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Heatmap: Cluster_172 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.08 -0.02 -0.04 0.01 0.22 0.66 0.64 0.29 0.07 -0.3 -0.61 -0.8 -0.73 -0.28 0.17 0.39 0.03 -0.19 0.37 -0.34 -2.77 -0.81 0.46 -0.4 0.66 0.26
-0.17 -0.63 -0.78 -0.58 -0.03 0.26 0.32 0.08 0.48 0.34 0.26 -0.27 -0.5 -0.35 0.49 0.01 -0.25 0.14 0.08 -0.34 -2.43 -0.07 0.76 0.48 0.35 -0.23
-0.37 0.07 -0.02 -0.33 -0.09 0.36 0.27 0.09 0.46 0.0 -0.13 -0.4 -0.82 -0.39 0.06 -0.82 -0.13 -0.03 0.42 0.17 -3.59 0.23 0.77 0.58 0.16 -0.01
-0.65 0.1 -0.03 0.09 0.53 0.69 0.32 0.21 0.18 0.09 0.15 -0.02 -0.98 -0.17 -0.04 0.06 -0.0 0.06 0.0 -0.03 -1.96 -1.14 0.91 -0.03 -0.37 -0.49
0.64 -0.52 -1.47 -0.12 0.11 -1.27 0.08 -0.21 0.24 0.33 0.67 0.42 1.2 -1.67 -1.06 -0.25 -1.08 0.04 -0.47 -0.62 -1.73 1.08 0.7 0.15 -0.11 -0.3
0.78 - -0.13 2.07 1.03 -0.38 -0.56 0.19 0.76 -0.23 1.36 0.54 0.04 - - - -2.49 -1.88 -2.07 -2.07 - -1.39 1.18 -1.23 1.4 -1.69
-0.48 -0.38 -0.33 -0.01 0.14 0.07 0.39 0.28 0.3 0.12 0.11 -0.03 -0.52 -0.14 -0.04 0.01 -0.14 0.31 0.09 -0.14 -1.95 0.16 0.64 0.19 -0.06 -0.07
-0.3 0.12 0.03 0.33 0.18 0.35 0.45 0.39 0.39 0.09 -0.01 -0.04 -0.51 -0.47 -0.06 -0.42 -0.38 0.29 0.1 -0.25 -2.64 0.16 0.46 -0.04 -0.24 -0.18
-0.81 -1.29 -1.26 -0.6 -0.02 0.08 0.75 0.25 0.19 0.23 -0.04 -0.87 -1.52 -0.37 -0.96 -0.98 -0.01 1.1 0.39 0.21 -1.31 -1.84 1.12 -0.19 1.03 0.74
-0.71 -0.81 -0.42 -0.01 -0.25 0.69 0.12 -0.3 -0.5 -0.44 -0.32 0.17 -0.87 0.23 0.03 -0.05 -0.05 0.59 0.32 0.25 -1.19 0.0 0.83 -0.3 0.47 0.41
-3.11 -1.33 -1.04 -0.46 0.42 0.79 0.09 0.03 -0.0 0.25 -0.32 0.03 -2.98 -0.42 -0.47 0.06 -0.12 0.18 0.17 -0.04 -0.35 0.41 1.36 0.85 -0.01 -0.24
-0.81 -1.07 -1.37 -0.79 0.2 0.17 0.64 0.53 0.12 -0.02 -0.42 -0.48 -1.62 -0.44 -0.66 0.06 0.14 0.99 0.91 0.36 -2.15 -1.83 1.14 -0.24 0.45 0.34
0.64 0.15 -0.14 0.04 0.09 -0.25 -0.03 0.22 0.12 0.25 0.41 0.58 0.66 -0.93 -0.54 -0.69 -0.57 -0.21 -0.03 -0.49 -1.19 0.36 0.42 0.2 -0.2 -0.92
0.06 0.37 -0.25 0.09 -0.05 -0.35 -0.36 -0.12 0.1 -0.08 0.03 -0.27 0.37 -0.7 -0.11 -0.27 -0.58 0.48 -0.2 -0.92 -2.42 0.85 0.77 -0.7 0.83 0.29
0.15 0.28 0.03 0.06 0.32 0.55 0.38 0.3 0.22 -0.26 -0.26 -0.34 -0.39 -0.36 -0.46 -0.37 -0.26 0.21 0.03 -0.47 -1.35 0.48 0.41 -0.26 0.15 -0.14
-0.3 -0.15 -0.13 -0.01 0.31 0.23 0.58 0.34 0.36 0.15 0.07 -0.14 -0.23 -0.19 -0.14 -0.07 0.01 0.41 0.23 0.12 -3.91 -1.15 1.09 -1.21 -0.13 -0.53
-0.11 -0.18 -0.04 0.12 0.32 0.39 0.38 0.34 0.15 0.01 -0.05 -0.13 0.02 -0.04 -0.1 0.13 -0.0 0.16 0.1 -0.05 -1.98 0.19 0.02 -0.52 -0.2 -0.2
-0.2 -0.81 -1.65 0.9 0.96 -0.44 0.74 0.9 0.4 0.72 0.88 0.95 0.45 -2.78 -3.06 -2.16 -2.76 -0.89 -1.01 -3.24 -1.64 0.15 0.64 0.8 -0.53 -0.22
0.7 -1.18 - - -1.13 - - -0.43 0.25 0.18 1.48 -0.23 0.67 - -1.41 - - -0.91 0.96 - -0.32 0.89 2.23 0.44 1.34 0.12
-0.27 -0.33 -0.28 -0.08 0.16 0.53 0.49 0.21 0.18 -0.02 -0.3 -0.57 -0.46 -0.35 0.02 -0.17 -0.14 0.22 0.31 0.04 -0.74 0.08 0.71 0.23 -0.22 -0.32
-0.88 -0.29 -0.13 -0.07 0.05 -0.04 -0.09 -0.01 0.16 0.05 0.18 0.15 -0.83 -0.06 -0.04 -0.23 -0.22 0.23 0.22 -0.56 -0.87 0.26 0.95 0.52 0.12 0.01
0.34 0.36 0.34 0.3 0.15 0.09 0.01 0.16 0.0 -0.27 -0.05 0.18 0.28 -0.87 -0.5 -0.3 -0.56 -0.15 -0.18 -0.47 -1.04 0.41 0.66 -0.3 0.28 -0.24
-0.56 -0.57 -0.27 -0.0 0.09 0.31 0.3 0.15 0.35 0.28 0.23 0.31 -0.1 -0.0 -0.06 0.12 -0.19 -0.11 -0.07 -0.18 -3.18 0.13 0.79 -0.01 -0.11 -0.33
-0.17 -0.01 -0.11 0.05 0.28 0.31 0.18 0.08 0.17 0.1 0.08 0.04 -0.42 -0.24 0.12 0.06 -0.28 0.44 0.12 -0.4 -1.13 0.0 0.15 -0.04 0.1 -0.22
-0.1 -0.15 -0.28 0.19 0.31 0.14 0.18 0.02 0.21 0.13 0.15 -0.08 -0.48 -0.59 -0.4 -0.53 -0.35 0.02 -0.11 -0.09 -2.58 1.03 0.75 0.09 0.03 -0.1
-0.85 -0.24 0.02 0.37 0.22 -0.26 0.15 0.28 0.17 0.0 0.11 -0.27 -1.34 0.2 0.44 0.35 -0.07 0.54 0.16 -0.3 -1.27 -0.94 0.67 -0.22 0.11 -0.05
-0.08 -0.63 -0.47 -0.21 -0.04 0.13 0.38 0.26 0.23 -0.09 -0.19 -0.09 0.08 0.2 -0.03 0.14 -0.29 0.06 -0.34 -0.43 -0.61 0.79 0.57 -0.33 0.01 -0.05
1.38 -0.6 -1.36 1.64 0.56 - -1.25 -0.38 0.21 -2.45 1.21 0.32 1.03 - - - - -0.95 -1.37 -2.74 -2.03 0.9 1.91 -0.76 -0.42 0.44
-0.26 0.05 -0.09 0.34 0.33 0.36 0.47 0.49 0.34 0.04 -0.15 -0.29 -0.43 -0.23 -0.34 -0.15 -0.13 0.57 0.13 0.05 -3.72 -0.2 0.44 -0.59 -0.02 -0.3
-0.15 -0.51 -0.13 0.02 0.23 0.24 0.11 0.18 0.23 0.08 0.08 0.22 -0.04 -0.28 -0.13 -0.21 -0.3 -0.02 -0.12 -0.16 -0.83 0.52 0.4 -0.05 0.1 -0.12
0.2 -0.02 -0.28 -0.0 0.11 -0.01 0.07 0.18 0.27 0.14 0.25 0.02 0.02 -0.64 -0.29 -0.54 -0.34 0.47 0.15 -0.39 -3.44 0.69 0.93 -0.65 -0.24 -0.02
-0.08 0.13 -0.08 0.16 0.39 0.18 0.11 0.07 -0.09 -0.01 -0.02 0.02 0.03 -0.47 -0.18 0.3 -0.13 0.16 -0.18 -0.11 -1.86 0.77 0.25 -0.2 -0.34 -0.21
-0.39 -0.16 -0.03 0.03 -0.05 -0.15 0.16 0.25 0.27 0.03 -0.09 -0.12 -0.18 0.1 0.23 0.23 0.16 0.37 0.16 0.05 -1.94 -1.52 0.64 -0.1 0.2 -0.08
-1.05 0.5 0.09 0.12 0.43 0.72 0.29 -0.26 -0.57 -1.03 -1.04 -0.81 -1.36 0.22 0.16 -0.27 0.11 0.32 0.76 0.15 -2.55 -0.07 0.11 -0.01 -0.15 0.96
0.93 0.41 0.87 0.28 -0.5 -0.49 0.2 0.14 -0.39 0.49 -0.55 0.46 0.25 0.19 -1.52 -1.21 -2.27 0.06 -0.93 -1.25 -2.4 -1.36 1.57 -0.23 -0.03 0.19
-0.89 -0.27 -0.12 0.18 0.4 0.69 0.12 -0.38 -0.02 -0.1 -0.22 -0.26 -0.99 -0.34 -0.09 0.06 -0.04 0.33 0.33 0.19 -1.31 0.29 0.49 0.21 0.1 0.01
-0.4 -0.65 -0.46 -0.21 0.34 0.85 0.69 0.4 0.3 -0.07 -0.57 -0.73 -0.43 -0.2 -0.09 -0.08 -0.18 0.19 0.19 0.03 -0.33 -0.93 0.9 0.24 -0.54 -0.31
1.02 0.29 -0.16 0.55 -0.19 -0.64 -0.35 -0.12 0.03 -0.2 0.57 0.16 0.42 -1.88 -1.23 -1.06 -0.87 -0.14 -0.47 -0.69 -0.66 0.54 1.0 0.58 0.07 -0.45
1.13 -0.11 -0.21 0.23 -0.81 -1.5 -0.88 -0.15 0.0 -0.17 0.42 0.01 0.08 -2.35 -1.11 -2.4 -1.46 -0.95 -0.85 -1.16 0.21 1.09 1.47 1.42 -0.17 -0.25
-1.33 -0.51 -0.4 -0.31 0.17 0.35 0.26 0.13 0.05 -0.0 -0.03 -0.11 -1.13 -0.34 -0.33 -0.29 0.05 0.2 0.41 0.27 -0.1 0.31 0.7 0.35 -0.06 0.13
-0.1 0.15 -0.09 0.09 0.31 0.23 0.29 0.29 0.18 -0.04 -0.15 -0.36 -0.23 -0.28 0.18 -0.11 -0.2 0.45 0.32 -0.11 -1.93 0.08 0.41 -0.32 -0.04 -0.45
0.02 0.08 0.22 0.41 0.42 0.2 0.1 0.15 0.08 -0.09 0.21 0.38 -0.55 -0.86 -0.98 -0.64 -1.18 0.1 -0.28 -0.2 -1.35 0.07 0.99 0.36 0.11 -0.1
-0.15 0.07 -0.56 -0.33 -0.0 0.07 -0.03 -0.13 -0.25 -0.22 -0.33 -0.18 -0.7 0.19 0.09 -0.12 -0.23 0.19 0.36 -0.29 -2.21 0.38 0.99 0.41 0.19 0.53
0.09 0.19 0.08 0.15 0.07 0.43 0.05 -0.0 -0.16 -0.57 -0.49 -0.49 -0.33 -0.39 -0.07 -0.31 -0.28 0.09 0.4 -0.09 -1.69 -0.18 0.58 0.61 0.44 0.22
0.71 0.08 0.27 0.18 -0.08 -0.1 -0.49 -0.05 0.18 -0.63 -0.1 0.12 0.53 -0.86 -1.47 -0.75 -0.94 -0.16 -0.6 -1.2 -1.43 1.26 1.2 -0.12 0.38 -0.24
-0.07 -0.04 -0.2 -0.23 0.1 0.23 0.07 -0.1 -0.36 -0.44 -0.53 -0.56 -1.05 -0.29 0.15 -0.09 0.11 0.48 0.68 0.41 -1.71 -0.98 0.97 0.24 0.52 0.11
-0.31 -0.2 0.0 0.24 0.36 0.28 0.55 0.38 0.16 0.12 -0.01 -0.16 -0.21 -0.03 -0.26 0.09 0.52 0.2 0.12 -0.02 -3.2 -0.13 0.04 -0.59 -0.26 -0.24
-1.8 -0.97 -0.16 0.06 0.39 0.71 0.54 0.29 0.28 -0.08 -0.26 -0.43 -1.58 0.1 0.12 -0.05 -0.21 -0.25 -0.14 -0.07 -1.83 0.37 1.1 0.34 0.06 -0.23
-0.97 -0.48 -0.4 0.06 0.29 0.23 0.38 0.37 0.53 0.14 0.13 -0.15 -1.39 -0.62 -0.26 -0.17 -0.14 0.15 0.2 0.07 -1.91 0.59 1.02 0.0 0.06 -0.65
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1.17 -0.07 -1.22 0.39 -1.2 -1.33 -2.95 -0.44 -0.29 -0.54 0.82 0.01 1.07 -3.72 -3.42 -3.51 -3.4 -2.23 -1.79 -3.23 0.0 1.45 1.36 1.19 1.05 0.46
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-2.11 -0.65 -0.41 0.16 0.42 0.45 0.68 0.34 0.26 0.2 0.0 -0.33 -1.12 0.25 -0.05 0.11 -0.21 0.01 -0.05 -0.1 -1.79 0.23 1.09 -0.6 0.08 -0.36
0.1 0.01 -0.21 -0.4 -0.16 0.09 -0.18 -0.36 -0.28 -0.53 -0.43 -0.24 -0.36 -0.31 -0.14 -0.53 -0.28 0.01 0.23 -0.05 -2.23 -0.1 1.21 0.83 0.79 0.55
1.01 -0.62 -0.02 0.94 0.29 -0.36 -0.05 0.69 0.52 1.49 0.92 0.74 0.94 -3.01 -4.1 -1.57 -3.8 -1.12 -0.77 -2.8 - -0.84 0.95 -3.4 0.27 -0.89
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-0.57 -0.07 0.16 0.15 0.12 0.24 0.16 0.25 0.08 -0.24 -0.23 -0.28 -0.76 -0.37 -0.03 -0.31 0.2 0.17 0.23 0.27 -0.91 -0.34 0.82 0.18 0.08 -0.13
-0.22 -0.02 0.09 0.12 0.35 0.52 0.63 0.55 0.5 0.08 -0.11 -0.28 -0.13 -0.34 -0.01 0.07 -0.01 0.4 0.28 -0.04 -3.92 -0.02 -0.16 -0.6 -0.67 -0.76
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-0.57 -0.64 -0.48 -0.52 0.28 0.86 0.33 -0.09 -0.42 -0.8 -0.78 -1.04 -0.93 0.12 0.46 0.34 0.32 0.66 0.57 0.09 -0.28 0.03 1.03 -0.25 -0.64 -0.59
0.4 0.33 0.1 0.59 0.44 0.29 0.02 0.06 0.04 -0.3 -0.23 0.01 0.24 -0.84 -0.19 -0.38 -1.01 -0.82 -0.51 -0.68 -0.85 0.25 1.31 -1.55 0.21 0.02
-0.56 0.23 0.07 -0.01 -0.1 0.15 -0.35 -0.19 -0.11 -0.27 -0.09 -0.04 -0.82 0.14 0.01 -0.2 -0.34 0.16 0.08 -0.65 -3.59 1.0 0.82 0.24 0.29 0.42
-1.15 -1.0 -1.11 -0.04 -0.57 0.89 0.62 -0.13 0.36 -0.71 -0.96 -1.58 -2.59 0.02 -0.39 0.06 -0.05 -0.37 0.74 0.43 0.84 0.12 1.56 -0.15 -0.16 -0.92
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-0.53 -0.36 -0.54 -0.66 -0.06 0.21 0.24 0.04 0.36 0.44 0.41 0.23 -0.68 0.02 -0.74 -0.39 -0.17 -0.03 -0.08 0.16 -2.09 0.21 1.1 0.33 -0.11 0.13
-0.47 -0.31 0.21 0.19 0.49 0.56 0.4 0.35 0.43 -0.35 -0.06 -0.37 -0.84 -0.67 -0.12 0.1 -0.35 0.18 0.1 -0.05 -2.34 -0.64 0.58 0.11 0.09 0.28
-2.04 -0.66 -0.94 -0.33 0.43 0.22 -0.11 -0.37 -0.01 -0.01 0.16 -0.05 -2.02 -0.15 0.04 -0.08 0.08 0.38 0.42 0.12 -2.73 0.72 1.42 0.31 0.15 -0.3
0.13 0.07 0.1 0.06 0.43 0.6 0.47 0.37 0.1 0.02 -0.14 -0.28 0.04 -0.37 -0.29 -0.19 0.04 0.11 0.15 -0.02 -3.53 0.55 0.16 -0.98 -0.14 -0.72
-0.14 -0.28 -0.7 -0.15 -0.03 0.16 0.39 0.3 0.32 0.3 0.29 0.13 -0.64 -0.38 0.0 0.01 -0.19 0.34 0.17 -0.22 -2.54 0.35 0.48 0.27 -0.2 -0.26
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-2.65 -2.36 -0.83 -0.01 0.78 0.96 0.71 0.22 0.4 0.39 0.35 -0.07 -2.32 0.32 -0.37 -0.05 -0.71 0.42 0.08 0.55 -5.5 -2.49 1.43 -0.1 -0.79 -0.46
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-0.0 -0.08 -0.02 0.12 0.28 0.4 0.38 0.29 0.26 0.02 -0.18 -0.34 -0.23 -0.36 -0.27 -0.16 -0.14 0.1 -0.08 0.01 -0.99 0.1 0.53 -0.21 -0.05 -0.15
-0.23 -0.04 -0.07 0.13 0.18 0.24 0.45 0.44 0.35 0.11 0.08 -0.2 -0.45 -0.46 -0.26 0.17 -0.23 0.34 0.12 -0.17 -1.04 -1.34 0.71 -0.24 0.25 -0.44
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.