Heatmap: Cluster_205 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.23 0.23 0.21 0.24 0.29 0.2 0.28 0.29 0.3 0.25 0.31 0.23 0.2 0.32 0.25 0.22 0.29 0.48 0.45 0.29 1.0 0.7 0.52 0.58 0.62 0.89
0.09 0.05 0.01 0.01 0.01 0.06 0.01 0.02 0.06 0.09 0.16 0.05 0.05 0.01 0.02 0.03 0.08 0.17 0.08 0.01 0.77 0.66 0.55 0.68 1.0 0.51
0.18 0.11 0.09 0.2 0.25 0.18 0.2 0.21 0.2 0.17 0.21 0.16 0.11 0.12 0.08 0.06 0.05 0.26 0.23 0.1 1.0 0.18 0.62 0.24 0.71 0.57
0.22 0.1 0.19 0.23 0.1 0.03 0.07 0.14 0.05 0.06 0.07 0.07 0.13 0.18 0.15 0.13 0.1 0.14 0.1 0.09 1.0 0.33 0.32 0.46 0.6 0.55
0.14 0.16 0.15 0.19 0.12 0.06 0.04 0.07 0.08 0.12 0.15 0.26 0.07 0.16 0.08 0.18 0.08 0.13 0.21 0.1 0.67 0.25 0.65 1.0 0.6 0.45
0.36 0.35 0.31 0.38 0.32 0.32 0.42 0.46 0.48 0.28 0.34 0.42 0.37 0.33 0.22 0.27 0.37 0.43 0.34 0.37 1.0 0.55 0.77 0.64 0.99 0.77
0.33 0.23 0.1 0.3 0.21 0.16 0.16 0.27 0.43 0.26 0.47 0.32 0.33 0.2 0.24 0.11 0.06 0.24 0.24 0.08 1.0 0.17 0.38 0.39 0.89 0.41
0.06 0.12 0.31 0.36 0.46 0.46 0.54 0.42 0.67 0.49 0.34 0.3 0.07 0.38 0.33 0.42 0.33 0.37 0.3 0.34 1.0 0.6 0.39 0.2 0.64 0.43
0.33 0.27 0.26 0.33 0.31 0.27 0.23 0.29 0.29 0.41 0.4 0.37 0.23 0.16 0.3 0.19 0.23 0.49 0.34 0.36 0.73 0.74 1.0 0.47 0.61 0.47
0.42 0.35 0.37 0.39 0.36 0.39 0.43 0.39 0.47 0.48 0.44 0.52 0.35 0.4 0.31 0.44 0.3 0.43 0.33 0.25 1.0 0.85 0.75 0.87 0.58 0.69
0.3 0.28 0.16 0.32 0.29 0.23 0.32 0.31 0.3 0.29 0.31 0.24 0.25 0.35 0.28 0.3 0.3 0.46 0.65 0.29 1.0 0.48 0.62 0.79 0.47 0.76
0.07 0.05 0.03 0.06 0.04 0.02 0.06 0.04 0.08 0.1 0.09 0.11 0.04 0.19 0.09 0.09 0.08 0.15 0.09 0.07 0.96 0.52 0.31 1.0 0.6 0.43
0.11 0.06 0.06 0.07 0.09 0.07 0.07 0.07 0.08 0.14 0.19 0.19 0.12 0.05 0.2 0.11 0.27 0.34 0.11 0.12 1.0 0.39 0.43 0.65 0.63 0.41
0.63 0.42 0.39 0.59 0.54 0.46 0.61 0.61 0.53 0.52 0.47 0.44 0.65 0.43 0.33 0.41 0.45 0.57 0.37 0.37 1.0 0.71 0.57 0.53 0.72 0.72
0.39 0.31 0.3 0.44 0.49 0.55 0.57 0.54 0.53 0.44 0.4 0.38 0.3 0.25 0.29 0.32 0.34 0.5 0.4 0.4 0.66 0.58 1.0 0.7 0.66 0.49
0.31 0.27 0.19 0.28 0.11 0.11 0.25 0.37 0.36 0.35 0.51 0.47 0.29 0.2 0.16 0.28 0.13 0.23 0.21 0.12 1.0 0.72 0.46 0.59 0.75 0.48
0.31 0.31 0.14 0.32 0.27 0.27 0.33 0.48 0.63 0.59 0.62 0.41 0.27 0.44 0.34 0.24 0.28 0.4 0.46 0.24 0.96 0.39 1.0 0.91 0.76 0.81
0.51 0.5 0.4 0.46 0.35 0.35 0.34 0.45 0.4 0.5 0.51 0.6 0.53 0.72 0.71 0.65 0.56 0.66 0.61 0.43 0.63 0.54 0.94 0.85 1.0 0.8
0.15 0.21 0.2 0.27 0.23 0.14 0.19 0.31 0.39 0.45 0.65 0.53 0.18 0.3 0.22 0.18 0.12 0.2 0.13 0.13 1.0 0.82 0.56 0.5 0.66 0.67
0.14 0.15 0.18 0.4 0.51 0.38 0.5 0.59 0.66 0.62 0.64 0.37 0.12 0.17 0.15 0.11 0.28 0.41 0.41 0.24 1.0 0.56 0.66 0.25 0.79 0.59
0.31 0.51 0.56 0.67 0.42 0.3 0.4 0.54 0.32 0.47 0.61 0.63 0.47 0.44 0.23 0.48 0.3 0.6 0.39 0.4 1.0 0.46 0.9 0.63 0.87 0.82
0.31 0.29 0.35 0.35 0.49 0.59 0.54 0.46 0.46 0.42 0.35 0.38 0.31 0.35 0.33 0.49 0.44 0.57 0.45 0.51 0.52 0.71 1.0 0.94 0.47 0.35
0.13 0.19 0.31 0.34 0.28 0.22 0.28 0.41 0.29 0.42 0.41 0.35 0.19 0.28 0.24 0.25 0.24 0.54 0.41 0.54 0.85 0.7 0.77 0.57 0.88 1.0
0.2 0.15 0.33 0.37 0.44 0.51 0.41 0.36 0.33 0.43 0.39 0.43 0.23 0.24 0.27 0.35 0.36 0.33 0.36 0.51 0.42 0.6 1.0 0.68 0.55 0.52
0.66 0.36 0.29 0.29 0.23 0.23 0.39 0.45 0.33 0.42 0.48 0.71 0.71 0.44 0.39 0.48 0.37 0.69 0.51 0.38 0.8 0.79 1.0 0.65 0.96 0.74
0.21 0.05 0.16 0.4 0.25 0.16 0.4 0.46 0.39 0.52 0.46 0.29 0.15 0.34 0.08 0.32 0.14 0.22 0.18 0.2 0.84 0.58 0.77 0.77 0.88 1.0
0.07 0.17 0.29 0.5 0.38 0.4 0.48 0.46 0.51 0.48 0.58 0.42 0.06 0.37 0.18 0.24 0.17 0.26 0.25 0.26 1.0 0.66 0.59 0.43 0.94 0.58
0.24 0.24 0.19 0.2 0.22 0.14 0.19 0.2 0.21 0.23 0.22 0.21 0.2 0.4 0.2 0.18 0.19 0.31 0.22 0.2 1.0 0.2 0.21 0.29 0.51 0.53
0.57 0.34 0.23 0.46 0.3 0.31 0.28 0.25 0.25 0.23 0.44 0.43 0.31 0.43 0.12 0.31 0.05 0.39 0.25 0.17 0.78 0.63 0.51 1.0 0.62 0.58
0.21 0.23 0.3 0.29 0.32 0.28 0.31 0.31 0.25 0.39 0.39 0.48 0.26 0.37 0.41 0.4 0.18 0.48 0.37 0.21 0.89 0.15 0.86 1.0 0.64 0.86
0.27 0.25 0.25 0.27 0.44 0.34 0.27 0.22 0.25 0.38 0.46 0.49 0.41 0.66 0.45 0.57 0.34 0.51 0.55 0.32 1.0 0.63 0.84 0.97 0.58 0.94
0.47 0.21 0.24 0.37 0.39 0.31 0.44 0.49 0.5 0.42 0.53 0.6 0.46 0.39 0.3 0.34 0.28 0.34 0.3 0.28 1.0 0.38 0.9 0.82 0.77 0.69
0.28 0.16 0.15 0.15 0.12 0.17 0.15 0.18 0.15 0.18 0.22 0.28 0.21 0.19 0.09 0.17 0.18 0.17 0.16 0.15 0.38 0.29 0.5 1.0 0.52 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.13 0.19 0.33 0.42 0.38 0.48 0.46 0.5 0.44 0.38 0.33 0.11 0.28 0.22 0.26 0.16 0.3 0.22 0.21 1.0 0.28 0.47 0.36 0.53 0.45
0.17 0.16 0.15 0.09 0.03 0.02 0.0 0.09 0.04 0.24 0.3 0.17 0.3 0.12 0.06 0.09 0.0 0.09 0.06 0.15 0.2 0.16 0.71 1.0 0.21 0.46
0.02 0.06 0.08 0.15 0.11 0.16 0.2 0.19 0.28 0.25 0.23 0.14 0.04 0.15 0.12 0.26 0.13 0.24 0.14 0.12 1.0 0.26 0.67 0.69 0.61 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0
0.64 0.52 0.45 0.61 0.58 0.51 0.58 0.59 0.64 0.63 0.68 0.55 0.53 0.76 0.67 0.71 0.68 0.59 0.81 0.57 0.98 0.64 0.75 1.0 0.61 0.82
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.01 0.02 0.06 0.01 0.2 0.15 0.04 0.03 0.94 0.52 0.4 1.0 0.61 0.58
0.3 0.33 0.4 0.47 0.51 0.35 0.51 0.5 0.38 0.45 0.47 0.42 0.29 0.48 0.34 0.4 0.43 0.5 0.42 0.32 0.69 1.0 0.69 0.41 0.84 0.6
0.47 0.38 0.39 0.42 0.34 0.26 0.41 0.47 0.46 0.47 0.57 0.54 0.38 0.36 0.23 0.33 0.3 0.43 0.42 0.29 1.0 0.83 0.47 0.39 0.88 0.65
0.61 0.74 0.57 0.52 0.46 0.51 0.54 0.58 0.64 0.61 0.58 0.54 0.54 0.16 0.2 0.15 0.28 0.41 0.39 0.43 0.77 0.52 1.0 0.71 0.75 0.58
0.38 0.5 0.4 0.36 0.31 0.25 0.37 0.44 0.43 0.44 0.41 0.39 0.35 0.13 0.14 0.12 0.22 0.38 0.24 0.31 0.67 0.49 1.0 0.61 0.62 0.42
0.11 0.14 0.34 0.43 0.41 0.52 0.39 0.4 0.41 0.36 0.34 0.39 0.13 0.3 0.4 0.37 0.32 0.43 0.48 0.52 0.33 0.31 1.0 0.78 0.44 0.45
0.02 0.13 0.2 0.2 0.37 0.04 0.27 0.31 0.28 0.33 0.34 0.32 0.02 0.23 0.08 0.09 0.06 0.23 0.48 0.09 0.92 0.19 1.0 0.97 0.45 0.72
0.44 0.3 0.27 0.28 0.18 0.13 0.23 0.29 0.17 0.19 0.22 0.24 0.44 0.26 0.38 0.38 0.26 0.5 0.29 0.23 0.81 1.0 0.63 0.41 0.87 0.67
0.29 0.31 0.36 0.56 0.47 0.24 0.44 0.64 0.54 0.46 0.62 0.47 0.33 0.66 0.52 0.6 0.42 0.63 0.35 0.24 0.36 0.54 0.97 0.45 1.0 0.82
0.21 0.07 0.05 0.11 0.1 0.07 0.06 0.09 0.21 0.32 0.13 0.17 0.07 0.0 0.03 0.0 0.04 0.22 0.04 0.01 1.0 0.26 0.21 0.17 0.68 0.25
0.23 0.15 0.12 0.16 0.13 0.15 0.19 0.28 0.21 0.21 0.21 0.17 0.29 0.27 0.28 0.27 0.11 0.33 0.19 0.16 1.0 0.47 0.61 0.48 0.78 0.55
0.29 0.25 0.21 0.39 0.44 0.34 0.38 0.3 0.49 0.36 0.53 0.7 0.35 0.28 0.25 0.38 0.23 0.47 0.32 0.19 0.86 0.48 1.0 0.68 0.7 0.62
0.18 0.12 0.07 0.07 0.11 0.05 0.06 0.16 0.1 0.16 0.22 0.16 0.17 0.18 0.12 0.05 0.04 0.08 0.05 0.03 1.0 0.46 0.31 0.83 0.42 0.43
0.33 0.37 0.25 0.41 0.29 0.17 0.24 0.3 0.31 0.36 0.45 0.39 0.28 0.15 0.19 0.21 0.15 0.39 0.3 0.13 1.0 0.6 0.72 0.6 0.69 0.46
0.19 0.2 0.25 0.31 0.41 0.33 0.36 0.39 0.48 0.42 0.47 0.37 0.16 0.31 0.18 0.3 0.19 0.28 0.25 0.18 1.0 0.28 0.47 0.59 0.53 0.6
0.25 0.27 0.36 0.43 0.4 0.38 0.5 0.45 0.49 0.58 0.6 0.46 0.25 0.55 0.36 0.41 0.31 0.44 0.45 0.35 1.0 0.19 0.38 0.73 0.46 0.7
0.31 0.33 0.21 0.24 0.32 0.4 0.49 0.5 0.48 0.39 0.37 0.31 0.27 0.36 0.24 0.29 0.28 0.47 0.37 0.34 1.0 0.85 0.32 0.43 0.71 0.51
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.05 0.01 0.05 0.72 0.32 0.43 1.0 0.43 0.88
0.24 0.21 0.15 0.21 0.21 0.2 0.24 0.17 0.2 0.22 0.26 0.38 0.25 0.16 0.19 0.13 0.1 0.25 0.24 0.11 0.48 0.36 0.47 1.0 0.54 0.36
0.65 0.65 0.67 0.7 0.65 0.62 0.67 0.7 0.63 0.62 0.59 0.61 0.66 0.4 0.45 0.41 0.52 0.84 0.57 0.61 0.87 0.73 0.95 0.81 1.0 0.87
0.61 0.42 0.38 0.48 0.46 0.33 0.35 0.44 0.35 0.37 0.41 0.38 0.54 0.36 0.45 0.47 0.3 0.56 0.51 0.26 1.0 0.81 0.68 0.72 0.57 0.47
0.14 0.16 0.15 0.31 0.42 0.37 0.39 0.4 0.28 0.26 0.26 0.17 0.06 0.07 0.09 0.07 0.15 0.4 0.37 0.22 0.53 0.13 1.0 0.48 0.35 0.2
0.04 0.04 0.1 0.19 0.23 0.3 0.6 0.54 0.58 0.44 0.33 0.27 0.03 0.2 0.11 0.22 0.25 0.35 0.23 0.26 1.0 0.19 0.36 0.3 0.28 0.29
0.05 0.03 0.07 0.16 0.24 0.32 0.55 0.49 0.56 0.38 0.31 0.23 0.03 0.18 0.12 0.11 0.13 0.2 0.18 0.18 1.0 0.26 0.52 0.21 0.4 0.3
0.17 0.09 0.03 0.18 0.13 0.06 0.1 0.14 0.15 0.17 0.26 0.16 0.15 0.06 0.06 0.05 0.04 0.11 0.08 0.05 1.0 0.09 0.12 0.22 0.62 0.39
0.14 0.23 0.3 0.41 0.39 0.41 0.5 0.49 0.47 0.47 0.47 0.39 0.1 0.22 0.24 0.24 0.3 0.4 0.33 0.34 1.0 0.24 0.47 0.29 0.37 0.34
0.43 0.36 0.34 0.44 0.27 0.16 0.3 0.42 0.24 0.26 0.29 0.24 0.25 0.4 0.28 0.36 0.3 0.51 0.36 0.26 1.0 0.31 0.87 0.4 0.92 0.91
0.18 0.24 0.25 0.47 0.33 0.17 0.32 0.34 0.23 0.35 0.35 0.25 0.1 0.5 0.43 0.52 0.26 0.53 0.41 0.23 0.54 0.3 0.81 0.27 1.0 0.66
0.08 0.1 0.06 0.1 0.12 0.05 0.09 0.08 0.11 0.18 0.15 0.13 0.1 0.23 0.1 0.09 0.08 0.24 0.23 0.08 1.0 0.51 0.39 0.76 0.76 0.66
0.24 0.19 0.2 0.23 0.13 0.09 0.13 0.19 0.13 0.17 0.23 0.22 0.27 0.23 0.18 0.19 0.13 0.18 0.16 0.08 0.98 0.72 0.57 0.43 1.0 0.88
0.59 0.7 0.54 0.4 0.33 0.33 0.33 0.4 0.41 0.41 0.45 0.58 0.54 0.23 0.27 0.24 0.26 0.34 0.34 0.32 0.74 0.47 1.0 0.73 0.75 0.55
0.28 0.5 0.25 0.34 0.17 0.15 0.17 0.25 0.25 0.14 0.45 0.2 0.34 0.28 0.16 0.31 0.23 0.17 0.3 0.29 0.63 0.65 1.0 0.39 0.78 0.55
0.03 0.11 0.19 0.33 0.39 0.37 0.45 0.45 0.43 0.33 0.27 0.37 0.01 0.12 0.15 0.24 0.16 0.34 0.27 0.23 1.0 0.39 0.69 0.37 0.56 0.35

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)