Heatmap: Cluster_113 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.19 0.31 0.46 0.65 0.83 0.94 0.9 0.92 1.0 0.92 0.89 0.85 0.21 0.38 0.34 0.33 0.38 0.77 0.65 0.52 0.71 0.9 0.75 0.52 0.85 0.82
0.34 0.47 0.38 0.52 0.59 0.54 0.69 0.64 1.0 0.79 0.84 0.66 0.28 0.63 0.34 0.58 0.37 0.5 0.35 0.32 0.73 0.62 0.81 0.59 0.45 0.46
0.25 0.74 0.88 0.89 0.9 0.85 0.94 1.0 0.85 0.85 0.7 0.56 0.18 0.31 0.45 0.4 0.56 0.88 0.7 0.79 0.65 0.61 0.62 0.63 0.66 0.52
0.92 0.63 0.51 1.0 1.0 0.76 0.75 0.73 0.5 0.4 0.38 0.32 0.67 0.42 0.42 0.54 0.49 0.48 0.5 0.31 0.35 0.37 0.52 0.4 0.68 0.45
0.28 0.23 0.28 0.41 0.64 0.97 1.0 0.9 1.0 1.0 0.71 0.54 0.33 0.39 0.35 0.28 0.27 0.56 0.33 0.61 0.72 0.63 0.53 0.46 0.67 0.48
0.03 0.07 0.26 0.65 0.96 0.91 0.73 0.51 0.88 0.81 0.68 0.54 0.06 0.28 0.25 0.26 0.28 0.45 0.39 0.41 0.84 1.0 0.31 0.84 0.7 0.6
0.05 0.1 0.29 0.58 0.43 0.33 0.48 0.7 0.59 0.58 0.56 0.36 0.05 0.1 0.14 0.11 0.28 0.47 0.5 0.24 0.48 0.38 0.92 0.17 1.0 0.38
0.19 0.21 0.11 0.26 0.42 0.87 0.79 0.55 1.0 0.85 0.81 0.77 0.3 0.32 0.42 0.3 0.16 0.35 0.41 0.28 0.82 0.34 0.67 0.6 0.23 0.33
0.48 0.6 0.47 0.8 0.92 0.81 0.96 0.97 0.99 0.8 0.71 0.56 0.25 0.46 0.35 0.57 0.5 0.66 0.68 0.63 0.69 0.27 0.5 0.36 1.0 0.77
0.43 0.45 0.56 0.53 0.77 0.89 0.85 0.8 0.85 0.82 0.87 1.0 0.59 0.34 0.57 0.48 0.44 0.58 0.62 0.51 0.52 0.27 0.29 0.46 0.45 0.24
0.3 0.28 0.35 0.49 0.49 0.52 0.7 0.68 0.56 0.4 0.33 0.3 0.26 0.28 0.38 0.43 0.35 0.51 0.59 0.32 1.0 0.31 0.79 0.39 0.43 0.54
0.66 0.51 0.47 0.68 0.74 0.82 1.0 0.93 0.9 0.69 0.71 0.67 0.6 0.46 0.5 0.44 0.42 0.63 0.63 0.46 0.65 0.49 0.52 0.53 0.69 0.43
0.83 0.68 0.7 0.85 0.99 1.0 0.88 0.88 0.59 0.55 0.61 0.54 0.99 0.5 0.35 0.43 0.32 0.37 0.39 0.37 0.94 0.66 0.4 0.5 0.78 0.72
0.06 0.05 0.24 0.59 0.83 0.78 1.0 0.72 0.65 0.48 0.49 0.46 0.09 0.32 0.24 0.3 0.23 0.36 0.32 0.27 1.0 0.6 0.2 0.41 0.7 0.49
0.57 0.58 0.63 0.78 0.5 0.32 0.36 0.59 0.42 0.35 0.46 0.35 0.46 0.16 0.25 0.19 0.6 0.46 0.55 0.55 0.53 0.86 0.35 0.29 1.0 0.54
0.15 0.33 0.39 0.58 0.58 0.37 0.54 0.69 0.49 0.51 0.54 0.39 0.12 0.29 0.34 0.29 0.32 0.69 0.48 0.29 1.0 0.59 0.69 0.41 0.68 0.44
0.22 0.5 0.62 0.91 0.89 0.79 0.83 1.0 0.87 0.8 0.8 0.55 0.21 0.37 0.53 0.39 0.44 0.73 0.76 0.44 0.98 0.74 0.82 0.43 0.82 0.47
0.11 0.34 0.46 0.67 0.84 0.77 0.84 0.73 1.0 0.78 0.74 0.63 0.15 0.43 0.35 0.45 0.29 0.48 0.35 0.29 0.51 0.66 0.92 0.59 0.43 0.52
0.13 0.29 0.22 0.5 1.0 0.81 0.57 0.6 0.09 0.14 0.07 0.03 0.07 0.02 0.09 0.05 0.2 0.32 0.25 0.38 0.51 0.02 0.02 0.01 0.39 0.19
0.16 0.2 0.36 0.56 0.74 0.59 0.62 0.74 0.92 0.93 0.95 0.72 0.2 0.24 0.24 0.11 0.46 0.67 0.43 0.31 1.0 0.27 0.6 0.26 0.66 0.46
0.11 0.45 0.41 0.42 0.32 0.32 0.51 0.71 0.97 0.94 1.0 0.59 0.14 0.16 0.21 0.19 0.3 0.57 0.53 0.41 0.26 0.28 0.36 0.43 0.63 0.25
0.71 1.0 0.75 0.55 0.34 0.32 0.41 0.58 0.46 0.28 0.31 0.33 0.72 0.19 0.42 0.32 0.42 0.76 0.49 0.45 0.79 0.62 0.56 0.3 0.94 0.43
0.29 0.51 0.55 0.61 0.71 0.63 0.78 0.95 0.92 1.0 0.93 0.76 0.18 0.21 0.34 0.19 0.35 0.61 0.59 0.59 0.48 0.49 0.42 0.53 0.68 0.35
0.18 0.08 0.2 0.33 0.33 0.36 0.51 0.53 0.58 0.51 0.37 0.29 0.14 0.4 0.13 0.47 0.22 0.19 0.23 0.28 0.54 0.28 0.59 0.65 0.5 1.0
0.2 0.3 0.23 0.53 1.0 0.79 0.57 0.58 0.12 0.24 0.21 0.13 0.06 0.12 0.13 0.19 0.3 0.43 0.48 0.43 0.52 0.09 0.12 0.09 0.72 0.34
0.0 0.37 0.28 0.28 0.47 1.0 0.0 0.57 0.15 0.14 0.14 0.15 0.32 0.19 0.13 0.13 0.14 0.4 0.52 0.11 0.86 0.23 0.0 0.26 0.26 0.0
0.35 0.54 0.69 0.67 0.52 0.55 0.52 0.62 0.57 0.53 0.5 0.53 0.29 0.25 0.33 0.25 0.33 0.47 0.38 0.45 0.53 0.24 1.0 0.61 0.42 0.52
0.03 0.04 0.13 0.53 1.0 0.65 0.53 0.48 0.51 0.4 0.42 0.25 0.03 0.34 0.09 0.31 0.03 0.17 0.13 0.15 0.33 0.57 0.44 0.22 0.35 0.38
0.05 0.04 0.25 0.64 1.0 0.96 0.7 0.62 0.53 0.57 0.48 0.26 0.06 0.77 0.18 0.59 0.13 0.29 0.27 0.28 0.47 0.59 0.51 0.29 0.7 0.55
0.37 0.57 0.59 0.91 1.0 0.9 0.9 0.79 0.46 0.46 0.46 0.41 0.38 0.52 0.41 0.37 0.35 0.64 0.48 0.37 0.89 0.59 0.34 0.36 0.72 0.55
0.03 0.09 0.25 0.62 0.9 0.93 0.88 0.65 1.0 0.9 0.77 0.58 0.02 0.27 0.39 0.37 0.37 0.34 0.4 0.32 0.77 0.83 0.69 0.51 0.34 0.29
0.54 0.51 0.45 0.48 0.66 0.71 0.86 0.79 0.83 0.61 0.54 0.4 0.43 0.41 0.54 0.57 0.63 0.66 0.62 0.75 0.97 0.24 1.0 0.57 0.68 0.54
0.42 0.72 0.86 1.0 0.85 0.74 0.82 0.94 0.74 0.63 0.65 0.64 0.39 0.49 0.65 0.6 0.59 0.69 0.65 0.57 0.63 0.34 0.86 0.57 0.73 0.55
0.39 0.79 0.88 0.93 0.88 0.58 0.83 0.88 0.69 0.67 0.62 0.54 0.34 0.68 0.81 0.72 0.84 1.0 0.76 0.79 0.62 0.39 0.85 0.46 0.58 0.53
0.38 0.37 0.66 0.55 0.32 0.67 1.0 0.75 0.56 0.05 0.0 0.0 0.0 0.11 0.2 0.1 0.05 0.39 0.75 0.39 0.93 0.17 0.03 0.05 0.51 0.15
0.24 0.35 0.32 0.26 0.23 0.48 0.67 0.96 0.99 0.94 1.0 0.87 0.22 0.26 0.34 0.33 0.22 0.56 0.59 0.44 0.05 0.29 0.27 0.49 0.67 0.37
0.28 0.72 0.9 1.0 0.79 0.42 0.67 0.71 0.78 0.56 0.65 0.49 0.14 0.19 0.22 0.13 0.16 0.8 0.63 0.59 0.57 0.16 0.32 0.22 0.98 0.53
0.2 0.71 0.73 0.84 0.98 0.73 0.69 0.63 0.84 0.73 0.81 0.74 0.2 0.51 0.57 0.48 0.59 0.84 0.75 0.65 0.49 0.61 0.99 0.73 1.0 0.63
0.44 0.91 0.92 0.92 0.85 0.68 0.63 0.66 0.59 0.54 0.5 0.46 0.42 0.17 0.4 0.23 0.53 0.84 0.53 0.62 0.86 0.99 0.45 0.5 1.0 0.5
0.34 0.5 0.6 0.68 0.85 0.83 0.95 1.0 0.79 0.82 0.82 0.69 0.28 0.22 0.3 0.25 0.25 0.53 0.5 0.52 0.55 0.32 0.56 0.38 0.6 0.65
0.09 0.29 0.26 0.47 0.93 0.93 1.0 0.97 0.56 0.58 0.42 0.35 0.13 0.06 0.07 0.13 0.2 0.28 0.39 0.29 0.81 0.02 0.65 0.35 0.21 0.05
0.33 0.41 0.44 0.75 1.0 0.65 0.69 0.55 0.54 0.77 0.83 0.72 0.36 0.32 0.17 0.27 0.08 0.34 0.18 0.16 0.39 0.69 0.42 0.81 0.6 0.61
0.18 0.11 0.18 0.46 0.53 0.6 0.86 0.86 0.85 0.52 0.46 0.47 0.17 0.27 0.26 0.37 0.19 0.23 0.26 0.19 0.57 0.86 0.43 1.0 0.97 0.52
0.04 0.2 0.3 0.4 0.56 0.81 0.84 0.78 0.86 0.73 0.67 0.65 0.1 0.14 0.31 0.21 0.4 0.82 0.63 0.52 1.0 0.25 0.42 0.41 0.31 0.22
0.02 0.03 0.07 0.29 0.61 0.53 0.56 0.41 1.0 0.86 0.67 0.41 0.03 0.07 0.2 0.06 0.19 0.39 0.38 0.54 0.26 0.03 0.29 0.28 0.11 0.08
0.19 0.18 0.45 0.52 0.53 0.71 1.0 0.96 0.88 0.51 0.3 0.2 0.12 0.3 0.28 0.36 0.41 0.46 0.45 0.46 0.85 0.24 0.79 0.3 0.62 0.64
0.15 0.09 0.12 0.22 0.35 0.45 0.67 0.52 0.97 0.94 1.0 0.75 0.18 0.56 0.49 0.61 0.44 0.5 0.25 0.31 0.57 0.82 0.61 0.58 0.3 0.36
0.0 0.0 0.04 0.82 0.82 0.76 0.14 0.05 0.09 0.08 0.22 0.09 0.04 0.0 0.0 0.05 0.04 0.05 0.0 0.0 1.0 0.14 0.06 0.68 0.43 0.12
0.87 0.59 0.44 0.98 0.65 0.4 0.67 0.74 0.75 0.62 0.74 0.47 0.63 0.18 0.24 0.23 0.31 0.52 0.48 0.23 0.62 0.27 0.55 0.29 1.0 0.67
0.25 0.4 0.67 0.72 0.93 0.71 0.78 0.79 0.9 0.97 1.0 0.81 0.37 0.73 0.5 0.79 0.67 0.53 0.45 0.41 0.26 0.3 0.2 0.41 0.4 0.55
0.08 0.06 0.13 0.21 0.36 0.61 0.84 0.7 1.0 0.52 0.29 0.16 0.02 0.06 0.14 0.18 0.24 0.27 0.22 0.23 0.48 0.07 0.45 0.34 0.55 0.24
0.34 0.45 0.47 0.58 0.66 0.68 0.66 0.61 0.42 0.29 0.22 0.2 0.27 0.2 0.2 0.27 0.5 0.53 0.53 0.64 0.96 0.2 1.0 0.37 0.61 0.28
0.43 0.48 0.57 0.7 0.88 0.95 0.93 0.79 1.0 0.86 0.94 0.83 0.34 0.56 0.5 0.57 0.48 0.55 0.48 0.39 0.43 0.19 0.23 0.33 0.39 0.36
0.14 0.51 0.35 0.47 0.89 1.0 0.83 0.61 0.92 0.77 0.93 0.66 0.06 0.15 0.41 0.28 0.28 0.71 0.6 0.38 0.43 0.34 0.31 0.64 0.8 0.38
0.03 0.01 0.04 0.02 0.19 0.79 1.0 0.5 0.78 0.54 0.38 0.24 0.07 0.59 0.06 0.1 0.13 0.05 0.13 0.04 0.41 0.06 0.53 0.34 0.09 0.24
0.31 0.35 0.47 0.57 1.0 0.91 0.59 0.5 0.17 0.39 0.14 0.1 0.18 0.19 0.25 0.18 0.25 0.63 0.46 0.67 0.13 0.06 0.08 0.2 0.6 0.47
0.85 0.7 0.33 0.36 0.46 0.42 0.76 0.75 0.73 0.57 0.71 0.42 0.5 0.25 0.31 0.23 0.4 0.58 0.46 0.34 0.53 0.35 0.74 0.78 1.0 0.49
0.03 0.12 0.16 0.28 0.32 0.46 0.86 0.59 0.48 0.2 0.12 0.12 0.05 0.1 0.22 0.18 0.15 0.31 0.42 0.24 1.0 0.03 0.73 0.16 0.46 0.33
0.14 0.17 0.28 0.54 0.73 0.86 1.0 0.91 0.4 0.25 0.11 0.06 0.09 0.09 0.13 0.35 0.23 0.22 0.28 0.3 0.81 0.07 0.12 0.09 0.49 0.3
0.02 0.07 0.25 0.43 0.55 0.67 1.0 0.94 0.63 0.27 0.18 0.12 0.01 0.06 0.14 0.21 0.27 0.37 0.31 0.31 0.66 0.07 0.15 0.04 0.57 0.38
0.1 0.08 0.2 0.21 0.51 0.72 0.66 0.37 0.66 1.0 0.68 0.64 0.23 0.18 0.11 0.23 0.02 0.08 0.06 0.03 1.0 0.06 0.28 0.39 0.22 0.19
0.08 0.08 0.03 0.26 0.21 0.5 0.53 0.35 0.71 0.64 0.56 0.42 0.18 0.05 0.1 0.14 0.02 0.06 0.05 0.02 1.0 0.08 0.33 0.44 0.12 0.19
0.02 0.22 0.61 0.81 0.82 0.62 0.61 0.78 0.79 0.74 0.73 0.81 0.03 0.28 0.39 0.24 0.42 0.54 0.55 0.56 0.94 0.33 0.57 0.33 0.99 1.0
0.52 0.57 0.6 0.62 0.79 0.81 0.82 0.82 0.77 0.89 0.87 1.0 0.55 0.54 0.43 0.34 0.51 0.79 0.69 0.62 0.94 0.73 0.55 0.67 0.74 0.94
0.06 0.08 0.11 0.06 0.22 0.16 0.36 0.25 0.59 0.41 0.61 0.45 0.07 0.1 0.12 0.26 0.12 0.23 0.17 0.11 0.96 0.22 0.69 1.0 0.39 0.88
0.86 0.81 0.59 1.0 0.96 0.84 0.82 0.82 0.56 0.55 0.55 0.6 0.72 0.3 0.39 0.43 0.52 0.96 0.65 0.56 0.76 0.41 0.61 0.51 0.92 0.7
0.17 0.48 0.62 0.88 0.79 0.5 0.53 0.48 0.46 0.4 0.45 0.38 0.08 0.23 0.29 0.25 0.29 0.57 0.42 0.41 0.33 0.34 1.0 0.53 0.62 0.57
0.49 0.71 0.67 0.66 0.82 0.82 0.85 0.87 0.84 0.93 1.0 0.86 0.5 0.54 0.62 0.55 0.63 0.83 0.73 0.53 0.41 0.75 0.95 0.65 0.7 0.54
0.1 0.07 0.08 0.12 0.39 0.61 0.65 0.58 0.56 0.66 0.69 0.57 0.17 0.33 0.44 0.22 0.5 0.91 0.32 0.27 1.0 0.2 0.74 0.94 0.32 0.29
0.27 0.22 0.27 0.37 0.51 0.62 0.74 0.95 0.97 0.89 0.65 0.61 0.27 0.51 0.35 0.59 0.43 0.28 0.44 0.46 1.0 0.76 0.71 0.62 0.84 0.71
0.48 0.37 0.45 0.63 0.82 0.84 0.7 0.84 0.68 0.89 1.0 0.78 0.63 0.55 0.4 0.47 0.29 0.35 0.36 0.47 0.29 0.26 0.28 0.31 0.36 0.37
0.32 0.41 0.5 0.74 0.83 0.93 1.0 0.87 0.91 0.73 0.55 0.48 0.18 0.17 0.21 0.24 0.27 0.36 0.36 0.36 0.44 0.17 0.21 0.22 0.37 0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)