1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_45 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
11.68 11.81 11.29 12.83 8.08 5.12 11.62 14.11 7.63 8.98 8.58 8.53 12.99 28.08 20.3 30.93 15.15 18.14 15.37 7.04 27.82 8.38 19.42 11.08 28.04 19.13
14.44 14.33 13.77 13.59 9.49 5.11 14.31 17.73 7.98 9.89 8.17 9.63 15.68 47.66 33.44 58.93 28.18 32.61 24.5 10.39 33.78 7.45 16.52 10.02 32.59 22.61
3.71 2.06 2.26 2.95 2.03 1.92 5.7 6.76 5.92 6.95 7.71 5.33 3.85 6.83 7.48 6.52 5.35 8.79 5.92 4.06 6.87 3.49 6.54 6.11 11.66 9.86
4.54 2.57 2.79 2.81 3.06 2.86 5.95 6.21 7.56 7.35 6.91 6.47 4.72 6.04 7.34 6.5 4.83 7.25 6.68 4.48 6.64 4.32 5.21 9.17 11.81 9.01
0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.02 0.23 0.11 0.03 0.37 0.02 0.06 0.02 0.27 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
112.52 59.78 44.1 42.58 55.1 57.76 103.17 79.11 65.56 99.07 104.21 97.29 86.96 123.23 28.34 52.05 103.44 89.36 82.19 86.81 85.27 37.67 153.49 202.08 93.03 180.21
79.9 44.42 30.22 33.97 43.92 47.66 68.09 56.32 46.7 67.7 68.03 74.49 62.16 84.32 19.5 30.52 60.52 74.18 60.79 52.3 92.31 37.13 137.06 153.23 94.18 159.23
124.15 65.98 45.88 51.62 74.0 99.65 96.49 82.16 82.4 103.87 109.57 110.24 104.81 84.78 20.68 36.41 67.06 55.52 62.21 56.16 84.33 40.41 160.59 180.5 111.83 160.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.01 0.04 0.0 0.02 0.05 0.26 0.08 0.05 0.12 0.09 0.2 0.09 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.14 0.03 0.19 0.09 0.08 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 0.0 0.03 0.02 0.0 0.17 0.02 0.04 0.36 0.06 0.11
0.61 0.23 0.22 0.36 0.23 0.24 0.11 0.13 0.11 0.66 0.85 0.66 0.38 0.03 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 2.2 2.2 0.36 4.52 2.43 2.98
0.41 0.17 0.17 0.2 0.14 0.09 0.13 0.09 0.07 0.39 0.61 0.47 0.38 0.03 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.42 1.82 0.24 2.87 2.04 2.38
0.09 0.17 0.0 0.11 0.14 0.02 0.05 0.14 0.11 0.08 0.15 0.02 0.18 0.55 0.17 0.09 0.15 0.15 0.14 0.26 0.24 0.17 0.0 1.3 0.06 0.01
1.67 1.18 1.29 2.44 3.1 1.91 1.42 1.67 1.69 2.18 2.89 2.12 0.91 0.75 1.09 0.57 0.98 0.99 1.77 2.33 5.68 3.99 10.1 9.02 5.55 8.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
5.87 4.13 4.88 4.72 4.89 4.83 6.42 7.03 7.05 7.36 6.73 6.5 6.22 8.05 7.18 7.47 6.13 6.83 5.58 6.16 4.77 6.59 6.76 7.86 8.97 8.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.09 0.16 0.11 0.28 0.17 0.22 0.25 0.31 0.25 0.26 0.23 0.03 0.32 0.26 0.28 0.26 0.21 0.18 0.2 0.59 0.24 0.4 0.48 0.43 0.27
0.31 0.62 0.82 0.72 0.48 0.56 0.39 0.52 0.54 0.62 0.62 0.51 0.21 0.94 0.9 0.49 0.4 2.04 1.48 0.4 2.31 0.26 2.02 0.57 3.02 0.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
24.63 30.75 26.48 19.42 9.14 5.87 13.47 27.96 38.67 43.53 42.19 42.48 30.8 25.68 41.97 29.99 35.19 57.61 34.99 28.63 31.64 32.37 23.32 37.08 36.79 28.82
9.77 8.45 7.93 9.56 11.07 9.13 9.28 9.34 8.56 9.41 9.76 8.36 9.34 10.86 11.63 13.28 9.94 12.93 9.77 10.53 11.09 9.5 9.39 10.48 12.55 12.92
0.34 0.07 0.04 0.2 0.14 0.07 0.05 0.17 0.16 0.1 0.34 0.19 0.07 0.19 0.06 0.09 0.08 0.13 0.12 0.08 0.58 0.35 0.52 1.31 0.9 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.04 0.0 0.18 0.0 0.19 0.04 0.0 0.24 0.37 0.0 0.0 0.67 0.03 0.0
0.37 0.21 0.18 0.24 0.18 0.21 0.28 0.14 0.18 0.19 0.42 0.47 0.37 0.14 0.12 0.15 0.05 0.16 0.19 0.19 0.28 0.07 0.97 0.93 0.56 0.67
0.0 0.16 0.13 0.07 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.24 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.08 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.61 0.0 0.07 0.08 0.48 0.27 0.39 0.41 0.46 3.03 5.1 3.93 0.87 0.22 0.27 0.02 2.2 1.57 0.53 0.41 1.15 1.12 1.01 11.88 1.65 1.58
0.31 0.04 0.0 0.0 0.16 0.05 0.0 0.27 0.56 1.41 1.77 1.82 0.68 0.01 0.14 0.0 0.56 0.56 0.45 0.03 0.87 0.14 0.51 4.78 0.64 1.22
0.19 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.87 2.06 2.17 0.2 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.99 0.5 0.01 4.13 0.1 0.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.49 0.49 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.25 0.02 0.02 0.95 0.0 0.14
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.39 0.78 0.49 0.14 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.18 1.79 0.05 0.2
0.06 0.03 0.04 0.0 0.06 0.17 0.02 0.14 0.05 0.08 0.12 0.02 0.02 0.09 0.04 0.17 0.03 0.37 0.59 0.03 0.0 0.13 0.0 0.51 0.03 0.62
0.04 0.11 0.04 0.07 0.12 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.02 0.0 0.06 2.45 2.46 2.12 1.28 0.5 0.66 1.27 1.67 0.58 6.24 8.45 2.6 6.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.02 0.64 0.57 0.2 0.17 6.27 1.83 0.92 7.03 3.03 6.5
0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.88 0.8 0.37 0.0 5.25 1.49 0.96 8.72 2.29 4.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
32.9 37.66 38.61 33.41 29.5 26.2 35.32 36.16 27.0 29.15 30.35 30.21 36.29 42.95 45.83 41.81 35.21 50.14 39.56 33.8 39.71 9.23 52.45 38.24 65.42 46.7
13.66 15.88 16.46 15.53 14.87 11.06 13.33 13.18 12.84 12.08 15.63 16.52 12.35 16.18 12.96 14.51 10.19 23.56 17.1 11.5 24.63 4.94 23.6 33.02 29.52 32.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.34 6.41 10.43 8.88 7.01 6.3 8.39 9.69 9.39 9.06 8.19 6.38 6.56 10.97 17.9 17.14 13.62 38.67 27.29 21.29 35.69 5.46 14.71 7.98 49.12 14.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.59 0.2 0.11 0.1 0.08 0.1 1.08 0.36 1.57 2.3 0.59 2.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.05 0.0 0.07 0.03 0.0 0.81 0.18 0.93 1.3 0.39 1.54
0.02 0.06 0.14 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.02 0.08 0.01 0.08 0.02 0.12 0.03 0.38 0.24 0.1 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.09 0.18 0.05 0.08 0.0 0.0 0.14 0.04 0.0
13.11 13.96 12.42 10.9 8.72 7.62 10.35 11.41 7.8 8.63 9.87 9.76 17.83 23.02 20.18 26.15 13.62 23.96 20.64 8.17 24.97 9.0 15.26 13.07 33.24 14.0
8.0 5.15 7.29 9.07 7.69 5.11 7.95 7.74 6.46 10.78 9.53 9.79 8.81 13.49 6.49 10.06 7.04 8.09 8.64 8.83 17.64 8.06 25.25 22.49 16.88 30.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.69 0.45 0.29 0.63 0.13 0.52 7.73 7.98 2.72 8.5 10.99 14.72
0.09 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.03 0.2 0.96 0.62 0.28 0.33 0.39 0.61 8.96 9.37 4.77 16.56 10.19 16.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
15.93 14.43 12.09 10.62 7.26 6.41 7.82 11.57 13.61 14.15 13.76 13.14 16.73 7.67 12.45 11.31 14.74 25.27 16.4 12.61 19.96 8.55 12.84 8.95 19.53 10.76
0.0 0.0 0.08 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0
0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.12 0.81 0.34 0.17 0.31 0.21 0.3 0.0 0.22 0.0 0.56 0.03 0.0
2.98 5.36 7.37 7.22 5.59 4.19 7.18 8.66 7.14 8.8 9.81 10.4 3.2 4.56 5.25 6.15 6.52 10.76 8.64 6.73 6.09 5.24 5.96 4.19 10.06 4.99
0.8 0.39 0.48 1.03 0.87 0.62 0.65 0.44 1.1 1.13 0.77 0.7 0.86 1.03 0.82 1.39 1.02 1.54 2.15 0.79 0.03 0.04 0.24 1.65 0.73 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.03 0.12 0.11 0.0 0.13 0.04 0.09 0.22 0.03 0.26 0.32 0.1 0.16
0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.07 0.06 0.06 0.05 0.05 0.14 0.12 0.05 0.0 0.11 0.09 0.04 0.01 0.0 0.07 0.14 0.0 0.22
0.13 0.29 0.2 0.13 0.2 0.52 0.35 0.31 0.21 0.14 0.22 0.23 0.12 0.21 0.52 0.4 0.09 0.2 0.79 0.16 0.44 0.32 0.31 0.69 0.5 0.47
1.13 1.08 0.79 1.14 0.58 1.4 1.43 0.38 1.68 1.58 1.35 1.4 0.91 1.5 1.81 1.56 0.89 2.84 2.4 0.82 0.86 0.36 0.96 2.44 1.08 2.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
13.44 11.92 10.55 5.79 5.54 6.87 9.81 9.99 7.38 7.7 7.07 6.28 14.17 6.02 8.96 7.01 6.75 18.4 16.39 9.97 11.81 3.67 12.37 9.75 18.08 12.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.18 0.05 0.07 0.25 0.15 0.12
5.92 4.14 4.47 4.85 3.6 2.69 5.66 7.61 4.92 7.33 8.03 7.22 8.69 11.47 5.61 8.04 4.03 9.63 7.74 7.58 8.3 8.4 6.48 4.8 8.66 8.36
10.48 6.96 7.87 8.22 4.86 3.96 9.06 11.02 8.34 11.75 10.84 10.4 13.25 18.04 10.62 12.46 6.03 16.01 14.69 13.01 13.98 15.63 12.47 6.23 14.38 13.62
0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.23 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.03 0.02 0.0 0.0 0.18 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)