Heatmap: Cluster_209 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.22 0.44 0.34 0.37 0.58 0.61 0.66 0.66 1.0 0.56 0.48 0.42 0.12 0.11 0.19 0.14 0.19 0.53 0.44 0.33 0.03 0.11 0.45 0.51 0.46 0.36
0.34 0.36 0.48 0.55 0.62 0.65 0.73 0.72 0.8 0.91 0.74 0.57 0.32 0.36 0.46 0.75 0.46 1.0 0.6 0.48 0.03 0.31 0.62 0.39 0.68 0.61
0.21 0.39 0.59 0.58 0.57 0.55 0.47 0.46 0.41 0.46 0.45 0.5 0.38 0.4 0.31 0.35 1.0 0.33 0.3 0.32 0.19 0.33 0.85 0.46 0.7 0.59
0.46 0.55 0.55 0.68 0.66 0.73 0.8 0.72 0.72 0.65 0.57 0.54 0.42 0.6 0.61 0.61 0.53 1.0 0.73 0.58 0.09 0.35 0.75 0.53 0.83 0.72
0.1 0.58 0.58 0.73 0.89 0.88 1.0 0.89 1.0 0.91 0.81 0.58 0.05 0.28 0.37 0.25 0.42 0.66 0.61 0.43 0.03 0.31 0.79 0.6 0.86 0.59
0.44 0.36 0.36 0.45 0.57 0.67 0.71 0.64 0.54 0.42 0.38 0.34 0.39 0.4 0.35 0.46 0.27 0.48 0.4 0.37 0.19 0.24 1.0 0.79 0.67 0.65
0.27 0.33 0.37 0.48 0.48 0.47 0.45 0.46 0.46 0.45 0.5 0.55 0.25 0.3 0.28 0.28 0.3 0.47 0.42 0.36 0.34 0.2 1.0 0.49 0.6 0.43
0.32 0.37 0.32 0.41 0.3 0.3 0.4 0.44 0.73 0.73 0.64 0.58 0.29 0.39 0.22 0.32 0.32 0.8 0.38 0.38 0.12 0.56 1.0 0.69 0.82 0.54
0.23 0.34 0.48 0.57 0.69 0.62 0.74 0.86 0.88 1.0 0.94 0.96 0.18 0.4 0.55 0.56 0.57 0.74 0.48 0.52 0.09 0.19 0.74 0.69 0.93 0.7
0.17 0.39 0.48 0.55 0.71 0.68 0.7 0.59 0.73 0.62 0.69 0.7 0.22 0.64 0.64 0.59 0.55 0.63 0.66 0.46 0.36 0.63 1.0 0.87 0.81 0.73
0.35 0.53 0.59 0.72 0.71 0.7 0.6 0.61 0.5 0.67 0.81 0.87 0.4 0.28 0.54 0.24 0.43 0.72 0.56 0.56 0.05 0.72 0.81 0.9 1.0 0.8
0.27 0.36 0.51 0.59 0.53 0.43 0.62 0.68 0.69 0.74 0.86 0.63 0.15 0.52 0.49 0.51 0.5 0.65 0.67 0.53 0.06 0.51 1.0 0.79 0.8 0.88
0.13 0.34 0.33 0.42 0.4 0.48 0.56 0.59 0.76 0.71 0.62 0.53 0.08 0.33 0.34 0.38 0.56 0.59 0.53 0.47 0.19 0.06 1.0 0.71 0.9 0.82
0.18 0.28 0.32 0.43 0.49 0.42 0.55 0.62 0.7 0.55 0.59 0.51 0.2 0.31 0.31 0.25 0.3 0.63 0.49 0.38 0.1 0.21 0.92 0.41 1.0 0.6
0.14 0.18 0.45 0.47 0.62 0.65 0.73 0.61 0.67 0.67 0.57 0.48 0.19 0.48 0.31 0.45 0.42 0.59 0.5 0.45 0.3 0.45 0.98 0.64 1.0 0.56
0.33 0.57 0.46 0.64 0.94 0.72 0.86 0.78 0.94 0.88 0.77 0.62 0.26 0.47 0.6 0.53 0.59 0.77 0.89 0.73 0.29 0.47 1.0 0.68 0.68 0.69
0.47 0.53 0.5 0.56 0.68 0.6 0.69 0.78 0.65 0.63 0.61 0.6 0.46 0.6 0.64 0.6 0.57 0.76 0.72 0.64 0.17 0.45 0.96 1.0 0.92 0.88
0.13 0.33 0.39 0.65 0.63 0.5 0.57 0.58 0.63 0.75 1.0 0.85 0.06 0.57 0.25 0.56 0.33 0.39 0.32 0.18 0.1 0.34 0.77 0.45 0.91 0.46
0.28 0.31 0.38 0.47 0.67 0.76 0.7 0.61 0.59 0.46 0.51 0.47 0.28 0.3 0.33 0.45 0.32 0.31 0.35 0.29 0.15 0.25 1.0 0.47 0.94 0.49
0.45 0.57 0.48 0.53 0.48 0.54 0.66 0.65 0.9 0.75 0.73 0.65 0.48 0.68 0.62 0.56 0.5 0.94 0.68 0.44 0.21 0.74 0.83 0.82 1.0 0.66
0.18 0.14 0.19 0.32 0.44 0.6 0.74 0.63 0.69 0.54 0.58 0.5 0.19 0.37 0.42 0.35 0.38 0.43 0.41 0.4 0.3 0.39 1.0 0.74 0.64 0.55
0.26 0.3 0.54 0.68 0.58 0.57 0.51 0.57 0.59 0.68 0.69 0.76 0.36 0.43 0.44 0.38 0.45 0.66 0.61 0.56 0.2 0.48 0.94 0.82 0.91 1.0
0.38 0.4 0.42 0.56 0.62 0.75 0.82 0.78 0.93 0.72 0.84 0.78 0.36 0.28 0.34 0.28 0.54 0.54 0.46 0.39 0.06 0.35 0.87 0.6 1.0 0.91
0.09 0.59 0.62 0.74 0.53 0.64 0.67 0.71 0.92 0.89 0.81 0.89 0.14 0.54 0.59 0.7 0.5 0.66 0.6 0.46 0.11 0.15 0.73 0.89 1.0 0.76
0.24 0.43 0.42 0.55 0.65 0.83 0.74 0.77 0.86 0.8 0.85 0.72 0.29 0.49 0.45 0.44 0.36 0.63 0.64 0.53 0.45 0.42 1.0 0.52 0.69 0.64
0.18 0.2 0.23 0.36 0.39 0.44 0.45 0.48 0.73 0.65 0.7 0.55 0.23 0.22 0.09 0.15 0.25 0.18 0.16 0.21 0.17 0.43 1.0 0.6 0.75 0.59
0.16 0.39 0.34 0.63 0.77 0.64 0.62 0.78 0.72 0.62 0.7 0.45 0.25 0.28 0.29 0.27 0.27 0.5 0.46 0.46 0.06 0.1 0.96 0.52 1.0 0.6
0.26 0.56 0.53 0.64 0.76 0.75 0.81 0.89 0.78 0.96 0.99 0.89 0.24 0.53 0.36 0.53 0.48 0.78 0.43 0.34 0.09 0.33 0.71 0.51 1.0 0.63
0.07 0.15 0.33 0.59 0.47 0.41 0.45 0.49 0.47 0.46 0.5 0.58 0.1 0.24 0.26 0.23 0.29 0.34 0.36 0.35 0.13 0.2 1.0 0.47 0.91 0.69
0.18 0.47 0.36 0.53 0.61 0.62 1.0 0.95 0.75 0.86 0.89 0.7 0.08 0.35 0.36 0.4 0.35 0.95 0.64 0.68 0.01 0.67 0.5 0.51 0.86 0.67
0.2 0.49 0.75 0.6 0.5 0.51 0.46 0.63 0.86 0.74 0.75 0.78 0.24 0.62 0.5 0.69 0.6 0.51 0.48 0.61 0.04 0.25 0.59 0.8 0.62 1.0
0.4 0.34 0.41 0.53 0.44 0.3 0.42 0.37 0.45 0.51 0.56 0.58 0.41 0.55 0.56 0.4 0.4 0.73 0.62 0.38 0.25 0.4 0.75 0.57 0.93 1.0
0.09 0.16 0.2 0.22 0.33 0.39 0.47 0.4 0.5 0.5 0.47 0.45 0.09 0.29 0.23 0.26 0.42 0.59 0.53 0.41 0.28 0.32 1.0 0.94 0.68 0.56
0.09 0.24 0.21 0.33 0.51 0.67 0.62 0.69 1.0 0.88 0.84 0.74 0.03 0.19 0.29 0.16 0.33 0.54 0.54 0.36 0.35 0.34 0.85 0.59 0.6 0.47
0.23 0.29 0.36 0.57 0.66 0.56 0.54 0.49 0.55 0.68 0.68 0.72 0.16 0.3 0.34 0.32 0.49 0.59 0.46 0.43 0.16 0.13 1.0 0.72 0.89 0.82
0.37 0.51 0.55 0.58 0.62 0.6 0.7 0.72 0.77 0.87 0.83 0.75 0.36 0.37 0.49 0.25 0.49 0.56 0.56 0.69 0.26 0.39 1.0 0.74 0.88 0.81
0.37 0.57 0.45 0.54 0.58 0.4 0.57 0.55 0.78 0.76 0.81 0.82 0.32 0.54 0.59 0.49 0.46 1.0 0.75 0.53 0.04 0.57 0.71 0.81 1.0 0.62
0.18 0.47 0.53 0.61 0.64 0.62 0.61 0.61 0.7 0.73 0.77 0.62 0.24 0.23 0.33 0.35 0.47 0.66 0.66 0.59 0.02 0.42 0.88 0.7 1.0 0.49
0.46 0.5 0.62 0.66 0.69 0.64 0.59 0.61 0.6 0.62 0.62 0.61 0.52 0.43 0.44 0.45 0.53 0.51 0.42 0.51 0.32 0.45 1.0 0.62 0.74 0.73
0.2 0.29 0.29 0.44 0.55 0.49 0.67 0.74 0.76 0.86 0.91 0.79 0.29 0.4 0.33 0.38 0.31 0.85 0.58 0.51 0.23 0.75 0.69 0.6 1.0 0.6
0.05 0.36 0.39 0.66 0.66 0.61 0.68 0.82 0.89 0.84 0.98 0.91 0.08 0.25 0.32 0.27 0.46 0.64 0.56 0.51 0.04 0.46 0.93 0.76 1.0 0.51
0.42 0.58 0.76 0.82 0.88 0.72 0.92 0.97 0.99 1.0 0.97 0.88 0.51 0.58 0.63 0.62 0.73 0.83 0.68 0.74 0.24 0.42 0.72 0.54 0.77 0.64
0.24 0.27 0.25 0.22 0.22 0.26 0.32 0.35 0.39 0.45 0.41 0.42 0.28 0.3 0.32 0.24 0.29 0.62 0.48 0.45 0.42 0.4 1.0 0.59 0.53 0.56
0.7 0.65 0.58 0.55 0.52 0.52 0.77 0.69 0.79 0.82 0.85 0.66 0.56 0.59 0.61 0.59 0.66 0.68 0.69 0.67 0.21 0.45 1.0 0.99 1.0 0.84
0.09 0.34 0.25 0.38 0.5 0.51 0.4 0.4 0.76 0.57 0.53 0.48 0.06 0.13 0.1 0.04 0.16 0.27 0.28 0.31 0.18 0.23 1.0 0.41 0.62 0.49
0.03 0.36 0.38 0.59 0.33 0.31 0.52 0.71 0.71 0.62 0.77 0.65 0.02 0.26 0.3 0.26 0.28 0.52 0.55 0.45 0.01 0.37 0.7 1.0 0.57 0.72
0.46 0.35 0.34 0.55 0.56 0.49 0.64 0.61 0.66 0.84 0.91 0.89 0.47 0.45 0.46 0.31 0.42 0.55 0.67 0.5 0.02 0.65 0.94 1.0 0.81 0.71
0.06 0.24 0.41 0.69 0.53 0.37 0.47 0.56 0.63 0.64 0.6 0.55 0.05 0.26 0.31 0.34 0.32 0.57 0.49 0.41 0.03 0.19 0.64 0.71 1.0 0.63
0.22 0.36 0.44 0.66 0.71 0.46 0.57 0.71 0.65 0.64 1.0 0.51 0.21 0.46 0.24 0.34 0.22 0.48 0.23 0.26 0.18 0.25 0.5 0.45 0.74 0.62
0.44 0.41 0.39 0.43 0.64 0.63 0.6 0.54 0.64 0.81 0.86 0.84 0.58 0.69 0.31 0.53 1.0 0.48 0.61 0.42 0.09 0.32 0.91 0.51 0.98 0.89
0.52 0.51 0.47 0.64 0.83 0.71 0.83 0.75 0.98 0.96 1.0 0.96 0.45 0.62 0.81 0.63 0.61 1.0 0.69 0.58 0.05 0.66 0.92 0.75 1.0 0.85
0.02 0.16 0.23 0.42 0.59 0.49 0.65 0.59 0.74 0.77 0.65 0.51 0.02 0.33 0.24 0.25 0.4 0.77 0.63 0.49 0.18 0.29 0.95 1.0 0.78 0.72
0.1 0.25 0.32 0.75 0.82 0.54 0.52 0.64 0.89 0.82 0.84 0.63 0.11 0.27 0.25 0.18 0.23 0.44 0.37 0.23 0.03 0.28 0.77 1.0 0.72 0.84
0.09 0.38 0.36 0.51 0.6 0.6 0.54 0.67 0.67 0.51 0.6 0.55 0.05 0.4 0.37 0.42 0.39 0.66 0.49 0.31 0.13 0.33 0.9 0.7 1.0 0.68
0.34 0.52 0.52 0.49 0.59 0.48 0.67 0.52 0.68 0.71 0.62 0.41 0.27 0.46 0.41 0.41 0.47 0.63 0.64 0.52 0.01 0.35 0.78 1.0 0.7 0.87
0.12 0.59 0.6 0.87 0.95 0.83 0.87 0.96 0.92 0.91 0.94 0.87 0.1 0.47 0.75 0.52 0.44 0.6 0.64 0.57 0.01 0.41 0.77 0.5 1.0 0.77
0.35 0.46 0.45 0.66 0.7 0.56 0.8 0.79 0.97 1.0 0.96 0.73 0.29 0.55 0.39 0.64 0.56 0.74 0.54 0.53 0.12 0.3 0.69 0.56 0.69 0.57

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)