Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.19 0.3 0.23 0.23 0.22 0.25 0.38 0.44 0.45 0.4 0.31 0.26 0.16 0.76 1.0 0.68 0.43 0.44 0.41 0.35 0.12 0.51 0.62 0.42 0.95 0.61
0.26 0.24 0.26 0.45 0.44 0.36 0.32 0.32 0.23 0.3 0.35 0.26 0.22 0.43 0.18 0.31 0.17 0.25 0.19 0.31 0.02 0.59 0.15 0.14 1.0 0.84
0.58 0.39 0.39 0.47 0.44 0.38 0.45 0.41 0.41 0.54 0.63 0.71 0.7 1.0 0.64 0.75 0.45 0.45 0.47 0.34 0.25 0.66 0.41 0.51 0.75 0.6
0.35 0.12 0.13 0.37 0.25 0.24 0.41 0.36 0.26 0.18 0.15 0.13 0.18 1.0 0.13 0.64 0.13 0.23 0.27 0.2 0.13 0.16 0.34 0.36 0.41 0.26
0.15 0.37 0.5 0.42 0.45 0.55 0.67 0.63 0.67 0.55 0.47 0.36 0.18 1.0 0.6 0.32 0.49 0.77 0.77 0.62 0.03 0.3 0.46 0.38 0.6 0.53
0.68 0.46 0.54 0.61 0.46 0.3 0.49 0.53 0.33 0.45 0.49 0.5 0.69 1.0 0.58 0.96 0.65 0.65 0.49 0.55 0.14 0.59 0.39 0.53 0.82 0.8
0.59 0.38 0.37 0.43 0.44 0.35 0.5 0.51 0.49 0.57 0.54 0.55 0.71 0.99 0.67 1.0 0.53 0.6 0.51 0.47 0.27 0.86 0.55 0.6 0.68 0.66
0.33 0.28 0.25 0.37 0.39 0.27 0.37 0.36 0.32 0.48 0.51 0.44 0.42 1.0 0.42 0.55 0.31 0.4 0.4 0.21 0.59 0.67 0.58 0.9 0.63 0.58
0.42 0.28 0.38 0.6 0.5 0.3 0.35 0.35 0.3 0.31 0.35 0.35 0.38 0.97 0.73 0.82 0.4 0.52 0.42 0.22 0.11 1.0 0.37 0.44 0.91 0.74
0.24 0.08 0.12 0.32 0.42 0.38 0.45 0.54 0.51 0.48 0.54 0.49 0.23 0.86 0.43 0.44 0.22 0.37 0.32 0.16 0.26 0.65 0.25 0.67 1.0 0.89
0.64 0.42 0.38 0.42 0.35 0.27 0.43 0.39 0.3 0.31 0.34 0.35 0.69 0.71 0.46 0.62 0.41 0.41 0.34 0.27 0.04 0.26 0.25 0.35 1.0 0.68
0.15 0.31 0.27 0.33 0.48 0.61 0.76 0.75 0.68 0.58 0.48 0.29 0.19 1.0 0.63 0.59 0.6 0.96 0.88 0.67 0.15 0.15 0.35 0.33 0.7 0.45
0.42 0.33 0.33 0.58 0.54 0.32 0.35 0.35 0.25 0.36 0.41 0.38 0.36 0.42 0.2 0.29 0.2 0.2 0.22 0.27 0.01 0.74 0.1 0.14 1.0 0.76
0.13 0.12 0.13 0.22 0.29 0.22 0.21 0.23 0.18 0.25 0.28 0.24 0.16 1.0 0.08 0.42 0.11 0.35 0.18 0.13 0.13 0.55 0.35 0.26 0.56 0.47
0.21 0.19 0.23 0.34 0.32 0.25 0.39 0.32 0.36 0.34 0.39 0.29 0.16 0.99 0.59 1.0 0.33 0.52 0.39 0.32 0.04 0.5 0.26 0.38 0.75 0.81
0.59 0.62 0.76 0.82 0.73 0.64 0.8 0.77 0.57 0.47 0.48 0.5 0.65 0.94 0.97 1.0 0.69 0.64 0.57 0.61 0.04 0.64 0.29 0.31 0.86 0.65
0.21 0.12 0.14 0.21 0.15 0.13 0.18 0.19 0.15 0.17 0.23 0.16 0.18 0.59 0.2 0.39 0.11 0.2 0.09 0.1 0.02 0.03 0.21 0.08 1.0 0.41
0.27 0.24 0.32 0.42 0.31 0.25 0.48 0.53 0.55 0.41 0.35 0.26 0.27 1.0 0.5 0.9 0.44 0.54 0.41 0.39 0.19 0.45 0.78 0.57 0.87 0.76
0.19 0.4 0.54 0.64 0.63 0.5 0.62 0.62 0.45 0.45 0.41 0.38 0.15 0.89 1.0 0.85 0.38 0.53 0.42 0.41 0.03 0.73 0.48 0.27 0.94 0.83
0.61 0.32 0.17 0.17 0.12 0.15 0.3 0.39 0.17 0.22 0.26 0.27 0.61 0.74 0.29 0.56 0.2 0.22 0.12 0.07 0.03 0.22 0.06 0.13 1.0 0.27
0.25 0.26 0.31 0.47 0.5 0.41 0.54 0.53 0.58 0.65 0.71 0.8 0.4 1.0 0.52 0.83 0.48 0.36 0.39 0.28 0.27 0.8 0.66 0.66 0.83 0.69
0.32 0.22 0.16 0.2 0.13 0.08 0.17 0.22 0.18 0.26 0.32 0.28 0.36 1.0 0.31 0.43 0.3 0.24 0.21 0.19 0.13 0.29 0.46 0.3 0.42 0.28
0.64 0.48 0.42 0.46 0.53 0.55 0.69 0.71 0.57 0.6 0.62 0.55 0.63 1.0 0.54 0.88 0.64 0.54 0.43 0.44 0.1 0.56 0.54 0.6 0.9 0.63
0.3 0.26 0.33 0.39 0.34 0.26 0.38 0.36 0.32 0.4 0.39 0.39 0.28 1.0 0.54 0.88 0.47 0.54 0.44 0.39 0.19 0.65 0.57 0.58 0.65 0.6
0.71 0.43 0.39 0.42 0.39 0.31 0.47 0.55 0.51 0.62 0.63 0.64 0.78 1.0 0.49 0.64 0.43 0.5 0.36 0.4 0.15 0.37 0.66 0.37 0.7 0.6
0.55 0.45 0.45 0.62 0.58 0.51 0.54 0.57 0.51 0.46 0.48 0.49 0.6 0.61 0.5 0.61 0.43 0.54 0.44 0.26 0.05 0.42 0.39 0.38 1.0 0.55
0.47 0.39 0.33 0.35 0.25 0.17 0.17 0.21 0.16 0.11 0.14 0.19 0.43 0.63 0.47 0.41 0.11 0.22 0.25 0.14 0.03 0.45 0.06 0.07 1.0 0.53
0.38 0.43 0.5 0.86 0.9 0.71 0.74 0.65 0.56 0.49 0.54 0.43 0.35 0.92 0.54 0.87 0.69 0.62 0.52 0.47 0.11 0.62 0.34 0.45 1.0 0.57
0.32 0.33 0.33 0.59 0.62 0.56 0.42 0.39 0.45 0.51 0.55 0.47 0.3 0.45 0.31 0.41 0.25 0.3 0.32 0.42 0.0 0.83 0.13 0.2 1.0 0.77
0.25 0.12 0.08 0.16 0.12 0.1 0.37 0.32 0.27 0.37 0.41 0.31 0.26 0.86 0.12 0.22 0.19 0.17 0.06 0.09 0.09 0.17 0.49 0.53 1.0 0.44
0.06 0.06 0.1 0.2 0.32 0.28 0.24 0.2 0.27 0.22 0.21 0.21 0.05 1.0 0.32 0.9 0.19 0.21 0.16 0.12 0.08 0.32 0.53 0.37 0.75 0.5
0.22 0.21 0.23 0.45 0.6 0.54 0.84 0.53 0.62 0.43 0.41 0.27 0.17 0.94 0.71 0.73 0.37 0.28 0.22 0.2 0.06 0.81 0.48 0.49 1.0 0.53
0.51 0.47 0.53 0.58 0.47 0.48 0.65 0.61 0.64 0.61 0.59 0.51 0.43 1.0 0.92 0.95 0.75 0.69 0.71 0.62 0.19 0.59 0.71 0.35 0.72 0.72
0.2 0.2 0.33 0.32 0.31 0.46 0.56 0.55 0.66 0.46 0.53 0.36 0.17 0.99 0.86 0.61 0.51 0.51 0.38 0.37 0.19 0.54 0.61 0.71 0.84 1.0
0.33 0.18 0.18 0.18 0.16 0.24 0.33 0.41 0.28 0.32 0.28 0.22 0.41 0.75 0.51 0.53 0.17 0.44 0.24 0.24 0.08 0.47 0.23 0.19 1.0 0.59
0.59 0.35 0.41 0.33 0.54 0.36 0.37 0.39 0.39 0.44 0.42 0.55 0.59 1.0 0.62 0.97 0.65 0.54 0.46 0.4 0.5 0.86 0.62 0.77 0.65 0.74
0.29 0.27 0.28 0.35 0.31 0.31 0.4 0.44 0.3 0.33 0.34 0.29 0.39 0.86 0.34 0.82 0.35 0.34 0.27 0.21 0.05 0.18 0.22 0.18 1.0 0.39
0.33 0.26 0.41 0.54 0.48 0.41 0.68 0.6 0.62 0.53 0.57 0.58 0.3 0.93 0.47 0.86 0.42 0.39 0.36 0.32 0.11 0.75 0.61 0.93 1.0 0.95
0.53 0.44 0.45 0.62 0.5 0.34 0.52 0.67 0.56 0.5 0.75 0.64 0.57 0.58 0.45 0.67 0.53 0.58 0.4 0.31 0.22 0.55 0.6 0.59 1.0 0.59
0.25 0.27 0.4 0.52 0.58 0.5 0.67 0.58 0.5 0.49 0.57 0.52 0.31 0.92 0.55 1.0 0.5 0.56 0.41 0.35 0.13 0.64 0.51 0.47 0.77 0.59
0.43 0.31 0.36 0.39 0.31 0.26 0.35 0.36 0.4 0.25 0.25 0.25 0.45 0.69 0.52 0.57 0.41 0.37 0.31 0.26 0.02 0.27 0.21 0.18 1.0 0.49
0.19 0.36 0.43 0.43 0.46 0.34 0.46 0.45 0.48 0.49 0.44 0.46 0.18 1.0 0.57 0.9 0.52 0.54 0.56 0.39 0.09 0.57 0.38 0.41 0.64 0.76
0.42 0.35 0.3 0.39 0.35 0.26 0.36 0.37 0.36 0.51 0.64 0.6 0.49 0.91 0.42 1.0 0.36 0.36 0.31 0.21 0.19 0.93 0.78 0.82 0.85 0.73
0.41 0.34 0.36 0.38 0.29 0.31 0.53 0.64 0.62 0.72 0.71 0.67 0.5 1.0 0.36 0.68 0.48 0.5 0.4 0.43 0.14 0.35 0.61 0.45 0.74 0.59
0.23 0.4 0.58 0.7 0.76 0.58 0.69 0.62 0.49 0.49 0.41 0.34 0.23 0.86 0.62 0.81 0.56 0.58 0.48 0.51 0.03 1.0 0.31 0.29 0.95 0.62
0.12 0.19 0.24 0.44 0.43 0.27 0.31 0.33 0.29 0.29 0.35 0.29 0.1 1.0 0.59 0.61 0.29 0.3 0.25 0.17 0.1 0.61 0.28 0.28 0.92 0.68
0.35 0.16 0.18 0.21 0.28 0.44 0.61 0.51 0.36 0.33 0.25 0.16 0.31 1.0 0.54 0.76 0.28 0.24 0.2 0.22 0.01 0.22 0.27 0.16 0.69 0.47
0.41 0.59 0.68 0.7 0.69 0.47 0.77 0.85 0.86 0.8 0.77 0.78 0.42 1.0 0.4 0.71 0.57 0.66 0.61 0.5 0.12 0.45 0.73 0.47 0.87 0.88
0.56 0.36 0.35 0.49 0.46 0.37 0.54 0.6 0.47 0.51 0.57 0.48 0.55 0.73 0.33 0.7 0.36 0.31 0.33 0.28 0.03 0.39 0.26 0.23 1.0 0.46
0.79 0.54 0.55 0.56 0.45 0.37 0.66 0.75 0.69 0.73 0.76 0.73 0.92 1.0 0.62 0.81 0.54 0.67 0.48 0.49 0.37 0.63 0.53 0.6 0.73 0.77
0.42 0.14 0.1 0.13 0.09 0.09 0.17 0.25 0.26 0.3 0.4 0.28 0.4 1.0 0.44 0.19 0.14 0.2 0.21 0.11 0.16 0.47 0.63 0.53 0.54 0.39
0.33 0.2 0.22 0.24 0.3 0.34 0.48 0.54 0.44 0.38 0.43 0.25 0.3 1.0 0.46 0.64 0.22 0.29 0.24 0.29 0.03 0.34 0.46 0.37 0.62 0.55
0.31 0.32 0.29 0.54 0.57 0.44 0.51 0.41 0.48 0.49 0.63 0.59 0.27 0.51 0.33 0.72 0.32 0.27 0.24 0.41 0.0 0.67 0.12 0.13 1.0 0.81
0.81 0.54 0.53 0.55 0.52 0.4 0.59 0.68 0.66 0.76 0.86 0.88 1.0 0.95 0.51 0.9 0.48 0.65 0.43 0.42 0.32 0.7 0.95 0.59 0.8 0.62
0.3 0.41 0.42 0.42 0.53 0.68 0.74 0.62 0.64 0.54 0.4 0.28 0.26 1.0 0.61 0.66 0.56 0.6 0.44 0.5 0.02 0.39 0.35 0.23 0.72 0.49
0.03 0.03 0.09 0.11 0.16 0.22 0.42 0.46 0.2 0.22 0.2 0.16 0.12 1.0 0.53 0.65 0.43 0.35 0.23 0.19 0.01 0.48 0.2 0.08 0.81 0.69
0.33 0.24 0.25 0.49 0.31 0.23 0.36 0.5 0.38 0.44 0.54 0.52 0.41 0.54 0.35 0.38 0.3 0.36 0.28 0.36 0.2 0.81 0.25 0.61 1.0 0.69
0.49 0.43 0.34 0.3 0.23 0.16 0.18 0.24 0.19 0.26 0.33 0.37 0.43 0.53 0.46 0.56 0.43 0.3 0.35 0.29 0.16 0.48 0.19 0.31 1.0 0.48
0.46 0.24 0.26 0.17 0.26 0.33 0.41 0.48 0.45 0.33 0.51 0.45 0.46 1.0 0.34 0.44 0.26 0.3 0.25 0.1 0.06 0.13 0.43 0.2 0.65 0.38
0.07 0.21 0.3 0.45 0.52 0.78 0.58 0.43 0.28 0.25 0.21 0.19 0.09 1.0 0.25 0.92 0.28 0.5 0.27 0.4 0.34 0.29 0.91 0.78 0.78 0.68
0.04 0.02 0.03 0.07 0.21 0.47 0.73 0.47 0.64 0.39 0.22 0.12 0.05 1.0 0.63 0.87 0.54 0.83 0.38 0.41 0.0 0.1 0.05 0.13 0.6 0.47
0.61 0.38 0.43 0.54 0.56 0.67 0.97 0.86 0.93 0.73 0.62 0.57 0.53 0.99 0.75 1.0 0.71 0.71 0.6 0.54 0.22 0.54 0.76 0.54 0.8 0.69
0.08 0.15 0.27 0.33 0.25 0.25 0.31 0.37 0.43 0.45 0.52 0.4 0.11 0.83 0.42 0.74 0.52 0.45 0.43 0.35 0.07 0.49 1.0 0.74 0.99 0.69
0.2 0.3 0.36 0.51 0.47 0.49 0.47 0.4 0.37 0.34 0.3 0.25 0.21 0.42 0.2 0.38 0.19 0.4 0.21 0.27 0.01 0.8 0.26 0.17 1.0 0.7
0.23 0.25 0.12 0.18 0.24 0.46 0.49 0.35 0.3 0.11 0.07 0.07 0.24 0.62 1.0 0.78 0.36 0.25 0.35 0.32 0.05 0.32 0.53 0.09 0.82 0.43
0.28 0.2 0.17 0.19 0.24 0.35 0.41 0.35 0.27 0.17 0.14 0.11 0.28 0.64 1.0 0.7 0.47 0.44 0.4 0.33 0.05 0.33 0.3 0.17 0.74 0.4
0.31 0.31 0.28 0.4 0.36 0.3 0.29 0.41 0.36 0.5 0.52 0.46 0.42 1.0 0.52 0.61 0.36 0.54 0.48 0.29 0.53 0.68 0.56 0.85 0.61 0.63
0.62 0.38 0.42 0.53 0.55 0.68 0.61 0.61 0.4 0.46 0.49 0.48 0.67 1.0 0.37 0.87 0.32 0.71 0.44 0.47 0.17 0.55 0.55 0.38 0.73 0.79
0.1 0.12 0.17 0.2 0.19 0.16 0.27 0.32 0.33 0.33 0.38 0.39 0.14 1.0 0.23 0.51 0.18 0.2 0.22 0.14 0.21 0.19 0.34 0.2 0.47 0.41
0.74 0.49 0.63 0.67 0.54 0.41 0.6 0.72 0.66 0.7 0.69 0.66 0.84 0.78 0.65 0.72 0.61 0.56 0.59 0.46 0.25 0.5 0.54 0.52 1.0 0.67
0.35 0.19 0.22 0.39 0.45 0.35 0.45 0.4 0.38 0.5 0.61 0.55 0.43 0.92 0.4 0.71 0.32 0.43 0.32 0.26 0.24 0.54 0.48 0.79 1.0 0.67
0.57 0.28 0.31 0.41 0.29 0.34 0.49 0.48 0.43 0.39 0.45 0.29 0.33 0.73 0.68 0.57 0.33 0.44 0.47 0.26 0.14 0.74 0.54 0.72 1.0 0.75
0.85 0.51 0.53 0.64 0.57 0.42 0.59 0.65 0.53 0.6 0.68 0.83 0.89 1.0 0.52 0.78 0.57 0.89 0.54 0.58 0.29 0.75 0.61 0.78 0.94 0.85

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)