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Heatmap: Cluster_70 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.72 0.43 0.37 0.25 0.22 -0.0 0.11 0.07 -0.72 -0.51 -0.76 -0.59 0.81 -0.02 0.04 0.28 0.34 0.47 0.19 0.1 -3.59 -0.5 -1.84 -1.13 0.43 -0.08
0.85 0.58 0.23 -0.39 -0.69 -1.31 -0.41 -0.09 -0.38 -0.29 0.21 0.56 0.56 -0.53 -0.53 -0.99 -0.16 0.61 -0.19 0.25 -5.19 -0.68 -0.55 0.78 0.7 0.4
1.33 0.17 0.12 -0.02 -0.45 -0.4 0.65 0.47 -0.39 -0.11 -0.32 -0.27 0.96 0.19 -0.24 0.03 -0.49 0.34 -0.26 -0.06 -3.74 -1.86 -2.11 -0.65 0.34 0.38
0.71 1.0 0.66 0.04 -0.82 -0.86 0.08 0.52 -0.04 -0.65 -0.5 -0.39 0.3 -0.08 -0.42 -0.78 -0.12 0.26 0.36 0.33 -3.18 -0.1 -1.44 -0.3 0.5 0.33
0.55 0.99 0.67 -0.04 -1.37 -1.73 0.14 0.6 -0.01 -0.57 -0.6 -0.56 0.04 0.12 -0.42 -0.68 -0.03 0.63 0.19 0.32 -2.8 0.29 -1.35 -0.62 0.63 0.4
0.69 0.28 0.19 -0.16 -0.26 -0.5 0.1 0.17 -0.15 -0.08 -0.07 0.07 0.9 0.4 0.21 0.49 -0.06 0.46 0.28 -0.26 -4.21 -3.34 -1.29 -1.19 0.59 -0.12
0.42 0.31 -0.05 -0.34 -1.09 -1.05 -1.12 -0.59 -0.14 -0.24 -0.11 0.37 0.54 0.27 -0.1 0.87 -0.01 0.96 0.77 0.06 -2.12 0.11 -1.42 -0.03 -0.17 -0.07
0.53 -0.02 -0.15 -0.5 -0.75 -0.86 -0.14 -0.06 -0.58 -0.35 -0.54 -0.47 0.43 0.71 0.58 0.43 0.26 0.75 0.71 0.43 -1.36 -1.81 -1.0 -0.54 0.19 0.48
1.16 0.2 -0.77 -1.07 -0.68 -0.3 0.4 0.08 -0.77 -0.51 -0.84 -1.06 0.63 0.3 -0.21 -0.4 0.14 0.85 0.73 0.0 -1.2 -0.97 -0.09 -0.16 0.31 0.5
0.82 0.59 0.31 0.09 -0.16 -0.48 0.06 0.1 -0.36 -0.3 -0.39 -0.23 0.58 -0.22 -0.45 -0.26 0.14 0.58 -0.1 0.11 -0.98 -0.34 -1.11 -1.0 0.67 0.17
0.54 0.53 0.17 0.09 -0.05 0.07 0.11 0.14 0.07 -0.2 -0.07 -0.04 0.45 -0.2 -0.02 -0.28 -0.3 0.48 0.08 -0.07 -2.99 -0.91 -0.46 -0.44 0.35 0.26
0.92 0.4 0.03 -0.15 -0.24 -0.36 -0.0 0.06 -0.22 -0.32 -0.42 -0.42 0.69 -0.17 0.12 -0.2 0.05 0.57 0.22 0.07 -1.23 -0.08 -0.15 -0.74 0.27 -0.34
0.67 0.28 0.39 0.35 0.05 -0.44 0.15 0.21 -0.21 -0.14 -0.17 -0.14 0.59 -0.12 0.04 0.25 0.1 0.41 0.09 -0.08 -2.34 -0.82 -0.75 -0.87 0.17 -0.1
0.82 0.47 0.26 0.05 -0.52 -0.95 -0.23 -0.18 -0.73 -0.34 -0.22 0.19 1.01 -0.26 -0.68 -0.07 0.05 0.53 -0.38 -0.27 -3.55 -0.78 -1.29 -0.42 1.16 0.78
0.05 0.1 -0.63 -0.57 -1.56 -2.03 -0.62 -0.48 -0.79 -0.09 -0.19 -0.42 -0.35 0.91 0.21 1.0 0.5 0.9 0.92 0.39 -1.64 -0.89 0.37 -0.24 0.07 0.17
0.47 0.3 -0.38 -0.6 -0.85 -1.61 -0.24 -0.11 -0.53 0.09 -0.22 0.15 0.04 0.7 0.38 0.52 0.44 0.58 0.59 0.14 -1.81 -1.04 0.14 -0.22 -0.13 0.09
0.51 0.79 0.57 0.65 0.28 0.05 -0.05 0.08 -0.42 -0.2 -0.02 -0.01 0.76 0.08 -0.32 -0.1 -0.25 -0.02 -0.08 -0.16 -4.6 -1.03 -0.67 -0.96 0.04 0.1
-0.05 -0.08 0.07 -0.11 -0.01 0.08 -0.11 -0.15 -0.03 -0.19 -0.08 -0.03 -0.07 0.26 0.31 0.26 0.13 0.11 0.33 0.2 -1.39 0.05 0.07 -0.09 -0.2 0.03
1.0 0.58 0.58 0.79 0.7 0.21 -0.19 -0.08 -1.18 -0.65 -0.16 0.28 1.4 0.29 -0.55 -0.14 -0.03 -0.45 -0.48 -0.85 -2.99 -1.45 -3.5 -1.59 0.21 -0.05
0.58 0.99 0.49 -0.19 -0.87 -1.17 -0.25 -0.08 -0.32 -0.01 0.0 0.07 -0.01 -0.05 -0.38 -0.47 0.17 0.72 0.27 0.34 -3.14 -1.28 -0.43 -0.32 0.65 0.36
1.15 0.47 0.47 0.25 -0.19 -0.29 0.17 0.15 -0.68 -0.9 -0.83 -0.77 1.11 0.14 0.34 0.05 -0.28 0.52 0.34 0.03 -5.83 -4.13 -2.05 -1.64 0.59 0.42
0.58 0.03 -0.55 -0.53 -0.06 -0.41 -0.23 -0.36 -0.44 -0.31 -0.27 -0.26 0.46 0.44 0.33 0.54 0.25 0.16 0.75 0.09 -1.41 0.01 -0.02 -0.05 -0.36 -0.11
0.3 0.65 0.25 -0.17 -0.34 -0.56 -0.33 -0.12 -0.39 -0.32 -0.43 -0.36 0.24 0.17 0.99 0.49 0.05 0.66 0.65 0.13 -2.55 -0.04 -0.66 -0.48 -0.72 -0.39
0.87 0.63 -0.03 -0.17 -0.73 -1.04 -0.22 0.16 -0.25 -0.12 0.08 0.26 0.52 -0.49 -0.85 -0.81 -0.08 0.73 -0.13 0.04 -5.14 -1.3 -0.73 -0.21 1.39 0.43
0.53 0.58 0.22 -0.17 -0.27 -0.34 -0.2 -0.18 -0.09 -0.15 -0.28 -0.2 0.38 0.06 0.7 0.28 0.13 0.65 0.44 -0.0 -2.05 -1.18 -0.24 -0.17 -0.39 -0.46
0.13 0.36 0.4 -0.03 -0.15 -0.31 -0.47 -0.61 -0.31 -0.12 -0.02 0.02 0.05 -0.2 0.02 0.18 0.36 0.15 0.23 -0.01 -0.92 0.16 -0.08 -0.15 0.54 -0.07
0.42 -0.14 -0.51 -0.66 -0.61 -0.14 0.37 0.36 -0.15 -0.14 -0.36 -0.16 0.2 0.59 0.1 0.33 0.52 0.69 0.33 -0.18 -3.66 -0.56 -1.54 -0.84 0.77 0.34
0.92 0.94 0.35 -0.1 -0.46 -0.56 0.03 0.2 -0.14 -0.01 0.08 0.22 0.57 -0.43 -0.78 -0.85 -0.07 0.36 -0.1 -0.07 -3.64 -0.87 -0.68 -0.6 0.86 0.11
1.38 0.91 0.57 -0.12 -1.14 -1.38 -0.21 0.27 -0.84 -0.72 -0.63 -0.42 1.07 0.79 -0.94 0.37 -0.47 -0.25 -0.67 -0.3 -2.75 -1.23 -0.74 -1.04 1.02 0.43
0.71 0.2 0.04 -0.09 -0.35 -0.62 0.43 0.49 -0.03 0.07 0.03 -0.12 0.84 0.22 -0.17 0.28 0.07 0.09 0.03 0.03 -4.84 -0.91 -1.3 -0.41 0.38 -0.25
0.95 0.6 0.31 0.14 -0.54 -0.55 -0.2 -0.1 -0.71 -0.68 -0.58 -0.54 1.02 -0.2 -0.2 0.02 0.97 0.47 0.3 -0.23 -3.56 -2.28 -1.82 -1.11 1.08 0.1
0.32 0.35 0.17 -0.33 -1.12 -1.43 -0.74 -0.51 -0.42 0.04 0.0 0.24 0.46 0.4 0.35 1.13 0.21 0.62 0.84 0.32 -5.03 -2.23 -0.49 -0.49 0.1 -0.25
1.47 0.4 -0.17 -0.57 -0.74 -0.61 0.38 0.62 -2.04 -1.76 -1.48 -0.6 1.84 0.51 0.23 0.02 -0.91 0.16 0.2 -0.45 -3.43 -2.21 -1.61 -3.16 1.05 0.21
0.31 -0.03 -0.15 -0.17 -0.49 -0.92 -0.47 -0.32 -1.09 -0.62 -0.43 -0.14 0.62 0.55 0.06 1.09 0.52 0.09 0.32 0.39 0.03 -1.02 -0.27 -0.71 -0.02 0.34
1.39 1.11 0.6 -0.33 -2.44 -2.65 -1.33 -0.21 -0.88 -1.1 -0.57 0.03 1.36 0.0 -0.15 0.07 0.33 0.24 0.13 0.11 -1.77 -2.31 -2.04 -1.25 1.25 -0.07
0.51 -0.36 -0.25 -0.03 -0.16 0.12 0.43 0.44 -0.01 -0.52 -0.61 -0.83 0.39 0.16 0.12 0.3 -0.1 0.51 0.31 -0.42 -2.53 -0.57 -0.47 -1.09 0.86 0.52
0.76 0.46 0.44 0.4 -0.29 -0.53 -0.12 0.37 -0.55 -0.65 -0.64 -0.68 0.29 0.15 0.19 0.66 -0.63 0.5 0.23 -0.14 -1.56 -0.29 -0.6 -0.77 -0.04 0.45
0.62 0.64 0.47 0.1 -0.6 -1.23 -0.91 -0.41 -0.16 0.01 0.16 0.29 0.5 -0.95 -0.41 -0.48 0.24 0.58 0.49 0.1 -2.13 -0.19 -0.27 -0.09 0.61 -0.2
0.35 0.03 -0.34 -0.62 -0.75 -0.89 -0.19 -0.07 -0.13 0.31 0.19 0.22 0.15 0.42 -0.11 0.15 0.07 0.89 0.32 0.42 -2.14 -0.69 -0.5 -0.18 0.41 0.14
0.44 0.05 -0.34 -0.53 -0.49 -0.31 0.17 0.12 0.05 0.35 0.14 0.09 0.24 0.62 -0.4 0.07 0.03 0.93 0.43 0.48 -2.48 -0.92 -0.99 -0.86 0.03 -0.05
1.0 0.66 -0.13 -0.62 -0.52 -0.36 0.3 0.23 -0.09 0.01 -0.19 -0.09 0.57 -0.28 -0.84 -0.81 -0.11 0.54 0.07 0.08 -2.25 -0.58 -0.11 -0.38 0.68 0.14
0.94 0.89 0.51 0.06 -0.52 -0.67 -0.39 -0.05 -0.55 -0.57 -0.43 -0.16 0.84 -0.84 -0.05 -0.3 0.23 0.37 0.1 0.2 -1.52 -0.15 -1.19 -0.74 0.77 -0.12
0.57 0.14 0.29 0.13 -0.13 -0.39 0.56 0.27 -0.25 -0.66 -1.09 -0.99 0.73 0.08 0.18 0.41 0.24 0.51 0.43 0.41 -5.15 -0.7 -1.1 -1.95 0.53 0.03
0.5 -0.22 -0.05 -0.21 -0.47 -0.02 0.0 0.23 -0.16 -0.38 -0.32 -0.15 0.68 0.56 0.52 0.07 0.04 0.32 0.28 0.07 -5.22 -2.41 -1.05 -1.75 1.05 0.57
1.19 0.54 0.12 -0.34 -1.04 -1.46 -0.42 -0.08 -0.47 -0.2 -0.12 0.2 1.14 -0.35 -0.14 -0.32 -0.09 0.5 0.07 0.09 -2.49 -0.15 -1.09 -0.68 0.8 0.14
0.94 0.34 0.25 0.21 0.27 0.09 0.29 0.13 -0.54 -0.71 -0.48 -0.12 1.12 0.02 0.08 0.19 0.13 0.32 -0.09 -0.32 -2.35 -1.17 -1.37 -1.14 0.17 -0.21
0.73 0.88 0.57 0.18 -0.49 -0.78 -0.25 0.23 -0.05 -0.01 -0.07 0.12 0.48 -1.28 -0.88 -1.42 -0.24 0.75 0.51 0.24 -4.76 -0.42 -1.41 -0.1 0.54 0.22
1.08 0.93 0.53 0.51 -0.2 -0.65 -0.35 -0.26 -0.68 -0.79 -0.55 -0.18 0.9 -0.91 -0.94 -0.99 -0.68 0.93 0.1 -0.1 -4.38 0.28 -2.87 -0.1 0.71 0.36
0.44 -0.26 -0.48 -0.98 -1.05 -0.96 -0.33 0.08 -0.23 0.09 -0.17 0.03 0.35 0.49 0.14 0.25 0.35 0.74 0.61 0.31 -2.65 -0.85 -0.64 0.08 0.21 0.74
0.53 -0.05 -0.03 -0.43 -0.6 -0.79 -0.36 -0.56 -0.48 -0.32 -0.33 -0.19 0.34 0.72 0.54 0.72 -0.02 0.82 1.04 0.31 -1.13 -0.33 -1.48 -0.51 -0.62 -0.06
1.14 0.73 0.32 -0.22 -0.71 -0.97 -0.25 -0.07 -0.69 -0.27 -0.19 0.0 1.23 0.01 -0.1 -0.4 -0.19 0.49 0.22 -0.03 -3.81 -0.99 -1.29 -0.92 0.79 0.12
0.99 0.73 0.49 0.0 -0.48 -0.71 0.04 0.29 -0.44 -0.09 -0.17 -0.31 0.69 -0.69 -0.05 -0.53 -0.21 0.73 0.17 0.21 -2.05 -1.5 -0.31 -0.78 0.36 0.07
1.16 0.75 0.28 0.18 -0.29 -0.78 0.29 0.18 -0.26 -0.61 -0.52 -0.49 0.61 0.02 -0.3 -0.48 -0.38 0.16 0.3 -0.26 -2.92 -1.26 -0.78 -0.13 0.72 0.46
0.89 0.66 0.4 -0.35 -1.17 -1.36 -0.83 -0.34 -1.29 -0.69 -0.82 -0.57 0.8 0.81 0.86 1.15 0.66 0.8 0.62 0.33 -4.33 -3.57 -2.23 -1.21 -0.24 -0.44
-0.26 -0.33 -0.54 -0.27 0.02 0.34 0.17 -0.14 0.08 -0.07 -0.08 -0.17 -0.37 0.56 0.54 0.45 0.32 0.1 0.78 0.66 -1.61 -0.39 -0.79 -0.88 -0.43 0.09
0.4 -0.01 -0.19 -0.28 -0.51 -0.44 -0.11 -0.12 -0.37 -0.42 -0.39 -0.29 0.24 0.42 0.13 0.21 0.42 1.05 0.43 0.26 -4.04 -0.9 -1.08 -0.45 0.62 0.63
0.57 0.24 -0.07 -0.52 -0.59 -0.11 0.21 0.34 -0.1 -0.16 -0.24 -0.4 0.36 0.15 0.04 0.27 0.08 0.5 0.17 0.0 -2.64 -0.67 -0.7 -0.66 0.93 0.09
0.33 0.37 0.52 -0.01 -0.62 -0.68 0.11 0.27 -0.48 -0.37 -0.46 -0.31 0.27 0.03 -0.01 0.77 0.03 0.27 0.22 0.44 -1.23 -1.88 -1.03 -0.69 0.24 0.82
0.56 0.67 0.9 0.8 0.12 -0.82 -0.14 0.26 -0.58 -0.02 0.17 0.1 0.42 0.05 -0.7 -0.0 0.15 -0.18 -0.3 -0.08 -4.51 -1.42 -1.79 -0.97 0.55 0.39
0.79 0.8 0.82 0.7 -0.07 -0.76 -0.38 0.0 -0.6 -0.32 0.19 0.3 0.58 -0.11 -0.66 0.08 0.16 0.13 0.25 0.09 -5.19 -2.1 -2.07 -1.37 0.13 0.52
0.94 -0.01 -0.12 -0.03 -0.71 -0.94 0.06 0.39 -0.16 -0.15 -0.05 -0.11 1.05 -0.06 -1.0 -0.05 -0.66 0.92 -0.05 0.15 -1.06 -1.29 -2.54 -1.84 1.0 0.66
0.64 -0.06 -0.05 -0.15 -0.67 -0.76 -0.03 0.03 -0.56 -0.21 -0.53 -0.28 0.68 0.44 -0.43 0.27 -0.11 1.08 0.85 0.68 -1.15 -1.72 -3.29 -2.44 0.11 0.9
1.6 -0.12 -0.14 -0.61 0.17 -0.53 -0.32 -0.42 -1.03 -0.97 -0.35 0.51 1.72 0.37 -0.47 0.07 -0.15 0.17 0.13 -0.0 -2.41 -2.44 -0.97 -3.71 0.77 -0.33
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1.17 0.09 -0.06 -0.15 -0.15 -0.01 0.25 0.22 -1.0 -1.03 -0.76 -0.4 1.47 0.41 0.16 0.55 0.34 0.02 -0.27 -0.38 -3.95 -0.7 -2.3 -1.84 0.73 -0.2
1.3 0.19 -0.08 -0.19 -0.56 -0.54 0.23 0.26 -0.51 -0.56 -0.51 -0.34 1.22 0.57 -0.28 0.4 -0.8 0.14 -0.29 -0.47 -2.04 -2.61 -0.13 -1.16 0.97 0.09
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1.36 1.02 0.64 -0.85 -3.55 -6.5 -2.02 -0.5 -0.77 0.16 -0.22 0.18 1.17 -0.21 -0.44 -0.92 -0.15 0.3 0.93 -0.02 -5.57 -2.4 -2.02 -0.21 0.04 1.48
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0.64 0.86 0.51 0.19 -0.29 -0.63 -0.41 -0.44 -0.88 -0.3 -0.27 0.03 0.67 -0.19 -1.01 -0.25 -0.26 0.63 0.46 0.64 -1.68 -0.71 -2.0 -0.58 0.45 0.64
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0.91 -0.17 -0.09 -0.06 -0.14 -0.37 0.03 -0.21 -0.05 0.06 -0.32 0.26 1.12 0.19 -0.1 0.24 -0.18 0.21 0.19 -0.27 -2.12 -2.56 -0.25 -0.73 0.45 0.15
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0.46 -0.75 -0.88 -0.68 -0.84 -1.06 -0.18 -0.76 -0.72 -0.57 -0.56 -0.65 0.77 0.48 1.32 1.55 0.76 0.89 0.56 0.33 -2.82 -2.2 -0.3 -1.19 -0.79 -0.41
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0.89 0.05 0.07 -0.01 0.09 0.32 0.38 0.25 -0.62 -0.63 -0.84 -0.68 0.76 0.2 -0.63 -0.21 0.18 0.44 0.5 0.32 -0.95 -2.0 -0.59 -0.85 -0.09 0.44
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0.17 -0.1 0.2 -0.12 -0.45 -0.99 -0.43 -0.51 -1.21 -0.47 -0.93 -0.5 0.41 0.11 -0.21 1.39 0.34 -0.19 0.01 0.78 -1.05 -1.27 -0.07 0.03 0.07 1.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.