Heatmap: Cluster_150 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.34 0.21 0.24 0.52 0.55 0.44 0.67 0.75 0.84 0.85 0.79 0.59 0.56 0.55 0.4 0.63 0.32 0.55 0.25 0.3 0.2 0.6 1.0 0.39 0.62 0.54
0.39 0.38 0.33 0.41 0.56 0.46 0.64 0.59 0.79 0.92 1.0 0.85 0.45 0.43 0.27 0.31 0.29 0.47 0.34 0.32 0.5 0.54 0.68 0.61 0.65 0.52
0.59 0.37 0.41 0.57 0.52 0.38 0.5 0.71 0.91 0.97 1.0 0.93 0.62 0.34 0.31 0.43 0.29 0.35 0.22 0.25 0.51 0.78 0.75 0.84 0.81 0.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.64 0.47 0.0 0.0
0.79 0.71 0.63 0.71 0.71 0.82 0.75 0.77 0.85 0.82 0.87 0.91 0.74 0.68 0.55 0.53 0.59 0.68 0.67 0.51 1.0 0.48 0.78 0.82 0.49 0.59
0.21 0.16 0.09 0.25 0.34 0.34 0.47 0.49 0.7 0.76 0.9 0.59 0.24 0.18 0.2 0.22 0.12 0.33 0.3 0.16 0.92 0.34 0.98 1.0 0.41 0.25
0.53 0.15 0.13 0.24 0.44 0.43 0.6 0.63 0.64 0.71 0.79 0.7 0.5 0.1 0.12 0.1 0.15 0.24 0.23 0.19 0.15 0.36 1.0 0.48 0.59 0.34
0.74 0.39 0.24 0.4 0.42 0.39 0.56 0.65 0.65 0.81 1.0 0.81 0.8 0.06 0.05 0.03 0.18 0.23 0.15 0.2 0.18 0.11 0.83 0.5 0.64 0.49
0.1 0.37 0.39 0.57 0.61 0.54 0.74 0.64 0.89 0.85 1.0 0.89 0.16 0.8 0.36 0.73 0.44 0.4 0.28 0.3 0.36 0.75 0.78 0.52 0.56 0.46
0.3 0.26 0.17 0.19 0.31 0.57 0.9 0.77 0.82 1.0 0.94 0.54 0.29 0.08 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.05 0.14 0.45 0.82 0.47 0.28 0.17
0.21 0.28 0.29 0.58 0.66 0.46 0.81 0.78 0.96 1.0 0.92 0.91 0.35 0.45 0.15 0.34 0.19 0.73 0.25 0.2 0.24 0.32 0.71 0.26 0.58 0.51
0.4 0.24 0.16 0.31 0.29 0.41 0.42 0.51 0.76 0.8 0.77 0.63 0.47 0.16 0.12 0.12 0.03 0.17 0.09 0.09 0.02 0.54 1.0 0.42 0.19 0.33
0.35 0.26 0.29 0.44 0.58 0.54 0.58 0.67 0.85 0.81 0.92 0.75 0.46 0.39 0.18 0.28 0.25 0.22 0.25 0.15 0.67 0.75 1.0 0.71 0.79 0.49
0.61 0.41 0.49 0.78 0.8 0.67 0.77 0.93 0.92 0.88 1.0 0.91 0.75 0.65 0.48 0.62 0.45 0.64 0.42 0.35 0.32 0.63 0.83 0.59 0.71 0.61
0.74 0.49 0.51 0.83 0.68 0.58 0.63 0.69 0.78 0.84 0.88 0.93 0.91 0.57 0.48 0.56 0.54 0.66 0.48 0.27 0.14 1.0 0.94 0.36 0.63 0.71
0.35 0.24 0.26 0.67 0.67 0.48 0.68 0.78 0.88 0.98 1.0 0.96 0.53 0.46 0.21 0.38 0.2 0.42 0.21 0.16 0.28 0.41 0.88 0.59 0.71 0.57
0.78 0.75 0.72 0.7 0.76 0.89 0.74 0.74 0.83 0.83 0.85 0.82 0.77 0.68 0.61 0.51 0.51 0.48 0.54 0.42 1.0 0.48 0.59 0.62 0.44 0.54
0.2 0.26 0.34 0.58 0.8 0.81 0.71 0.56 0.87 1.0 1.0 0.99 0.35 0.53 0.21 0.37 0.2 0.2 0.18 0.19 0.09 0.99 0.85 0.49 0.38 0.68
0.39 0.62 0.79 0.76 0.63 0.47 0.6 0.58 0.55 0.52 0.47 0.45 0.42 0.54 0.6 0.62 0.44 0.57 0.42 0.4 1.0 0.39 0.5 0.31 0.35 0.34
0.39 0.57 0.71 0.69 0.63 0.66 0.53 0.52 0.55 0.46 0.46 0.44 0.41 0.41 0.51 0.47 0.31 0.41 0.39 0.31 1.0 0.35 0.45 0.27 0.34 0.35
0.06 0.09 0.16 0.36 0.14 0.05 0.07 0.02 0.13 0.32 1.0 0.93 0.11 0.04 0.0 0.06 0.27 0.0 0.01 0.01 0.85 0.02 0.57 0.08 0.23 0.18
0.05 0.0 0.0 0.2 0.58 0.13 0.42 0.41 0.88 0.68 0.97 0.63 0.0 0.04 0.0 0.06 0.06 0.35 0.1 0.05 0.17 0.63 1.0 0.4 0.84 0.45
0.12 0.3 0.51 0.69 0.86 0.75 0.73 0.77 0.98 1.0 0.97 0.84 0.17 0.51 0.34 0.49 0.25 0.34 0.28 0.33 0.22 0.6 0.99 0.64 0.44 0.69
0.46 0.48 0.47 0.53 0.49 0.52 0.74 0.82 0.92 0.95 0.99 1.0 0.51 0.79 0.48 0.78 0.45 0.61 0.42 0.39 0.36 0.76 0.74 0.7 0.81 0.63
0.19 0.3 0.27 0.36 0.44 0.54 0.87 0.81 1.0 0.82 0.58 0.47 0.18 0.19 0.13 0.24 0.25 0.2 0.2 0.21 0.31 0.12 0.51 0.22 0.25 0.2
0.86 0.13 0.1 0.13 0.45 0.3 0.55 0.49 0.66 0.64 0.63 0.58 0.78 0.07 0.03 0.17 0.1 0.22 0.17 0.16 0.05 0.06 1.0 0.46 0.41 0.4
0.63 0.3 0.23 0.49 0.59 0.29 0.27 0.29 0.3 0.64 0.87 0.98 0.56 0.04 0.04 0.03 0.08 0.08 0.07 0.13 0.05 0.48 0.97 1.0 0.29 0.36
0.08 0.15 0.33 0.49 0.46 0.6 0.89 0.78 1.0 0.81 0.61 0.5 0.08 0.38 0.26 0.39 0.21 0.48 0.27 0.27 0.31 0.06 0.73 0.28 0.23 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0
0.13 0.06 0.09 0.23 0.25 0.16 0.26 0.29 0.41 0.41 0.6 0.44 0.12 0.12 0.14 0.11 0.1 0.2 0.15 0.14 1.0 0.32 0.78 0.49 0.35 0.27
0.25 0.09 0.15 0.26 0.31 0.31 0.39 0.46 0.47 0.59 0.79 1.0 0.46 0.22 0.25 0.29 0.17 0.39 0.26 0.1 0.07 0.21 0.68 0.38 0.33 0.48
0.61 0.21 0.16 0.35 0.43 0.25 0.34 0.36 0.37 0.59 1.0 0.88 0.87 0.21 0.08 0.12 0.08 0.11 0.01 0.02 0.22 0.13 0.93 0.73 0.6 0.31
0.68 0.16 0.21 0.36 0.5 0.18 0.32 0.36 0.4 0.57 0.95 1.0 0.72 0.08 0.07 0.0 0.0 0.12 0.03 0.0 0.09 0.05 0.41 0.82 0.82 0.27
0.37 0.12 0.16 0.25 0.32 0.34 0.32 0.3 0.46 0.66 0.85 0.73 0.47 0.19 0.09 0.62 0.1 0.04 0.03 0.1 1.0 0.18 0.98 0.31 0.08 0.23
0.29 0.22 0.37 0.54 0.48 0.8 0.8 0.53 0.92 0.93 1.0 0.73 0.4 0.45 0.27 0.19 0.19 0.28 0.34 0.18 0.42 0.54 0.55 0.26 0.36 0.41
0.31 0.38 0.25 0.42 0.4 0.28 0.31 0.42 0.44 0.65 0.88 0.7 0.42 0.13 0.33 0.48 0.12 0.57 0.29 0.19 1.0 0.09 0.73 0.15 0.09 0.14
0.4 0.32 0.34 0.34 0.39 0.46 0.55 0.64 0.74 0.9 1.0 0.87 0.56 0.25 0.14 0.25 0.36 0.26 0.16 0.17 0.7 0.04 0.78 0.64 0.51 0.42
0.03 0.03 0.1 0.28 0.46 0.46 0.67 0.67 0.86 0.93 1.0 0.76 0.08 0.32 0.17 0.27 0.27 0.35 0.29 0.44 0.42 0.8 0.74 0.55 0.75 0.46
0.15 0.08 0.08 0.16 0.22 0.22 0.48 0.48 0.82 0.75 1.0 0.54 0.26 0.19 0.12 0.17 0.06 0.12 0.05 0.12 0.88 0.25 0.91 0.73 0.62 0.4
0.52 0.26 0.21 0.31 0.27 0.28 0.55 0.58 0.56 0.86 1.0 0.87 0.66 0.12 0.05 0.09 0.08 0.11 0.09 0.09 0.26 0.59 0.84 0.62 0.46 0.36
0.65 0.17 0.07 0.16 0.3 0.5 0.72 0.84 0.79 0.82 0.78 0.53 0.65 0.06 0.1 0.05 0.11 0.22 0.24 0.09 0.13 0.1 1.0 0.39 0.36 0.15
0.17 0.06 0.14 0.18 0.38 0.48 0.44 0.37 0.67 0.75 0.81 1.0 0.33 0.14 0.18 0.12 0.21 0.29 0.31 0.22 0.43 0.06 0.9 0.55 0.37 0.21
0.27 0.24 0.17 0.26 0.68 0.45 0.43 0.49 0.83 0.94 1.0 0.56 0.15 0.17 0.12 0.21 0.15 0.52 0.36 0.19 0.11 0.85 0.64 0.34 0.55 0.46
0.52 0.48 0.51 0.65 0.79 0.6 0.97 1.0 0.97 0.99 0.98 0.94 0.75 0.67 0.47 0.72 0.39 0.62 0.49 0.32 0.29 0.66 0.93 0.73 0.88 0.57
0.56 0.33 0.36 0.58 0.49 0.38 0.64 0.7 0.85 0.76 0.99 1.0 0.63 0.57 0.32 0.56 0.36 0.67 0.4 0.3 0.25 0.88 0.86 0.43 0.82 0.54
0.45 0.31 0.34 0.58 0.54 0.51 0.8 0.84 0.77 0.73 0.84 1.0 0.6 0.57 0.38 0.65 0.35 0.63 0.42 0.33 0.25 0.3 0.9 0.51 0.52 0.53
0.61 0.25 0.17 0.17 0.29 0.37 0.68 0.53 0.72 0.74 0.92 0.55 0.5 0.06 0.14 0.06 0.17 0.37 0.11 0.14 0.05 0.23 1.0 0.42 0.73 0.37
0.41 0.33 0.33 0.59 0.65 0.52 0.59 0.61 0.83 1.0 0.93 0.79 0.49 0.28 0.33 0.43 0.31 0.51 0.49 0.39 0.31 0.69 0.64 0.64 0.55 0.37
0.09 0.24 0.34 0.59 0.53 0.48 0.59 0.78 1.0 0.94 0.91 0.78 0.15 0.33 0.17 0.32 0.17 0.35 0.17 0.2 0.33 0.31 0.81 0.44 0.5 0.51
0.53 0.29 0.35 0.49 0.6 0.41 0.48 0.48 0.75 0.76 0.9 1.0 0.69 0.47 0.41 0.34 0.25 0.4 0.37 0.22 0.18 0.93 0.79 0.65 0.6 0.56
0.16 0.16 0.32 0.53 0.6 0.63 0.78 0.68 0.97 0.95 1.0 0.86 0.3 0.34 0.23 0.28 0.19 0.12 0.13 0.09 0.52 0.5 0.77 0.36 0.34 0.32
0.29 0.11 0.14 0.21 0.36 0.35 0.33 0.29 0.46 0.83 0.88 1.0 0.55 0.46 0.21 0.24 0.09 0.11 0.13 0.13 0.09 0.62 0.78 0.74 0.47 0.63
0.25 0.29 0.26 0.64 0.65 0.41 0.62 0.7 0.8 0.88 1.0 0.72 0.22 0.4 0.19 0.31 0.2 0.32 0.25 0.18 0.53 0.45 0.88 0.62 0.83 0.53
0.41 0.17 0.24 0.33 0.54 0.39 0.35 0.46 0.44 0.38 0.63 0.31 0.33 0.09 0.04 0.1 0.05 0.16 0.14 0.05 1.0 0.37 0.97 0.43 0.65 0.32
0.65 0.38 0.4 0.57 0.73 0.84 0.78 0.7 0.9 0.89 0.96 1.0 0.79 0.17 0.16 0.38 0.2 0.28 0.14 0.16 0.51 0.45 0.96 0.97 0.7 0.59
0.23 0.21 0.11 0.52 0.69 0.49 0.54 0.68 0.57 1.0 0.89 0.76 0.38 0.14 0.16 0.18 0.13 0.36 0.17 0.1 0.19 0.56 0.42 0.8 0.56 0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)