Heatmap: Cluster_149 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.18 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.35 0.41 0.47 0.54 0.62 0.69 0.63 0.64 0.57 0.42 0.44 0.29 0.34 0.33 1.0 0.36 0.33 0.32 0.43 0.1 0.31 0.46 0.63 0.28 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.09 0.18 1.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0
0.42 0.42 0.41 0.4 0.45 0.51 0.55 0.5 0.44 0.45 0.39 0.42 0.44 0.33 0.27 1.0 0.29 0.46 0.48 0.4 0.12 0.35 0.2 0.2 0.33 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.12 0.1 0.05 0.12 0.16 0.36 0.35 0.6 0.81 0.68 0.77 0.05 0.13 0.11 1.0 0.19 0.23 0.27 0.31 0.02 0.01 0.61 0.67 0.6 0.28
0.24 0.28 0.32 0.38 0.47 0.36 0.41 0.42 0.39 0.33 0.28 0.25 0.21 0.29 0.36 1.0 0.14 0.25 0.37 0.22 0.14 0.63 0.12 0.24 0.26 0.32
0.38 0.13 0.0 0.18 0.35 0.36 0.55 0.43 0.26 0.16 0.25 0.27 0.66 1.0 0.22 0.99 0.0 0.51 0.08 0.0 0.28 0.55 0.25 0.0 0.39 0.12
0.11 0.12 0.1 0.13 0.07 0.02 0.05 0.08 0.07 0.17 0.22 0.2 0.23 0.02 0.03 1.0 0.21 0.05 0.04 0.02 0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.05 0.07 0.05 0.2 0.35 0.35 0.35 0.24 0.25 0.33 0.23 0.11 0.27 0.0 1.0 0.15 0.02 0.01 0.19 0.01 0.02 0.07 0.15 0.09 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.37 0.21 0.03 0.22 1.0 0.04 0.08 0.14 0.09 0.0 0.06 0.27 0.06 0.05 0.0
0.2 0.13 0.09 0.04 0.02 0.05 0.22 0.18 0.16 0.4 0.35 0.24 0.17 0.15 0.08 1.0 0.26 0.22 0.27 0.29 0.01 0.25 0.16 0.21 0.28 0.4
0.36 0.12 0.13 0.14 0.04 0.02 0.29 0.59 0.51 0.79 1.0 0.73 0.34 0.19 0.07 0.87 0.15 0.19 0.18 0.29 0.06 0.08 0.52 0.71 0.84 0.83
0.45 0.31 0.34 0.32 0.3 0.27 0.52 0.62 0.75 0.92 1.0 0.78 0.42 0.19 0.15 0.89 0.27 0.47 0.29 0.46 0.04 0.05 0.61 0.91 0.59 0.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 0.3 0.23 0.25 0.24 0.21 0.34 0.27 0.3 0.18 0.2 0.2 0.17 0.12 0.15 1.0 0.12 0.2 0.26 0.13 0.04 0.35 0.14 0.23 0.51 0.21
0.28 0.29 0.21 0.24 0.24 0.23 0.27 0.29 0.24 0.22 0.2 0.25 0.2 0.09 0.14 1.0 0.14 0.21 0.31 0.15 0.02 0.24 0.1 0.11 0.28 0.17
0.18 0.2 0.24 0.35 0.31 0.45 0.64 0.43 0.51 0.32 0.28 0.19 0.15 0.31 0.15 1.0 0.07 0.15 0.13 0.13 0.06 0.12 0.13 0.13 0.23 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.17 0.07 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.08 0.26 0.14 0.07 0.1 0.24 0.47 0.58 0.71 0.84 0.57 0.19 0.22 0.12 1.0 0.18 0.24 0.25 0.21 0.01 0.04 0.29 0.14 0.41 0.17
0.39 0.42 0.3 0.24 0.15 0.2 0.29 0.39 0.49 0.94 0.87 0.9 0.66 0.23 0.15 1.0 0.14 0.37 0.19 0.37 0.07 0.09 0.23 0.64 0.51 0.49
0.06 0.01 0.01 0.02 0.03 0.04 0.29 0.58 0.63 1.0 0.82 0.42 0.11 0.15 0.24 0.99 0.12 0.1 0.14 0.09 0.02 0.05 0.49 0.34 0.28 0.33
0.04 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.23 0.47 0.42 0.82 0.67 0.32 0.09 0.16 0.18 1.0 0.12 0.12 0.17 0.09 0.01 0.04 0.51 0.22 0.19 0.37
0.07 0.03 0.05 0.04 0.03 0.06 0.26 0.49 0.57 0.81 0.81 0.54 0.28 0.1 0.23 0.66 0.19 0.18 0.2 0.22 0.0 0.23 0.72 1.0 0.27 0.45
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.23 0.31 0.6 0.88 1.0 0.36 0.02 0.06 0.11 0.5 0.09 0.01 0.04 0.01 0.01 0.02 0.45 0.38 0.45 0.54
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.2 0.31 0.61 1.0 0.81 0.28 0.02 0.08 0.16 0.46 0.1 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.73 0.3 0.7 0.62
0.32 0.34 0.32 0.31 0.38 0.49 0.41 0.5 0.42 0.48 0.32 0.36 0.29 0.44 0.22 1.0 0.18 0.35 0.42 0.35 0.04 0.53 0.09 0.04 0.19 0.28
0.38 0.39 0.37 0.37 0.43 0.59 0.49 0.39 0.45 0.35 0.27 0.21 0.3 0.43 0.21 1.0 0.22 0.28 0.42 0.34 0.03 0.58 0.12 0.13 0.32 0.25
0.14 0.2 0.25 0.34 0.49 0.46 0.47 0.47 0.48 0.53 0.51 0.33 0.12 0.1 0.09 1.0 0.16 0.26 0.26 0.25 0.06 0.13 0.11 0.2 0.24 0.23
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.32 0.37 0.46 0.44 0.42 0.41 0.4 0.44 0.46 0.44 0.37 0.22 0.11 0.22 1.0 0.27 0.27 0.29 0.29 0.06 0.18 0.2 0.27 0.29 0.26
0.62 0.29 0.13 0.17 0.31 0.52 0.78 0.73 0.74 0.65 0.51 0.36 0.55 0.34 0.43 1.0 0.57 0.8 0.6 0.61 0.03 0.35 0.54 0.47 0.54 0.37
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 1.0 0.17 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.34 1.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.2 0.0 0.0 0.19 0.0 0.16 0.17 1.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.12 0.13 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.25 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.39 0.46 0.43 0.52 0.47 0.43 0.38 0.35 0.27 0.18 0.15 0.17 0.1 0.24 1.0 0.47 0.82 0.65 0.72 0.02 0.32 0.06 0.13 0.81 0.36
0.09 0.1 0.13 0.15 0.16 0.12 0.09 0.08 0.13 0.27 0.36 0.34 0.17 0.08 0.27 1.0 0.16 0.05 0.02 0.04 0.01 0.22 0.01 0.35 0.31 0.28
0.51 0.25 0.16 0.08 0.05 0.07 0.13 0.26 0.17 0.26 0.28 0.24 0.42 0.18 0.06 1.0 0.06 0.13 0.12 0.11 0.06 0.05 0.58 0.21 0.25 0.35
0.08 0.15 0.15 0.14 0.17 0.14 0.2 0.13 0.11 0.12 0.13 0.12 0.08 0.17 0.24 1.0 0.23 0.18 0.13 0.12 0.09 0.12 0.08 0.28 0.24 0.19
0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.04 0.04 0.08 0.21 0.23 0.36 0.04 0.04 0.06 0.07 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.14 0.03 0.12 0.0 0.08 0.14
0.35 0.36 0.33 0.54 0.75 0.76 0.9 0.82 0.85 0.82 0.62 0.41 0.42 0.57 0.64 1.0 0.56 0.48 0.5 0.56 0.17 0.57 0.36 0.35 0.46 0.36
0.01 0.03 0.1 0.21 0.41 0.64 0.68 0.57 0.58 0.39 0.3 0.18 0.01 0.17 0.33 1.0 0.22 0.28 0.26 0.22 0.03 0.11 0.25 0.15 0.25 0.14
0.04 0.04 0.08 0.07 0.07 0.05 0.05 0.07 0.08 0.17 0.2 0.22 0.06 0.04 0.09 1.0 0.17 0.12 0.02 0.06 0.01 0.06 0.01 0.06 0.07 0.18
0.07 0.11 0.12 0.14 0.15 0.11 0.1 0.1 0.15 0.32 0.38 0.42 0.16 0.05 0.15 1.0 0.14 0.17 0.03 0.08 0.03 0.24 0.03 0.07 0.17 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.24 0.33 0.47 0.56 0.54 0.68 0.58 0.52 0.37 0.32 0.3 0.04 0.39 0.35 1.0 0.37 0.46 0.31 0.29 0.05 0.28 0.22 0.12 0.38 0.28
0.12 0.33 0.38 0.38 0.34 0.3 0.3 0.38 0.32 0.32 0.26 0.2 0.11 0.1 0.2 1.0 0.24 0.38 0.36 0.35 0.0 0.11 0.03 0.06 0.23 0.15
0.17 0.27 0.4 0.42 0.48 0.42 0.35 0.37 0.37 0.35 0.27 0.23 0.16 0.13 0.28 1.0 0.3 0.49 0.49 0.4 0.02 0.27 0.17 0.17 0.35 0.2
0.06 0.28 0.38 0.55 0.7 0.73 0.72 0.65 0.61 0.41 0.34 0.32 0.05 0.37 0.34 1.0 0.32 0.37 0.37 0.27 0.08 0.55 0.41 0.13 0.46 0.42
0.04 0.15 0.15 0.3 0.6 0.98 0.81 0.8 0.4 0.33 0.24 0.18 0.02 0.29 0.33 1.0 0.4 0.65 0.59 0.51 0.03 0.1 0.3 0.22 0.46 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.01 0.07 0.13 0.31 0.46 0.53 1.0 0.63 0.3 0.13 0.03 0.22 0.19 0.91 0.3 0.16 0.18 0.33 0.17 0.01 0.4 0.16 0.04 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.25 0.27 0.31 0.51 0.48 0.43 0.34 0.38 0.26 0.35 0.35 0.15 0.12 0.11 1.0 0.08 0.1 0.06 0.16 0.01 0.02 0.12 0.04 0.24 0.28
0.46 0.25 0.19 0.18 0.16 0.21 0.35 0.43 0.35 0.41 0.38 0.37 0.43 0.18 0.18 1.0 0.19 0.38 0.31 0.27 0.05 0.18 0.36 0.31 0.35 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.22 0.21 0.39 0.34 0.27 0.42 0.56 0.54 0.76 0.71 0.54 0.37 0.22 0.1 1.0 0.14 0.42 0.24 0.19 0.11 0.07 0.54 0.85 0.78 0.5
0.48 0.42 0.45 0.87 0.55 0.35 0.43 0.57 0.55 0.5 0.76 0.57 0.69 0.23 0.23 1.0 0.46 0.35 0.26 0.16 0.05 0.32 0.59 0.76 0.66 0.46
0.21 0.2 0.2 0.19 0.19 0.18 0.3 0.37 0.39 0.46 0.55 0.56 0.33 0.19 0.17 1.0 0.15 0.26 0.22 0.24 0.05 0.23 0.2 0.26 0.29 0.35
0.42 0.24 0.24 0.24 0.33 0.37 0.26 0.22 0.19 0.22 0.23 0.25 0.49 0.32 0.28 1.0 0.25 0.33 0.31 0.28 0.03 0.75 0.1 0.15 0.39 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.32 0.37 1.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.13 0.0 0.13 0.0 0.0
0.06 0.0 0.09 0.07 0.15 0.15 0.17 0.3 0.15 0.14 0.0 0.16 0.0 0.0 0.13 1.0 0.07 0.42 0.33 0.13 0.04 0.0 0.0 0.0 0.14 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)