1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_63 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.16 1.53 -0.07 -0.22 - 0.84 -0.09 - 1.39 -0.39 2.45 2.38 - - -0.55 0.64 - -0.45 - -0.62 - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.21 - - - - - 2.9 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.58 - - - 3.81 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
-0.32 0.42 -2.0 -3.04 -0.66 0.04 0.77 0.94 2.25 1.18 1.61 1.47 0.67 - -3.22 -3.23 - -0.79 0.61 -1.46 - - -3.5 -1.18 -1.97 -1.7
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.73 - 1.63 1.98 1.94 - - - 2.72 - 1.63 - - - - - - - - - - - 1.06 -
1.07 -1.45 -0.8 0.05 2.11 1.64 -1.02 -0.82 0.03 0.51 0.48 1.39 0.38 -1.2 - -0.89 0.17 -1.62 -0.39 - 0.15 - -0.11 -1.13 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.08 2.29 0.25 - 2.13 1.09 0.9 0.01 - 1.4 - - 2.34 - - -0.0 - - - -0.37 - - -
- 2.12 - - - 1.77 1.88 - - - 3.41 1.96 - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.07 - - 1.32 - - 1.0 3.38 2.81 - 0.95 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.71 - - - 3.69 - - - - - - - - - - -
- - - 0.31 - - - 1.19 0.22 - 2.77 0.34 2.21 - - 0.37 - 0.88 1.68 - - - - - 1.18 -
- - - - 4.05 - - - - - - 3.24 - - - - - - - - - - - - - -
- 1.98 - - 3.63 - - - - - - - - 2.73 1.63 - - - - - - - - - - -
- - -1.79 - 4.2 - -1.59 - - -1.88 - - - - - - - -2.38 -0.23 - - -0.73 2.15 - -0.62 -
- - - - - - - - - - 3.85 - - - - - - - - - - 3.53 - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.34 - - - - - 3.37 - - - - - - - - - 2.46 - - - - -
- - - - 3.92 - - - - - - - - - - - - 3.44 - - - - - - - -
-3.12 -0.77 0.12 -0.31 2.1 2.0 2.04 0.75 0.15 -3.15 -2.46 -2.96 - -3.41 - - - -2.34 -1.99 - -1.16 -3.45 - 0.55 2.35 -2.97
0.22 -0.58 0.01 -0.07 1.19 1.22 1.08 0.08 -2.29 -2.39 1.74 0.05 1.45 -0.4 -1.08 -0.9 -1.53 -1.06 -2.79 -0.93 -1.97 1.15 -1.16 -1.81 -2.75 -1.82
- 1.26 0.01 0.96 1.76 1.91 1.12 - - 0.93 2.26 - - - - - 1.24 -0.53 - 0.68 - - - - - -
- - - - 3.68 - - - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - -
2.16 - - - - - - - 2.15 1.91 2.96 - 2.46 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.12 - 1.49 2.66 - 1.55 1.75 - - - 1.63 - - - - - - 2.41 - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.1 0.11 - - - 2.67 1.93 1.09 1.84 1.17 2.22 0.06 - - - - - - - - - - - - - -
- -3.57 0.44 0.92 1.38 2.59 0.76 0.77 - -3.23 2.25 -3.06 1.58 -0.56 -1.65 -1.42 -2.95 -0.72 - -1.23 - - - -2.73 - -
- - - - 1.38 - - - - 1.37 - - - - - - - 0.89 - 2.38 - 1.09 1.11 1.38 - 2.78
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.69 3.71 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.09 - 2.32 - 1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.64 - - - - - 3.75 - - - - - - - - - - - - - - -
1.48 - - 0.27 1.48 - - 0.22 2.22 0.15 2.93 1.89 - - -0.06 - - - - - - - - - - -
1.91 -0.24 -0.49 - 1.1 -0.24 -0.48 - 1.64 2.61 2.27 1.19 - - - - - - -0.56 - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.85 - - - - - - - 3.11 0.94 3.57 - - - 0.82 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
2.13 - - 2.52 - - - - - - 3.37 - - 0.26 0.76 - - - - - - - - - - 1.43
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.78 - - - 2.55 2.9 - - - - - - 2.54 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
2.93 - - - - - 3.24 - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.98 - - - 2.64 - - 1.98 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
1.79 -1.22 0.3 -3.36 2.47 -1.14 -1.07 -0.08 -1.77 -1.0 -0.71 2.14 -0.72 -2.44 -0.46 1.65 - -1.07 -0.08 -4.7 -2.19 - -3.45 - -0.0 -3.29
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 0.95 2.15 0.93 1.84 1.87 - 2.77 - - - - - 0.87 0.86 - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.59 - 0.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.