Heatmap: Cluster_129 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.21 0.44 0.39 0.32 0.27 0.16 0.26 0.36 0.24 0.38 0.48 0.37 0.3 0.28 0.36 0.47 0.74 0.29 0.2 0.21 0.59 0.51 0.45 0.5 1.0 0.72
0.36 0.68 0.61 0.58 0.45 0.28 0.41 0.57 0.5 0.68 0.81 0.72 0.59 0.33 0.46 0.54 0.85 0.29 0.24 0.26 0.53 0.44 0.41 0.57 1.0 0.81
0.8 0.33 0.3 0.26 0.16 0.09 0.24 0.37 0.21 0.32 0.37 0.5 1.0 0.47 0.76 0.91 0.29 0.44 0.37 0.33 0.72 0.55 0.17 0.3 0.55 0.5
0.68 0.4 0.35 0.39 0.38 0.36 0.51 0.53 0.56 0.65 0.76 0.99 1.0 0.62 0.31 0.51 0.33 0.4 0.3 0.28 0.7 0.59 0.57 0.56 0.53 0.54
0.87 0.74 0.76 0.8 0.72 0.68 0.64 0.69 0.56 0.56 0.62 0.62 1.0 0.72 0.75 0.95 0.72 0.69 0.64 0.45 0.6 0.54 0.35 0.51 0.55 0.59
0.61 0.5 0.53 0.63 0.72 0.73 0.52 0.59 0.69 0.72 0.9 1.0 0.7 0.27 0.39 0.25 0.35 0.36 0.48 0.47 0.55 0.69 0.55 0.72 0.67 0.37
0.69 0.52 0.61 0.65 0.67 0.58 0.63 0.67 0.59 0.6 0.7 0.85 1.0 0.41 0.37 0.43 0.72 0.32 0.37 0.35 0.34 0.9 0.49 0.48 0.56 0.63
0.74 0.52 0.57 0.63 0.48 0.37 0.44 0.53 0.4 0.48 0.55 0.69 1.0 0.18 0.13 0.17 0.23 0.25 0.22 0.38 0.5 0.27 0.42 0.35 0.3 0.43
0.71 0.44 0.48 0.56 0.38 0.35 0.32 0.3 0.45 0.72 0.91 1.0 0.7 0.36 0.1 0.5 0.19 0.07 0.1 0.27 0.21 0.82 0.45 0.46 0.28 0.35
1.0 0.3 0.19 0.19 0.11 0.17 0.26 0.59 0.46 0.34 0.55 0.5 0.7 0.09 0.19 0.11 0.12 0.33 0.25 0.15 0.81 0.31 0.51 0.31 0.45 0.38
0.82 0.48 0.55 0.56 0.49 0.48 0.48 0.59 0.53 0.52 0.67 0.77 1.0 0.43 0.35 0.36 0.37 0.22 0.3 0.26 0.31 0.62 0.46 0.43 0.45 0.46
0.92 0.66 0.55 0.55 0.64 0.53 0.49 0.53 0.37 0.39 0.42 0.44 1.0 0.65 0.88 0.96 0.45 0.66 0.69 0.43 0.61 0.7 0.4 0.34 0.43 0.5
0.75 0.33 0.35 0.55 0.53 0.39 0.68 0.77 0.74 0.68 0.81 0.81 1.0 0.79 0.52 0.81 0.39 0.46 0.51 0.31 0.62 0.57 0.95 0.7 0.79 0.55
0.4 0.3 0.3 0.36 0.4 0.35 0.31 0.34 0.36 0.43 0.58 0.6 0.52 0.44 0.43 0.36 0.29 0.33 0.37 0.23 0.33 0.4 0.39 1.0 0.46 0.47
0.37 0.27 0.26 0.28 0.28 0.26 0.29 0.3 0.44 0.62 0.81 1.0 0.36 0.52 0.31 0.48 0.4 0.35 0.3 0.33 0.37 0.86 0.51 0.64 0.5 0.55
0.77 0.36 0.32 0.3 0.2 0.16 0.19 0.25 0.37 0.47 0.77 1.0 0.9 0.44 0.22 0.84 0.53 0.4 0.32 0.26 0.45 0.6 0.62 0.92 0.53 0.33
0.62 0.43 0.32 0.42 0.34 0.22 0.35 0.36 0.51 0.58 0.8 1.0 0.76 0.23 0.16 0.31 0.14 0.16 0.17 0.16 0.91 0.23 0.13 0.67 0.26 0.28
0.59 0.26 0.32 0.46 0.38 0.24 0.32 0.36 0.31 0.44 0.71 1.0 0.84 0.22 0.1 0.14 0.16 0.13 0.13 0.15 0.56 0.57 0.37 0.41 0.21 0.29
0.65 0.41 0.36 0.51 0.5 0.56 0.62 0.65 0.76 0.86 1.0 0.84 0.91 0.56 0.69 0.84 0.45 0.74 0.69 0.42 0.52 0.34 1.0 0.55 0.86 0.58
0.7 0.54 0.45 0.33 0.3 0.39 0.47 0.55 0.89 0.85 0.83 0.68 0.8 0.27 0.49 0.45 0.21 0.56 0.47 0.3 0.22 0.26 1.0 0.86 0.96 0.34
0.75 0.63 0.64 0.68 0.59 0.53 0.47 0.52 0.56 0.6 0.77 1.0 0.98 0.3 0.26 0.58 0.41 0.34 0.26 0.3 0.34 0.58 0.5 0.63 0.37 0.38
0.19 0.14 0.15 0.15 0.1 0.07 0.11 0.14 0.21 0.4 0.67 1.0 0.25 0.11 0.08 0.15 0.15 0.13 0.1 0.1 0.68 0.28 0.39 0.63 0.21 0.26
0.67 0.37 0.34 0.63 0.54 0.13 0.23 0.43 0.62 0.66 0.76 0.39 0.87 0.22 0.13 0.18 0.1 0.37 0.17 0.13 1.0 0.63 0.27 0.34 0.81 0.34
0.51 0.28 0.31 0.35 0.28 0.22 0.2 0.26 0.34 0.46 0.62 0.71 0.6 0.39 0.33 0.3 0.23 0.3 0.28 0.08 0.6 0.26 0.54 1.0 0.64 0.43
0.43 0.54 0.36 0.36 0.29 0.22 0.38 0.32 0.26 0.41 0.6 0.81 1.0 0.44 0.27 0.32 0.18 0.26 0.19 0.07 0.31 0.06 0.42 0.27 0.39 0.52
0.18 0.38 0.42 0.39 0.41 0.33 0.2 0.22 0.37 0.61 0.98 1.0 0.31 0.0 0.0 0.54 0.03 0.01 0.0 0.03 0.55 0.62 0.14 0.84 0.17 0.39
0.06 0.22 0.26 0.25 0.2 0.19 0.16 0.19 0.34 0.69 1.0 0.99 0.05 0.02 0.03 0.96 0.07 0.02 0.0 0.04 0.59 0.53 0.06 0.77 0.31 0.54
0.23 0.14 0.16 0.19 0.29 0.25 0.2 0.16 0.22 0.42 0.55 0.52 0.23 0.06 0.21 1.0 0.14 0.11 0.13 0.23 0.1 0.75 0.03 0.73 0.46 0.58
0.57 1.0 0.43 0.29 0.17 0.05 0.03 0.06 0.17 0.35 0.52 0.6 0.66 0.02 0.01 0.26 0.02 0.02 0.0 0.02 0.68 0.21 0.11 0.6 0.29 0.49
0.58 0.91 0.52 0.36 0.15 0.05 0.01 0.11 0.15 0.36 0.65 0.63 0.68 0.03 0.01 0.49 0.08 0.01 0.0 0.01 1.0 0.26 0.3 0.97 0.44 0.61
0.81 0.46 0.37 0.27 0.17 0.14 0.26 0.36 0.36 0.45 0.64 0.93 0.88 0.57 0.44 1.0 0.63 0.54 0.49 0.41 0.56 0.35 0.4 0.76 0.58 0.45
0.73 0.54 0.55 0.5 0.35 0.14 0.18 0.36 0.47 0.53 0.92 1.0 0.99 0.17 0.06 0.1 0.09 0.15 0.14 0.13 0.63 0.37 0.23 0.28 0.53 0.24
0.95 0.43 0.35 0.43 0.39 0.37 0.55 0.62 0.68 0.94 1.0 0.82 0.79 0.27 0.24 0.15 0.25 0.27 0.29 0.39 0.97 0.31 0.4 0.23 0.5 0.46
0.33 0.29 0.26 0.33 0.36 0.11 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.5 0.31 0.22 0.09 0.08 0.18 0.06 0.07 0.2 1.0 0.26 0.25 0.03 0.03
0.78 0.54 0.62 0.69 0.62 0.58 0.83 0.96 0.89 1.0 0.94 0.95 0.97 0.41 0.63 0.32 0.18 0.43 0.4 0.29 0.85 0.84 0.81 0.78 0.78 0.55
0.08 0.06 0.06 0.18 0.18 0.17 0.14 0.18 0.33 0.49 0.79 1.0 0.23 0.21 0.04 0.08 0.09 0.01 0.02 0.02 0.1 0.37 0.2 0.54 0.17 0.13
0.59 0.46 0.49 0.43 0.26 0.09 0.08 0.16 0.15 0.15 0.23 0.38 0.67 0.17 0.16 0.36 0.2 0.28 0.22 0.28 0.54 1.0 0.07 0.16 0.48 0.4
0.6 0.43 0.3 0.2 0.07 0.03 0.11 0.22 0.15 0.26 0.39 0.5 1.0 0.23 0.14 0.17 0.19 0.1 0.09 0.08 0.36 0.16 0.15 0.13 0.41 0.16
0.45 0.21 0.09 0.55 0.11 0.21 0.0 0.0 0.29 0.26 0.37 0.7 0.51 0.27 0.34 0.21 0.31 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.72 0.6 0.66 0.76
0.22 0.16 0.16 0.15 0.11 0.07 0.09 0.12 0.21 0.37 0.64 1.0 0.25 0.08 0.05 0.08 0.14 0.15 0.08 0.15 0.16 0.54 0.11 0.33 0.35 0.4
0.2 0.16 0.17 0.15 0.1 0.06 0.09 0.12 0.21 0.4 0.65 1.0 0.24 0.1 0.06 0.11 0.2 0.16 0.1 0.22 0.1 0.41 0.08 0.37 0.24 0.35
0.56 0.1 0.29 0.49 0.72 0.29 0.36 0.3 0.48 0.43 0.54 0.86 0.98 0.26 0.57 0.16 0.52 0.15 0.06 0.06 0.72 0.08 0.54 1.0 0.61 0.59
0.94 1.0 0.86 0.7 0.68 0.83 0.67 0.72 0.61 0.5 0.48 0.45 0.77 0.62 0.84 0.72 0.57 0.48 0.67 0.45 0.71 0.4 0.58 0.48 0.61 0.49
0.35 0.69 0.54 0.39 0.11 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.04 0.39 0.11 0.04 0.08 0.12 0.05 0.03 0.03 0.39 1.0 0.02 0.03 0.07 0.11
0.35 1.0 0.65 0.43 0.11 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.04 0.07 0.46 0.05 0.05 0.05 0.07 0.03 0.03 0.03 0.46 0.59 0.04 0.06 0.07 0.06
0.34 1.0 0.68 0.42 0.09 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.05 0.07 0.41 0.07 0.06 0.06 0.06 0.05 0.04 0.03 0.57 0.72 0.04 0.06 0.07 0.08
0.67 0.64 0.56 0.51 0.3 0.11 0.19 0.35 0.36 0.53 0.74 0.81 1.0 0.19 0.34 0.19 0.83 0.23 0.18 0.19 0.63 0.19 0.39 0.31 0.66 0.59
0.95 0.69 0.49 0.46 0.13 0.05 0.14 0.13 0.21 0.44 0.76 0.77 1.0 0.34 0.03 0.18 0.07 0.48 0.17 0.08 0.4 0.2 0.16 0.75 0.73 0.45
0.67 0.68 0.3 0.48 0.32 0.06 0.37 0.58 0.28 0.69 0.8 0.51 1.0 0.37 0.33 0.22 0.25 0.29 0.37 0.2 0.3 0.02 0.56 0.35 0.47 0.44
0.63 0.43 0.3 0.39 0.27 0.06 0.14 0.16 0.13 0.32 0.66 0.89 1.0 0.08 0.05 0.08 0.14 0.09 0.02 0.0 0.53 0.48 0.24 0.99 0.87 0.28
0.48 0.3 0.25 0.22 0.15 0.11 0.13 0.14 0.24 0.45 0.69 1.0 0.55 0.16 0.15 0.21 0.32 0.31 0.2 0.28 0.53 0.61 0.17 0.53 0.46 0.36
0.76 0.72 0.52 0.41 0.36 0.29 0.41 0.41 0.48 0.56 0.61 0.71 0.74 0.4 0.45 0.91 0.56 0.83 0.57 0.46 0.46 0.55 0.46 1.0 0.46 0.44

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)