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Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.09 0.14 0.26 0.45 0.41 -0.17 0.09 -0.08 -0.19 -0.4 -0.66 -0.74 -0.45 -0.76 -0.65 -0.48 -0.39 0.09 -0.62 0.07 -1.04 0.71 0.37 0.05 1.0 0.71
0.45 0.37 0.42 0.58 0.33 -0.06 0.1 0.37 -0.09 -0.3 -0.21 -0.04 0.4 -0.85 -0.8 -0.68 -0.72 -0.1 -0.55 -0.3 -0.55 -0.27 0.17 -0.2 0.56 0.31
-0.02 0.02 0.29 0.19 -0.04 -0.21 -0.62 -0.32 0.29 -0.03 0.04 -0.11 -1.44 -0.61 -0.14 -0.52 0.03 0.04 0.07 -0.25 -2.01 0.18 -0.08 0.25 0.77 1.28
0.46 0.22 0.34 0.56 0.28 -0.21 -0.19 0.28 0.03 -0.55 -0.26 -0.36 0.14 -0.79 -0.92 -0.69 -0.78 -0.34 -0.79 -0.21 -0.26 0.56 -0.14 -0.28 0.94 0.7
0.47 0.46 0.58 0.67 0.4 0.09 0.09 0.44 0.14 -0.36 -0.2 -0.16 0.39 -0.96 -0.82 -1.03 -0.86 -0.5 -0.95 -0.37 -0.77 0.6 -0.6 -0.8 0.61 0.49
0.52 0.55 0.57 0.61 0.23 -0.19 0.07 0.44 0.18 -0.39 -0.32 -0.16 0.3 -0.92 -0.89 -0.66 -0.67 -0.1 -0.59 -0.05 -1.35 0.56 -1.11 -0.27 0.61 0.33
0.44 0.64 0.67 0.71 0.45 -0.01 -0.02 0.37 0.23 -0.48 -0.29 -0.07 0.38 -1.22 -1.14 -0.85 -0.74 -0.37 -0.7 -0.12 -1.34 0.48 -0.91 -0.34 0.61 0.34
-0.21 0.2 0.45 0.57 0.51 0.36 0.14 -0.19 -0.28 -0.31 -0.28 -0.07 -0.22 -0.82 -1.28 -0.29 -0.42 -0.42 -0.52 -0.2 -0.85 -0.21 0.33 0.64 0.78 0.45
0.59 0.28 0.39 0.65 0.44 0.1 -0.15 -0.16 -0.52 -0.59 -0.49 -0.18 0.8 -0.39 -0.55 -0.41 -0.47 -0.52 -0.77 -0.42 -0.44 -0.19 -0.02 -0.82 1.02 0.42
0.31 -0.2 -0.07 -0.21 -0.85 -1.3 -0.29 0.01 -0.0 0.11 0.28 0.32 0.25 -0.35 -0.43 -0.53 -0.36 0.09 0.13 -0.11 -2.02 0.23 -0.6 0.33 0.88 1.2
-0.8 -0.36 0.27 0.45 0.72 0.36 0.12 -0.05 0.4 0.32 0.24 0.19 -0.72 0.18 -0.79 -0.31 -0.92 -0.24 -0.29 -0.19 -1.38 0.43 0.11 -0.25 0.23 0.24
0.16 0.49 0.57 0.71 0.27 -0.09 -0.3 0.06 -0.32 -0.71 -0.74 -0.66 -0.03 -1.26 -0.93 -1.15 -0.89 0.65 -0.09 0.02 -0.55 0.26 0.19 -0.28 0.83 0.71
1.15 0.58 0.83 0.76 -0.22 -0.76 -0.17 0.48 -0.56 -0.6 -0.42 -0.22 1.09 -1.06 -1.08 -1.21 -1.19 -1.1 -1.12 -0.51 0.29 -1.09 -0.37 -0.4 0.57 0.9
-0.04 -0.12 0.14 0.06 -0.32 -0.16 -0.28 -0.34 -0.45 -0.24 -0.48 -0.56 -0.4 -0.37 -1.26 -0.93 -0.81 0.08 0.1 -0.15 -1.52 0.08 0.96 0.28 1.28 1.39
-0.03 -0.09 -0.03 -0.16 -0.58 -0.25 -0.58 -0.55 -0.2 -0.01 -0.02 -0.03 -0.39 -0.61 -1.08 -0.89 -0.94 -0.32 -0.03 0.01 -1.55 0.64 0.56 0.18 1.12 1.64
0.81 0.51 0.69 0.44 -0.57 -0.94 -0.65 -0.02 -0.58 -0.94 -0.5 -0.08 0.26 -1.0 -0.76 -0.37 -0.7 -0.72 -0.67 -0.37 -0.86 0.97 0.58 0.2 0.85 0.63
-1.02 -0.41 0.13 0.1 0.23 0.08 0.48 0.41 0.63 0.36 0.17 -0.15 -0.78 -0.12 -0.11 -0.16 -0.31 -0.63 -0.03 0.1 -1.76 0.06 0.13 -0.89 0.04 0.96
0.27 0.27 0.39 0.35 0.23 -0.15 -0.14 0.11 -0.31 -0.6 -0.68 -0.69 0.09 -0.86 -0.63 -0.53 -0.41 0.42 -0.14 0.03 -0.5 0.7 -0.96 -0.59 1.06 0.72
0.97 0.5 0.71 0.89 0.44 -0.17 0.15 0.43 -1.76 -1.4 -1.2 -0.8 1.07 -0.02 -0.73 -0.03 -0.92 -0.51 -0.98 -0.42 -0.22 -1.25 -0.84 -1.38 0.82 0.69
0.48 0.64 0.58 0.65 0.4 0.02 0.04 0.37 0.2 -0.42 -0.34 -0.22 0.32 -0.78 -0.77 -0.81 -0.63 -0.24 -0.51 -0.01 -0.43 0.28 -1.23 -0.67 0.41 0.36
0.61 -0.18 0.11 0.19 -0.06 -0.41 -0.04 0.07 -0.15 -0.04 -0.05 0.2 0.52 -0.21 -0.38 -0.34 -0.17 0.11 -0.64 -0.05 -0.18 -0.46 -0.39 -0.27 0.55 0.63
-0.18 -0.83 -0.29 -0.16 -0.37 -0.4 0.14 0.22 0.1 0.36 0.34 0.24 -0.51 -0.22 -1.42 -0.78 -0.47 -0.21 0.07 0.29 -1.63 0.4 0.4 0.27 0.7 1.05
0.22 0.26 0.09 -0.16 -0.68 -1.24 -0.15 -0.12 -0.83 -0.03 -0.15 -0.16 0.13 -0.0 -1.3 -1.18 -0.33 0.16 -0.5 0.06 -1.31 0.23 0.56 0.32 1.16 1.22
0.37 0.35 0.39 0.4 0.31 0.05 -0.04 0.26 -0.14 -0.43 -0.42 -0.38 0.12 -0.61 -0.11 -0.53 -0.7 0.28 -0.08 -0.16 -0.99 -0.08 -0.62 -0.33 0.64 0.76
0.92 0.6 0.63 0.44 -0.57 -1.18 0.0 0.44 -0.72 -0.59 -0.48 -0.4 0.77 0.09 -1.6 -0.24 -0.65 -0.1 -1.03 -0.4 0.11 -0.67 -0.57 -0.47 0.87 0.85
0.96 0.69 0.73 0.44 -0.52 -1.04 0.01 0.36 -0.62 -0.65 -0.58 -0.41 0.77 -0.01 -1.5 -0.33 -0.73 -0.34 -0.83 -0.42 0.01 -0.94 -0.7 -0.52 0.85 1.03
1.0 0.8 0.71 0.49 -0.45 -0.59 0.01 0.37 -0.55 -0.63 -0.62 -0.46 0.75 -0.1 -1.52 -0.51 -0.9 -0.35 -0.71 -0.37 -0.1 -0.83 -0.67 -0.69 0.83 0.96
0.44 0.54 0.36 0.47 0.28 0.09 -0.0 0.29 0.22 -0.38 -0.19 -0.2 0.33 -0.83 -0.71 -0.65 -0.72 -0.36 -0.39 -0.18 -0.69 0.46 -0.05 -0.4 0.34 0.35
0.54 0.34 0.44 0.6 0.12 -0.01 0.01 0.25 -0.11 -0.42 -0.36 -0.26 0.43 -0.73 -0.62 -0.69 -0.87 0.1 -0.44 -0.34 -0.16 0.23 -0.25 -0.15 0.28 0.53
0.04 0.25 0.44 0.4 0.4 -0.02 -0.39 -0.1 -0.13 -0.38 -0.32 -0.36 -0.05 -0.73 -0.38 -0.73 -0.31 -0.53 -0.36 0.06 -0.88 0.44 0.67 0.42 0.56 0.36
-0.09 0.48 0.41 0.56 0.3 0.19 -0.09 0.18 0.16 -0.32 -0.52 -0.52 -0.15 -1.07 -0.68 -1.02 -0.84 0.57 -0.34 -0.25 -1.23 0.95 -0.78 -0.63 0.95 0.5
0.29 0.43 0.59 0.6 0.35 0.21 0.05 0.31 0.14 -0.36 -0.36 -0.34 0.07 -0.87 -0.68 -0.74 -0.65 -0.07 -0.46 -0.03 -0.72 0.48 -0.34 -0.48 0.53 0.24
0.57 0.64 0.74 0.69 0.23 -0.08 -0.47 -0.01 -0.48 -0.8 -0.63 -0.56 -0.03 -0.6 -0.17 -0.99 -0.68 0.07 -0.18 -0.27 -0.8 0.61 -0.63 -0.47 0.77 0.72
0.22 0.39 0.25 0.36 0.23 0.05 0.02 0.2 0.21 -0.17 -0.14 -0.1 0.1 -0.47 -0.71 -0.01 -0.41 0.08 -0.2 -0.09 -0.53 0.22 -0.44 -0.07 0.26 0.03
0.55 0.34 0.4 0.76 0.2 -0.58 -0.17 0.13 -0.61 -0.36 -0.25 -0.25 0.21 -0.56 -1.26 -0.72 -0.51 0.1 0.01 0.46 -1.98 0.49 0.08 -0.3 0.51 0.46
1.17 0.37 0.51 0.55 -0.04 -0.91 -0.59 0.21 -0.72 -1.14 -0.7 -0.62 0.83 -0.94 -0.61 -0.78 -1.35 -0.57 -0.96 -0.64 -0.1 -0.42 0.8 -0.67 1.15 0.92
0.34 0.2 -0.07 -0.21 -0.56 -0.03 -0.39 -0.42 -0.4 -0.73 -1.06 -0.95 0.51 0.29 -0.28 0.08 -1.03 -0.06 0.07 -0.91 -2.03 0.28 0.65 -0.21 1.53 0.92
0.13 0.58 0.64 0.72 0.56 0.09 -0.13 -0.16 -0.24 -0.19 -0.2 -0.06 -0.09 -1.76 -1.21 -1.27 -0.41 0.56 -0.25 0.26 -1.9 0.45 0.15 0.13 0.05 0.1
0.34 0.11 0.09 0.28 0.04 0.03 -0.22 0.06 0.03 -0.45 -0.28 -0.11 0.26 -1.34 -1.24 -1.3 -1.04 0.22 -0.53 -0.61 -0.86 1.1 0.19 0.01 1.09 0.61
0.57 0.37 0.18 -0.05 -1.53 -1.57 -1.1 -0.17 -0.39 -0.14 -0.32 -0.13 0.11 -0.86 -0.96 -0.4 -0.62 0.39 -0.05 -0.09 -2.05 -0.57 0.27 0.46 1.46 1.43
0.46 0.23 0.28 0.29 0.26 0.23 0.19 0.08 0.11 -0.35 -0.14 0.07 0.12 0.16 -0.46 0.34 -0.33 -0.31 -0.14 -0.24 -3.16 0.37 0.09 -0.82 0.07 -0.05
1.22 0.77 0.57 0.23 -0.55 -0.86 -0.21 0.24 -0.84 -0.73 -0.43 -0.23 0.94 -0.99 -1.31 -1.08 -0.82 -0.96 -0.86 -0.62 0.29 -0.92 0.08 -0.01 1.15 0.75
-0.91 -0.21 0.54 0.79 0.6 -0.18 -0.11 -0.15 -0.39 -0.07 -0.21 0.16 -0.55 -0.37 -0.48 0.07 -0.58 0.13 -0.49 -0.38 -1.88 -0.29 0.55 0.4 0.58 0.73
0.29 0.47 0.59 0.54 0.18 -0.49 -0.68 -0.34 -0.43 -0.63 -0.42 -0.2 -0.08 -1.13 -1.23 -1.4 -0.75 -0.44 -0.96 -0.03 -1.71 0.16 0.67 0.39 1.36 1.16
0.65 0.08 -0.36 -0.6 -0.66 -0.53 -0.05 0.13 -0.56 0.01 -0.05 -0.14 0.32 -0.07 -1.93 -1.41 -0.0 -0.07 -0.17 -0.32 -2.92 -0.73 -0.03 0.5 1.11 1.69
0.26 0.09 0.43 0.6 0.29 -0.1 -0.15 0.05 -0.14 -0.52 -0.4 -0.2 0.23 -0.65 -1.15 -0.25 -1.1 -0.87 -1.07 -0.29 0.49 0.82 0.18 0.1 0.41 0.51
-0.75 0.09 0.66 1.17 0.46 0.15 -0.05 0.32 0.1 -0.66 -0.66 -0.5 -1.69 -0.93 -0.41 -1.2 -0.99 -0.44 -0.13 -0.52 -3.19 0.11 0.94 -0.08 1.0 0.89
0.06 0.3 0.43 0.53 0.18 -0.13 -0.04 0.09 0.07 -0.12 -0.17 -0.13 -0.26 -0.69 -0.85 -0.67 -0.49 0.07 0.0 0.33 -2.79 0.46 0.13 0.21 0.58 0.2
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0.39 0.43 0.45 0.5 0.46 0.25 0.11 0.29 0.22 -0.25 -0.2 -0.39 0.06 -0.77 -0.57 -0.58 -0.64 -0.33 -0.36 -0.07 -0.76 0.05 -0.25 -0.7 0.66 0.31
0.59 0.4 0.51 0.49 0.27 0.06 -0.05 0.24 0.05 -0.3 -0.14 -0.04 0.32 -0.91 -0.25 -0.68 -0.49 -0.62 -0.41 0.07 -0.63 -0.34 0.11 0.16 0.17 0.07
0.8 0.47 0.56 0.46 -0.32 -1.15 -0.45 0.1 -0.64 -0.39 -0.18 -0.02 0.45 -1.09 -1.53 -1.7 -0.82 0.0 -0.11 -0.17 -0.43 0.09 0.34 -0.17 0.92 0.96
0.89 0.55 0.49 0.58 0.31 0.44 0.16 0.38 -0.49 -0.76 -0.51 -0.18 0.79 -0.47 -0.95 -0.25 -1.29 -0.49 -0.54 -0.51 -1.46 0.31 0.14 -1.85 0.24 0.48
0.94 0.63 0.61 0.62 0.36 0.54 0.29 0.45 -0.79 -0.91 -0.45 -0.27 0.88 -0.81 -1.0 -0.19 -1.39 -0.77 -0.57 -0.71 -1.68 0.1 0.14 -1.32 0.11 0.55
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0.54 0.86 0.49 -0.04 -0.86 -0.92 -1.43 -0.81 -1.03 -0.16 -0.3 0.39 0.3 -0.87 -2.04 -3.03 -0.54 0.11 0.41 0.35 -2.98 -0.32 -0.67 0.1 1.67 1.32
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0.49 0.32 0.44 0.44 0.23 0.04 0.15 0.34 -0.22 -0.28 -0.32 -0.32 0.31 -0.61 -0.31 -0.38 -0.47 -0.06 -0.22 -0.04 -0.65 -0.17 -0.51 -0.27 0.38 0.5
0.36 0.56 0.55 0.64 0.58 0.09 -0.28 0.07 0.12 -0.52 -0.28 -0.18 0.39 -0.81 -0.68 -0.63 -0.82 -0.83 -0.54 -0.21 0.08 0.22 0.06 -0.2 0.26 0.18
0.36 0.34 0.29 0.11 -0.23 -0.32 -0.41 -0.51 -1.13 -0.68 -0.65 -0.31 0.34 -0.26 -0.31 -0.27 -0.3 0.2 -0.25 -0.35 -1.63 -0.82 0.51 0.51 1.34 0.94
0.73 0.49 0.5 0.52 0.19 -0.17 -0.26 0.08 -0.13 -0.67 -0.38 -0.0 0.53 -1.08 -0.86 -0.84 -1.0 -0.37 -0.76 -0.19 -0.21 0.53 -0.07 -0.13 0.4 0.67
-0.02 -0.46 -0.7 -0.17 0.1 -0.01 0.24 0.23 -0.26 0.03 -0.1 -0.42 -0.31 -1.49 -0.75 -1.54 -0.66 -0.09 0.22 0.27 -1.34 0.57 0.35 0.6 1.17 0.89
-0.55 0.16 0.7 0.62 0.23 -0.12 -0.82 -0.42 -0.69 -1.51 -1.41 -1.9 -2.06 -2.36 -2.34 -2.36 -2.3 -1.93 -1.74 -1.5 1.2 1.24 0.74 0.14 1.48 1.95

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.