1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.47 0.55 0.6 0.68 0.66 0.44 0.53 0.47 0.44 0.38 0.32 0.3 0.37 0.29 0.32 0.36 0.38 0.53 0.32 0.52 0.24 0.82 0.65 0.52 1.0 0.81
0.91 0.87 0.89 1.0 0.84 0.64 0.72 0.87 0.63 0.55 0.58 0.65 0.89 0.37 0.38 0.42 0.41 0.62 0.46 0.54 0.46 0.55 0.75 0.58 0.98 0.83
0.41 0.42 0.5 0.47 0.4 0.36 0.27 0.33 0.51 0.4 0.42 0.38 0.15 0.27 0.37 0.29 0.42 0.42 0.43 0.35 0.1 0.47 0.39 0.49 0.7 1.0
0.72 0.61 0.66 0.77 0.63 0.45 0.46 0.63 0.53 0.36 0.43 0.4 0.58 0.3 0.28 0.32 0.3 0.41 0.3 0.45 0.43 0.77 0.47 0.43 1.0 0.85
0.87 0.86 0.94 1.0 0.83 0.67 0.67 0.85 0.69 0.49 0.54 0.56 0.82 0.32 0.36 0.31 0.34 0.44 0.32 0.48 0.37 0.95 0.41 0.36 0.95 0.88
0.94 0.95 0.97 1.0 0.76 0.57 0.69 0.89 0.74 0.5 0.52 0.58 0.81 0.34 0.35 0.41 0.41 0.61 0.43 0.63 0.26 0.96 0.3 0.54 1.0 0.82
0.83 0.95 0.97 1.0 0.83 0.61 0.6 0.79 0.72 0.44 0.5 0.58 0.8 0.26 0.28 0.34 0.36 0.47 0.38 0.56 0.24 0.85 0.32 0.48 0.93 0.77
0.5 0.67 0.79 0.86 0.83 0.75 0.64 0.51 0.48 0.47 0.48 0.56 0.5 0.33 0.24 0.48 0.44 0.44 0.41 0.51 0.32 0.5 0.73 0.91 1.0 0.79
0.74 0.6 0.65 0.77 0.67 0.53 0.45 0.44 0.34 0.33 0.35 0.44 0.86 0.38 0.34 0.37 0.36 0.34 0.29 0.37 0.36 0.43 0.49 0.28 1.0 0.66
0.54 0.38 0.41 0.38 0.24 0.18 0.36 0.44 0.44 0.47 0.53 0.54 0.52 0.34 0.32 0.3 0.34 0.47 0.48 0.4 0.11 0.51 0.29 0.55 0.8 1.0
0.35 0.48 0.74 0.83 1.0 0.78 0.66 0.59 0.8 0.76 0.72 0.7 0.37 0.69 0.35 0.49 0.32 0.52 0.5 0.54 0.23 0.82 0.66 0.51 0.71 0.72
0.63 0.79 0.83 0.92 0.68 0.53 0.46 0.59 0.45 0.34 0.34 0.36 0.55 0.23 0.29 0.25 0.3 0.88 0.53 0.57 0.38 0.67 0.64 0.46 1.0 0.92
1.0 0.67 0.8 0.76 0.39 0.26 0.4 0.63 0.31 0.3 0.34 0.39 0.96 0.22 0.21 0.2 0.2 0.21 0.21 0.32 0.55 0.21 0.35 0.34 0.67 0.84
0.37 0.35 0.42 0.4 0.3 0.34 0.31 0.3 0.28 0.32 0.27 0.26 0.29 0.29 0.16 0.2 0.22 0.4 0.41 0.34 0.13 0.4 0.74 0.46 0.92 1.0
0.31 0.3 0.31 0.29 0.21 0.27 0.21 0.22 0.28 0.32 0.32 0.31 0.25 0.21 0.15 0.17 0.17 0.26 0.31 0.32 0.11 0.5 0.47 0.36 0.7 1.0
0.89 0.73 0.82 0.69 0.34 0.27 0.32 0.51 0.34 0.27 0.36 0.48 0.61 0.25 0.3 0.4 0.31 0.31 0.32 0.39 0.28 1.0 0.76 0.59 0.92 0.79
0.25 0.39 0.56 0.55 0.6 0.54 0.71 0.68 0.79 0.66 0.58 0.46 0.3 0.47 0.48 0.46 0.42 0.33 0.5 0.55 0.15 0.53 0.56 0.28 0.53 1.0
0.58 0.58 0.63 0.61 0.56 0.43 0.44 0.52 0.39 0.32 0.3 0.3 0.51 0.26 0.31 0.33 0.36 0.64 0.43 0.49 0.34 0.78 0.25 0.32 1.0 0.79
0.93 0.67 0.78 0.88 0.65 0.42 0.53 0.64 0.14 0.18 0.21 0.27 1.0 0.47 0.29 0.47 0.25 0.33 0.24 0.35 0.41 0.2 0.27 0.18 0.84 0.77
0.89 0.99 0.95 1.0 0.84 0.64 0.65 0.82 0.73 0.48 0.5 0.55 0.79 0.37 0.37 0.36 0.41 0.54 0.45 0.63 0.47 0.77 0.27 0.4 0.85 0.82
0.99 0.57 0.7 0.74 0.62 0.49 0.63 0.68 0.59 0.63 0.63 0.74 0.93 0.56 0.5 0.51 0.57 0.7 0.42 0.63 0.57 0.47 0.49 0.54 0.95 1.0
0.43 0.27 0.4 0.43 0.37 0.36 0.53 0.56 0.52 0.62 0.61 0.57 0.34 0.42 0.18 0.28 0.35 0.42 0.51 0.59 0.16 0.64 0.64 0.58 0.78 1.0
0.5 0.52 0.46 0.38 0.27 0.18 0.39 0.4 0.24 0.42 0.39 0.38 0.47 0.43 0.17 0.19 0.34 0.48 0.31 0.45 0.17 0.5 0.63 0.54 0.96 1.0
0.76 0.75 0.78 0.78 0.74 0.61 0.58 0.71 0.54 0.44 0.44 0.46 0.65 0.39 0.55 0.41 0.36 0.72 0.56 0.53 0.3 0.56 0.39 0.47 0.92 1.0
1.0 0.8 0.82 0.72 0.36 0.23 0.53 0.72 0.32 0.35 0.38 0.4 0.91 0.56 0.17 0.45 0.34 0.49 0.26 0.4 0.57 0.33 0.36 0.38 0.97 0.96
0.95 0.79 0.81 0.66 0.34 0.24 0.49 0.63 0.32 0.31 0.33 0.37 0.83 0.49 0.17 0.39 0.29 0.39 0.27 0.37 0.49 0.25 0.3 0.34 0.88 1.0
1.0 0.87 0.82 0.7 0.37 0.33 0.51 0.65 0.34 0.32 0.33 0.36 0.84 0.47 0.17 0.35 0.27 0.39 0.31 0.39 0.47 0.28 0.32 0.31 0.89 0.97
0.94 1.0 0.88 0.96 0.84 0.74 0.69 0.84 0.8 0.53 0.6 0.6 0.86 0.39 0.42 0.44 0.42 0.54 0.53 0.61 0.43 0.95 0.67 0.52 0.87 0.88
0.96 0.84 0.9 1.0 0.72 0.65 0.66 0.78 0.61 0.49 0.51 0.55 0.89 0.4 0.43 0.41 0.36 0.71 0.49 0.52 0.59 0.78 0.55 0.6 0.8 0.95
0.65 0.75 0.86 0.83 0.83 0.62 0.48 0.59 0.57 0.49 0.5 0.49 0.61 0.38 0.48 0.38 0.51 0.43 0.49 0.66 0.34 0.85 1.0 0.84 0.93 0.8
0.49 0.72 0.69 0.76 0.64 0.59 0.49 0.59 0.58 0.41 0.36 0.36 0.47 0.25 0.32 0.25 0.29 0.77 0.41 0.44 0.22 1.0 0.3 0.33 1.0 0.73
0.81 0.89 1.0 1.0 0.84 0.77 0.69 0.82 0.73 0.51 0.52 0.52 0.7 0.36 0.41 0.4 0.42 0.63 0.48 0.65 0.4 0.92 0.52 0.47 0.96 0.78
0.87 0.92 0.98 0.95 0.69 0.56 0.43 0.58 0.42 0.34 0.38 0.4 0.58 0.39 0.52 0.3 0.37 0.62 0.52 0.49 0.34 0.89 0.38 0.42 1.0 0.97
0.89 1.0 0.91 0.98 0.89 0.79 0.77 0.88 0.88 0.68 0.69 0.71 0.82 0.55 0.47 0.76 0.57 0.8 0.66 0.72 0.53 0.89 0.56 0.73 0.91 0.78
0.86 0.75 0.78 1.0 0.68 0.39 0.53 0.65 0.39 0.46 0.5 0.5 0.68 0.4 0.25 0.36 0.41 0.63 0.6 0.81 0.15 0.83 0.63 0.48 0.84 0.81
1.0 0.58 0.63 0.65 0.43 0.24 0.3 0.52 0.27 0.2 0.27 0.29 0.79 0.23 0.29 0.26 0.18 0.3 0.23 0.29 0.42 0.33 0.78 0.28 0.99 0.84
0.44 0.4 0.33 0.3 0.23 0.34 0.26 0.26 0.26 0.21 0.17 0.18 0.49 0.42 0.28 0.37 0.17 0.33 0.36 0.18 0.08 0.42 0.54 0.3 1.0 0.66
0.66 0.91 0.94 1.0 0.89 0.64 0.55 0.54 0.51 0.53 0.53 0.58 0.57 0.18 0.26 0.25 0.46 0.89 0.51 0.73 0.16 0.83 0.67 0.66 0.63 0.65
0.59 0.51 0.5 0.57 0.48 0.48 0.4 0.49 0.48 0.34 0.39 0.43 0.56 0.18 0.2 0.19 0.23 0.55 0.32 0.31 0.26 1.0 0.53 0.47 1.0 0.71
0.54 0.47 0.41 0.35 0.13 0.12 0.17 0.32 0.28 0.33 0.29 0.33 0.39 0.2 0.19 0.28 0.24 0.48 0.35 0.34 0.09 0.25 0.44 0.5 1.0 0.98
1.0 0.85 0.89 0.89 0.87 0.85 0.83 0.77 0.78 0.57 0.66 0.76 0.79 0.81 0.53 0.92 0.58 0.58 0.66 0.62 0.08 0.94 0.78 0.41 0.76 0.7
1.0 0.73 0.64 0.5 0.29 0.24 0.37 0.51 0.24 0.26 0.32 0.37 0.83 0.22 0.17 0.2 0.24 0.22 0.24 0.28 0.52 0.23 0.45 0.43 0.96 0.73
0.31 0.5 0.84 1.0 0.88 0.51 0.54 0.52 0.44 0.55 0.5 0.65 0.4 0.45 0.41 0.61 0.39 0.63 0.41 0.45 0.16 0.47 0.85 0.76 0.87 0.96
0.48 0.54 0.58 0.57 0.44 0.28 0.24 0.31 0.29 0.25 0.29 0.34 0.37 0.18 0.17 0.15 0.23 0.29 0.2 0.38 0.12 0.43 0.62 0.51 1.0 0.87
0.48 0.33 0.24 0.2 0.2 0.21 0.3 0.34 0.21 0.31 0.3 0.28 0.39 0.29 0.08 0.12 0.31 0.29 0.27 0.25 0.04 0.19 0.3 0.44 0.67 1.0
0.68 0.6 0.77 0.86 0.69 0.53 0.51 0.59 0.51 0.4 0.43 0.49 0.67 0.36 0.26 0.48 0.26 0.31 0.27 0.46 0.8 1.0 0.64 0.61 0.75 0.81
0.26 0.47 0.7 1.0 0.61 0.49 0.43 0.55 0.47 0.28 0.28 0.31 0.14 0.23 0.33 0.19 0.22 0.33 0.4 0.31 0.05 0.48 0.85 0.42 0.88 0.82
0.7 0.83 0.9 0.97 0.76 0.61 0.65 0.71 0.71 0.62 0.6 0.61 0.56 0.42 0.37 0.42 0.48 0.71 0.67 0.84 0.1 0.92 0.73 0.77 1.0 0.77
0.73 0.77 0.82 0.76 0.65 0.6 0.54 0.63 0.58 0.39 0.43 0.48 0.58 0.37 0.4 0.44 0.4 0.44 0.38 0.6 0.45 1.0 0.87 0.66 0.89 0.79
0.82 0.85 0.86 0.89 0.87 0.75 0.68 0.77 0.74 0.53 0.55 0.48 0.66 0.37 0.42 0.42 0.4 0.5 0.49 0.6 0.37 0.65 0.53 0.39 1.0 0.78
1.0 0.88 0.95 0.93 0.8 0.7 0.64 0.78 0.69 0.54 0.61 0.65 0.83 0.36 0.56 0.42 0.48 0.43 0.5 0.7 0.43 0.53 0.72 0.75 0.75 0.7
0.9 0.71 0.76 0.71 0.41 0.23 0.38 0.55 0.33 0.39 0.45 0.51 0.7 0.24 0.18 0.16 0.29 0.51 0.48 0.46 0.38 0.55 0.65 0.46 0.97 1.0
1.0 0.79 0.76 0.8 0.67 0.73 0.6 0.7 0.38 0.32 0.38 0.48 0.93 0.39 0.28 0.45 0.22 0.38 0.37 0.38 0.2 0.67 0.59 0.15 0.64 0.75
1.0 0.8 0.8 0.8 0.67 0.76 0.64 0.71 0.3 0.28 0.38 0.43 0.96 0.3 0.26 0.46 0.2 0.31 0.35 0.32 0.16 0.56 0.57 0.21 0.56 0.76
0.54 0.4 0.53 0.53 0.16 0.12 0.19 0.42 0.1 0.09 0.12 0.17 0.37 0.13 0.09 0.12 0.1 0.27 0.15 0.25 0.41 0.51 0.1 0.18 1.0 0.8
0.46 0.57 0.44 0.31 0.17 0.17 0.12 0.18 0.15 0.28 0.26 0.41 0.39 0.17 0.08 0.04 0.22 0.34 0.42 0.4 0.04 0.25 0.2 0.34 1.0 0.79
0.41 0.59 0.43 0.39 0.26 0.23 0.25 0.27 0.19 0.3 0.36 0.42 0.43 0.15 0.04 0.06 0.1 0.35 0.32 0.36 0.05 0.17 0.23 0.37 0.92 1.0
1.0 0.88 0.96 0.96 0.83 0.72 0.79 0.89 0.61 0.58 0.57 0.57 0.88 0.46 0.57 0.54 0.51 0.68 0.61 0.69 0.45 0.63 0.5 0.59 0.92 1.0
0.82 0.94 0.94 1.0 0.96 0.68 0.53 0.67 0.7 0.45 0.53 0.57 0.84 0.37 0.4 0.41 0.36 0.36 0.44 0.55 0.68 0.75 0.67 0.56 0.77 0.73
0.51 0.5 0.48 0.42 0.34 0.32 0.3 0.28 0.18 0.25 0.25 0.32 0.5 0.33 0.32 0.33 0.32 0.45 0.33 0.31 0.13 0.22 0.56 0.56 1.0 0.76
1.0 0.84 0.85 0.86 0.69 0.53 0.5 0.64 0.55 0.38 0.46 0.6 0.87 0.29 0.33 0.34 0.3 0.46 0.36 0.53 0.52 0.87 0.57 0.55 0.79 0.95
0.44 0.32 0.27 0.39 0.48 0.44 0.52 0.52 0.37 0.45 0.41 0.33 0.36 0.16 0.26 0.15 0.28 0.42 0.52 0.54 0.17 0.66 0.57 0.67 1.0 0.82
0.18 0.29 0.42 0.4 0.3 0.24 0.15 0.19 0.16 0.09 0.1 0.07 0.06 0.05 0.05 0.05 0.05 0.07 0.08 0.09 0.6 0.61 0.43 0.29 0.72 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)