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Heatmap: Cluster_191 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.02 -0.22 0.04 -0.01 0.26 0.14 0.08 0.15 -0.18 0.29 0.46 0.2 -0.33 -0.03 -0.94 -0.27 -0.54 -0.65 -0.22 -0.0 -2.62 -0.74 0.8 0.36 0.66 0.45
-1.73 -0.6 -0.01 -0.09 0.21 0.41 0.05 0.08 -0.07 -0.01 -0.33 -0.42 -2.47 -0.27 -0.03 0.36 0.13 0.16 0.35 0.79 -0.09 -1.52 0.68 0.43 -0.11 0.49
-1.23 -0.56 -0.35 -0.34 -0.26 0.17 0.08 -0.16 0.11 0.02 -0.08 0.16 -1.08 0.0 -0.07 0.02 -0.06 0.06 0.04 -0.25 0.4 0.2 0.42 0.38 0.54 0.47
-0.71 -0.43 -0.46 0.18 0.32 0.46 0.18 0.09 -0.29 -0.46 -0.55 -0.78 -2.63 -0.46 -0.4 0.16 -0.46 0.22 0.71 0.22 -1.0 -1.7 1.16 0.47 0.66 0.75
0.86 0.25 0.22 0.23 -0.12 -0.26 0.22 0.55 -0.06 -0.15 -0.18 -0.46 0.72 -1.06 -0.95 -1.16 -1.09 0.09 -0.07 -0.47 -1.64 -2.37 0.93 -0.48 0.86 0.62
-0.32 0.18 -0.38 0.33 -0.12 -0.17 0.56 -0.1 0.63 0.2 0.71 0.38 0.04 -1.56 -0.8 -1.83 -0.9 0.41 -0.34 -0.74 -2.8 -0.4 1.43 0.34 0.01 -0.26
-2.69 -0.67 0.08 0.09 0.29 0.4 0.1 0.16 0.15 0.09 -0.14 -0.23 -2.96 0.18 -0.12 0.14 -0.12 0.44 0.4 0.04 -0.18 -0.06 0.26 0.17 0.0 0.44
-2.65 -3.64 -1.29 -0.03 0.64 0.96 0.69 0.15 0.18 0.24 0.03 -0.04 -1.88 -0.13 -0.11 0.24 0.31 -0.51 -0.55 -0.25 0.09 -0.19 1.07 0.51 -0.23 -0.4
-0.11 0.23 0.0 0.35 0.27 0.29 0.23 0.08 0.26 -0.2 -0.23 -0.22 -0.68 -0.88 -0.52 -0.33 -0.38 0.18 0.31 -0.29 -0.53 -0.78 0.59 0.34 0.21 0.46
0.45 0.36 0.09 0.06 -0.18 0.19 0.04 0.1 -0.15 -0.44 -0.33 -0.38 0.16 -0.39 -0.01 -0.3 -0.32 0.4 0.13 -0.19 -0.11 -2.3 0.87 0.11 -0.06 0.2
-1.41 -0.81 -0.42 0.02 0.32 0.64 0.42 0.04 0.32 0.01 -0.55 -0.59 -2.06 -0.12 -0.9 -0.26 -0.4 0.6 0.27 -0.17 -0.04 -0.58 0.71 0.69 0.23 0.64
-1.72 -2.68 -0.71 0.42 0.05 -0.15 0.13 0.48 0.59 0.55 0.55 -0.11 -2.48 -0.9 -1.16 -0.65 -1.79 0.1 -0.41 -0.12 0.62 -0.56 1.12 -0.13 1.13 0.57
0.61 0.52 0.29 0.2 0.25 0.37 0.09 0.07 0.14 -0.2 -0.23 -0.07 0.33 -0.79 -0.46 -0.38 -0.54 -0.25 -0.32 -0.37 -0.18 -0.93 1.12 -0.29 -0.53 -0.39
0.35 0.08 -0.24 0.32 0.17 -0.38 0.31 0.45 -0.29 -0.08 0.23 0.28 0.23 -0.43 -0.56 -0.32 -0.9 -0.03 -0.21 -0.68 -0.59 0.35 0.28 -0.35 0.26 0.48
-1.08 -0.59 -1.01 0.17 0.61 0.17 0.6 0.45 -0.85 -0.34 -0.53 -1.23 -1.64 -0.77 -0.11 -0.72 0.03 0.45 0.27 0.32 -0.71 -0.4 0.55 0.73 1.12 0.36
-2.11 -1.32 -0.96 -0.73 0.48 1.23 0.96 0.56 0.01 -0.81 -0.81 -1.33 -2.31 -0.81 -0.57 0.61 0.01 -0.08 0.12 -0.11 -0.01 0.14 0.85 0.5 0.47 -0.15
0.18 0.47 0.17 -0.03 0.1 0.16 -0.02 -0.13 -0.06 -0.24 -0.16 -0.21 -0.24 -0.37 -0.29 -0.2 -0.17 0.13 0.09 -0.02 -0.0 -0.74 0.38 0.56 0.03 0.0
0.53 0.04 -0.15 0.33 -0.38 -0.88 0.72 1.28 0.54 0.22 -0.15 -0.6 0.45 -0.71 -1.18 -0.37 -1.3 0.01 -0.21 -0.39 -0.58 -1.37 0.69 -1.02 0.37 0.14
-1.35 -0.34 -0.44 -0.32 -0.05 0.22 0.02 -0.36 0.05 -0.47 -0.22 -0.47 -2.11 -0.01 0.73 0.24 0.01 0.36 0.73 -0.26 -1.33 -0.93 0.91 0.72 0.3 0.57
-2.38 -0.45 -0.33 -0.69 -0.34 -0.11 0.01 0.27 0.56 0.26 0.62 0.72 -2.56 -0.53 0.03 -0.68 -0.35 0.35 0.63 -0.5 -1.93 0.47 0.71 0.22 0.49 0.27
0.28 0.41 0.08 -0.22 -0.7 -1.32 -0.78 -0.37 -0.32 0.01 -0.12 -0.03 0.03 -0.39 -0.87 0.28 -0.14 0.56 0.38 0.17 -0.26 0.19 0.71 0.55 0.02 0.01
-0.36 -0.27 -0.14 0.07 -0.04 -0.04 0.27 0.02 0.02 -0.18 -0.57 -0.31 -0.49 -0.96 -0.57 -0.48 -0.32 0.28 0.23 -0.06 -1.02 0.17 0.9 0.45 0.92 0.47
0.64 0.39 0.07 -0.13 -0.15 0.26 0.22 0.21 -0.14 -0.49 -0.46 -0.43 0.24 -0.65 -0.15 -0.75 0.02 -0.04 0.44 0.21 -0.39 -1.09 1.06 -0.14 -0.27 -0.39
0.78 0.71 0.54 0.47 -0.15 -0.36 0.02 0.31 -0.09 -0.27 -0.19 -0.26 0.38 -0.8 -0.61 -0.75 -0.77 -0.04 -0.32 -0.15 -1.09 -1.35 0.42 -0.12 0.55 0.52
-0.08 -0.05 0.04 0.02 0.05 0.13 -0.13 -0.25 -0.08 -0.07 -0.2 -0.18 0.01 -0.2 0.09 0.07 -0.0 0.37 0.01 -0.17 -0.4 -0.41 0.57 0.22 -0.03 0.27
0.28 0.24 -0.1 -0.38 -0.05 0.24 0.11 0.2 0.22 -0.22 -0.02 -0.06 0.06 -0.22 -0.37 -0.12 -0.1 -0.44 -0.12 -0.26 -0.55 0.53 0.71 -0.07 0.14 -0.48
-1.96 -0.7 -0.44 -0.12 -0.19 0.23 0.52 0.09 0.07 -0.05 -0.3 -0.16 -2.05 0.1 -0.03 0.34 -0.23 0.24 0.17 -0.12 -1.0 -0.43 1.0 -0.14 0.73 0.81
0.43 0.09 0.15 0.68 0.7 0.72 0.2 0.75 0.34 0.5 0.52 0.36 -0.69 -0.37 -1.05 -1.39 -1.66 -0.86 -0.46 -0.9 -3.07 -2.43 0.72 -0.54 0.55 -0.17
0.84 0.37 0.02 -0.04 0.04 0.07 -0.01 0.07 -0.26 -0.43 -0.16 -0.14 0.63 -0.92 -0.8 -1.01 0.03 -0.0 -0.08 -0.1 -0.38 0.26 0.85 -0.18 -0.19 -0.23
-2.52 -0.13 -1.09 -0.18 0.51 0.78 0.21 0.2 -0.79 -0.72 -0.72 -0.3 -2.9 -1.29 -0.79 -0.84 -0.41 0.65 0.17 0.57 -0.69 -0.91 1.06 0.94 0.89 0.94
-1.21 -0.9 -1.2 -0.52 -0.35 0.33 -0.25 -0.2 0.73 0.78 1.03 1.19 -1.35 -0.63 -1.22 -0.94 -1.33 0.43 0.24 -0.71 -2.2 -2.58 1.67 0.07 0.71 -0.6
0.74 -1.0 0.68 0.56 0.75 0.51 0.16 -0.81 -1.46 -1.31 -0.56 -1.4 -0.73 -0.26 -1.41 0.13 -0.86 0.47 0.61 -1.6 1.26 -3.14 1.54 -3.92 -1.13 0.57
-1.45 -0.18 0.08 -0.16 0.09 0.55 0.07 -0.21 0.08 -0.28 0.15 -0.11 -2.4 -0.62 0.34 -0.01 -0.37 0.31 0.87 0.42 -1.04 -3.05 1.0 0.06 0.12 0.51
-2.1 -0.17 -0.15 0.25 0.4 0.76 0.39 0.46 0.38 -0.33 -0.22 -0.52 -2.69 -0.51 -0.55 -0.32 -0.26 -0.19 -0.08 0.08 -2.46 -0.47 1.15 -0.8 0.89 0.88
-0.74 0.13 0.19 -0.2 -0.21 -0.17 0.1 -0.36 0.17 0.07 -0.0 -0.21 -0.71 -0.75 -1.19 -0.65 -0.61 0.51 -0.34 0.18 -1.56 0.15 1.49 -0.11 0.74 0.6
-2.56 -1.32 -0.65 -0.42 0.19 0.26 0.05 0.16 0.29 0.41 -0.03 -0.03 -2.71 -0.11 -0.38 -1.14 -0.13 0.65 0.51 0.08 0.32 0.34 0.45 0.28 0.33 0.51
-2.96 -2.04 -0.64 -0.41 0.38 0.74 0.1 -0.38 -0.19 -0.45 -0.79 -0.62 -2.92 -0.26 -0.11 -0.26 0.16 0.14 0.77 0.26 -0.33 0.05 0.74 1.1 0.55 0.71
0.57 -0.21 -0.09 0.36 -0.2 -0.2 0.44 0.79 0.21 0.01 0.11 -0.1 0.44 -0.56 -0.94 -0.27 -0.71 -0.44 -0.32 -0.5 -0.47 -0.73 0.32 -0.16 0.43 0.47
-2.87 -1.72 -0.83 -0.43 -0.62 -1.12 -0.37 -0.3 0.03 0.08 0.29 0.45 -1.96 0.11 -0.76 -0.23 -0.79 0.28 -0.96 -0.71 0.95 -0.13 0.56 1.51 1.19 0.8
0.25 0.34 0.36 0.41 0.13 0.36 0.4 0.47 -0.04 -0.25 -0.18 -0.35 0.07 -0.79 -0.83 -0.81 -0.64 0.11 -0.16 -0.38 -0.76 -0.66 0.7 -0.22 0.24 0.43
-0.18 -0.11 0.01 -0.21 -0.39 -0.18 -0.39 -0.21 -0.02 -0.0 0.6 1.03 -0.5 -0.67 -0.97 -0.21 -0.44 0.06 0.03 -0.19 -1.66 0.74 0.59 0.6 0.26 -0.17
-0.07 0.11 0.43 0.53 0.31 0.31 0.14 0.29 0.29 0.01 0.22 0.17 -0.59 -0.15 -0.85 -0.54 -0.03 0.01 -0.51 -0.02 -1.59 -0.92 0.68 -0.65 -0.1 0.43
0.41 0.25 -0.02 -0.04 0.12 0.46 0.18 0.33 0.55 0.22 0.2 0.13 0.35 -0.42 -0.4 -0.56 -0.6 -0.2 -0.39 -0.47 -0.11 -1.26 1.14 -0.36 -0.85 -1.18
0.4 0.31 0.15 -0.0 0.14 0.35 0.06 0.04 -0.22 -0.18 -0.07 0.03 -0.04 -0.2 -0.07 -0.2 -0.01 -0.46 -0.26 -0.12 0.08 -0.37 0.43 0.39 -0.44 -0.31
0.44 0.01 0.24 0.52 0.14 0.01 0.38 0.55 -0.33 -0.52 -0.53 -0.44 0.62 -0.67 -0.46 -0.08 -0.67 -0.45 -0.31 -0.27 -0.74 -0.15 0.83 -0.33 0.05 0.34
-2.14 -0.76 -0.43 -0.1 0.04 0.28 0.21 -0.01 -0.17 -0.11 -0.42 -0.98 -1.6 0.26 -0.1 0.23 0.09 0.26 0.06 -0.08 -1.08 -0.19 1.32 0.04 0.82 0.62
0.02 0.11 0.1 0.41 0.44 0.06 0.44 0.19 0.16 0.2 0.23 -0.25 -1.14 -0.89 -0.37 -0.35 -0.54 0.27 0.25 -0.34 -2.78 -1.51 0.52 0.62 0.38 0.22
-0.45 -0.28 -0.06 0.12 0.19 -0.17 -0.23 -0.28 -0.08 0.2 0.45 0.57 -0.25 -0.72 -0.48 0.36 -0.25 0.42 0.27 0.06 -1.3 -0.16 0.47 0.46 -0.09 -0.16
-0.29 -0.23 -0.49 -0.16 0.25 0.26 0.28 0.18 0.45 0.43 0.16 0.2 -0.13 -0.58 -0.01 -0.17 -0.87 0.41 0.27 -0.24 -1.1 -0.36 0.79 -0.51 -0.1 0.0
-3.01 -1.92 -0.96 -0.91 -0.85 -0.45 -0.0 0.21 0.45 0.6 0.62 0.21 -2.62 -0.29 -0.92 -0.51 -0.36 0.43 0.33 0.22 0.58 0.06 0.83 0.53 0.61 0.57

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.