Heatmap: Cluster_161 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.7 0.56 0.48 0.55 0.54 0.37 0.55 0.56 0.39 0.42 0.46 0.53 0.84 0.77 0.3 0.63 0.38 0.49 0.4 0.34 0.17 0.32 1.0 0.39 0.54 0.39
0.38 0.41 0.37 0.42 0.45 0.39 0.44 0.56 0.66 0.24 0.43 0.34 0.37 0.66 0.59 0.51 0.23 0.53 0.45 0.22 0.23 0.27 0.42 0.17 1.0 0.55
0.79 0.51 0.66 0.67 0.42 0.41 0.53 0.65 0.47 0.47 0.64 0.7 1.0 0.88 0.4 0.85 0.39 0.54 0.41 0.44 0.64 0.59 0.86 0.82 0.6 1.0
0.16 0.11 0.14 0.16 0.18 0.17 0.21 0.19 0.11 0.13 0.11 0.1 0.18 0.54 0.19 1.0 0.18 0.15 0.12 0.14 0.22 0.23 0.17 0.19 0.3 0.35
0.9 0.64 0.68 0.81 0.67 0.47 0.63 0.65 0.59 0.73 0.81 0.78 0.75 0.48 0.37 0.92 0.48 0.52 0.51 0.55 0.07 0.45 0.54 0.64 1.0 0.91
0.78 0.59 0.47 0.77 0.53 0.31 0.48 0.57 0.43 0.54 0.81 0.58 0.67 0.31 0.17 0.71 0.37 0.4 0.32 0.37 0.06 0.56 0.33 0.63 1.0 0.85
0.27 0.66 1.0 0.83 0.35 0.2 0.23 0.33 0.31 0.46 0.58 0.9 0.38 0.82 0.49 0.8 0.46 0.54 0.29 0.45 0.16 0.34 0.42 0.55 0.75 0.97
0.89 0.48 0.65 0.74 0.81 0.86 0.95 0.93 0.71 0.5 0.47 0.39 0.74 0.79 0.62 0.96 0.63 0.61 0.71 0.66 0.16 0.52 0.5 0.39 1.0 0.85
0.72 0.38 0.71 0.51 0.43 0.4 0.36 0.36 0.27 0.31 0.26 0.32 0.82 0.77 0.42 0.68 0.35 0.58 0.51 0.33 0.04 0.16 0.47 0.51 0.84 1.0
0.89 0.59 0.73 0.62 0.6 0.7 0.44 0.5 0.33 0.35 0.37 0.31 0.73 1.0 0.53 0.86 0.34 0.53 0.79 0.45 0.04 0.19 0.31 0.37 0.68 0.9
0.55 0.36 0.4 0.37 0.29 0.24 0.24 0.29 0.17 0.13 0.18 0.21 0.52 0.67 0.36 0.5 0.22 0.44 0.44 0.3 0.02 0.23 0.15 0.11 1.0 0.63
0.85 0.65 0.65 0.68 0.66 0.57 0.67 0.69 0.71 0.59 0.7 0.57 0.88 0.65 0.75 0.77 0.53 0.73 0.72 0.62 0.04 0.95 0.48 0.56 1.0 0.84
0.24 0.89 0.82 0.59 0.46 0.33 0.23 0.18 0.16 0.25 0.36 0.39 0.2 0.93 0.36 0.71 0.48 0.52 0.41 0.35 0.16 0.89 0.52 0.8 0.93 1.0
0.57 0.26 0.26 0.21 0.3 0.34 0.54 0.55 0.39 0.43 0.39 0.39 0.53 1.0 0.56 0.85 0.43 0.39 0.35 0.42 0.01 0.08 0.12 0.1 0.58 0.58
0.46 0.16 0.13 0.14 0.17 0.26 0.46 0.44 0.44 0.47 0.43 0.35 0.44 1.0 0.3 0.49 0.36 0.42 0.39 0.35 0.0 0.02 0.01 0.02 0.29 0.2
0.61 0.36 0.29 0.37 0.41 0.41 0.67 0.68 0.53 0.53 0.58 0.49 0.72 0.67 0.45 0.46 0.25 0.32 0.23 0.28 0.03 0.29 0.36 0.2 1.0 0.51
0.87 0.62 0.75 0.76 0.8 0.87 0.97 1.0 0.88 0.69 0.68 0.7 0.88 0.88 0.52 0.73 0.47 0.56 0.46 0.52 0.22 0.16 0.72 0.4 0.86 0.81
0.71 0.58 0.74 0.82 0.51 0.27 0.35 0.45 0.19 0.31 0.44 0.66 0.8 1.0 0.49 0.75 0.33 0.23 0.17 0.26 0.27 0.33 0.22 0.32 0.9 0.79
0.66 0.51 0.67 0.79 0.66 0.68 0.76 0.99 0.26 0.21 0.19 0.16 0.64 0.69 0.23 0.84 0.42 0.49 0.41 0.41 0.01 0.27 0.03 0.05 1.0 0.71
0.54 0.47 0.37 0.39 0.32 0.26 0.34 0.43 0.49 0.64 0.68 0.58 0.51 1.0 0.4 0.8 0.38 0.65 0.6 0.43 0.41 0.38 0.39 0.44 0.75 0.92
0.69 0.47 0.44 0.42 0.38 0.31 0.42 0.45 0.32 0.27 0.3 0.34 0.81 0.78 0.97 0.43 0.28 0.36 0.34 0.24 0.07 0.3 0.41 0.18 1.0 0.66
0.58 0.27 0.23 0.22 0.22 0.27 0.42 0.47 0.42 0.42 0.38 0.35 0.54 1.0 0.4 0.62 0.34 0.48 0.41 0.34 0.04 0.17 0.28 0.28 0.42 0.38
0.57 0.59 0.68 0.74 0.71 0.51 0.53 0.52 0.52 0.59 0.62 0.67 0.55 1.0 0.54 0.96 0.6 0.57 0.4 0.54 0.39 0.4 0.59 0.63 0.63 0.77
0.41 0.65 0.58 0.76 0.65 0.53 0.83 0.89 0.6 0.63 0.66 0.52 0.28 0.56 0.64 0.84 0.46 0.58 0.54 0.53 0.0 0.09 0.19 0.21 1.0 0.77
0.87 0.59 0.66 0.69 0.51 0.49 0.79 0.91 0.53 0.52 0.53 0.46 0.83 1.0 0.44 0.77 0.47 0.51 0.45 0.52 0.06 0.42 0.35 0.41 0.86 0.81
0.79 0.67 0.7 0.65 0.67 0.59 0.57 0.55 0.47 0.58 0.6 0.66 0.84 1.0 0.66 0.88 0.67 0.58 0.68 0.61 0.06 0.4 0.85 0.69 0.42 0.74
1.0 0.78 0.76 0.68 0.89 0.77 0.66 0.69 0.65 0.66 0.79 0.78 0.92 0.88 0.57 0.73 0.5 0.41 0.46 0.44 0.07 0.35 0.93 0.48 0.55 0.73
0.2 0.16 0.24 0.24 0.17 0.15 0.32 0.34 0.18 0.21 0.22 0.19 0.25 0.57 0.16 1.0 0.12 0.18 0.09 0.13 0.26 0.33 0.13 0.13 0.55 0.52
0.82 0.51 0.48 0.6 0.67 0.75 0.89 0.72 0.76 0.6 0.65 0.49 0.76 1.0 0.89 0.77 0.47 0.55 0.77 0.56 0.09 0.99 0.43 0.58 0.88 0.88
0.88 0.66 0.72 0.74 0.71 0.68 0.72 0.71 0.52 0.53 0.51 0.52 1.0 0.92 0.83 0.88 0.63 0.76 0.6 0.5 0.27 0.63 0.52 0.49 0.88 0.87
0.23 0.4 0.67 0.61 0.33 0.26 0.5 0.59 0.53 0.62 0.91 0.98 0.32 0.75 0.47 0.51 0.46 0.36 0.42 0.34 0.24 0.56 0.49 0.66 1.0 0.92
0.94 0.65 0.59 0.65 0.6 0.58 0.68 0.63 0.43 0.45 0.42 0.42 0.91 0.78 0.5 0.62 0.48 0.49 0.6 0.45 0.16 0.25 0.65 0.39 1.0 0.79
0.5 0.53 0.68 0.95 0.86 0.77 0.94 1.0 0.86 0.7 0.77 0.64 0.52 0.83 0.75 0.64 0.4 0.46 0.37 0.42 0.03 0.48 0.31 0.32 0.78 0.93
0.63 0.38 0.53 0.8 0.54 0.37 0.73 1.0 0.67 0.65 0.59 0.52 0.45 0.77 0.32 0.72 0.43 0.67 0.39 0.43 0.12 0.16 0.41 0.34 0.77 0.72
0.34 0.23 0.18 0.42 0.48 0.22 0.46 0.64 0.55 0.48 0.62 0.45 0.38 0.54 0.2 0.46 0.21 0.21 0.23 0.23 0.02 0.12 0.55 0.41 1.0 0.4
0.22 0.25 0.29 0.35 0.36 0.38 0.4 0.43 0.41 0.4 0.38 0.27 0.11 0.66 0.57 1.0 0.43 0.46 0.53 0.42 0.1 0.29 0.37 0.23 0.76 0.46
0.66 0.72 0.78 0.8 0.63 0.45 0.5 0.61 0.57 0.62 0.65 0.58 0.63 0.49 0.34 0.53 0.38 0.46 0.47 0.38 0.1 0.28 0.29 0.33 1.0 0.59
0.76 0.59 0.55 0.84 0.71 0.63 0.62 0.68 0.58 0.73 0.9 0.71 0.62 0.51 0.48 0.79 0.39 0.63 0.64 0.46 0.09 0.39 0.49 0.85 1.0 0.66
0.59 0.43 0.39 0.35 0.38 0.49 0.63 0.54 0.36 0.3 0.27 0.25 0.55 0.77 0.25 0.82 0.34 0.31 0.3 0.34 0.06 0.11 0.09 0.11 1.0 0.47
1.0 0.71 0.73 0.72 0.56 0.46 0.61 0.61 0.37 0.38 0.34 0.37 0.95 0.61 0.62 0.48 0.55 0.7 0.63 0.52 0.09 0.24 0.85 0.51 0.79 0.93
0.57 0.56 0.74 0.85 0.82 0.74 0.8 0.79 0.81 0.69 0.76 0.71 0.66 0.88 0.74 1.0 0.39 0.7 0.68 0.58 0.16 0.24 0.53 0.41 0.61 0.94
0.43 0.33 0.43 0.47 0.47 0.43 0.45 0.41 0.39 0.43 0.42 0.35 0.45 0.69 0.51 1.0 0.41 0.41 0.31 0.38 0.17 0.51 0.36 0.32 0.63 0.65
0.72 0.55 0.64 0.58 0.42 0.42 0.49 0.55 0.47 0.42 0.51 0.51 0.63 0.7 0.67 0.98 0.41 0.53 0.54 0.39 0.1 0.15 1.0 0.35 0.5 0.57
0.35 0.32 0.41 0.55 0.27 0.18 0.27 0.41 0.32 0.33 0.45 0.53 0.5 1.0 0.1 0.62 0.25 0.38 0.41 0.43 0.51 0.28 0.61 0.35 0.84 0.99
0.55 0.3 0.27 0.41 0.21 0.08 0.16 0.27 0.13 0.13 0.18 0.15 0.52 0.59 0.15 1.0 0.13 0.11 0.07 0.09 0.03 0.32 0.1 0.1 0.89 0.64
0.62 0.36 0.47 0.56 0.59 0.76 0.79 0.97 0.82 0.62 0.6 0.52 0.49 0.93 0.38 1.0 0.45 0.5 0.49 0.53 0.11 0.24 0.67 0.62 0.77 0.78
0.49 0.3 0.34 0.47 0.44 0.57 0.77 0.71 0.66 0.58 0.48 0.44 0.38 1.0 0.31 0.99 0.39 0.52 0.48 0.55 0.08 0.22 0.66 0.66 0.57 0.75
0.69 0.29 0.33 0.61 0.48 0.37 0.89 0.95 0.55 0.35 0.23 0.17 0.75 0.56 0.3 0.56 0.34 0.43 0.31 0.29 0.05 0.22 0.05 0.09 1.0 0.58
0.88 0.58 0.63 0.84 0.61 0.52 0.79 1.0 0.82 0.78 0.63 0.66 0.9 0.63 0.38 0.78 0.38 0.6 0.43 0.57 0.41 0.48 0.43 0.41 0.77 0.88
0.39 0.32 0.29 0.3 0.31 0.32 0.28 0.26 0.24 0.28 0.3 0.34 0.36 0.47 0.36 1.0 0.3 0.35 0.33 0.26 0.29 0.46 0.43 0.46 0.52 0.4
1.0 0.65 0.78 0.9 0.8 0.52 0.72 0.91 0.62 0.63 0.68 0.57 0.92 0.67 0.59 0.73 0.45 0.52 0.48 0.54 0.05 0.14 0.36 0.27 1.0 0.91
0.33 0.32 0.27 0.32 0.39 0.3 0.21 0.17 0.11 0.05 0.06 0.05 0.11 0.4 0.22 1.0 0.15 0.53 0.29 0.25 0.14 0.49 0.29 0.09 0.41 0.32

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)