Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.43 0.22 0.18 0.24 0.13 0.08 0.12 0.15 0.13 0.13 0.26 0.37 0.5 0.14 0.07 0.08 0.09 0.21 0.11 0.06 0.32 1.0 0.52 0.4 0.61 0.35
0.26 0.26 0.25 0.21 0.16 0.12 0.21 0.22 0.19 0.24 0.23 0.22 0.31 0.38 0.42 0.44 0.28 0.39 0.33 0.22 0.35 1.0 0.37 0.31 0.29 0.37
0.23 0.31 0.28 0.35 0.26 0.16 0.2 0.3 0.29 0.28 0.34 0.28 0.34 0.61 0.51 0.84 0.19 0.66 0.35 0.08 0.19 1.0 0.35 0.36 0.46 0.28
0.37 0.32 0.22 0.26 0.27 0.17 0.26 0.23 0.21 0.29 0.29 0.28 0.33 0.31 0.28 0.28 0.26 0.38 0.3 0.22 1.0 0.51 0.29 0.26 0.39 0.33
0.25 0.21 0.18 0.17 0.15 0.09 0.19 0.17 0.14 0.21 0.19 0.19 0.2 0.24 0.25 0.28 0.22 0.29 0.33 0.19 1.0 0.63 0.32 0.22 0.45 0.27
0.22 0.16 0.13 0.13 0.11 0.07 0.15 0.14 0.1 0.19 0.16 0.15 0.15 0.24 0.26 0.27 0.26 0.3 0.3 0.18 1.0 0.51 0.26 0.22 0.39 0.27
0.14 0.11 0.09 0.08 0.07 0.05 0.09 0.09 0.07 0.12 0.09 0.1 0.09 0.2 0.21 0.21 0.21 0.24 0.22 0.15 1.0 0.54 0.26 0.21 0.35 0.25
0.17 0.12 0.11 0.1 0.09 0.05 0.1 0.1 0.06 0.13 0.11 0.12 0.11 0.24 0.23 0.23 0.25 0.29 0.23 0.18 1.0 0.54 0.25 0.18 0.41 0.28
0.22 0.18 0.16 0.13 0.11 0.08 0.13 0.14 0.11 0.16 0.14 0.15 0.14 0.31 0.36 0.31 0.33 0.26 0.27 0.24 1.0 0.6 0.31 0.28 0.52 0.31
0.24 0.22 0.17 0.12 0.13 0.12 0.14 0.17 0.11 0.14 0.16 0.18 0.16 0.31 0.38 0.34 0.29 0.23 0.26 0.3 1.0 0.6 0.24 0.2 0.45 0.33
0.29 0.17 0.22 0.13 0.17 0.14 0.18 0.17 0.13 0.17 0.14 0.17 0.16 0.32 0.42 0.36 0.35 0.23 0.24 0.29 1.0 0.7 0.32 0.24 0.53 0.4
0.38 0.33 0.3 0.27 0.23 0.22 0.23 0.25 0.22 0.28 0.22 0.29 0.26 0.48 0.51 0.42 0.44 0.26 0.33 0.38 1.0 0.67 0.35 0.36 0.61 0.35
0.3 0.28 0.21 0.19 0.18 0.17 0.18 0.17 0.15 0.19 0.16 0.22 0.18 0.32 0.38 0.27 0.34 0.14 0.2 0.28 1.0 0.78 0.36 0.24 0.67 0.39
0.32 0.29 0.25 0.21 0.2 0.17 0.22 0.22 0.19 0.21 0.18 0.24 0.23 0.44 0.48 0.35 0.42 0.24 0.27 0.34 1.0 0.76 0.35 0.28 0.57 0.38
0.44 0.37 0.34 0.28 0.24 0.19 0.29 0.3 0.21 0.24 0.29 0.36 0.4 0.58 0.64 0.5 0.58 0.32 0.32 0.5 1.0 0.6 0.29 0.23 0.54 0.36
0.03 0.02 0.04 0.06 0.08 0.06 0.08 0.04 0.04 0.1 0.07 0.07 0.05 0.4 0.47 1.0 0.86 0.79 0.53 0.35 0.55 1.0 0.12 0.26 0.7 0.48
0.07 0.06 0.08 0.1 0.12 0.11 0.1 0.08 0.09 0.13 0.14 0.12 0.06 0.51 0.58 1.0 0.69 0.56 0.37 0.23 0.56 0.99 0.16 0.41 0.73 0.51
0.21 0.19 0.18 0.26 0.29 0.23 0.29 0.28 0.34 0.39 0.42 0.37 0.25 0.62 0.59 0.66 0.37 0.59 0.38 0.27 0.31 1.0 0.4 0.51 0.41 0.41
0.51 0.57 0.54 0.58 0.48 0.38 0.4 0.49 0.41 0.38 0.37 0.37 0.45 0.31 0.59 0.47 0.33 0.66 0.57 0.32 0.6 1.0 0.66 0.45 0.5 0.42
0.51 0.2 0.14 0.16 0.1 0.07 0.11 0.14 0.13 0.19 0.34 0.45 0.56 0.07 0.13 0.06 0.12 0.21 0.08 0.15 0.54 1.0 0.41 0.49 0.5 0.45
0.34 0.43 0.42 0.34 0.2 0.14 0.2 0.29 0.28 0.31 0.35 0.34 0.43 0.32 0.52 0.41 0.27 0.48 0.58 0.26 0.37 1.0 0.44 0.33 0.34 0.41
0.48 0.64 0.58 0.5 0.27 0.21 0.32 0.36 0.39 0.4 0.41 0.53 0.63 0.34 0.61 0.53 0.31 0.57 0.54 0.28 0.57 1.0 0.46 0.39 0.43 0.45
0.23 0.29 0.31 0.25 0.14 0.08 0.16 0.21 0.2 0.28 0.25 0.21 0.33 0.41 0.58 0.55 0.38 0.62 0.54 0.28 0.64 1.0 0.63 0.4 0.49 0.49
0.28 0.16 0.15 0.15 0.18 0.23 0.31 0.31 0.3 0.21 0.18 0.18 0.34 0.28 0.3 0.68 0.22 0.39 0.3 0.16 0.55 1.0 0.42 0.23 0.56 0.29
0.51 0.4 0.3 0.36 0.34 0.15 0.18 0.25 0.17 0.27 0.31 0.33 0.7 0.38 0.58 0.53 0.27 0.54 0.24 0.29 0.68 1.0 0.54 0.58 0.5 0.4
0.74 0.61 0.46 0.55 0.53 0.29 0.38 0.39 0.33 0.37 0.47 0.38 1.0 0.75 0.94 1.0 0.38 0.73 0.51 0.27 0.83 0.97 0.51 0.66 0.75 0.51
0.34 0.36 0.35 0.3 0.21 0.19 0.26 0.27 0.15 0.18 0.17 0.16 0.31 0.61 0.36 0.47 0.27 0.29 0.28 0.28 1.0 0.78 0.56 0.3 0.52 0.52
0.4 0.3 0.17 0.28 0.18 0.19 0.29 0.32 0.04 0.02 0.02 0.02 0.18 0.77 0.58 0.84 0.33 0.34 0.37 0.34 0.26 1.0 0.11 0.12 0.48 0.63
0.17 0.16 0.17 0.18 0.17 0.13 0.2 0.19 0.19 0.18 0.19 0.16 0.18 0.27 0.41 0.27 0.4 0.48 0.32 0.21 0.44 1.0 0.46 0.36 0.57 0.35
0.55 0.35 0.27 0.3 0.36 0.32 0.3 0.28 0.23 0.19 0.2 0.24 0.52 0.3 0.3 0.42 0.2 0.4 0.33 0.16 0.49 1.0 0.39 0.32 0.57 0.34
0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.03 0.28 0.34 0.38 0.1 0.29 0.31 0.18 0.38 0.94 0.16 0.16 1.0 0.94
0.2 0.24 0.26 0.35 0.3 0.22 0.24 0.26 0.13 0.12 0.13 0.12 0.26 0.25 0.34 0.31 0.15 0.35 0.31 0.11 0.53 1.0 0.3 0.2 0.5 0.38
0.18 0.22 0.27 0.27 0.21 0.11 0.21 0.2 0.1 0.12 0.1 0.07 0.15 0.34 0.47 0.5 0.23 0.47 0.34 0.14 0.61 1.0 0.32 0.28 0.51 0.46
0.17 0.14 0.14 0.18 0.21 0.27 0.3 0.28 0.32 0.22 0.21 0.15 0.11 0.18 0.18 0.22 0.19 0.34 0.32 0.2 0.44 1.0 0.32 0.19 0.43 0.31
0.33 0.28 0.24 0.32 0.38 0.27 0.36 0.42 0.45 0.35 0.46 0.35 0.3 0.46 0.68 0.55 0.4 0.74 0.68 0.32 0.59 1.0 0.83 0.79 0.49 0.54
0.42 0.34 0.38 0.4 0.36 0.26 0.34 0.38 0.29 0.35 0.33 0.32 0.41 0.55 0.65 0.61 0.45 0.73 0.6 0.39 0.53 1.0 0.5 0.41 0.42 0.49
0.54 0.3 0.26 0.18 0.07 0.04 0.11 0.15 0.07 0.11 0.12 0.16 0.53 0.69 0.64 0.88 0.45 0.63 0.51 0.44 0.6 1.0 0.27 0.4 0.7 0.68
0.38 0.16 0.13 0.33 0.2 0.11 0.21 0.22 0.19 0.29 0.41 0.5 0.41 0.16 0.1 0.09 0.19 0.19 0.14 0.12 1.0 0.9 0.53 0.39 0.6 0.41
0.21 0.2 0.25 0.29 0.28 0.22 0.26 0.25 0.19 0.21 0.19 0.2 0.26 0.46 0.51 0.6 0.37 0.43 0.46 0.27 0.34 1.0 0.46 0.33 0.31 0.37
0.41 0.19 0.11 0.1 0.12 0.15 0.26 0.26 0.18 0.15 0.13 0.12 0.37 0.3 0.36 0.3 0.2 0.5 0.43 0.14 0.46 1.0 0.32 0.23 0.34 0.26
0.11 0.2 0.13 0.16 0.2 0.17 0.17 0.18 0.19 0.17 0.15 0.11 0.11 0.23 0.28 0.36 0.13 0.46 0.31 0.12 0.36 1.0 0.24 0.2 0.2 0.26
0.41 0.34 0.34 0.38 0.41 0.42 0.39 0.4 0.42 0.42 0.43 0.44 0.38 0.56 0.53 1.0 0.44 0.36 0.41 0.38 0.81 0.78 0.66 0.57 0.63 0.61
0.32 0.28 0.21 0.27 0.26 0.21 0.29 0.33 0.28 0.33 0.31 0.34 0.26 0.42 0.57 0.38 0.25 0.49 0.28 0.24 0.3 1.0 0.33 0.33 0.43 0.34
0.65 0.41 0.4 0.75 0.67 0.39 0.48 0.61 0.5 0.62 0.78 0.67 0.75 0.4 0.24 0.36 0.43 0.32 0.19 0.2 0.95 1.0 0.69 0.62 0.8 0.65
0.24 0.25 0.38 0.34 0.16 0.08 0.16 0.22 0.16 0.21 0.25 0.29 0.33 0.73 0.63 0.72 0.24 0.33 0.22 0.18 1.0 0.36 0.51 0.48 0.49 0.49
0.05 0.13 0.16 0.14 0.1 0.07 0.14 0.19 0.18 0.22 0.23 0.24 0.08 0.39 0.5 0.54 0.3 0.52 0.39 0.19 0.47 1.0 0.59 0.3 0.36 0.27
0.18 0.11 0.15 0.13 0.1 0.13 0.12 0.13 0.11 0.07 0.06 0.06 0.13 0.65 0.44 0.61 0.29 0.34 0.39 0.36 0.18 1.0 0.07 0.26 0.5 0.65
0.36 0.35 0.3 0.39 0.22 0.12 0.15 0.16 0.15 0.22 0.33 0.34 0.47 0.21 0.21 0.19 0.26 0.44 0.16 0.17 0.58 1.0 0.38 0.62 0.72 0.5
0.39 0.3 0.31 0.37 0.22 0.08 0.13 0.15 0.13 0.19 0.31 0.31 0.39 0.22 0.2 0.21 0.28 0.33 0.15 0.15 0.45 1.0 0.4 0.47 0.39 0.38
0.29 0.29 0.25 0.33 0.32 0.23 0.26 0.31 0.4 0.34 0.33 0.33 0.27 0.38 0.45 0.38 0.24 0.69 0.41 0.2 0.48 1.0 0.41 0.34 0.5 0.36
0.53 0.41 0.38 0.38 0.32 0.21 0.26 0.26 0.26 0.28 0.32 0.35 0.51 0.61 0.48 0.63 0.4 0.46 0.45 0.29 0.75 1.0 0.58 0.55 0.64 0.55
0.41 0.2 0.14 0.42 0.35 0.23 0.28 0.51 0.37 0.39 0.4 0.25 0.28 0.2 0.11 0.13 0.06 0.26 0.11 0.06 0.74 1.0 0.51 0.44 0.69 0.42
0.43 0.2 0.17 0.3 0.28 0.18 0.28 0.33 0.25 0.35 0.42 0.58 0.49 0.17 0.14 0.19 0.15 0.16 0.14 0.17 0.6 1.0 0.32 0.42 0.49 0.34
0.44 0.21 0.19 0.26 0.23 0.18 0.29 0.28 0.21 0.3 0.42 0.54 0.47 0.2 0.19 0.22 0.17 0.23 0.17 0.19 0.66 1.0 0.37 0.39 0.43 0.51
0.41 0.19 0.2 0.25 0.23 0.16 0.26 0.31 0.21 0.32 0.43 0.53 0.49 0.19 0.17 0.25 0.19 0.2 0.17 0.17 0.73 1.0 0.41 0.4 0.51 0.5
0.58 0.36 0.37 0.52 0.43 0.23 0.35 0.42 0.31 0.39 0.52 0.56 0.48 0.4 0.26 0.29 0.3 0.23 0.25 0.22 0.78 1.0 0.48 0.41 0.55 0.47
0.28 0.17 0.16 0.18 0.18 0.1 0.14 0.19 0.13 0.21 0.24 0.22 0.16 0.39 0.2 0.32 0.34 0.34 0.29 0.2 0.96 1.0 0.45 0.35 0.43 0.43
0.21 0.19 0.23 0.25 0.34 0.35 0.37 0.37 0.23 0.19 0.18 0.18 0.2 0.4 0.41 0.48 0.32 0.42 0.4 0.28 0.4 1.0 0.27 0.18 0.37 0.27
0.15 0.12 0.15 0.16 0.23 0.26 0.27 0.25 0.17 0.13 0.14 0.1 0.1 0.25 0.28 0.35 0.22 0.29 0.35 0.17 0.36 1.0 0.3 0.27 0.33 0.32

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)