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Heatmap: Cluster_20 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.06 -1.21 -1.08 0.06 -0.75 -0.9 0.38 0.22 0.46 0.03 0.49 -1.0 -1.4 -1.15 -1.32 -0.34 -1.01 0.01 0.22 -0.67 0.34 1.06 1.1 -0.14 0.86 0.74
0.49 -0.24 - - - - - -1.95 - -0.31 -0.3 0.84 -0.67 0.97 - -0.25 - -2.43 -2.19 - -1.51 -1.16 2.69 2.36 1.21 0.64
-0.69 -0.53 -0.76 -0.79 -0.3 -0.6 -0.33 -0.32 -0.07 -0.14 -0.13 -0.29 -1.51 -0.06 -0.09 0.78 -0.27 -0.11 0.06 -0.56 0.94 0.04 0.65 0.38 1.2 0.39
0.08 -0.15 -0.27 0.11 0.07 -0.07 -0.15 -0.1 -0.13 -0.36 -0.33 0.03 0.01 -0.13 -0.82 -0.06 -0.51 -0.02 -0.36 -0.67 0.18 0.11 1.13 0.37 0.67 -0.07
0.08 0.21 0.23 0.51 0.3 0.22 -0.06 0.06 -0.04 -0.24 -0.14 -0.16 -0.24 -0.93 0.01 -0.22 -0.75 -0.06 -0.3 -0.81 -0.0 0.49 0.98 -0.01 -0.23 -0.38
0.91 0.26 0.24 0.42 -0.06 -0.44 -0.37 -0.15 -1.1 -1.08 -0.34 -0.02 0.92 -1.14 -1.4 -1.28 -1.07 -0.77 -1.04 -0.97 0.39 -1.35 1.7 0.11 0.86 0.38
0.59 -0.15 -0.22 -0.16 -0.48 -0.45 -0.59 -0.13 -0.62 -0.51 0.11 0.8 0.94 -0.8 -1.05 -0.3 -0.85 -0.46 -1.02 -0.82 0.62 -0.42 0.68 0.55 1.0 0.23
0.73 0.3 0.42 0.26 -0.31 -0.7 -0.53 -0.49 -0.53 -0.71 -0.34 0.05 0.18 -0.98 -0.91 -0.34 -1.19 -0.92 -0.72 -0.65 0.31 -0.05 1.0 -0.14 1.6 0.37
0.8 0.61 0.15 -0.13 -0.65 -0.77 -0.37 -0.04 0.13 0.11 0.39 0.54 0.7 -1.06 0.14 -1.27 -0.41 -0.51 -0.54 -0.29 0.22 -1.3 0.75 0.22 -0.02 -0.28
0.95 0.3 -0.07 -0.22 -0.44 -0.89 -0.72 -0.37 -1.21 -1.77 -0.84 -0.15 1.15 -0.55 -0.87 0.02 -0.94 -0.76 -1.23 -1.59 1.32 0.28 -0.32 0.02 1.69 0.13
0.68 0.33 0.43 0.26 -0.41 -0.81 -0.52 -0.1 -0.49 -0.9 -0.67 -0.46 0.24 -0.48 -0.32 -0.83 -0.44 -0.66 -0.41 -0.21 -0.19 -0.05 1.52 0.08 0.53 0.65
0.67 -0.09 -0.15 -0.21 -0.13 -0.03 -0.26 -0.22 -0.2 -0.25 -0.06 0.15 0.68 -0.55 -0.49 0.13 -0.37 -0.12 -0.32 -0.53 -0.29 0.32 1.07 0.01 0.04 -0.26
0.66 0.02 0.17 0.21 0.06 0.04 0.24 0.42 -0.54 -0.71 -0.61 -0.53 0.51 -1.09 -1.32 -1.52 -1.47 -1.14 -1.15 -0.83 -0.13 -0.62 1.73 0.09 0.85 0.73
1.73 0.41 0.17 -0.07 -1.34 -0.43 -1.34 0.05 -0.94 -0.55 -0.01 0.8 1.76 -1.24 -4.32 -1.74 -2.51 -1.67 -2.23 -1.51 0.73 0.01 1.33 -0.27 -0.13 -0.67
-0.58 -0.36 -0.27 -0.18 0.25 0.01 -0.11 -0.23 -0.28 -0.17 0.09 0.17 -0.35 0.05 -0.21 0.11 -0.29 -0.0 -0.29 -0.43 -0.12 -0.03 0.96 0.55 0.52 0.11
0.71 0.34 0.24 0.2 -0.57 -1.59 -1.76 -0.65 -0.74 -0.34 0.27 0.5 0.36 -1.5 -1.59 -1.77 -1.23 -0.98 -1.11 -0.65 0.35 0.53 1.53 0.93 0.61 0.57
0.27 0.13 0.27 0.32 0.18 0.16 0.04 0.13 0.04 -0.08 -0.03 0.06 0.55 -0.68 -0.32 -0.59 -0.72 -0.08 -0.4 -0.55 -0.14 0.12 0.92 -0.17 -0.38 -0.32
0.66 0.38 -1.24 -0.77 -1.1 -1.63 -0.55 0.09 -0.83 -0.51 0.37 0.92 0.54 -0.56 -0.83 -2.03 -2.18 -0.91 -0.35 -2.46 -2.76 -0.75 2.11 1.29 0.69 0.42
-0.75 -1.32 -1.62 -0.6 -0.89 -0.94 -0.8 -1.8 -0.48 -0.29 -0.29 -0.28 -0.14 0.32 0.01 0.65 -0.24 -0.2 -0.14 -0.47 1.28 -0.47 0.92 0.76 1.36 0.61
-0.15 -1.12 -0.71 -0.4 -0.6 -0.65 0.34 0.56 0.02 -0.42 -0.73 -1.27 0.01 -0.31 0.03 -0.67 -0.81 0.08 -0.53 -0.28 0.83 -1.51 1.45 0.01 1.26 0.66
-0.94 -1.72 -2.99 0.03 -0.84 -1.76 -1.6 -1.06 -0.93 -2.62 -1.83 -0.2 -1.43 - - -1.6 - -2.28 -2.68 - 1.33 1.97 2.51 0.71 2.06 0.63
0.54 -0.46 -0.8 -0.69 -0.69 -0.78 0.12 0.14 -0.35 -0.33 -0.23 -0.4 1.05 -0.1 -0.19 -0.77 -0.52 0.26 -0.33 0.18 -0.86 -1.05 1.29 -0.36 0.99 0.58
0.8 0.58 0.53 0.36 -0.11 -0.59 -0.47 -0.12 -0.43 -0.43 -0.13 0.05 0.35 -0.99 -0.92 -0.61 -1.0 -0.82 -0.88 -0.26 -0.21 -0.04 1.19 0.05 0.66 0.29
0.57 -0.84 -1.6 -0.35 -0.62 -1.96 -0.94 -0.2 0.64 -0.05 0.46 -0.55 -2.58 -1.15 -1.77 -0.5 -0.95 -0.24 0.13 -3.32 0.64 0.88 1.29 1.39 1.04 0.35
-0.71 -0.32 -0.58 -0.22 -0.94 -1.87 -0.91 -0.38 -0.77 -0.51 0.02 -0.3 -0.39 -0.31 -0.62 -0.41 0.18 -0.02 -0.33 -0.63 1.11 -0.38 1.25 0.4 1.61 0.72
-0.03 -0.43 -1.03 -1.28 -1.99 -1.45 -0.16 0.06 0.86 0.53 0.68 0.58 -0.08 -0.36 -0.0 0.13 -0.4 -0.0 -0.58 -0.88 -0.52 -2.98 1.43 0.36 0.17 0.81
0.19 0.01 -0.25 -0.05 -0.15 -0.53 -0.07 -0.02 -0.23 -0.33 -0.22 -0.24 0.47 -0.28 -0.34 -0.16 -0.7 0.09 -0.42 -0.8 0.18 -0.02 0.38 -0.01 1.41 0.24
-1.98 - - 0.34 0.1 0.44 - -0.79 -1.69 -0.15 -0.14 -0.58 - -0.33 - - - - -0.34 - 2.13 -0.44 -0.65 - 3.05 1.62
-0.01 -0.16 -0.5 -0.45 -0.2 0.34 0.09 -0.29 -0.25 -0.3 -0.49 -0.13 -0.3 -1.04 -0.99 -1.16 -1.32 0.23 -0.74 -0.81 0.71 -0.5 0.66 1.47 1.09 0.64
1.16 0.33 -0.23 -0.08 -1.98 -3.03 -0.51 0.27 -1.64 -0.72 0.09 0.46 1.13 -2.27 -3.71 -3.22 -3.46 -1.43 -1.67 -1.13 0.18 -1.71 1.72 1.14 1.09 1.13
0.38 -0.21 -0.44 0.15 -0.81 -1.34 -0.62 -0.47 -1.79 -1.37 -1.78 -1.77 0.38 -0.98 -0.22 -0.14 -1.49 0.25 -0.58 -1.74 1.18 -0.13 1.61 0.06 1.78 0.69
0.91 0.2 0.05 0.04 -0.35 -0.45 -0.44 0.01 -0.6 -0.65 -0.52 -0.29 0.86 -0.82 -0.95 -0.73 -0.81 -0.2 -0.51 -0.83 -0.53 0.21 1.85 -0.95 0.58 0.24
0.89 0.5 -0.12 0.1 0.02 0.16 0.1 0.01 -0.4 -0.82 -0.71 -0.4 0.59 -0.45 -0.42 -0.82 -0.64 -0.32 -0.46 -1.13 -0.36 -0.16 1.22 0.31 0.57 -0.12
0.27 0.14 -0.13 0.36 0.43 0.17 -0.02 -0.12 -0.13 0.03 0.04 -0.01 -0.02 -0.54 -0.53 -0.28 -0.9 -0.16 -0.12 -0.34 0.15 -0.26 0.52 -0.0 0.45 0.12
0.44 -0.29 -0.61 -0.13 0.15 -0.42 0.2 -0.0 -0.02 0.07 0.1 -0.23 0.16 -0.08 -0.06 -0.01 -0.6 -0.06 -0.35 -0.55 0.22 0.04 0.77 -0.23 0.27 0.31
0.69 0.02 0.04 0.67 0.34 -0.06 -0.13 0.12 -0.45 -0.04 0.23 0.51 1.03 -1.63 -1.97 -1.35 -1.01 -1.16 -1.46 -1.36 -0.21 0.34 1.02 -0.47 0.47 0.33
-0.17 -1.29 -1.79 -0.33 -0.35 -0.44 -0.39 -0.43 -1.01 0.16 0.16 -0.47 -0.71 -0.12 -1.68 -1.69 -1.43 -1.11 -0.52 -2.68 0.35 -0.59 2.25 1.26 0.8 1.3
0.35 -0.82 -1.27 -1.11 -0.07 -0.48 -0.15 0.37 -0.34 -0.2 0.07 -0.79 -0.43 -2.85 -3.03 -3.94 -2.28 -0.84 -0.94 -0.78 1.04 -0.85 2.22 0.52 1.41 0.87
0.44 0.28 0.22 0.06 -0.31 -0.47 -0.43 -0.21 -0.38 -0.79 -0.6 -0.03 0.13 -1.4 -1.19 -0.93 -1.05 -0.69 -0.5 -0.48 0.35 0.49 1.67 0.39 0.71 0.41
0.67 -0.33 -0.43 -0.33 -0.61 -1.14 -0.59 -0.65 -0.75 -0.61 -0.22 0.2 0.55 -0.01 -0.41 -0.07 -0.92 -0.15 -0.16 -0.87 0.67 -0.06 1.41 0.63 0.5 0.27
0.82 0.14 -0.22 0.42 -0.04 -0.89 -0.16 -0.1 -0.38 -0.55 0.02 -0.08 0.7 -1.08 -0.86 -1.1 -1.33 -0.42 -0.33 -0.6 0.32 -0.19 0.96 0.26 0.98 0.31
-0.34 -1.03 -1.26 -0.88 -0.73 -0.71 -0.3 -0.1 -0.71 -0.46 -0.07 0.17 0.3 -1.68 -1.13 -1.21 -0.6 -0.68 -0.82 -1.43 1.02 -1.16 2.09 0.44 2.0 -0.61
0.75 0.83 0.14 -0.81 -1.52 -1.14 -0.4 0.05 -0.47 -0.42 -0.53 -0.55 0.44 -0.31 -0.21 -0.32 0.44 0.41 0.09 -0.22 -0.59 -0.89 1.21 -0.64 1.07 -0.44
0.03 -0.62 -0.88 -0.13 -0.89 -1.31 -1.12 -0.69 -1.72 -1.5 -1.53 -1.22 0.1 0.08 -1.31 -0.64 -1.58 -0.5 -1.19 -1.35 1.3 -1.53 0.58 -0.43 2.8 1.23
0.93 0.07 -0.15 -0.36 -0.95 -0.87 -0.02 0.44 -0.28 -0.14 0.83 -0.05 0.26 -1.57 -1.31 -1.54 -2.54 -1.72 -1.17 -1.86 0.68 -1.41 1.51 -0.61 1.59 0.6
-0.11 0.46 -0.05 0.29 0.12 0.13 -0.19 -0.27 -0.28 -0.49 -0.33 0.05 -0.8 -0.49 -1.08 -0.24 -1.1 -0.37 -0.47 -0.99 0.22 0.11 1.47 0.31 1.04 -0.17
1.12 -0.84 -1.45 0.11 -0.12 -1.07 -0.69 -0.95 -0.32 -1.02 -0.21 -0.41 -0.08 -0.64 -3.76 -1.57 - -0.41 -2.28 - 0.84 1.37 1.83 0.84 1.4 0.12
1.77 0.61 0.02 -0.72 -1.74 -1.61 -0.59 0.21 -1.12 -1.14 -0.68 -0.54 1.26 -1.98 -1.1 -1.93 -1.16 -0.24 -0.12 -0.4 0.58 -0.44 1.27 0.55 0.33 0.07
0.65 0.11 -0.33 -0.13 -0.71 -1.28 -0.74 -0.66 -1.17 -1.17 -0.7 -0.27 0.84 -0.69 -0.83 -0.69 -0.42 -0.67 -0.85 -1.53 0.54 -0.25 2.12 -0.09 1.26 0.28
1.09 -0.53 -1.98 0.31 0.08 -1.69 -0.66 0.01 0.25 -0.13 0.4 -0.24 0.08 -0.83 -1.09 -1.59 -1.08 -0.09 -1.13 -1.43 0.65 0.99 1.06 0.13 0.86 0.27
0.4 0.11 -0.28 -0.22 -0.38 -0.53 -0.05 0.07 0.01 0.15 0.3 0.54 0.48 -1.46 -1.27 -1.08 -1.06 -0.64 -1.11 -0.87 0.39 0.55 1.32 0.47 0.29 -0.05
0.89 0.53 0.21 0.1 -0.11 -0.21 -0.12 0.08 -0.22 -0.48 -0.24 -0.02 0.85 -0.8 -0.64 -0.84 -0.73 -0.18 -0.47 -0.73 0.35 -0.42 0.79 -0.28 0.55 -0.19
0.37 0.28 0.18 0.12 0.31 0.42 0.18 0.23 -0.6 -0.65 -0.55 -0.79 0.44 -0.53 -0.51 -0.54 -0.53 -0.23 -0.59 -0.43 0.03 -0.43 0.82 -0.72 1.19 0.05
0.25 0.31 -0.23 -0.17 -0.01 -0.65 -0.08 0.18 -0.12 0.23 0.29 0.3 0.06 -0.78 -1.0 -1.0 -0.0 0.04 -0.32 -1.24 0.6 -0.48 0.81 -0.66 0.87 0.34
0.48 -0.04 -0.26 0.23 -0.05 -0.02 0.29 0.14 -0.46 -0.15 -0.31 -0.73 -0.1 -0.64 -0.72 -0.42 -0.65 -0.55 -0.32 -0.37 -0.38 0.04 1.25 0.48 0.65 0.42
0.1 0.42 0.0 -0.27 -0.42 -0.22 -0.1 -0.02 0.18 0.07 0.12 0.08 -0.05 -0.29 -0.26 -0.46 0.03 0.1 0.11 0.04 -0.51 -0.51 0.46 -0.01 0.75 -0.15
-0.04 0.16 -0.38 -0.49 -0.83 -1.29 -0.63 0.03 0.03 0.18 0.24 0.14 -0.13 0.01 -0.16 0.19 -0.34 0.36 -0.14 -0.47 -0.14 -1.68 1.27 0.08 0.74 0.43
0.37 0.04 0.19 0.3 0.12 -0.21 -0.02 0.02 -0.44 -0.64 -0.57 -0.44 0.46 -0.08 -0.13 0.12 -0.3 0.09 -0.13 -0.44 -0.42 -0.51 0.98 -0.52 0.54 0.16
-1.14 -0.28 -0.2 -0.46 -0.79 -1.0 -0.63 -0.22 -0.17 -0.0 0.09 0.06 -1.03 -0.21 -0.16 -0.32 0.14 0.09 -0.12 -0.09 0.73 -0.99 0.78 0.77 1.32 0.47
-0.98 -0.44 -0.16 0.32 0.34 0.0 0.02 0.49 0.36 0.04 0.19 -0.2 -1.1 -0.54 -0.91 0.31 -1.33 0.14 -0.15 -0.73 -0.17 0.59 1.05 0.17 0.32 -0.27
0.35 0.08 0.06 0.34 0.2 -0.18 -0.04 0.19 -0.01 0.07 0.23 0.24 0.64 -0.59 -0.72 -0.5 -0.66 -0.54 -0.58 -0.41 0.0 0.06 0.74 -0.14 -0.26 0.1
1.19 0.43 0.21 -0.39 -0.89 -0.35 -0.27 -0.16 -1.04 -0.81 -0.71 -0.47 1.19 -0.02 -0.3 0.55 -0.75 -0.43 -0.17 -1.25 0.26 -1.08 0.84 -0.46 0.87 -0.33
0.55 0.16 -0.59 -1.0 -1.29 -1.77 -0.59 -0.51 -1.5 -1.31 -0.94 -0.77 0.64 -0.44 -0.49 0.44 -1.35 0.03 -0.7 -1.56 1.12 -0.76 1.57 -0.11 1.91 0.23
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-0.9 -0.31 -0.42 0.12 -1.88 -1.7 -1.75 0.28 -1.02 0.62 -0.34 0.47 -3.44 0.43 -0.0 -0.59 -1.37 -0.07 -0.15 -2.02 0.97 0.42 1.21 0.26 1.34 0.68
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0.31 -0.67 -1.06 -0.94 -0.91 -0.55 -0.63 -0.75 -0.68 -0.92 -0.76 -0.89 0.07 -0.45 0.6 -0.71 -0.67 -0.08 -0.32 -0.73 0.7 -0.51 1.7 1.38 0.83 0.64
1.03 0.59 0.21 -0.33 -1.3 -1.74 -0.69 -0.08 -0.3 -0.22 0.11 0.37 1.03 -0.6 -0.69 -0.33 0.0 -0.25 -0.65 -0.5 -0.24 -1.14 0.95 -0.39 0.95 -0.08
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0.67 0.59 0.49 0.53 0.08 -0.37 -0.59 -0.05 -1.05 -1.13 -0.96 -0.66 0.6 -1.11 -0.57 -0.65 -0.46 -0.4 0.07 -0.55 0.38 -0.47 0.95 -0.36 0.87 0.52
0.63 -0.12 -0.31 -0.34 -1.04 -1.13 -0.59 -0.42 -0.86 -0.85 -0.18 0.13 0.62 -0.49 -1.22 -1.01 -0.4 -0.55 -0.66 -0.78 -0.9 0.52 2.18 0.01 0.84 0.46
0.84 -0.03 -0.94 -1.09 -1.02 -1.38 -1.06 -0.65 -1.31 -1.18 -0.86 -0.82 0.98 -1.14 -0.24 -0.16 -0.61 0.15 0.19 -0.9 0.81 -1.31 1.34 0.49 1.82 0.05
1.06 0.85 0.26 0.23 -0.27 -0.25 -0.25 -0.08 -0.47 -0.57 -0.39 -0.12 1.03 -1.05 -0.93 -0.75 -0.91 -0.01 -0.04 -0.55 0.52 -0.71 1.06 -0.11 -0.57 -0.63
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0.46 0.04 -0.03 0.01 -0.26 -0.69 -0.34 -0.05 -0.4 -0.24 -0.08 -0.23 0.82 -0.2 -0.26 -0.05 -0.26 -0.04 -0.14 -0.56 0.35 -0.81 0.9 -0.0 0.69 -0.24
0.4 -0.54 -1.23 -1.03 -1.05 -1.37 -0.5 -0.2 -1.18 -1.09 -0.34 0.3 0.57 -0.86 -1.06 -1.13 -1.15 -0.39 -0.66 -1.09 1.57 -1.45 1.6 0.91 1.61 0.17
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0.77 0.79 0.03 0.02 -0.33 -0.56 -0.37 -0.14 -0.94 -0.69 -0.33 -0.01 0.76 -0.83 -0.63 -0.59 -0.32 -0.61 -0.02 -0.81 0.51 -0.27 0.12 0.19 1.12 0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.