Heatmap: Cluster_192 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.19 0.13 0.14 0.25 0.35 0.31 0.45 0.6 0.57 0.54 0.39 0.2 0.14 0.22 0.24 0.21 0.24 0.33 0.29 0.25 0.45 1.0 0.41 0.33 0.46 0.37
0.26 0.32 0.44 0.67 0.61 0.39 0.34 0.37 0.29 0.3 0.31 0.32 0.25 0.21 0.16 0.17 0.16 0.2 0.14 0.24 0.4 1.0 0.31 0.28 0.59 0.48
0.51 0.37 0.33 0.43 0.45 0.42 0.49 0.51 0.52 0.49 0.51 0.46 0.51 0.33 0.25 0.27 0.25 0.35 0.3 0.27 0.37 1.0 0.26 0.45 0.56 0.47
0.19 0.17 0.18 0.27 0.24 0.18 0.23 0.28 0.32 0.33 0.3 0.31 0.23 0.24 0.22 0.27 0.24 0.26 0.21 0.16 0.14 1.0 0.42 0.5 0.51 0.37
0.42 0.3 0.37 0.51 0.48 0.36 0.35 0.38 0.22 0.21 0.26 0.24 0.41 0.24 0.25 0.24 0.1 0.13 0.13 0.09 0.19 1.0 0.22 0.16 0.43 0.25
0.19 0.23 0.22 0.32 0.31 0.14 0.1 0.09 0.06 0.07 0.08 0.07 0.18 0.25 0.17 0.26 0.15 0.13 0.16 0.08 0.28 1.0 0.2 0.17 0.25 0.23
0.37 0.28 0.31 0.77 0.77 0.25 0.17 0.19 0.12 0.17 0.18 0.14 0.37 0.17 0.11 0.1 0.1 0.11 0.1 0.07 0.35 1.0 0.27 0.11 0.29 0.29
0.37 0.29 0.29 0.46 0.43 0.31 0.36 0.37 0.29 0.35 0.45 0.45 0.4 0.4 0.18 0.21 0.19 0.2 0.15 0.15 0.29 1.0 0.42 0.26 0.63 0.5
0.17 0.27 0.31 0.39 0.4 0.31 0.24 0.2 0.19 0.22 0.24 0.17 0.15 0.17 0.07 0.17 0.08 0.11 0.08 0.1 0.11 1.0 0.5 0.22 0.38 0.32
0.25 0.19 0.21 0.32 0.5 0.61 0.29 0.26 0.21 0.2 0.21 0.21 0.24 0.38 0.27 0.24 0.17 0.21 0.18 0.14 0.07 1.0 0.21 0.15 0.22 0.21
0.25 0.18 0.22 0.32 0.31 0.27 0.34 0.39 0.3 0.3 0.29 0.32 0.3 0.38 0.25 0.35 0.25 0.24 0.26 0.22 0.4 1.0 0.38 0.29 0.46 0.45
0.41 0.24 0.27 0.26 0.32 0.31 0.32 0.29 0.18 0.23 0.25 0.32 0.5 0.29 0.3 0.31 0.33 0.37 0.28 0.32 0.3 1.0 0.39 0.25 0.4 0.42
0.29 0.15 0.18 0.2 0.17 0.15 0.15 0.18 0.12 0.14 0.16 0.12 0.22 0.24 0.18 0.25 0.14 0.21 0.18 0.16 0.19 1.0 0.25 0.24 0.33 0.35
0.16 0.17 0.16 0.33 0.29 0.2 0.33 0.38 0.38 0.34 0.44 0.36 0.18 0.14 0.08 0.14 0.08 0.19 0.15 0.08 0.37 1.0 0.34 0.35 0.39 0.39
0.02 0.01 0.08 0.38 0.44 0.41 0.17 0.15 0.19 0.18 0.25 0.2 0.04 0.09 0.03 0.1 0.01 0.07 0.05 0.15 0.08 1.0 0.31 0.36 0.29 0.23
0.44 0.45 0.45 0.58 0.61 0.55 0.51 0.52 0.47 0.48 0.46 0.47 0.48 0.49 0.34 0.46 0.37 0.34 0.33 0.34 0.08 1.0 0.31 0.34 0.44 0.47
0.18 0.12 0.12 0.16 0.17 0.19 0.3 0.33 0.22 0.25 0.24 0.2 0.18 0.28 0.15 0.26 0.28 0.48 0.21 0.2 0.11 1.0 0.54 0.49 0.89 0.45
0.13 0.24 0.31 0.44 0.54 0.43 0.31 0.25 0.18 0.17 0.17 0.18 0.14 0.09 0.06 0.07 0.08 0.15 0.09 0.13 0.15 1.0 0.29 0.14 0.31 0.32
0.13 0.24 0.34 0.45 0.49 0.36 0.3 0.25 0.18 0.16 0.16 0.15 0.12 0.12 0.09 0.1 0.12 0.16 0.12 0.17 0.16 1.0 0.25 0.13 0.29 0.3
0.18 0.11 0.13 0.29 0.32 0.22 0.31 0.36 0.22 0.26 0.32 0.24 0.27 0.29 0.12 0.27 0.12 0.2 0.11 0.1 0.23 1.0 0.36 0.2 0.48 0.38
0.32 0.43 0.34 0.33 0.31 0.28 0.36 0.31 0.17 0.2 0.19 0.2 0.42 0.12 0.08 0.1 0.12 0.16 0.19 0.27 0.13 1.0 0.31 0.29 0.41 0.4
0.29 0.06 0.08 0.17 0.07 0.12 0.18 0.17 0.15 0.12 0.11 0.08 0.29 0.12 0.12 0.03 0.1 0.31 0.12 0.07 0.1 1.0 0.41 0.29 0.54 0.37
0.03 0.03 0.03 0.15 0.18 0.13 0.19 0.14 0.21 0.18 0.23 0.15 0.04 0.13 0.06 0.1 0.06 0.1 0.06 0.06 0.16 1.0 0.45 0.36 0.37 0.36
0.16 0.11 0.12 0.2 0.29 0.19 0.27 0.28 0.32 0.3 0.3 0.23 0.17 0.18 0.14 0.19 0.11 0.27 0.14 0.12 0.34 1.0 0.42 0.2 0.44 0.2
0.03 0.15 0.21 0.47 0.36 0.22 0.09 0.11 0.04 0.03 0.05 0.03 0.0 0.26 0.08 0.22 0.1 0.06 0.08 0.06 0.02 1.0 0.14 0.05 0.29 0.28
0.28 0.32 0.28 0.48 0.43 0.3 0.29 0.31 0.35 0.3 0.36 0.34 0.32 0.3 0.18 0.31 0.22 0.3 0.27 0.19 0.03 1.0 0.29 0.28 0.46 0.34
0.35 0.37 0.33 0.49 0.55 0.32 0.51 0.51 0.57 0.51 0.58 0.59 0.28 0.3 0.34 0.43 0.28 0.46 0.39 0.25 0.45 1.0 0.38 0.38 0.66 0.53
0.15 0.14 0.22 0.37 0.35 0.23 0.07 0.1 0.13 0.1 0.13 0.14 0.14 0.12 0.03 0.21 0.09 0.11 0.09 0.07 0.05 1.0 0.27 0.43 0.41 0.31
0.34 0.29 0.33 0.46 0.42 0.37 0.51 0.53 0.44 0.38 0.39 0.35 0.37 0.34 0.31 0.42 0.27 0.44 0.32 0.3 0.23 1.0 0.47 0.36 0.54 0.45
0.05 0.06 0.02 0.05 0.09 0.09 0.15 0.18 0.23 0.22 0.21 0.18 0.06 0.06 0.03 0.06 0.09 0.1 0.07 0.08 0.03 1.0 0.41 0.33 0.26 0.27
0.16 0.1 0.1 0.23 0.34 0.3 0.27 0.24 0.16 0.18 0.23 0.2 0.14 0.11 0.08 0.38 0.04 0.07 0.07 0.06 0.08 1.0 0.47 0.12 0.29 0.25
0.53 0.37 0.21 0.17 0.23 0.26 0.38 0.38 0.38 0.4 0.44 0.46 0.42 0.47 0.2 0.3 0.31 0.32 0.28 0.28 0.19 1.0 0.68 0.69 0.63 0.58
0.31 0.33 0.33 0.51 0.42 0.45 0.39 0.38 0.41 0.3 0.3 0.32 0.31 0.19 0.17 0.28 0.27 0.23 0.24 0.26 0.38 1.0 0.34 0.18 0.49 0.3
0.26 0.15 0.15 0.14 0.08 0.04 0.03 0.04 0.03 0.03 0.05 0.11 0.32 0.18 0.14 0.12 0.09 0.07 0.05 0.04 0.14 1.0 0.21 0.17 0.14 0.16
0.29 0.37 0.45 0.67 0.58 0.26 0.22 0.25 0.14 0.26 0.3 0.26 0.29 0.21 0.1 0.21 0.19 0.23 0.18 0.22 0.12 1.0 0.38 0.47 0.7 0.58
0.1 0.11 0.09 0.17 0.29 0.24 0.21 0.17 0.19 0.19 0.22 0.17 0.13 0.21 0.15 0.16 0.16 0.16 0.13 0.13 0.1 1.0 0.41 0.33 0.4 0.38
0.19 0.12 0.14 0.38 0.38 0.14 0.14 0.18 0.12 0.13 0.19 0.18 0.23 0.26 0.11 0.14 0.07 0.12 0.09 0.05 0.15 1.0 0.25 0.16 0.34 0.21
0.3 0.14 0.05 0.09 0.17 0.25 0.46 0.44 0.35 0.29 0.27 0.24 0.25 0.24 0.17 0.18 0.2 0.44 0.33 0.18 0.07 1.0 0.59 0.49 0.55 0.38
0.15 0.17 0.17 0.34 0.36 0.26 0.27 0.27 0.3 0.34 0.37 0.38 0.19 0.22 0.12 0.2 0.16 0.18 0.14 0.14 0.32 1.0 0.39 0.5 0.39 0.33
0.1 0.04 0.05 0.18 0.14 0.05 0.11 0.1 0.13 0.11 0.2 0.13 0.03 0.07 0.03 0.07 0.06 0.07 0.05 0.04 0.29 1.0 0.51 0.45 0.41 0.38
0.07 0.05 0.07 0.21 0.26 0.22 0.32 0.4 0.33 0.36 0.28 0.17 0.11 0.09 0.07 0.17 0.09 0.14 0.08 0.1 0.53 1.0 0.35 0.21 0.44 0.32
0.19 0.25 0.27 0.32 0.28 0.16 0.19 0.22 0.14 0.14 0.13 0.14 0.17 0.24 0.16 0.27 0.09 0.2 0.18 0.12 0.33 1.0 0.17 0.22 0.29 0.48
0.22 0.18 0.22 0.2 0.11 0.05 0.08 0.14 0.06 0.08 0.07 0.06 0.16 0.07 0.08 0.17 0.04 0.17 0.16 0.13 0.2 1.0 0.06 0.12 0.16 0.38
0.3 0.26 0.29 0.45 0.4 0.3 0.33 0.39 0.28 0.29 0.3 0.29 0.3 0.29 0.28 0.31 0.22 0.32 0.24 0.21 0.25 1.0 0.39 0.31 0.48 0.44
0.28 0.19 0.13 0.28 0.16 0.1 0.13 0.16 0.14 0.17 0.31 0.36 0.29 0.2 0.14 0.15 0.14 0.1 0.11 0.09 0.17 1.0 0.39 0.42 0.29 0.21
0.28 0.18 0.16 0.26 0.23 0.12 0.12 0.14 0.12 0.15 0.24 0.25 0.31 0.1 0.04 0.09 0.09 0.12 0.08 0.09 0.12 1.0 0.21 0.25 0.3 0.23
0.33 0.2 0.21 0.27 0.27 0.24 0.36 0.36 0.2 0.19 0.17 0.14 0.29 0.33 0.29 0.35 0.18 0.44 0.27 0.23 0.14 1.0 0.39 0.26 0.55 0.41
0.26 0.21 0.17 0.36 0.44 0.32 0.29 0.28 0.12 0.11 0.11 0.08 0.22 0.05 0.05 0.06 0.1 0.17 0.12 0.13 0.01 1.0 0.04 0.08 0.18 0.11
0.22 0.14 0.19 0.32 0.31 0.21 0.29 0.31 0.28 0.26 0.32 0.29 0.23 0.18 0.16 0.22 0.13 0.25 0.21 0.11 0.37 1.0 0.5 0.3 0.43 0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)