Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.05 0.0 0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.13 0.0 0.12 0.04 0.1 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0
7.78 66.03 65.94 57.2 89.28 80.52 110.85 91.06 62.4 47.64 51.73 35.11 20.95 1.13 33.27 12.7 211.75 1.47 2.93 1.58 53.72 60.6 7.05 80.02 102.44 63.81
10.58 74.37 77.51 66.18 100.61 108.31 134.31 101.52 89.32 70.64 60.68 46.01 27.44 0.98 37.48 14.33 225.02 1.6 5.12 1.07 72.72 92.68 7.74 96.91 142.37 85.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.06 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.1 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.91 1.16 1.23 0.9 0.91 0.76 0.3 0.55 1.26 1.38 0.72 0.09 1.02 0.21 0.06 4.5 1.17 0.28 2.1 0.13 0.21 0.07 1.01 0.26 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.16 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 1.03 0.12 0.67 0.03 0.16 0.0 0.43 0.02 0.03 0.1 0.32 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.39 0.33 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.09 0.0 0.34 0.14 0.43 0.0 0.0 0.11 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.02 0.0 0.07 0.07 0.0 0.03 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.21 0.0 0.06 0.17 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.07 0.48 0.21 0.0 0.19 0.0 0.19 0.22 0.0 0.0 0.1 0.06 0.08
0.64 0.35 0.09 0.48 0.0 0.27 0.81 0.38 1.01 0.26 0.08 0.09 0.45 0.42 0.63 0.35 0.55 0.08 0.72 0.64 0.14 0.0 0.06 0.3 1.26 0.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.95 0.35 0.34 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.05 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.09 0.15 0.36 0.04 0.08 0.09 0.16 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.13 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.13 0.0 0.08 0.03 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0
0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.02 0.0 0.03 0.04 0.03
0.04 0.0 0.04 0.09 0.08 0.26 0.1 0.0 0.07 0.06 0.04 0.07 0.0 0.0 0.06 0.04 0.78 0.02 0.03 0.05 0.29 0.05 0.0 0.09 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.07 0.09 0.06 0.15 0.02 0.0 0.0 0.14 0.18 0.28 0.2 0.0 0.17 0.0 0.01 0.0 0.0 0.1 0.01 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.02 0.09 0.02 0.0 0.03 0.04 0.1 0.01 0.03
0.0 0.03 0.12 0.27 0.99 2.55 1.62 0.62 1.14 0.19 0.04 0.12 0.0 0.33 0.33 0.24 0.47 0.25 0.44 0.45 0.03 0.03 0.76 0.36 0.06 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.66 0.96 0.47 0.09 0.22 0.39 0.36 0.46 2.14 2.48 1.66 0.83 0.23 0.04 0.12 4.5 0.49 0.42 0.39 0.52 0.05 0.08 1.22 0.18 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.43 0.0 0.0 0.0 0.08 0.16 0.06 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.36 0.13 0.31 0.09 0.56 0.35 0.24 0.38 0.18 0.0 0.34 0.18
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.08 0.01 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.16 0.19 0.09 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)