Heatmap: Cluster_211 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-1.26 -0.69 -0.21 0.15 0.14 0.24 0.13 0.07 0.13 0.01 -0.1 -0.28 -1.25 -0.33 0.21 0.51 -0.3 0.24 -0.04 -0.09 -2.87 0.41 0.46 -0.07 0.66 0.7
-1.76 -0.19 -0.34 -0.41 -0.03 -0.32 -0.25 -0.27 -0.02 0.2 0.31 0.32 -1.68 0.14 -0.42 -0.43 -0.35 0.01 -0.26 -0.29 -1.69 0.81 0.82 0.66 0.86 0.72
-2.78 -2.32 -1.18 0.04 -0.16 -0.17 -1.12 -1.16 -0.05 0.17 0.23 -0.15 -1.8 0.84 0.36 1.07 -0.18 -0.09 0.08 -0.83 -2.02 -1.1 1.91 0.42 0.36 0.41
-1.22 -0.65 0.06 0.0 0.24 0.49 0.24 0.3 0.21 -0.21 -0.33 -0.73 -1.43 -0.13 0.08 0.2 0.37 0.41 0.45 0.26 -3.19 -0.04 0.38 0.11 0.22 0.22
-1.16 -0.64 -0.46 -0.21 -0.12 -0.47 0.01 -0.02 0.38 0.41 0.38 0.1 -0.77 0.5 -0.37 0.08 0.01 0.12 -0.34 -0.14 -1.58 -0.18 0.56 0.58 0.54 0.51
-0.59 -0.69 -0.32 -0.33 0.08 0.15 0.14 -0.09 0.02 0.18 -0.1 -0.26 -0.57 0.23 0.17 0.34 0.0 -0.02 0.03 -0.07 -1.34 -0.74 1.05 0.19 0.33 0.42
-0.8 0.11 0.08 -0.0 0.23 0.53 0.27 0.06 0.07 -0.22 -0.43 -0.56 -0.73 0.09 -0.15 0.36 0.07 0.62 0.38 0.2 -1.59 -0.51 0.16 -0.24 0.02 0.26
-1.61 -0.87 0.04 0.42 0.55 0.07 0.1 0.1 0.3 0.08 -0.08 -0.09 -1.42 -0.05 0.15 0.15 -0.39 0.56 0.61 -0.14 -2.61 0.13 -0.07 0.1 0.24 0.3
-1.65 -0.75 -1.1 -0.43 -0.26 -0.29 0.25 0.26 0.27 0.09 0.04 -0.42 -2.23 -0.59 -0.28 -0.8 -0.29 0.35 0.08 -0.1 -2.84 1.16 1.18 0.92 0.57 0.51
-0.57 -0.63 -0.33 -0.34 0.04 -0.08 0.45 0.13 0.22 -0.04 -0.18 -0.46 -0.68 0.07 0.32 0.25 -0.05 0.4 0.55 0.2 -0.79 -0.15 0.83 -0.17 -0.26 -0.11
-0.78 -0.6 -0.63 -0.23 -0.0 0.03 0.38 0.35 0.44 0.35 0.16 -0.01 -0.83 -0.21 -0.49 -0.22 -0.46 0.04 -0.19 -0.47 -2.93 0.84 0.88 0.25 0.58 0.18
-1.48 -1.02 -0.46 -0.14 0.35 0.44 0.29 0.02 0.53 0.02 -0.34 -0.28 -1.59 -0.24 -0.2 0.0 -0.21 0.04 -0.08 -0.6 -2.24 -0.13 1.47 0.49 0.8 0.0
-1.08 -0.43 -0.2 0.05 0.09 -0.26 0.35 0.13 -0.11 0.11 0.33 0.35 -1.36 -0.09 -0.48 -0.1 -0.05 -0.07 -0.08 -0.35 -2.65 0.56 0.79 -0.01 0.84 0.38
-3.17 -1.72 -0.53 0.03 -0.17 -0.25 -0.37 0.09 -0.02 -0.39 0.11 -0.36 -2.69 -0.41 -0.29 -0.86 -0.77 0.27 0.42 -0.71 -2.91 1.45 1.24 0.68 1.02 0.87
-0.63 -0.36 -0.51 -0.62 -0.67 -0.55 0.01 -0.5 0.47 0.2 0.32 0.56 -0.54 0.52 0.4 0.43 -0.1 0.46 0.1 -0.49 -3.14 -0.24 1.16 0.0 0.14 -0.39
-1.78 -0.69 -0.5 -0.21 -0.2 -0.39 -0.22 -0.02 0.09 0.4 0.33 0.07 -1.61 0.04 0.14 0.01 -0.52 0.33 0.11 -0.28 -1.78 -0.25 1.04 0.57 1.02 0.41
-0.36 -0.53 -0.71 -0.74 -0.39 0.06 -0.08 0.01 -0.14 0.13 -0.15 0.07 -0.5 0.14 0.08 0.43 0.13 0.28 0.23 -0.02 -1.25 0.25 1.02 0.11 0.37 -0.15
-0.96 -0.78 -0.78 -0.08 0.07 -0.17 0.25 0.3 0.36 0.22 0.15 -0.15 -0.76 0.11 -0.89 -0.14 -0.5 -0.14 -0.24 -0.6 -1.5 0.74 1.09 0.37 0.72 0.3
-1.87 -0.54 -0.23 0.19 0.3 0.17 0.31 0.11 0.39 0.19 0.14 -0.23 -2.58 0.3 0.23 0.15 -0.1 0.15 -0.01 -0.07 -3.37 0.45 0.55 -0.2 0.34 0.28
-1.52 -0.53 -0.37 0.15 0.14 0.1 0.25 -0.15 0.14 0.01 -0.08 -0.2 -1.46 -0.43 -0.73 -0.13 -0.23 0.46 -0.72 -0.62 -0.72 0.89 1.16 0.64 0.57 0.06
-0.27 -0.58 -0.25 0.09 0.03 -0.03 0.2 0.28 0.37 0.43 0.27 0.24 -0.34 -0.66 -0.63 -0.97 -0.07 0.31 -0.52 0.0 -3.59 0.53 0.68 0.04 0.52 0.18
-0.72 -0.45 -0.74 -0.42 -0.05 0.21 0.16 0.1 0.51 0.09 0.22 -0.11 -1.54 -0.33 -0.16 -0.5 -0.24 -0.32 0.21 -0.28 -1.66 -1.3 1.37 1.07 0.55 0.24
-1.99 -0.99 -0.52 -0.07 -0.01 -0.12 0.5 0.35 0.32 0.3 0.28 0.06 -2.08 -0.03 -0.16 0.07 -0.17 0.12 -0.12 -0.36 -1.24 0.36 0.86 0.19 0.71 0.15
-4.17 -3.93 -1.17 -0.14 0.25 0.26 0.39 0.16 0.62 0.19 0.07 -0.47 -3.18 -0.86 -0.44 -0.72 -0.79 0.46 -0.15 -0.96 -1.32 0.35 1.72 0.69 1.11 0.21
-4.39 -1.76 -0.46 -0.3 -0.29 -0.44 -0.23 0.09 0.33 0.14 0.34 -0.02 -4.51 -0.53 -0.58 -0.91 -0.82 -0.47 -0.64 -0.9 -2.48 0.83 1.55 1.22 1.0 1.28
-1.3 -0.81 -0.8 -0.35 -0.11 -0.17 -0.15 -0.11 0.03 0.04 0.08 -0.21 -1.09 -0.25 0.3 -0.14 0.03 0.27 0.4 0.01 -2.72 1.06 0.87 0.42 0.65 0.11
0.02 -0.29 -0.33 -0.23 -0.08 -0.4 0.19 -0.1 -0.07 0.16 -0.07 -0.16 -0.12 0.26 0.19 0.35 -0.02 0.35 0.14 -0.11 -2.49 -0.26 0.74 -0.28 0.33 0.32
-0.98 -0.69 -0.7 -0.29 -0.22 -0.21 0.08 -0.38 0.41 0.44 0.33 0.05 -0.82 0.11 -0.05 0.1 -0.45 0.14 -0.3 -0.6 -1.38 1.22 0.84 0.1 0.39 0.08
-1.01 -0.92 -0.78 -0.2 -0.04 -0.24 -0.22 -0.12 -0.05 0.11 0.34 0.05 -0.76 0.02 -0.25 0.06 -0.14 0.02 0.01 -0.19 -1.2 0.42 0.93 0.62 0.48 0.74
-1.42 -0.84 -0.78 -0.4 -0.11 -0.49 -0.11 -0.08 0.18 0.11 0.53 0.69 -1.21 -0.08 -0.8 -0.68 -0.65 -0.19 -0.14 -0.61 -1.58 0.76 1.18 1.0 0.76 0.41
-1.38 -0.12 -0.2 0.12 0.44 0.44 0.29 0.16 0.28 -0.07 0.02 -0.2 -2.04 -1.02 -0.71 -0.66 -0.53 0.05 -0.24 -0.83 -0.83 0.77 1.24 0.41 0.67 -0.07
-2.77 -0.67 -0.31 -0.0 -0.33 -0.78 0.03 -0.03 0.12 0.26 0.04 0.01 -2.97 0.21 0.26 0.5 0.27 0.35 0.27 -0.07 -2.53 -0.11 1.23 0.16 0.5 0.26
-0.63 -0.44 -0.1 0.18 0.11 -0.15 0.2 0.19 0.12 0.22 0.28 0.13 -0.49 0.15 -0.14 0.24 -0.2 0.15 -0.08 -0.54 -1.37 0.59 0.29 -0.36 0.26 0.16
-0.39 -0.96 -0.81 -0.79 -0.38 0.03 -0.12 -0.02 0.19 -0.29 -0.59 -0.71 -0.18 -0.03 0.71 0.34 0.16 0.71 0.51 0.31 -1.77 0.43 1.13 -0.64 0.0 -0.03
-1.68 -0.39 -0.38 0.1 0.28 0.09 -0.02 -0.04 -0.01 -0.19 -0.06 -0.42 -2.11 0.12 0.07 -0.01 -0.35 0.17 0.2 -0.29 -2.47 0.63 1.18 0.48 0.35 0.44
-0.97 -1.69 -0.75 -0.05 -0.03 -0.17 0.18 0.05 0.23 0.25 0.36 0.34 -0.61 0.01 -0.29 -0.26 -0.34 -0.04 0.14 -0.32 -2.44 0.32 0.99 0.36 0.6 0.56
-2.31 -0.7 -0.23 -0.11 -0.23 -0.37 0.06 -0.02 0.32 0.16 0.2 0.13 -2.2 0.08 -0.58 0.02 -0.69 -0.19 -0.44 -0.87 -1.45 0.6 1.1 1.0 0.97 0.53
-0.28 -0.51 -0.28 0.14 0.43 0.28 0.12 -0.13 0.14 0.12 0.09 0.04 -0.13 0.14 0.33 0.1 0.02 0.09 -0.25 -0.25 -2.24 0.17 0.14 0.08 -0.03 0.19
-2.16 -1.2 -0.75 0.04 -0.06 -0.56 0.05 0.11 0.18 0.24 0.49 0.45 -2.17 -0.05 -0.5 0.13 -0.55 -0.19 -0.46 -0.63 -2.57 0.96 1.07 0.22 0.85 0.84
-2.88 -0.91 -0.03 0.28 0.21 0.03 0.25 0.21 0.3 0.1 -0.42 -0.45 -2.36 -0.31 -0.02 -0.19 -0.06 0.62 0.66 0.4 -3.91 0.27 0.39 -0.17 0.79 0.46
-1.76 -0.19 -0.46 -0.19 -0.09 -0.03 0.21 0.07 0.53 -0.07 -0.09 -0.09 -2.15 -0.13 -0.11 -0.05 0.01 0.32 0.09 -0.26 -1.52 0.22 1.09 0.41 0.64 0.12
-1.1 -0.59 -0.46 -0.19 0.21 -0.05 0.1 -0.05 0.31 0.23 0.32 0.09 -0.69 0.27 -0.29 0.11 -0.16 0.12 -0.01 -0.24 -1.56 0.63 0.56 -0.26 0.65 0.08
-1.64 -0.17 0.04 0.3 0.36 0.02 0.07 0.04 0.05 0.01 0.03 -0.09 -1.61 -0.03 0.09 0.01 0.26 0.37 0.35 0.06 -2.59 -0.11 0.43 -0.25 0.49 0.37
-1.18 -0.39 -0.12 0.07 -0.09 -0.58 0.12 0.08 -0.06 0.09 0.11 -0.18 -1.33 0.14 0.28 -0.05 0.15 0.58 0.31 -0.02 -2.95 -0.81 0.78 -0.15 0.87 0.52
-0.45 -0.33 -0.3 -0.11 0.15 0.11 0.19 0.04 0.26 -0.04 -0.09 -0.39 -0.71 0.19 0.09 0.23 0.15 0.33 0.24 0.02 -1.74 -0.3 0.64 -0.02 0.29 0.11
-2.21 -0.51 -0.5 -0.07 0.03 -0.11 0.05 -0.02 0.41 0.28 0.44 0.3 -2.09 0.08 0.06 0.18 -0.26 0.47 0.01 -0.22 -2.98 -0.8 1.19 0.28 0.3 0.44
-1.03 -1.29 -0.74 -0.17 -0.19 -0.47 0.31 0.54 0.69 0.41 0.42 0.15 -1.03 -0.06 -0.99 -0.06 -0.66 0.35 -0.47 -0.53 -1.75 1.06 1.0 -0.41 0.62 0.02
-1.39 -0.45 -0.66 -0.39 -0.44 -0.13 -0.08 -0.18 -0.01 -0.03 -0.28 -0.63 -1.34 0.5 0.1 0.52 0.27 0.14 0.14 0.31 -2.04 -0.28 1.34 0.53 0.09 0.57
-1.01 -0.79 -0.68 -0.29 -0.14 -0.39 -0.05 -0.08 0.02 0.05 -0.03 -0.17 -0.86 0.18 0.3 0.1 -0.32 -0.1 -0.06 -0.25 -1.64 0.95 0.56 0.95 0.44 0.54
-0.66 -0.33 -0.37 -0.38 -1.39 -0.64 -0.05 0.23 0.35 0.43 0.47 0.24 -0.37 0.1 0.03 0.01 -0.34 0.01 -0.32 0.2 -2.44 -0.06 1.24 0.05 -0.07 0.63
-2.42 -0.59 -0.59 0.25 0.7 -0.3 0.22 -0.15 0.44 -0.03 0.44 -0.02 -2.69 -0.98 -0.96 -0.96 -2.58 -0.67 -1.08 -1.91 -1.82 1.28 1.66 0.94 0.74 0.52
-3.07 -0.79 -0.86 -0.29 -0.24 -0.15 0.54 0.78 0.93 0.67 0.62 0.32 -4.33 -0.82 -0.73 -0.84 -1.22 0.16 -0.35 -0.6 -3.22 1.03 1.07 0.01 0.65 0.2
-0.67 -0.3 -0.05 -0.13 -0.0 -0.24 0.2 0.14 -0.05 0.23 0.17 0.05 -0.85 -0.02 -0.11 -0.05 0.06 0.29 0.07 0.13 -1.99 0.18 0.53 -0.12 0.65 0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.