Heatmap: Cluster_68 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.24 0.44 0.58 0.63 0.55 0.43 0.48 0.45 0.23 0.25 0.19 0.17 0.12 0.21 0.22 0.24 0.36 0.49 0.47 0.52 0.01 0.17 0.17 0.26 0.74 1.0
0.33 0.5 0.78 0.78 0.53 0.39 0.48 0.57 0.27 0.26 0.22 0.21 0.27 0.61 0.52 0.68 0.39 0.51 0.43 0.44 0.03 0.24 0.12 0.14 1.0 0.93
0.1 0.21 0.55 0.67 0.36 0.16 0.09 0.18 0.0 0.01 0.01 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.2 0.0 0.04 1.0 0.78
0.12 0.19 0.43 0.37 0.15 0.1 0.14 0.23 0.07 0.08 0.07 0.07 0.14 0.05 0.06 0.05 0.07 0.07 0.05 0.1 0.01 0.05 0.05 0.05 0.87 1.0
0.03 0.03 0.56 0.38 0.08 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.28
0.07 0.04 0.84 0.72 0.13 0.02 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.04 1.0 0.65
0.17 0.48 0.63 0.59 0.43 0.32 0.52 0.61 0.26 0.37 0.39 0.49 0.36 0.16 0.18 0.12 0.17 0.28 0.28 0.55 0.01 0.07 0.21 0.28 0.81 1.0
0.29 0.38 0.59 0.93 0.66 0.3 0.33 0.55 0.14 0.24 0.36 0.31 0.25 0.02 0.04 0.01 0.05 0.16 0.2 0.3 0.01 0.03 0.02 0.19 1.0 1.0
0.53 0.41 0.63 0.6 0.33 0.21 0.45 0.51 0.27 0.24 0.24 0.24 0.42 0.3 0.28 0.33 0.38 0.53 0.43 0.51 0.03 0.26 0.17 0.34 0.83 1.0
0.61 0.62 0.74 0.88 0.62 0.38 0.49 0.59 0.31 0.29 0.35 0.41 0.41 0.34 0.36 0.31 0.38 0.36 0.32 0.47 0.1 0.08 0.28 0.36 1.0 1.0
0.43 0.61 0.7 0.67 0.45 0.37 0.49 0.5 0.28 0.37 0.32 0.31 0.51 0.16 0.14 0.15 0.2 0.29 0.24 0.51 0.19 0.05 0.34 0.37 0.87 1.0
0.3 0.36 1.0 0.86 0.34 0.11 0.09 0.24 0.01 0.02 0.02 0.03 0.23 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.07 0.0 0.08 0.01 0.01 0.69 0.9
0.24 0.51 0.56 0.51 0.19 0.08 0.2 0.41 0.01 0.05 0.07 0.07 0.17 0.01 0.05 0.01 0.01 0.03 0.05 0.17 0.14 0.2 0.05 0.11 0.99 1.0
0.41 0.54 0.74 0.84 0.65 0.43 0.33 0.39 0.27 0.15 0.16 0.15 0.29 0.16 0.16 0.15 0.2 0.29 0.26 0.37 0.05 0.23 0.21 0.19 1.0 0.95
0.17 0.27 0.49 0.66 0.37 0.28 0.3 0.37 0.21 0.16 0.18 0.17 0.16 0.12 0.08 0.14 0.08 0.11 0.1 0.12 0.05 0.64 0.16 0.15 0.81 1.0
0.07 0.12 0.41 0.49 0.33 0.26 0.26 0.35 0.33 0.25 0.21 0.12 0.06 0.22 0.2 0.29 0.21 0.34 0.22 0.21 0.17 0.21 0.34 0.21 1.0 0.71
0.09 0.48 0.57 0.63 0.55 0.52 0.64 0.48 0.54 0.3 0.19 0.17 0.07 0.37 0.35 0.39 0.31 0.39 0.31 0.34 0.12 0.38 0.34 0.28 0.97 1.0
0.37 0.37 0.75 0.94 0.57 0.31 0.38 0.57 0.11 0.02 0.03 0.04 0.16 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.14 0.0 0.04 0.91 1.0
0.3 0.36 0.43 0.43 0.29 0.26 0.33 0.37 0.18 0.18 0.17 0.17 0.3 0.28 0.26 0.32 0.22 0.31 0.3 0.26 0.31 0.13 0.18 0.15 1.0 0.85
0.39 0.32 0.56 0.66 0.3 0.15 0.28 0.41 0.25 0.3 0.33 0.35 0.41 0.23 0.32 0.27 0.31 0.47 0.37 0.55 0.26 0.21 0.41 0.46 0.81 1.0
0.63 0.44 0.69 0.82 0.45 0.27 0.33 0.63 0.33 0.21 0.27 0.35 0.6 0.54 0.37 0.42 0.29 0.21 0.33 0.66 0.03 0.14 0.08 0.18 0.96 1.0
0.31 0.44 0.62 0.73 0.68 0.52 0.48 0.48 0.3 0.23 0.17 0.17 0.31 0.17 0.16 0.17 0.15 0.21 0.19 0.39 0.05 0.06 0.16 0.2 0.69 1.0
0.55 0.48 0.44 0.48 0.42 0.5 0.53 0.54 0.57 0.29 0.31 0.26 0.48 0.36 0.36 0.32 0.35 0.55 0.43 0.42 0.39 0.22 0.51 0.4 0.93 1.0
0.24 0.16 0.39 0.44 0.24 0.07 0.14 0.23 0.03 0.02 0.1 0.09 0.16 0.1 0.04 0.04 0.03 0.05 0.04 0.04 0.0 0.17 0.16 0.25 1.0 0.63
0.28 0.04 0.13 0.57 0.36 0.02 0.1 0.26 0.04 0.02 0.08 0.07 0.03 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.23 0.19 0.8 1.0 0.77
0.04 0.12 0.88 0.61 0.22 0.05 0.03 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.13 0.0 0.0 0.58 1.0
0.1 0.26 0.56 0.8 0.53 0.25 0.22 0.29 0.04 0.04 0.04 0.04 0.06 0.04 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.07 0.02 0.49 0.02 0.06 1.0 0.99
0.07 0.12 0.53 0.6 0.52 0.42 0.33 0.39 0.24 0.18 0.15 0.12 0.06 0.09 0.16 0.15 0.19 0.33 0.32 0.4 0.03 0.61 0.09 0.11 1.0 0.82
0.43 0.69 0.91 0.96 0.99 0.97 0.59 0.61 0.22 0.15 0.15 0.19 0.46 0.39 0.38 0.4 0.36 0.27 0.3 0.42 0.07 0.36 0.04 0.17 1.0 0.98
0.26 0.42 0.9 0.91 0.75 0.46 0.52 0.59 0.58 0.57 0.54 0.63 0.31 0.36 0.3 0.28 0.35 0.6 0.53 0.53 0.42 0.53 0.7 0.24 1.0 0.71
0.2 0.16 0.62 0.99 0.52 0.09 0.1 0.35 0.06 0.01 0.01 0.02 0.09 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.11 0.0 0.05 0.0 0.02 0.7 1.0
0.27 0.16 0.62 1.0 0.39 0.09 0.13 0.29 0.01 0.01 0.01 0.02 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.1 0.0 0.02 0.6 0.89
0.55 0.53 0.91 1.0 0.73 0.49 0.58 0.62 0.35 0.21 0.24 0.25 0.5 0.36 0.42 0.43 0.48 0.29 0.24 0.4 0.03 0.17 0.14 0.18 0.93 0.91
0.29 0.36 0.4 0.52 0.44 0.35 0.23 0.27 0.21 0.14 0.13 0.15 0.2 0.1 0.11 0.12 0.1 0.2 0.16 0.15 0.03 0.66 0.12 0.19 1.0 0.79
0.5 0.52 0.81 0.9 0.69 0.59 0.56 0.69 0.44 0.33 0.29 0.3 0.43 0.24 0.19 0.18 0.14 0.24 0.24 0.24 0.11 0.49 0.2 0.24 0.95 1.0
0.5 0.54 0.94 0.99 0.74 0.44 0.64 0.75 0.46 0.39 0.33 0.33 0.45 0.31 0.23 0.25 0.19 0.32 0.29 0.32 0.1 0.3 0.14 0.21 0.69 1.0
0.03 0.11 0.32 0.4 0.29 0.34 0.32 0.34 0.04 0.04 0.02 0.01 0.01 0.53 0.04 0.82 0.03 0.03 0.05 0.15 0.01 0.06 0.03 0.03 0.69 1.0
0.68 0.55 0.64 0.57 0.47 0.43 0.38 0.45 0.28 0.32 0.27 0.32 0.49 0.27 0.27 0.3 0.31 0.38 0.43 0.4 0.15 0.31 0.72 0.39 0.9 1.0
0.59 0.32 0.53 0.37 0.17 0.04 0.15 0.31 0.04 0.08 0.14 0.11 0.3 0.19 0.14 0.08 0.15 0.37 0.26 0.29 0.02 0.08 0.06 0.06 0.69 1.0
0.49 0.65 0.81 0.69 0.5 0.4 0.38 0.45 0.31 0.32 0.35 0.35 0.35 0.42 0.45 0.52 0.41 0.43 0.45 0.48 0.23 0.47 0.34 0.54 0.88 1.0
0.18 0.32 0.54 0.6 0.34 0.29 0.35 0.49 0.5 0.45 0.47 0.28 0.12 0.57 0.49 1.0 0.39 0.38 0.37 0.45 0.13 0.39 0.36 0.32 0.54 0.8
0.03 0.06 0.6 0.75 0.28 0.04 0.03 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.87
0.03 0.06 0.68 0.52 0.1 0.02 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.03 0.0 0.0 0.83 1.0
0.38 0.36 0.63 0.87 0.51 0.2 0.3 0.45 0.07 0.11 0.13 0.11 0.35 0.05 0.03 0.05 0.04 0.07 0.05 0.17 0.07 0.48 0.05 0.11 0.95 1.0
0.52 0.5 0.63 0.65 0.61 0.6 0.53 0.49 0.32 0.26 0.23 0.22 0.4 0.31 0.24 0.29 0.25 0.31 0.31 0.39 0.07 0.38 0.21 0.25 1.0 0.95
0.49 0.4 0.51 0.41 0.26 0.24 0.24 0.33 0.19 0.2 0.22 0.28 0.46 0.36 0.33 0.4 0.3 0.36 0.36 0.34 0.04 0.09 0.34 0.31 0.83 1.0
0.45 0.45 0.51 0.5 0.2 0.09 0.2 0.34 0.11 0.19 0.2 0.18 0.44 0.37 0.26 0.56 0.26 0.32 0.3 0.38 0.12 0.11 0.39 0.31 1.0 0.98
0.24 0.48 0.62 0.57 0.32 0.31 0.36 0.41 0.18 0.25 0.25 0.3 0.31 0.26 0.28 0.29 0.3 0.36 0.27 0.38 0.08 0.13 0.37 0.33 1.0 0.88
0.32 0.45 0.73 0.74 0.65 0.47 0.44 0.45 0.34 0.26 0.2 0.17 0.25 0.43 0.51 0.41 0.36 0.47 0.43 0.47 0.05 0.45 0.26 0.28 0.85 1.0
0.55 0.53 0.71 0.6 0.54 0.56 0.5 0.45 0.34 0.38 0.44 0.56 0.49 0.23 0.49 0.25 0.33 0.33 0.4 0.58 0.21 0.27 0.38 0.6 0.8 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)