0.36 0.37 0.44 0.53 0.33 0.16 0.21 0.17 0.18 0.27 0.24 0.19 0.11 0.21 1.0 0.52 0.38 0.2
0.19 0.15 0.14 0.13 0.06 0.05 0.1 0.12 0.06 0.14 0.17 0.23 0.23 0.06 0.05 0.06 0.09 0.11 0.12 0.08 0.03 0.04 1.0 0.19 0.57 0.24
0.32 0.23 0.24 0.22 0.24 0.17 0.28 0.28 0.29 0.38 0.41 0.54 0.32 0.23 0.13 0.22 0.17 0.23 0.19 0.2 0.18 0.41 1.0 0.49 0.53 0.35
0.08 0.18 0.14 0.16 0.11 0.09 0.1 0.13 0.17 0.22 0.28 0.39 0.08 0.07 0.06 0.05 0.08 0.15 0.15 0.07 0.08 0.07 1.0 0.5 0.22 0.24
0.27 0.16 0.09 0.13 0.25 0.32 0.37 0.34 0.42 0.5 0.57 0.52 0.17 0.15 0.07 0.08 0.15 0.19 0.17 0.2 0.05 0.21 1.0 0.8 0.44 0.36
0.1 0.1 0.07 0.1 0.07 0.07 0.07 0.13 0.26 0.23 0.28 0.26 0.09 0.07 0.09 0.11 0.13 0.18 0.15 0.13 0.04 0.07 1.0 0.43 0.67 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)