Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.11 0.64 1.0 0.0 0.18 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.09 0.21 0.11 0.15 0.46 0.0 0.0 0.24
0.07 0.1 0.11 0.1 0.1 0.14 0.08 0.13 0.15 0.09 0.1 0.11 0.05 1.0 0.97 0.89 0.8 0.67 0.23 0.14 0.1 0.88 0.11 0.06 0.26 0.22
0.23 0.3 0.45 0.67 0.98 1.0 0.59 0.41 0.14 0.11 0.08 0.08 0.31 0.35 0.21 0.54 0.47 0.28 0.24 0.23 0.03 0.32 0.1 0.03 0.3 0.24
0.15 0.15 0.19 0.41 0.47 0.39 0.36 0.37 0.28 0.3 0.31 0.23 0.18 0.59 0.66 0.4 0.11 0.15 0.13 0.09 0.03 1.0 0.06 0.14 0.72 0.51
0.22 0.22 0.29 0.48 0.5 0.54 0.58 0.45 0.34 0.32 0.34 0.26 0.25 0.91 1.0 0.64 0.16 0.19 0.18 0.13 0.03 0.77 0.08 0.11 0.7 0.49
0.04 0.07 0.1 0.2 0.33 0.49 0.48 0.28 0.19 0.24 0.24 0.21 0.04 0.64 0.71 0.4 0.17 0.17 0.16 0.15 0.03 1.0 0.11 0.11 0.47 0.34
0.03 0.01 0.05 0.14 0.18 0.24 0.17 0.13 0.15 0.18 0.13 0.08 0.0 0.34 0.22 0.31 0.11 0.16 0.11 0.1 0.03 1.0 0.07 0.06 0.15 0.19
0.02 0.07 0.09 0.27 0.72 1.0 0.66 0.28 0.12 0.08 0.05 0.06 0.03 0.36 0.08 0.17 0.03 0.04 0.05 0.05 0.02 0.57 0.08 0.02 0.34 0.14
0.67 0.64 0.71 0.82 1.0 0.85 0.64 0.51 0.51 0.62 0.53 0.53 0.66 0.56 0.81 0.77 0.53 0.68 0.79 0.69 0.14 0.35 0.31 0.42 0.37 0.43
0.0 0.26 0.56 1.0 0.62 0.7 0.28 0.02 0.03 0.01 0.02 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.05 0.17 0.71 0.14 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0
0.04 0.21 0.48 0.69 1.0 0.99 0.92 0.81 0.46 0.25 0.1 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.07 0.09 0.0
0.02 0.08 0.1 0.24 0.78 1.0 0.69 0.35 0.13 0.08 0.06 0.06 0.04 0.39 0.03 0.13 0.04 0.09 0.05 0.04 0.01 0.36 0.05 0.01 0.33 0.16
0.48 0.53 0.0 0.98 1.0 0.97 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.37 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0
0.01 0.18 0.25 0.84 1.0 0.6 0.47 0.18 0.07 0.03 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.01 0.02 0.04 0.03 0.06 0.13 0.03 0.04 0.01 0.16 0.02
0.44 0.45 0.5 0.87 1.0 0.45 0.31 0.27 0.12 0.13 0.12 0.12 0.35 0.35 0.21 0.33 0.23 0.24 0.23 0.15 0.03 0.54 0.14 0.11 0.37 0.21
0.17 0.2 0.24 0.33 0.49 0.64 1.0 0.74 0.53 0.5 0.48 0.38 0.22 0.27 0.29 0.2 0.31 0.29 0.3 0.35 0.07 0.33 0.27 0.13 0.33 0.22
0.24 0.21 0.28 0.35 0.51 0.63 1.0 0.87 0.51 0.52 0.48 0.36 0.2 0.38 0.35 0.32 0.45 0.39 0.36 0.4 0.1 0.6 0.46 0.28 0.43 0.3
0.19 0.21 0.31 0.36 0.46 0.58 1.0 0.81 0.42 0.52 0.48 0.32 0.21 0.5 0.48 0.42 0.55 0.6 0.48 0.54 0.1 0.37 0.32 0.13 0.5 0.26
0.16 0.27 0.27 0.65 1.0 0.98 0.9 0.72 0.49 0.58 0.37 0.36 0.19 0.63 0.57 0.61 0.27 0.63 0.52 0.43 0.31 0.1 0.78 0.32 0.31 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.3 0.29 0.76 1.0 0.46 0.31 0.1 0.08 0.0 0.06 0.02 0.03 0.08 0.11 0.12 0.01 0.12 0.19 0.32 0.41 0.08 0.3 0.01 0.04 0.2
0.0 0.03 0.34 0.6 1.0 0.88 0.6 0.19 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.13 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.21 0.72 0.91 1.0 0.69 0.62 0.39 0.26 0.25 0.31 0.18 0.06 0.52 0.41 0.35 0.33 0.27 0.34 0.42 0.01 0.08 0.05 0.23 0.12 0.3
0.13 0.36 0.55 1.0 0.88 0.44 0.13 0.12 0.07 0.14 0.27 0.3 0.14 0.12 0.15 0.14 0.46 0.24 0.27 0.36 0.03 0.64 0.71 0.49 0.26 0.33
0.34 0.26 0.28 0.36 0.59 0.9 1.0 0.75 0.79 0.44 0.32 0.25 0.38 0.87 0.6 0.61 0.47 0.47 0.34 0.38 0.04 0.35 0.3 0.15 0.63 0.44
0.01 0.0 0.01 0.05 0.31 0.93 1.0 0.3 0.67 0.19 0.09 0.04 0.01 0.63 0.34 0.21 0.15 0.06 0.08 0.1 0.01 1.0 0.16 0.07 0.11 0.05
0.01 0.0 0.0 0.02 0.17 0.48 0.58 0.2 0.37 0.11 0.05 0.03 0.0 0.36 0.18 0.12 0.09 0.05 0.04 0.05 0.01 1.0 0.15 0.05 0.08 0.04
0.0 0.0 0.0 0.03 0.18 0.46 0.54 0.19 0.28 0.09 0.04 0.01 0.0 0.36 0.16 0.12 0.07 0.05 0.03 0.04 0.01 1.0 0.18 0.08 0.09 0.02
0.72 0.74 0.74 0.81 0.95 0.85 0.68 0.58 0.41 0.46 0.49 0.57 0.98 0.62 0.45 0.57 0.69 0.45 0.34 0.39 0.09 1.0 0.28 0.29 0.72 0.55
0.2 0.36 0.47 0.74 1.0 0.95 0.43 0.26 0.04 0.04 0.04 0.04 0.17 0.1 0.11 0.35 0.24 0.16 0.17 0.2 0.0 0.07 0.01 0.02 0.28 0.12
0.07 0.11 0.18 0.23 0.5 1.0 0.56 0.35 0.38 0.31 0.24 0.17 0.07 0.21 0.22 0.16 0.19 0.23 0.24 0.26 0.16 0.82 0.29 0.12 0.22 0.24
0.15 0.09 0.12 0.19 0.3 0.57 1.0 0.54 0.33 0.25 0.22 0.2 0.16 0.3 0.09 0.26 0.09 0.11 0.11 0.11 0.05 0.35 0.41 0.1 0.24 0.14
0.08 0.39 0.44 0.77 1.0 0.4 0.2 0.09 0.13 0.15 0.07 0.12 0.06 0.55 0.23 0.55 0.31 0.13 0.11 0.17 0.01 0.68 0.16 0.03 0.22 0.3
0.56 0.0 0.0 0.33 1.0 0.31 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.29 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0
0.05 0.04 0.14 0.23 0.54 0.76 0.65 0.32 1.0 0.36 0.31 0.24 0.06 0.55 0.55 0.35 0.29 0.24 0.28 0.23 0.07 0.56 0.42 0.35 0.4 0.51
0.0 0.08 0.1 0.24 1.0 0.72 0.7 0.5 0.2 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.11 0.01 0.01
0.02 0.01 0.06 0.11 0.25 0.53 0.42 0.26 0.29 0.24 0.26 0.22 0.06 0.21 0.12 0.17 0.14 0.14 0.15 0.17 0.09 1.0 0.25 0.35 0.2 0.3
0.08 0.07 0.06 0.25 0.45 0.27 0.2 0.2 0.13 0.1 0.1 0.09 0.1 0.02 0.03 0.02 0.01 0.03 0.03 0.02 0.08 1.0 0.15 0.06 0.09 0.08
0.58 0.5 0.55 0.92 0.91 0.76 0.53 0.41 0.12 0.12 0.11 0.19 0.56 0.35 0.11 0.3 0.12 0.11 0.09 0.09 0.05 1.0 0.14 0.04 0.41 0.38
0.2 0.17 0.49 0.66 1.0 0.64 0.39 0.14 0.1 0.02 0.17 0.17 0.09 0.01 0.17 0.25 0.02 0.21 0.16 0.31 0.19 0.07 0.22 0.1 0.01 0.0
0.01 0.09 0.1 0.46 1.0 0.49 0.31 0.22 0.07 0.06 0.0 0.03 0.01 0.0 0.02 0.01 0.03 0.09 0.04 0.05 0.07 0.01 0.1 0.02 0.0 0.01
0.08 0.1 0.09 0.2 0.6 1.0 0.88 0.62 0.36 0.22 0.12 0.07 0.04 0.4 0.37 0.6 0.12 0.14 0.08 0.09 0.04 0.34 0.08 0.0 0.25 0.12
0.08 0.08 0.07 0.15 0.62 1.0 0.88 0.54 0.3 0.21 0.15 0.07 0.02 0.67 0.49 0.82 0.17 0.23 0.15 0.19 0.04 0.57 0.19 0.03 0.47 0.27
0.02 0.04 0.05 0.11 0.55 1.0 0.88 0.42 0.34 0.41 0.39 0.3 0.04 0.45 0.36 0.41 0.07 0.46 0.28 0.43 0.08 0.19 0.22 0.15 0.24 0.15
0.44 0.89 0.72 0.98 1.0 0.62 0.48 0.41 0.29 0.23 0.2 0.16 0.34 0.62 0.52 0.55 0.78 0.54 0.47 0.24 0.01 0.56 0.09 0.15 0.74 0.36
0.07 0.3 0.64 0.79 1.0 0.83 0.41 0.17 0.16 0.1 0.09 0.08 0.07 0.18 0.17 0.14 0.06 0.17 0.17 0.22 0.5 0.17 0.62 0.27 0.13 0.16
0.06 0.34 0.63 0.86 1.0 0.77 0.44 0.14 0.15 0.07 0.07 0.07 0.04 0.13 0.09 0.08 0.04 0.11 0.15 0.24 0.38 0.08 0.43 0.11 0.06 0.11
0.02 0.2 0.66 0.81 1.0 0.67 0.43 0.2 0.21 0.22 0.19 0.1 0.02 0.14 0.08 0.15 0.1 0.26 0.16 0.3 0.06 0.08 0.06 0.03 0.12 0.06
0.07 0.39 0.79 0.98 0.98 1.0 0.63 0.27 0.4 0.52 0.22 0.43 0.07 0.69 0.55 0.6 0.4 0.44 0.53 0.68 0.03 0.17 0.04 0.15 0.1 0.15
0.03 0.21 0.63 0.96 1.0 0.8 0.46 0.06 0.05 0.01 0.01 0.05 0.0 0.01 0.03 0.04 0.01 0.07 0.07 0.19 0.06 0.03 0.03 0.0 0.01 0.01
0.01 0.21 0.53 0.56 1.0 0.61 0.28 0.04 0.08 0.05 0.03 0.02 0.02 0.03 0.04 0.04 0.02 0.06 0.11 0.1 0.43 0.12 0.1 0.06 0.01 0.07
0.12 0.02 0.06 0.12 0.38 0.68 1.0 0.44 0.2 0.36 0.37 0.28 0.16 0.95 0.17 0.37 0.09 0.1 0.11 0.11 0.04 0.15 0.04 0.04 0.36 0.31
0.12 0.03 0.06 0.13 0.4 0.76 1.0 0.41 0.27 0.35 0.35 0.31 0.16 0.53 0.11 0.21 0.05 0.05 0.06 0.07 0.02 0.12 0.04 0.06 0.2 0.24
0.1 0.22 0.78 0.87 0.87 0.84 0.63 0.45 0.51 0.49 0.41 0.35 0.16 0.49 0.3 0.41 0.3 0.44 0.43 0.51 0.69 0.44 1.0 0.25 0.34 0.34
0.27 0.44 0.53 0.55 0.97 0.97 1.0 0.73 0.48 0.47 0.44 0.51 0.27 0.79 0.75 0.73 0.51 0.83 0.78 0.41 0.39 0.35 0.77 0.41 0.88 0.58
0.37 0.31 0.21 0.34 0.53 0.59 0.91 0.86 0.6 0.49 0.44 0.41 0.41 1.0 0.46 0.65 0.35 0.34 0.42 0.33 0.35 0.24 0.5 0.4 0.4 0.31
0.29 0.3 0.18 0.3 0.44 0.45 0.76 0.69 0.38 0.44 0.4 0.29 0.34 1.0 0.37 0.74 0.36 0.44 0.4 0.33 0.34 0.13 0.53 0.28 0.36 0.26
0.04 0.14 0.35 0.94 0.85 0.93 0.61 0.27 0.15 0.11 0.09 0.12 0.01 0.7 0.71 0.53 0.32 0.87 0.42 0.55 0.56 0.12 1.0 0.17 0.09 0.27
0.04 0.09 0.2 0.45 0.64 0.8 0.47 0.29 0.19 0.26 0.25 0.17 0.04 0.14 0.08 0.17 0.11 0.09 0.18 0.26 0.02 1.0 0.03 0.1 0.19 0.19
0.02 0.12 0.2 0.35 0.59 0.55 0.4 0.24 0.18 0.27 0.19 0.12 0.03 0.19 0.13 0.17 0.12 0.18 0.16 0.31 0.03 1.0 0.04 0.09 0.38 0.31
0.0 0.0 0.41 0.77 1.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.29 0.1 0.0 0.27 0.29 0.0 0.0
0.4 0.29 0.25 0.54 1.0 0.6 0.45 0.32 0.23 0.22 0.22 0.26 0.49 0.29 0.14 0.36 0.09 0.06 0.13 0.08 0.76 0.53 0.56 0.08 0.12 0.1
0.08 0.26 0.16 0.76 1.0 0.62 0.29 0.22 0.09 0.14 0.15 0.26 0.11 0.07 0.04 0.17 0.11 0.05 0.14 0.13 0.03 0.02 0.05 0.09 0.04 0.09
0.91 0.65 0.77 0.8 0.77 0.55 0.5 0.46 0.25 0.24 0.23 0.31 1.0 0.57 0.89 0.42 0.41 0.44 0.33 0.23 0.1 0.83 0.2 0.22 0.44 0.47
0.19 0.19 0.14 0.17 0.3 0.39 0.34 0.24 0.14 0.08 0.08 0.07 0.2 0.64 0.74 0.67 0.27 0.32 0.29 0.13 0.01 1.0 0.11 0.05 0.22 0.11
0.86 0.61 0.61 0.63 0.64 0.5 0.66 0.71 0.52 0.55 0.52 0.54 1.0 0.65 0.54 0.73 0.43 0.56 0.45 0.42 0.23 0.86 0.42 0.39 0.55 0.62
0.58 0.49 0.54 0.62 0.69 0.47 0.32 0.32 0.23 0.28 0.32 0.35 0.82 0.21 0.17 0.22 0.68 0.24 0.16 0.16 1.0 0.74 0.5 0.38 0.23 0.23
0.03 0.0 0.0 0.04 0.22 0.41 0.6 0.47 0.24 0.17 0.17 0.14 0.14 0.62 0.68 0.26 0.46 0.2 0.16 0.11 0.01 1.0 0.12 0.04 0.96 0.49
0.15 0.07 0.21 0.64 1.0 0.55 0.34 0.22 0.0 0.04 0.02 0.03 0.22 0.0 0.01 0.02 0.0 0.05 0.07 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.23 0.52 0.77 1.0 0.93 0.56 0.42 0.3 0.21 0.17 0.16 0.04 0.52 0.31 0.45 0.35 0.24 0.21 0.3 0.03 0.25 0.17 0.17 0.33 0.44
0.02 0.17 0.4 1.0 0.99 0.69 0.37 0.15 0.08 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.09 0.31 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0
0.36 0.47 0.46 0.93 0.79 0.36 0.32 0.37 0.22 0.25 0.32 0.27 0.36 0.56 0.25 0.59 0.33 0.28 0.21 0.24 0.17 0.63 0.37 0.26 1.0 0.37
0.37 0.96 1.0 0.85 0.98 0.79 0.9 0.73 0.63 0.53 0.46 0.39 0.5 0.35 0.93 0.27 0.93 0.69 0.74 0.55 0.01 0.95 0.01 0.14 0.38 0.39
0.0 0.08 0.48 0.65 0.55 1.0 0.45 0.21 0.08 0.0 0.07 0.0 0.1 0.0 0.07 0.0 0.0 0.22 0.0 0.36 0.0 0.12 0.05 0.0 0.0 0.16
0.0 0.0 0.04 0.54 1.0 0.98 0.85 0.41 0.23 0.63 0.58 0.48 0.13 0.57 0.07 0.52 0.08 0.32 0.3 0.13 0.05 0.13 0.22 0.79 0.14 0.16
0.14 0.2 0.25 0.34 0.6 0.68 0.67 0.48 0.43 0.4 0.33 0.26 0.1 0.24 0.15 0.23 0.13 0.21 0.2 0.18 0.09 1.0 0.18 0.18 0.21 0.19
0.54 0.12 0.41 0.42 1.0 0.53 0.12 0.1 0.0 0.29 0.2 0.22 0.73 0.07 0.0 0.43 0.0 0.07 0.0 0.08 0.96 1.0 0.33 0.0 0.07 0.07
0.36 0.54 0.64 0.95 1.0 0.87 0.7 0.67 0.25 0.25 0.26 0.24 0.48 0.57 0.47 0.62 0.57 0.32 0.33 0.25 0.03 0.76 0.14 0.25 0.6 0.41
0.02 0.08 0.07 0.35 0.68 1.0 0.73 0.36 0.4 0.43 0.57 0.28 0.08 0.46 0.42 0.28 0.14 0.06 0.19 0.12 0.01 0.61 0.04 0.14 0.17 0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)