Heatmap: Cluster_157 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.2 0.19 0.17 0.17 0.17 0.23 0.29 0.3 0.17 0.15 0.16 0.11 0.19 1.0 0.24 0.56 0.27 0.21 0.19 0.24 0.04 0.02 0.34 0.09 0.35 0.36
0.2 0.22 0.22 0.35 0.32 0.44 0.42 0.39 0.77 0.8 0.98 1.0 0.29 0.86 0.47 0.7 0.43 0.44 0.29 0.26 0.24 0.96 0.37 0.18 0.29 0.33
0.12 0.22 0.22 0.27 0.25 0.31 0.4 0.33 0.59 0.66 0.78 0.87 0.28 1.0 0.58 0.79 0.56 0.54 0.38 0.39 0.22 0.58 0.36 0.27 0.27 0.24
0.03 0.05 0.03 0.05 0.1 0.09 0.17 0.17 0.25 0.26 0.24 0.15 0.06 1.0 0.13 0.15 0.09 0.26 0.17 0.12 0.03 0.15 0.26 0.17 0.33 0.21
0.15 0.14 0.15 0.2 0.18 0.31 0.39 0.27 0.5 0.26 0.24 0.32 0.13 1.0 0.38 0.54 0.16 0.15 0.16 0.08 0.04 0.13 0.07 0.07 0.16 0.15
0.22 0.08 0.06 0.16 0.16 0.15 0.27 0.33 0.38 0.35 0.33 0.25 0.2 1.0 0.26 0.31 0.19 0.26 0.18 0.17 0.03 0.65 0.18 0.13 0.47 0.35
0.07 0.14 0.19 0.18 0.25 0.49 0.87 0.67 1.0 0.65 0.57 0.45 0.11 0.97 0.84 0.88 0.51 0.4 0.27 0.25 0.09 0.49 0.23 0.36 0.44 0.41
0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.21 0.38 0.32 0.27 0.18 0.08 0.03 0.0 1.0 0.66 0.52 0.24 0.14 0.15 0.08 0.0 0.01 0.07 0.02 0.23 0.08
0.05 0.04 0.04 0.05 0.11 0.19 0.28 0.18 0.23 0.1 0.06 0.04 0.06 1.0 0.72 0.58 0.3 0.21 0.16 0.08 0.01 0.35 0.04 0.05 0.26 0.11
0.49 0.22 0.16 0.18 0.16 0.12 0.2 0.26 0.45 0.63 0.65 0.6 0.43 1.0 0.36 0.53 0.16 0.29 0.36 0.17 0.18 0.24 0.35 0.38 0.24 0.28
0.32 0.16 0.09 0.14 0.09 0.07 0.27 0.16 0.31 0.43 0.39 0.53 0.32 1.0 0.37 0.62 0.19 0.26 0.29 0.16 0.12 0.26 0.25 0.33 0.38 0.25
0.43 0.2 0.15 0.19 0.1 0.08 0.25 0.18 0.35 0.66 0.73 0.65 0.57 1.0 0.38 0.62 0.15 0.32 0.33 0.28 0.18 0.49 0.32 0.5 0.29 0.37
0.03 0.07 0.12 0.17 0.28 0.43 0.46 0.32 0.3 0.15 0.09 0.05 0.03 1.0 0.38 0.29 0.19 0.17 0.17 0.19 0.01 0.04 0.03 0.01 0.16 0.09
0.08 0.08 0.12 0.13 0.12 0.22 0.44 0.37 0.91 0.69 0.67 0.55 0.17 1.0 0.74 0.38 0.11 0.15 0.11 0.11 0.01 0.06 0.04 0.1 0.4 0.29
0.15 0.11 0.11 0.13 0.19 0.24 0.39 0.42 0.49 0.68 0.69 0.57 0.22 1.0 0.31 0.43 0.4 0.32 0.29 0.23 0.03 0.12 0.52 0.24 0.21 0.19
0.51 0.44 0.44 0.47 0.47 0.45 0.43 0.42 0.42 0.47 0.46 0.5 0.43 1.0 0.33 0.47 0.36 0.4 0.39 0.37 0.01 0.27 0.22 0.31 0.31 0.42
0.7 0.47 0.42 0.58 0.42 0.25 0.3 0.42 0.42 0.56 0.8 0.84 0.76 1.0 0.61 0.74 0.59 0.52 0.63 0.48 0.17 0.52 0.35 0.8 0.75 0.72
0.08 0.09 0.1 0.11 0.18 0.28 0.33 0.27 0.34 0.31 0.3 0.25 0.09 1.0 0.58 0.7 0.32 0.27 0.23 0.21 0.09 0.63 0.23 0.23 0.27 0.25
0.03 0.07 0.02 0.11 0.21 0.22 0.17 0.1 0.19 0.15 0.26 0.24 0.08 1.0 0.28 0.33 0.2 0.06 0.08 0.02 0.02 0.56 0.02 0.09 0.03 0.02
0.04 0.06 0.1 0.12 0.19 0.4 0.56 0.4 0.83 0.57 0.49 0.28 0.06 1.0 0.49 0.59 0.43 0.18 0.15 0.23 0.01 0.24 0.09 0.08 0.13 0.1
0.02 0.02 0.01 0.01 0.04 0.13 0.26 0.18 0.31 0.12 0.07 0.04 0.02 1.0 0.62 0.27 0.12 0.13 0.1 0.06 0.0 0.02 0.03 0.02 0.04 0.02
0.15 0.12 0.1 0.05 0.01 0.02 0.06 0.09 0.08 0.1 0.08 0.06 0.18 1.0 0.05 0.06 0.06 0.06 0.04 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.02
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.05 0.03 0.05 0.05 0.01 0.03 0.0 1.0 0.01 0.0 0.07 0.04 0.04 0.02 0.03 0.03 0.16 0.11 0.05 0.09
0.01 0.01 0.01 0.07 0.07 0.1 0.41 0.37 0.39 0.47 0.42 0.25 0.01 1.0 0.37 0.54 0.23 0.29 0.19 0.11 0.02 0.15 0.09 0.13 0.78 0.28
0.55 0.38 0.37 0.34 0.22 0.17 0.28 0.37 0.36 0.55 0.79 0.87 0.81 0.74 0.69 0.57 0.93 0.64 0.49 0.45 0.26 0.54 0.44 0.68 1.0 0.72
0.31 0.13 0.15 0.18 0.11 0.11 0.38 0.71 0.3 0.31 0.26 0.19 0.39 1.0 0.04 0.21 0.23 0.15 0.16 0.17 0.0 0.01 0.01 0.01 0.31 0.18
0.06 0.02 0.01 0.02 0.03 0.05 0.11 0.12 0.17 0.11 0.11 0.08 0.05 1.0 0.49 0.16 0.05 0.07 0.07 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01
0.28 0.04 0.04 0.05 0.04 0.08 0.25 0.31 0.21 0.24 0.19 0.15 0.44 1.0 0.01 0.08 0.04 0.08 0.09 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.1 0.07
0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.04 0.08 0.06 0.1 0.06 0.05 0.03 0.0 1.0 0.13 0.21 0.08 0.07 0.05 0.03 0.02 0.04 0.03 0.02 0.05 0.04
0.27 0.31 0.32 0.28 0.33 0.41 0.56 0.61 0.69 0.65 0.6 0.55 0.25 1.0 0.19 0.88 0.45 0.44 0.46 0.62 0.18 0.09 0.46 0.27 0.24 0.24
0.35 0.42 0.37 0.36 0.42 0.35 0.72 0.71 0.95 0.83 0.85 0.79 0.48 1.0 0.72 0.9 0.39 0.66 0.63 0.47 0.12 0.33 0.38 0.59 0.77 0.64
0.15 0.19 0.18 0.21 0.21 0.2 0.34 0.38 0.64 0.85 0.9 0.81 0.22 1.0 0.36 0.68 0.25 0.37 0.32 0.4 0.06 0.54 0.42 0.47 0.57 0.57
0.1 0.15 0.14 0.15 0.13 0.12 0.26 0.31 0.45 0.68 0.72 0.58 0.16 1.0 0.31 0.69 0.28 0.36 0.26 0.36 0.06 0.59 0.34 0.32 0.43 0.45
0.01 0.0 0.01 0.04 0.08 0.17 0.3 0.31 0.26 0.25 0.16 0.09 0.0 1.0 0.65 0.62 0.77 0.33 0.35 0.27 0.03 0.17 0.11 0.28 0.42 0.25
0.88 0.65 0.54 0.36 0.24 0.23 0.4 0.53 0.83 0.89 0.88 1.0 0.92 0.86 0.52 0.43 0.63 0.62 0.54 0.59 0.1 0.5 0.41 0.59 0.57 0.63
0.21 0.07 0.06 0.08 0.13 0.23 0.33 0.31 0.45 0.52 0.59 0.61 0.39 1.0 0.49 0.94 0.42 0.32 0.19 0.25 0.09 0.23 0.15 0.2 0.44 0.34
0.01 0.03 0.08 0.11 0.14 0.26 0.32 0.18 0.29 0.17 0.16 0.13 0.01 1.0 0.48 0.78 0.22 0.16 0.18 0.13 0.05 0.35 0.14 0.11 0.21 0.18
0.26 0.07 0.05 0.03 0.04 0.16 0.33 0.36 0.51 0.64 0.62 0.5 0.33 1.0 0.14 0.39 0.16 0.19 0.19 0.22 0.01 0.03 0.26 0.13 0.18 0.12
0.72 0.59 0.54 0.49 0.42 0.38 0.58 0.64 0.68 0.78 0.86 1.0 0.77 0.79 0.69 0.69 0.6 0.64 0.58 0.54 0.19 0.58 0.57 0.66 0.62 0.65
0.02 0.01 0.02 0.03 0.04 0.06 0.07 0.05 0.05 0.04 0.03 0.03 0.03 1.0 0.05 0.15 0.03 0.03 0.05 0.06 0.03 0.02 0.05 0.03 0.18 0.16
0.03 0.01 0.02 0.04 0.06 0.08 0.1 0.08 0.05 0.07 0.05 0.04 0.04 1.0 0.05 0.19 0.04 0.04 0.04 0.08 0.03 0.01 0.06 0.03 0.34 0.2
0.15 0.04 0.07 0.11 0.08 0.06 0.1 0.15 0.12 0.18 0.22 0.17 0.14 1.0 0.03 0.14 0.03 0.09 0.11 0.04 0.02 0.12 0.06 0.11 0.14 0.09
0.14 0.06 0.04 0.03 0.04 0.05 0.13 0.15 0.2 0.28 0.23 0.16 0.17 1.0 0.02 0.09 0.06 0.1 0.12 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.07
0.3 0.11 0.14 0.17 0.07 0.05 0.13 0.23 0.2 0.27 0.35 0.33 0.26 1.0 0.17 0.25 0.09 0.28 0.19 0.14 0.05 0.43 0.03 0.08 0.32 0.25
0.01 0.03 0.05 0.07 0.09 0.12 0.07 0.02 0.03 0.04 0.04 0.03 0.01 1.0 0.09 0.6 0.03 0.13 0.09 0.1 0.01 0.14 0.01 0.04 0.12 0.26
0.15 0.08 0.12 0.15 0.16 0.27 0.65 0.71 0.68 0.64 0.55 0.4 0.17 1.0 0.71 0.66 0.55 0.31 0.3 0.28 0.19 0.25 0.19 0.19 0.54 0.29
0.6 0.75 0.6 0.44 0.19 0.08 0.15 0.24 0.33 0.53 0.69 0.75 0.61 0.79 0.53 0.5 0.72 0.69 0.64 0.5 0.31 0.73 0.68 0.99 1.0 0.89
0.03 0.07 0.15 0.24 0.17 0.16 0.4 0.42 0.58 0.59 0.48 0.54 0.0 0.92 1.0 0.74 0.35 0.36 0.28 0.17 0.07 0.33 0.17 0.4 0.45 0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)