Heatmap: Cluster_112 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.16 0.17 0.18 0.27 0.18 0.3 0.22 0.33 0.31 0.22 0.36 0.22 0.12 0.15 0.22 0.28 0.14 0.18 0.09 0.09 0.65 0.57 1.0 0.94 0.61 0.77
0.47 0.34 0.33 0.48 0.44 0.34 0.49 0.53 0.56 0.68 0.84 0.78 0.61 0.39 0.27 0.33 0.3 0.28 0.23 0.18 0.5 1.0 0.92 0.82 0.79 0.62
0.52 0.43 0.38 0.54 0.6 0.55 0.61 0.61 0.69 0.66 0.73 0.77 0.58 0.5 0.43 0.47 0.32 0.36 0.5 0.24 0.51 0.91 1.0 0.82 0.89 0.75
0.73 0.49 0.37 0.39 0.3 0.17 0.33 0.4 0.42 0.52 0.72 0.7 0.71 0.35 0.22 0.28 0.24 0.4 0.28 0.23 0.34 0.8 1.0 0.62 0.74 0.54
0.3 0.22 0.25 0.27 0.26 0.19 0.35 0.4 0.39 0.47 0.5 0.48 0.43 0.36 0.24 0.39 0.21 0.25 0.23 0.2 0.49 0.57 0.72 1.0 0.57 0.74
0.12 0.11 0.14 0.19 0.18 0.24 0.29 0.33 0.61 0.65 0.53 0.45 0.13 0.13 0.1 0.13 0.12 0.23 0.16 0.2 0.63 0.63 1.0 0.68 0.43 0.46
0.44 0.23 0.23 0.4 0.36 0.39 0.46 0.58 0.53 0.45 0.64 0.42 0.36 0.21 0.18 0.19 0.22 0.42 0.34 0.28 0.71 1.0 0.87 0.87 0.93 0.71
0.23 0.28 0.28 0.44 0.46 0.33 0.31 0.32 0.36 0.33 0.35 0.32 0.16 0.22 0.17 0.2 0.17 0.21 0.25 0.18 0.73 0.68 0.9 1.0 0.48 0.41
0.43 0.35 0.32 0.48 0.47 0.42 0.5 0.56 0.61 0.61 0.74 0.68 0.47 0.48 0.29 0.42 0.29 0.31 0.27 0.22 0.17 0.95 1.0 0.62 0.64 0.48
0.62 0.31 0.27 0.58 0.45 0.26 0.44 0.54 0.61 0.63 0.77 0.7 0.58 0.45 0.26 0.45 0.28 0.38 0.29 0.34 0.52 1.0 0.88 0.85 0.92 0.7
0.24 0.37 0.35 0.35 0.35 0.24 0.37 0.28 0.45 0.5 0.37 0.31 0.27 0.3 0.23 0.27 0.59 0.72 0.36 0.38 0.37 0.41 0.64 0.99 1.0 0.45
0.52 0.26 0.18 0.3 0.34 0.28 0.31 0.41 0.44 0.41 0.49 0.34 0.53 0.22 0.17 0.23 0.18 0.34 0.29 0.2 0.3 0.67 1.0 0.52 0.63 0.47
0.25 0.2 0.23 0.36 0.37 0.33 0.49 0.53 0.49 0.5 0.59 0.58 0.28 0.35 0.18 0.32 0.23 0.18 0.18 0.18 0.61 0.74 1.0 0.73 0.65 0.45
0.27 0.24 0.26 0.29 0.3 0.26 0.4 0.41 0.38 0.38 0.42 0.37 0.29 0.27 0.24 0.34 0.2 0.31 0.23 0.23 0.61 0.68 0.73 1.0 0.44 0.48
0.21 0.13 0.16 0.36 0.41 0.45 0.48 0.52 0.54 0.53 0.4 0.46 0.19 0.21 0.09 0.11 0.14 0.29 0.16 0.19 1.0 0.54 0.92 0.56 0.59 0.64
0.01 0.0 0.03 0.06 0.08 0.05 0.08 0.05 0.24 0.42 0.52 0.44 0.04 0.18 0.05 0.13 0.07 0.04 0.06 0.04 0.49 0.14 0.58 1.0 0.2 0.33
0.4 0.28 0.3 0.41 0.39 0.31 0.44 0.45 0.45 0.5 0.58 0.64 0.47 0.58 0.41 0.51 0.37 0.35 0.31 0.26 0.73 0.91 1.0 0.98 0.71 0.64
1.0 0.31 0.26 0.41 0.43 0.38 0.47 0.41 0.57 0.52 0.64 0.57 0.92 0.41 0.33 0.42 0.32 0.46 0.32 0.24 0.45 0.98 0.89 0.62 0.78 0.56
0.35 0.24 0.22 0.3 0.33 0.24 0.36 0.43 0.4 0.53 0.68 0.63 0.4 0.37 0.16 0.34 0.2 0.16 0.17 0.21 0.3 0.71 1.0 0.64 0.7 0.52
0.34 0.27 0.27 0.37 0.38 0.27 0.4 0.52 0.42 0.5 0.61 0.64 0.47 0.4 0.27 0.39 0.28 0.41 0.29 0.22 0.58 0.95 1.0 0.85 0.7 0.58
0.59 0.2 0.11 0.28 0.21 0.09 0.17 0.27 0.31 0.33 0.65 0.47 0.49 0.1 0.06 0.1 0.07 0.19 0.12 0.06 0.12 1.0 0.82 0.38 0.66 0.36
0.48 0.19 0.18 0.48 0.35 0.23 0.27 0.38 0.34 0.34 0.51 0.47 0.58 0.18 0.12 0.2 0.11 0.21 0.12 0.1 0.58 1.0 0.76 0.55 0.76 0.55
0.3 0.17 0.23 0.37 0.3 0.35 0.46 0.54 0.55 0.59 0.61 0.54 0.23 0.2 0.11 0.17 0.16 0.3 0.2 0.21 0.64 0.77 1.0 0.89 0.85 0.88
0.17 0.06 0.17 0.29 0.18 0.28 0.27 0.32 0.35 0.27 0.36 0.34 0.14 0.04 0.02 0.07 0.1 0.17 0.11 0.16 0.75 0.51 1.0 0.48 0.54 0.63
0.09 0.11 0.16 0.2 0.24 0.34 0.31 0.33 0.35 0.34 0.4 0.44 0.05 0.09 0.06 0.09 0.09 0.21 0.26 0.09 0.4 0.06 0.63 1.0 0.22 0.34
0.46 0.33 0.29 0.43 0.37 0.31 0.38 0.4 0.41 0.37 0.57 0.54 0.53 0.39 0.21 0.43 0.21 0.26 0.18 0.16 0.33 0.77 1.0 0.6 0.63 0.57
0.51 0.33 0.31 0.5 0.49 0.48 0.56 0.63 0.5 0.45 0.52 0.54 0.49 0.45 0.37 0.47 0.4 0.49 0.39 0.37 0.37 1.0 0.69 0.6 0.57 0.63
0.28 0.28 0.24 0.32 0.31 0.23 0.34 0.33 0.43 0.62 0.79 0.59 0.36 0.38 0.25 0.31 0.15 0.34 0.24 0.15 0.49 0.36 0.61 1.0 0.54 0.71
0.28 0.2 0.17 0.24 0.28 0.2 0.36 0.34 0.38 0.54 0.62 0.74 0.36 0.35 0.25 0.31 0.16 0.27 0.18 0.18 0.17 1.0 0.91 0.42 0.41 0.42
0.42 0.26 0.27 0.26 0.22 0.26 0.54 0.68 0.55 0.66 0.8 0.98 0.61 0.57 0.49 0.56 0.4 0.67 0.41 0.37 0.68 1.0 0.76 0.74 0.85 0.67
0.28 0.27 0.29 0.39 0.45 0.35 0.48 0.47 0.4 0.44 0.51 0.45 0.37 0.41 0.26 0.44 0.24 0.25 0.22 0.18 0.27 0.81 1.0 0.44 0.56 0.34
0.8 0.54 0.43 0.55 0.51 0.4 0.56 0.64 0.5 0.59 0.74 0.71 0.85 0.58 0.35 0.46 0.29 0.39 0.31 0.32 0.5 0.79 0.81 0.83 1.0 0.81
0.43 0.26 0.22 0.38 0.34 0.26 0.38 0.43 0.39 0.45 0.6 0.59 0.39 0.44 0.23 0.54 0.2 0.23 0.19 0.14 0.37 0.64 1.0 0.55 0.76 0.53
0.57 0.36 0.33 0.51 0.49 0.3 0.4 0.44 0.42 0.59 0.89 0.84 0.66 0.21 0.14 0.19 0.22 0.21 0.15 0.2 0.58 0.71 0.93 0.76 1.0 0.67
0.78 0.17 0.12 0.15 0.08 0.06 0.29 0.46 0.37 0.53 0.7 0.6 0.81 0.18 0.15 0.11 0.1 0.16 0.13 0.14 0.51 0.79 0.95 0.85 1.0 0.65
0.16 0.19 0.09 0.23 0.23 0.21 0.23 0.27 0.16 0.31 0.36 0.26 0.17 0.43 0.18 0.13 0.26 0.35 0.22 0.21 0.21 0.3 0.55 1.0 0.95 0.52
0.21 0.24 0.18 0.38 0.34 0.29 0.37 0.35 0.42 0.52 0.61 0.42 0.3 0.44 0.27 0.16 0.3 0.33 0.24 0.23 0.27 0.36 0.65 1.0 0.82 0.74
0.39 0.31 0.35 0.37 0.36 0.36 0.47 0.52 0.55 0.6 0.62 0.7 0.49 0.78 0.47 0.75 0.55 0.55 0.47 0.41 0.6 1.0 0.87 0.62 0.5 0.71
0.76 0.52 0.5 0.57 0.46 0.34 0.49 0.64 0.62 0.76 0.94 0.97 0.89 0.59 0.52 0.66 0.45 0.65 0.63 0.35 0.65 0.88 0.78 0.65 1.0 0.64
0.65 0.27 0.27 0.53 0.59 0.41 0.6 0.66 0.59 0.61 0.7 0.68 0.82 0.37 0.27 0.37 0.28 0.4 0.28 0.25 0.58 0.95 0.87 0.63 1.0 0.57
0.66 0.39 0.38 0.48 0.39 0.23 0.4 0.51 0.4 0.46 0.55 0.58 0.67 0.39 0.23 0.37 0.22 0.34 0.26 0.24 0.45 0.87 1.0 0.69 0.94 0.65
0.06 0.17 0.17 0.53 0.5 0.35 0.37 0.48 0.59 0.56 1.0 0.74 0.1 0.26 0.18 0.21 0.13 0.41 0.3 0.22 0.76 0.58 0.89 0.98 0.79 0.98
0.46 0.3 0.26 0.42 0.44 0.27 0.36 0.4 0.39 0.45 0.52 0.51 0.57 0.42 0.25 0.35 0.24 0.3 0.19 0.18 0.4 0.93 1.0 0.66 0.79 0.72
0.6 0.46 0.44 0.6 0.62 0.5 0.64 0.65 0.69 0.8 0.93 0.84 0.76 0.68 0.39 0.57 0.37 0.44 0.36 0.29 0.27 0.98 1.0 0.68 0.76 0.62
0.34 0.28 0.36 0.51 0.54 0.38 0.35 0.39 0.43 0.61 0.7 0.77 0.47 0.74 0.69 0.66 0.45 0.36 0.22 0.31 0.64 0.91 1.0 0.81 0.84 0.88
0.49 0.29 0.27 0.34 0.28 0.2 0.3 0.38 0.37 0.41 0.53 0.58 0.53 0.39 0.23 0.33 0.21 0.27 0.23 0.18 0.53 0.67 1.0 0.74 0.77 0.57
0.47 0.31 0.33 0.38 0.4 0.37 0.54 0.5 0.58 0.61 0.61 0.69 0.65 0.68 0.5 0.63 0.46 0.6 0.44 0.39 0.53 1.0 0.67 0.56 0.83 0.65
0.35 0.17 0.2 0.27 0.32 0.25 0.29 0.35 0.41 0.51 0.68 0.68 0.38 0.56 0.34 0.36 0.31 0.37 0.35 0.22 0.4 0.57 0.82 1.0 0.69 0.69
0.55 0.29 0.2 0.46 0.35 0.3 0.42 0.46 0.6 0.54 0.63 0.56 0.32 0.22 0.19 0.24 0.23 0.37 0.24 0.17 0.5 0.9 0.89 0.75 1.0 0.61
0.47 0.45 0.36 0.49 0.4 0.34 0.52 0.45 0.36 0.3 0.4 0.44 0.44 0.24 0.12 0.26 0.18 0.2 0.19 0.17 0.47 0.94 1.0 0.51 0.68 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)