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Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - 2.83 - - - - - - 4.24 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.04 0.7 - 0.07 -0.18 1.37 1.78 - 1.18 - 0.08 1.81 0.01 - 0.03 0.1 - -0.03 - - - - - - 0.5 -
3.72 - - - - - 2.74 - - - - - 2.62 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- 2.26 - - 1.58 - 2.13 - - 1.63 1.65 - - - - 1.82 - - - - - - 2.02 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.28 -2.71 -2.29 -2.21 - -1.16 - - -2.28 -1.79 -1.33 - -1.46 -2.29 -1.85 -2.4 -1.09 -2.31 -0.52 - - 0.18 - -1.69 -0.78 -1.8
- - - - - - - 2.62 - 2.55 - - - - 1.57 1.56 - - 2.59 - - - - - 1.05 -
- - - - - - 3.83 - - - 3.56 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.23 - 2.85 - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.16 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
0.69 0.7 0.56 2.14 - - 2.22 0.45 - - 0.52 - 0.95 - 1.47 - - - - 2.24 - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.74 - - - - - - - - 3.66 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.67 2.46 0.68 - 1.97 - 0.69 - - - - - 1.08 0.52 0.43 - - 0.09 - - 2.15 0.43 - - - -
1.18 1.62 - - - - - - - - 1.45 - - - 1.23 - - - 2.41 1.1 1.54 - - 2.38 - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.38 - - - - - - - 2.12 - - - 2.05 - - - - - - - - 2.83 - - -
- 4.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.1 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.99 - - - - 0.73 - 1.28 - - - - 3.38 - - 0.25 - 1.25 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.87 - - 1.83 - 1.89 3.54 - - - - - 1.77 - - - - - - - - - - - - -
2.03 1.92 2.04 2.11 - 1.05 - - - 0.95 - 2.13 - - - - - - - - - - - - 0.42 -
- - - - - - 1.47 - - - - 1.55 - - 3.18 - - 1.79 - - 2.49 - 1.08 - - -
3.59 - - - - - 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.21 3.13 1.22 - 0.8 1.0 1.11 -0.02 1.11 - 0.06 - 1.53 - - 0.08 - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.41 - 2.23 0.4 - 0.44 - - - 0.29 - - 0.54 - 2.18 3.13 - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 2.69 - - - - - - - - 4.29 - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.72 - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.94 -0.74 -0.99 -0.91 0.07 2.43 0.12 - -0.86 -1.03 -0.98 - 1.04 - - -1.0 -0.75 -1.58 1.03 -1.36 - 0.45 -1.65 - - -
- 3.78 - - - - - - - - - - - - - - - 3.61 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.24 - - - - - - - - - - 4.05 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.87 -1.64 -1.53 -2.77 -1.75 -1.56 -1.13 -0.4 -0.71 -1.61 -1.12 -1.06 3.66 -1.69 -1.23 -1.53 -1.55 -1.53 -0.95 -1.77 -2.29 2.01 -0.58 -2.75 -1.64 -1.53
2.88 - - - - - - - - - - 3.0 - - - - - - - 2.57 - - - - 2.22 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.93 - 0.6 - 3.91 - - - - - 1.1 2.44 - - - - - - - - - - - -
1.18 2.33 -0.15 - -3.83 -1.48 0.43 - - -4.8 - - 1.4 - -4.84 -0.75 -0.73 -4.9 - 1.1 1.65 2.37 - - - 0.72
2.95 - - - - - - - - - - 3.07 - - - - - - - - 3.3 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.33 - - 2.56 - - - -
2.47 - - - 0.8 2.39 - 1.92 0.89 - - - - - - - - - 0.89 2.58 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
2.73 1.33 2.97 - 1.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.64 - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
0.15 1.59 - - 0.36 - - 0.48 - - 1.4 - 0.35 0.81 0.21 0.35 - - 1.97 - 1.1 0.06 - - - 2.0
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.09 - - - - - 3.53 - - - - - - - - - - - - 2.57 - - - - -
- - - - 2.27 0.78 - - - - - - 0.66 - - - - 1.94 3.05 0.44 - - - 0.66 - 1.51
- 2.86 - 1.23 - - 1.73 - - - 1.24 - - - 1.02 2.42 - 0.53 - 0.95 - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.39 - - - - - - - 3.96 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.3 2.53 - - 1.56 2.27 - 2.33 - 1.32 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.35 - - - - - 4.39 - - - - - - -
- -1.41 - - -0.03 -0.98 -0.54 - - 0.55 - 0.11 0.42 - -1.08 -0.85 0.79 -1.58 2.86 - 1.74 1.2 0.67 - -0.08 0.09
- 3.96 - - - - - 2.27 - - - 2.48 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.64 2.65 - - - - - - - - 2.86 - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.88 - - - - - - - - - - - 4.15 - - 1.5 1.48 - -0.29 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - 2.98 - - 3.16 - - - - - - - - - - 3.2 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- 0.6 - - 0.36 - 2.53 2.07 - 0.38 0.43 0.58 3.18 - - - - - - - - - - - - -
- 2.69 - 0.6 1.81 - - - - - - - - -0.06 2.66 - - 1.65 2.04 - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.51 1.1 - - - - - - - - - - - - 3.43 - 0.75 1.37 - 0.43 - - 0.85 - - 2.09
2.52 1.04 1.02 - - - 1.0 0.68 0.92 - 2.36 2.47 - - - - - - - - - - - - - -
3.09 - - - - - - - - - 2.06 2.19 2.53 - - - - - - - - - - - - 1.59
- - - - 2.26 - 3.32 1.51 - - 2.0 1.59 0.38 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - -0.45 - - - - - - - - - - 4.56 - - -0.87 - - - 0.11
2.09 - - 3.18 - - - - - - - - - 1.51 - - - - - - 2.16 - - - 2.42 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.05 - - - - 1.82 0.87 - - - 0.77 - 2.08 - 2.79 - - - 1.2 1.76 - -
- - - - - - - - - - - - 4.04 - - - - - - - - 3.25 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - - - 1.13 - - - 1.2 - - - 1.0 - - 4.2 - 0.17 - - - - -
- - 1.96 - - 0.62 - 0.59 1.95 1.87 - - - - - - - 1.81 2.62 - -0.61 - - 0.27 - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
1.27 0.54 1.34 0.36 - 0.36 -0.65 -0.77 2.19 1.26 0.28 1.44 -0.76 - - - -0.68 -0.25 - - - 0.09 - -0.05 -1.27 -1.23
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - -
2.58 3.17 - - - - - - - - - - 2.99 - - - - - - - 1.61 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 1.52 - 4.31 - - 1.73 - - - - - - - - - -
- - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - 3.68 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.05 2.27 - - - - - - 2.22 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.89 1.77 - - - - - - - - - - - - 2.1 2.08 - 1.65 2.12 - - - 1.53 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.21 2.22 2.13 1.89 2.01 - - - - - - - - - - - - - - -
3.09 - - - - - - - 3.22 - 3.03 - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.49 - - - - - - - - - - - - - 2.05 - - 3.77 - - - 1.54 - 1.3 -
- - - - - - - - - - - - - - 3.81 - - - - 3.58 - - - - - -
1.88 2.91 - - - - - - - - - - - - 1.65 - - - 3.26 - - - - - 1.07 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
2.09 -0.37 1.92 0.33 -0.35 -0.12 - -1.36 -1.13 -1.34 0.27 1.31 1.1 0.71 - -1.27 -1.02 -0.84 -1.61 - 0.62 -0.58 -1.63 -1.35 -0.93 -1.76
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.44 - -0.25 - -0.35 - - 1.38 -0.21 -0.34 1.34 -0.14 - 1.74 - - - -0.84 - - - -0.51 - - - 0.32
- 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - 3.05 - - 2.86 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.16 - - - - - - 3.02 - - - - - -
- - - 1.72 - - 1.85 - - - - - 2.04 - - - - - - 2.91 0.7 - - - 2.55 -
- 3.51 - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - - - - - - - -
0.94 3.49 - 2.32 - - - - - - 1.21 1.34 - 1.59 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.22 -0.92 -0.13 -1.42 0.01 -0.52 0.14 -2.61 -0.5 -1.57 -1.56 -1.4 -0.47 1.01 2.88 -0.42 1.31 - -0.56 -0.12 1.76 - -1.88 - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.46 - - - - - 3.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.02 1.31 -0.24 0.71 0.56 0.71 0.21 - 0.81 0.71 -0.31 -0.15 -0.35 - -0.33 - -0.04 0.12 -0.6 1.02 - - - 0.36 - -
1.18 0.36 1.93 - - 0.13 0.57 - 2.81 - 1.63 - 0.01 - - - - - - - - - - 2.3 - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.12 1.94 - 2.83 - - - - - - - - 3.06 - - - - - 1.24 -
3.26 2.85 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.2 - - - - - - -
- 1.16 -0.01 - -0.3 2.29 - 0.88 - 0.95 - - - - - -0.11 0.22 -0.16 2.29 1.4 - - - 0.6 0.32 -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.24 3.49 2.12 2.64 0.91 - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.35 - - 1.14 - 1.03 - - - 4.01 - - 0.95 - - 0.16 - - - - -
- 3.31 - - - - - - - - 2.66 - - - 2.64 - - - - - 1.8 - - - - -
- - - - - - - - - - - 1.49 - 1.23 - - - - 2.91 - 2.46 2.58 - - - 0.89
- - - - - - 4.21 - - 2.91 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.4 - - - - - 2.28 -
4.52 - 1.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.94 - - - - - - - - - 3.41 -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.86 0.01 0.09 0.85 -0.82 0.59 -2.29 -2.26 0.23 - -1.22 - 0.42 0.6 1.27 2.14 0.13 1.76 0.4 - -1.02 -1.97 - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- 3.5 - - - - - - - 3.87 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.18 - - - - - - 0.47 1.36 - - - - - - - - - - 1.6 - - - - -0.08
- - - - - - - - - - - - - 2.75 - - - - 4.27 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.9 - - 2.85 - - - - - - - - - - - - - - 3.5 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.23 - - - - - 0.59 - 1.6 - - - 4.07 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.63 1.86 - 2.72 1.77 - - - - - - - - - - - - - - -
4.11 - 3.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.4 - 2.92 - 2.98 - - - - - - - - -
2.28 1.73 - - - - - 2.17 - - - - - - 1.9 - - 1.4 - - 2.8 - - - - -
- - - - -0.04 - 1.93 2.2 0.1 0.94 - - - - - - 2.15 1.04 2.1 -0.03 -0.88 - -0.6 - -0.56 -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.15 1.92 2.62 1.98 - 0.84 - - 1.85 - - 0.94 - 0.37 - - - - - - - 0.38
4.01 1.83 1.7 - - - - - - - - - - - - - - - 1.63 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 1.62 3.08 2.96 1.72 1.76 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.91 - - - - - -1.98 3.39 - - - - - - - - - -1.94 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.