1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_128 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.54 0.57 0.61 0.98 0.97 0.81 1.0 0.82 0.67 0.97 0.82 0.91 0.45 0.19 0.23 0.09 0.24 0.51 0.47 0.44 0.26 0.77 0.36 0.32 0.95 0.9
0.77 0.62 0.65 0.79 0.69 0.73 0.93 1.0 0.76 0.56 0.54 0.46 0.34 0.32 0.31 0.31 0.4 0.56 0.6 0.56 0.02 0.59 0.57 0.4 0.92 0.77
1.0 0.93 0.95 0.86 0.51 0.33 0.4 0.59 0.36 0.28 0.27 0.35 1.0 0.3 0.23 0.32 0.32 0.6 0.57 0.62 0.0 0.49 0.02 0.16 0.57 0.65
0.29 0.23 0.21 0.46 0.61 0.56 0.53 0.64 0.47 0.53 0.42 0.27 0.31 0.05 0.09 0.1 0.16 0.33 0.15 0.15 0.09 0.35 0.36 0.19 1.0 0.47
0.47 0.45 0.4 0.63 0.66 0.51 0.57 0.54 0.51 0.49 0.46 0.45 0.2 0.12 0.13 0.06 0.28 0.43 0.35 0.37 0.08 0.35 0.38 0.5 1.0 0.65
0.76 1.0 0.96 0.83 0.54 0.4 0.44 0.64 0.64 0.54 0.57 0.61 0.78 0.14 0.24 0.14 0.24 0.45 0.39 0.46 0.05 0.2 0.23 0.34 0.47 0.49
0.55 0.64 0.96 1.0 0.64 0.29 0.25 0.46 0.23 0.06 0.09 0.11 0.45 0.02 0.03 0.02 0.03 0.08 0.07 0.33 0.02 0.21 0.01 0.06 0.53 0.75
0.78 0.89 1.0 0.92 0.72 0.51 0.56 0.7 0.67 0.41 0.44 0.48 0.67 0.36 0.38 0.37 0.45 0.42 0.38 0.62 0.2 0.53 0.23 0.29 0.63 0.59
1.0 0.97 0.76 0.74 0.57 0.59 0.62 0.68 0.46 0.46 0.46 0.49 0.78 0.33 0.37 0.34 0.38 0.57 0.45 0.37 0.18 0.16 0.25 0.36 0.9 0.6
0.54 0.73 0.56 0.7 0.53 0.45 0.54 0.59 0.49 0.42 0.43 0.37 0.41 0.3 0.33 0.3 0.34 0.46 0.46 0.34 0.08 0.21 0.79 0.46 1.0 0.57
0.82 0.64 0.66 0.64 0.64 0.73 0.91 0.96 0.81 0.6 0.63 0.64 0.62 0.45 0.45 0.39 0.55 0.69 0.53 0.51 0.06 0.79 0.67 0.54 1.0 0.68
0.52 0.42 0.46 0.6 0.58 0.54 0.85 1.0 0.55 0.55 0.52 0.53 0.43 0.13 0.15 0.09 0.37 0.53 0.43 0.52 0.04 0.67 0.33 0.25 0.8 0.75
0.61 0.86 0.99 1.0 0.78 0.57 0.66 0.82 0.86 0.56 0.48 0.44 0.48 0.23 0.41 0.24 0.44 0.63 0.52 0.92 0.13 0.61 0.26 0.34 0.77 0.81
0.56 0.91 1.0 0.92 0.61 0.37 0.31 0.45 0.43 0.28 0.29 0.3 0.43 0.21 0.19 0.19 0.22 0.25 0.28 0.49 0.13 0.58 0.22 0.26 0.55 0.8
0.85 0.92 1.0 0.91 0.64 0.36 0.32 0.56 0.53 0.38 0.51 0.65 0.83 0.08 0.32 0.13 0.23 0.29 0.23 0.57 0.09 0.44 0.18 0.3 0.49 0.56
0.54 0.9 1.0 0.99 0.61 0.38 0.41 0.59 0.28 0.17 0.17 0.17 0.5 0.06 0.14 0.06 0.13 0.35 0.27 0.5 0.08 0.17 0.04 0.11 0.6 0.7
1.0 0.81 0.45 0.64 0.6 0.63 0.69 0.82 0.7 0.58 0.51 0.4 0.53 0.16 0.26 0.16 0.28 0.35 0.39 0.43 0.03 0.2 0.53 0.15 0.68 0.43
0.59 0.71 1.0 0.96 0.53 0.22 0.31 0.57 0.25 0.11 0.17 0.18 0.55 0.03 0.1 0.04 0.14 0.22 0.16 0.46 0.01 0.06 0.01 0.06 0.42 0.53
0.95 0.59 0.55 0.52 0.56 0.61 0.44 0.48 0.45 0.38 0.4 0.56 1.0 0.22 0.39 0.27 0.22 0.33 0.27 0.27 0.12 0.14 0.34 0.28 1.0 0.33
0.95 0.92 0.77 0.67 0.47 0.33 0.42 0.57 0.31 0.35 0.31 0.36 0.7 0.12 0.2 0.14 0.28 0.34 0.32 0.35 0.02 0.12 0.25 0.11 1.0 0.46
1.0 0.83 0.77 0.77 0.8 0.88 0.97 0.97 0.89 0.81 0.73 0.7 0.93 0.53 0.53 0.5 0.59 0.63 0.54 0.62 0.12 0.54 0.6 0.64 0.85 0.61
0.95 1.0 0.94 0.84 0.78 0.73 0.71 0.77 0.62 0.51 0.5 0.5 0.84 0.36 0.32 0.35 0.45 0.46 0.42 0.56 0.03 0.46 0.29 0.24 0.79 0.54
1.0 0.8 0.87 0.8 0.61 0.45 0.47 0.61 0.41 0.45 0.5 0.51 0.84 0.45 0.45 0.49 0.32 0.43 0.41 0.51 0.05 0.8 0.17 0.3 0.67 0.76
0.91 1.0 0.87 0.78 0.68 0.48 0.51 0.54 0.35 0.43 0.52 0.59 0.81 0.33 0.32 0.35 0.56 0.4 0.33 0.41 0.11 0.64 0.61 0.43 0.87 0.43
1.0 0.86 0.75 0.93 0.72 0.73 0.74 0.6 0.63 0.5 0.51 0.52 0.64 0.21 0.27 0.39 0.31 0.44 0.32 0.38 0.02 0.35 0.3 0.23 0.66 0.4
0.97 1.0 0.93 0.87 0.73 0.78 0.8 0.87 0.66 0.54 0.48 0.48 0.79 0.34 0.31 0.34 0.45 0.58 0.44 0.61 0.03 0.22 0.22 0.23 0.9 0.6
1.0 0.68 0.51 0.68 0.55 0.55 0.78 0.9 0.61 0.49 0.52 0.45 0.92 0.2 0.27 0.24 0.31 0.44 0.4 0.41 0.03 0.24 0.44 0.48 0.63 0.6
0.82 0.65 0.55 0.61 0.49 0.4 0.68 0.83 0.57 0.43 0.46 0.46 0.76 0.29 0.29 0.28 0.46 0.67 0.47 0.48 0.03 0.39 0.64 0.45 1.0 0.73
1.0 0.83 0.73 0.61 0.48 0.54 0.5 0.52 0.43 0.39 0.49 0.48 0.87 0.23 0.25 0.18 0.28 0.27 0.25 0.38 0.02 0.34 0.29 0.36 0.55 0.37
0.75 0.94 1.0 0.89 0.51 0.24 0.21 0.45 0.29 0.13 0.18 0.22 0.61 0.06 0.13 0.06 0.17 0.29 0.28 0.61 0.05 0.22 0.02 0.08 0.46 0.61
0.7 0.88 1.0 0.87 0.49 0.16 0.21 0.45 0.28 0.13 0.19 0.22 0.6 0.06 0.13 0.06 0.18 0.3 0.18 0.6 0.05 0.21 0.02 0.07 0.4 0.54
0.62 0.83 1.0 0.92 0.45 0.32 0.59 0.65 0.1 0.07 0.05 0.03 0.93 0.18 0.24 0.2 0.32 0.32 0.31 0.3 0.11 0.19 0.06 0.03 0.6 0.51
0.63 1.0 0.99 0.83 0.5 0.23 0.28 0.47 0.42 0.26 0.28 0.33 0.64 0.1 0.22 0.1 0.21 0.32 0.3 0.66 0.08 0.34 0.04 0.16 0.7 0.83
0.64 0.88 1.0 0.92 0.69 0.37 0.36 0.51 0.58 0.44 0.47 0.51 0.6 0.08 0.23 0.13 0.28 0.4 0.3 0.65 0.14 0.79 0.11 0.29 0.51 0.64
1.0 0.63 0.67 0.8 0.86 0.91 0.95 0.91 0.62 0.5 0.59 0.49 0.66 0.24 0.25 0.2 0.28 0.51 0.47 0.38 0.02 0.31 0.46 0.55 0.74 0.62
0.85 0.99 0.86 0.81 0.8 0.87 0.98 1.0 0.8 0.77 0.71 0.66 0.77 0.37 0.37 0.43 0.38 0.68 0.57 0.45 0.46 0.29 0.34 0.34 0.54 0.5
0.85 0.99 0.75 0.8 0.69 0.6 0.65 0.71 0.59 0.5 0.47 0.52 0.71 0.23 0.25 0.26 0.36 0.44 0.34 0.3 0.15 0.29 0.58 0.51 1.0 0.41
0.89 0.89 0.89 0.87 0.76 0.77 0.95 1.0 0.7 0.74 0.63 0.58 0.88 0.22 0.18 0.23 0.27 0.43 0.35 0.33 0.15 0.13 0.26 0.26 0.89 0.54
0.82 1.0 0.99 0.84 0.81 0.69 0.89 0.82 0.81 0.81 0.82 0.72 0.81 0.5 0.68 0.58 0.36 0.81 0.56 0.38 0.42 0.48 0.45 0.36 0.4 0.39
0.92 0.99 0.93 0.77 0.63 0.51 0.45 0.37 0.25 0.21 0.21 0.32 1.0 0.46 0.38 0.35 0.36 0.25 0.29 0.22 0.06 0.13 0.52 0.45 0.72 0.42
1.0 0.79 0.68 0.56 0.5 0.6 0.6 0.63 0.48 0.43 0.45 0.45 0.87 0.41 0.35 0.32 0.37 0.36 0.36 0.4 0.03 0.3 0.19 0.25 0.54 0.47
1.0 0.74 0.76 0.51 0.39 0.3 0.32 0.31 0.17 0.22 0.2 0.2 0.72 0.1 0.12 0.11 0.19 0.27 0.34 0.29 0.0 0.06 0.14 0.07 0.62 0.42
1.0 0.93 0.68 0.6 0.59 0.51 0.61 0.57 0.4 0.38 0.28 0.22 0.83 0.64 0.31 0.39 0.36 0.33 0.24 0.28 0.03 0.64 0.4 0.22 0.68 0.44
0.71 0.87 0.89 1.0 0.84 0.69 0.75 0.9 0.72 0.72 0.7 0.59 0.73 0.18 0.21 0.19 0.34 0.52 0.35 0.57 0.02 0.13 0.15 0.29 0.76 0.65
0.93 1.0 0.86 0.78 0.65 0.58 0.56 0.66 0.6 0.39 0.44 0.53 0.95 0.38 0.33 0.37 0.38 0.56 0.45 0.49 0.02 0.19 0.19 0.19 0.47 0.32
0.77 0.75 1.0 0.96 0.68 0.62 0.62 0.8 0.66 0.84 0.65 0.55 0.49 0.11 0.23 0.13 0.43 0.46 0.43 0.75 0.03 0.2 0.27 0.19 0.5 0.51
0.78 1.0 1.0 0.92 0.5 0.28 0.37 0.6 0.37 0.35 0.38 0.43 0.79 0.11 0.14 0.09 0.21 0.45 0.3 0.58 0.01 0.14 0.03 0.15 0.57 0.83
0.58 0.92 1.0 0.86 0.54 0.3 0.29 0.42 0.34 0.18 0.19 0.23 0.53 0.08 0.13 0.26 0.19 0.23 0.23 0.53 0.04 0.16 0.07 0.09 0.26 0.32
0.6 0.59 0.44 0.58 0.68 0.64 0.55 0.57 0.5 0.54 0.43 0.36 0.41 0.34 0.29 0.27 0.36 0.53 0.49 0.45 0.09 0.29 0.59 0.53 1.0 0.63
1.0 0.72 0.58 0.64 0.45 0.53 0.35 0.49 0.3 0.34 0.46 0.54 0.84 0.14 0.25 0.14 0.22 0.23 0.26 0.17 0.1 0.17 0.56 0.23 1.0 0.33
0.98 1.0 0.9 0.75 0.62 0.62 0.7 0.74 0.64 0.58 0.55 0.59 0.83 0.47 0.42 0.49 0.57 0.68 0.53 0.7 0.11 0.4 0.31 0.34 0.88 0.64
0.65 1.0 0.8 0.69 0.57 0.45 0.46 0.51 0.41 0.43 0.47 0.51 0.65 0.08 0.15 0.08 0.24 0.43 0.29 0.52 0.0 0.28 0.15 0.21 0.46 0.45
0.79 1.0 0.89 0.88 0.71 0.54 0.6 0.69 0.57 0.43 0.42 0.46 0.68 0.25 0.33 0.31 0.37 0.49 0.54 0.53 0.11 0.74 0.14 0.25 0.57 0.68
0.3 0.39 0.72 1.0 0.6 0.19 0.18 0.38 0.11 0.01 0.02 0.02 0.23 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.29 0.03 0.06 0.01 0.03 0.32 0.5
0.87 1.0 0.8 0.68 0.44 0.41 0.4 0.49 0.36 0.33 0.35 0.37 0.64 0.08 0.12 0.1 0.23 0.25 0.22 0.28 0.07 0.22 0.38 0.32 0.64 0.36

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)