Heatmap: Cluster_191 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.57 0.5 0.59 0.57 0.69 0.64 0.61 0.64 0.51 0.71 0.79 0.66 0.46 0.56 0.3 0.48 0.4 0.37 0.49 0.58 0.09 0.34 1.0 0.74 0.91 0.79
0.17 0.38 0.57 0.54 0.67 0.77 0.6 0.61 0.55 0.58 0.46 0.43 0.1 0.48 0.56 0.74 0.63 0.64 0.74 1.0 0.55 0.2 0.93 0.78 0.54 0.81
0.29 0.47 0.54 0.54 0.57 0.77 0.73 0.62 0.74 0.7 0.65 0.77 0.33 0.69 0.65 0.7 0.66 0.72 0.7 0.58 0.91 0.79 0.92 0.89 1.0 0.95
0.28 0.33 0.33 0.51 0.56 0.62 0.51 0.48 0.37 0.33 0.31 0.26 0.07 0.33 0.34 0.5 0.33 0.52 0.73 0.52 0.22 0.14 1.0 0.62 0.71 0.76
0.95 0.62 0.61 0.62 0.48 0.44 0.61 0.77 0.5 0.47 0.46 0.38 0.86 0.25 0.27 0.24 0.25 0.56 0.5 0.38 0.17 0.1 1.0 0.38 0.95 0.8
0.3 0.42 0.28 0.46 0.34 0.33 0.54 0.35 0.57 0.42 0.61 0.48 0.38 0.13 0.21 0.1 0.2 0.49 0.29 0.22 0.05 0.28 1.0 0.47 0.37 0.31
0.11 0.46 0.78 0.79 0.9 0.97 0.79 0.82 0.82 0.79 0.67 0.63 0.09 0.84 0.68 0.81 0.68 1.0 0.97 0.76 0.65 0.71 0.88 0.83 0.74 1.0
0.08 0.04 0.2 0.47 0.74 0.93 0.77 0.53 0.54 0.56 0.49 0.46 0.13 0.44 0.44 0.56 0.59 0.33 0.33 0.4 0.51 0.42 1.0 0.68 0.41 0.36
0.62 0.78 0.67 0.85 0.8 0.81 0.78 0.71 0.8 0.58 0.57 0.57 0.42 0.36 0.46 0.53 0.51 0.76 0.83 0.55 0.46 0.39 1.0 0.84 0.77 0.92
0.75 0.7 0.58 0.57 0.49 0.62 0.56 0.59 0.49 0.4 0.43 0.42 0.61 0.42 0.54 0.45 0.44 0.72 0.6 0.48 0.51 0.11 1.0 0.59 0.52 0.63
0.23 0.35 0.46 0.62 0.77 0.95 0.82 0.63 0.77 0.62 0.42 0.41 0.15 0.56 0.33 0.51 0.46 0.93 0.74 0.54 0.59 0.41 1.0 0.99 0.72 0.96
0.14 0.07 0.28 0.61 0.47 0.41 0.5 0.64 0.69 0.67 0.67 0.42 0.08 0.24 0.2 0.29 0.13 0.49 0.34 0.42 0.7 0.31 1.0 0.42 1.0 0.68
0.7 0.66 0.56 0.53 0.54 0.59 0.49 0.48 0.5 0.4 0.39 0.44 0.58 0.27 0.33 0.35 0.32 0.39 0.37 0.36 0.4 0.24 1.0 0.38 0.32 0.35
0.92 0.76 0.61 0.9 0.81 0.55 0.89 0.98 0.59 0.68 0.84 0.87 0.84 0.54 0.49 0.58 0.38 0.7 0.62 0.45 0.48 0.92 0.88 0.56 0.86 1.0
0.22 0.3 0.23 0.52 0.7 0.52 0.7 0.63 0.25 0.36 0.32 0.2 0.15 0.27 0.43 0.28 0.47 0.63 0.55 0.57 0.28 0.35 0.67 0.76 1.0 0.59
0.1 0.17 0.22 0.26 0.6 1.0 0.83 0.63 0.43 0.24 0.24 0.17 0.09 0.24 0.29 0.65 0.43 0.4 0.46 0.4 0.42 0.47 0.77 0.61 0.59 0.39
0.77 0.94 0.76 0.66 0.73 0.76 0.67 0.62 0.65 0.58 0.61 0.59 0.57 0.52 0.55 0.59 0.6 0.74 0.72 0.67 0.68 0.41 0.88 1.0 0.69 0.68
0.59 0.42 0.37 0.51 0.32 0.22 0.67 1.0 0.6 0.48 0.37 0.27 0.56 0.25 0.18 0.32 0.17 0.41 0.36 0.31 0.28 0.16 0.66 0.2 0.53 0.45
0.21 0.42 0.39 0.42 0.51 0.62 0.54 0.41 0.55 0.38 0.46 0.38 0.12 0.53 0.88 0.63 0.53 0.68 0.88 0.44 0.21 0.28 1.0 0.88 0.65 0.79
0.12 0.45 0.48 0.38 0.48 0.56 0.61 0.73 0.9 0.72 0.93 1.0 0.1 0.42 0.62 0.38 0.48 0.78 0.94 0.43 0.16 0.84 1.0 0.71 0.85 0.73
0.74 0.82 0.65 0.53 0.38 0.25 0.36 0.47 0.49 0.62 0.56 0.6 0.63 0.47 0.34 0.75 0.56 0.91 0.8 0.69 0.51 0.7 1.0 0.9 0.62 0.62
0.41 0.44 0.48 0.55 0.51 0.51 0.64 0.54 0.53 0.47 0.36 0.43 0.38 0.27 0.36 0.38 0.42 0.64 0.62 0.51 0.26 0.59 0.99 0.72 1.0 0.73
0.75 0.63 0.5 0.44 0.43 0.57 0.56 0.56 0.43 0.34 0.35 0.36 0.57 0.31 0.43 0.28 0.49 0.47 0.65 0.56 0.36 0.23 1.0 0.44 0.4 0.37
1.0 0.96 0.85 0.81 0.53 0.45 0.59 0.73 0.55 0.49 0.51 0.49 0.76 0.34 0.38 0.35 0.34 0.57 0.47 0.53 0.27 0.23 0.78 0.54 0.85 0.84
0.64 0.65 0.69 0.68 0.7 0.74 0.62 0.57 0.64 0.64 0.59 0.59 0.68 0.59 0.72 0.71 0.67 0.87 0.68 0.6 0.51 0.51 1.0 0.79 0.66 0.81
0.74 0.72 0.57 0.47 0.59 0.72 0.66 0.7 0.71 0.53 0.6 0.59 0.64 0.52 0.47 0.56 0.57 0.45 0.56 0.51 0.42 0.88 1.0 0.58 0.68 0.44
0.13 0.31 0.37 0.46 0.44 0.59 0.72 0.54 0.53 0.49 0.41 0.45 0.12 0.54 0.49 0.63 0.43 0.59 0.56 0.46 0.25 0.37 1.0 0.45 0.83 0.88
0.8 0.63 0.66 0.96 0.97 0.98 0.69 1.0 0.75 0.84 0.86 0.76 0.37 0.46 0.29 0.23 0.19 0.33 0.43 0.32 0.07 0.11 0.98 0.41 0.88 0.53
0.99 0.71 0.56 0.54 0.57 0.58 0.55 0.58 0.46 0.41 0.49 0.5 0.86 0.29 0.32 0.27 0.56 0.55 0.52 0.52 0.43 0.66 1.0 0.49 0.48 0.47
0.08 0.44 0.22 0.42 0.68 0.82 0.55 0.55 0.28 0.29 0.29 0.39 0.06 0.2 0.28 0.27 0.36 0.75 0.54 0.71 0.3 0.26 1.0 0.92 0.89 0.92
0.14 0.17 0.14 0.22 0.25 0.4 0.26 0.27 0.52 0.54 0.64 0.72 0.12 0.2 0.13 0.16 0.12 0.42 0.37 0.19 0.07 0.05 1.0 0.33 0.51 0.21
0.57 0.17 0.55 0.51 0.58 0.49 0.38 0.2 0.13 0.14 0.23 0.13 0.21 0.29 0.13 0.38 0.19 0.48 0.52 0.11 0.82 0.04 1.0 0.02 0.16 0.51
0.18 0.44 0.53 0.45 0.53 0.73 0.53 0.43 0.53 0.41 0.56 0.46 0.09 0.33 0.64 0.5 0.39 0.62 0.92 0.67 0.24 0.06 1.0 0.52 0.54 0.71
0.11 0.4 0.41 0.53 0.6 0.76 0.59 0.62 0.59 0.36 0.39 0.32 0.07 0.32 0.31 0.36 0.38 0.39 0.43 0.48 0.08 0.33 1.0 0.26 0.84 0.83
0.21 0.39 0.41 0.31 0.31 0.32 0.38 0.28 0.4 0.38 0.36 0.31 0.22 0.21 0.16 0.23 0.23 0.51 0.28 0.4 0.12 0.4 1.0 0.33 0.6 0.54
0.11 0.26 0.41 0.47 0.73 0.76 0.66 0.71 0.78 0.85 0.62 0.62 0.1 0.59 0.49 0.29 0.58 1.0 0.91 0.67 0.8 0.8 0.87 0.77 0.8 0.9
0.06 0.11 0.3 0.35 0.61 0.78 0.5 0.36 0.41 0.34 0.27 0.3 0.06 0.39 0.43 0.39 0.52 0.52 0.8 0.56 0.37 0.48 0.78 1.0 0.68 0.77
0.86 0.5 0.54 0.74 0.5 0.5 0.78 1.0 0.67 0.58 0.63 0.54 0.78 0.39 0.3 0.48 0.35 0.43 0.46 0.41 0.42 0.35 0.73 0.52 0.78 0.8
0.05 0.11 0.2 0.26 0.23 0.16 0.27 0.29 0.36 0.37 0.43 0.48 0.09 0.38 0.21 0.3 0.2 0.43 0.18 0.21 0.68 0.32 0.52 1.0 0.8 0.61
0.73 0.78 0.79 0.82 0.68 0.79 0.82 0.86 0.6 0.52 0.54 0.48 0.65 0.36 0.35 0.35 0.4 0.66 0.55 0.47 0.36 0.39 1.0 0.53 0.73 0.83
0.43 0.45 0.49 0.42 0.37 0.43 0.37 0.42 0.48 0.49 0.74 1.0 0.35 0.31 0.25 0.42 0.36 0.51 0.5 0.43 0.15 0.82 0.74 0.74 0.58 0.43
0.59 0.67 0.84 0.9 0.77 0.77 0.69 0.76 0.76 0.63 0.73 0.7 0.41 0.56 0.34 0.43 0.61 0.63 0.44 0.61 0.21 0.33 1.0 0.4 0.58 0.84
0.6 0.54 0.45 0.44 0.49 0.62 0.51 0.57 0.66 0.53 0.52 0.49 0.58 0.34 0.34 0.31 0.3 0.39 0.35 0.33 0.42 0.19 1.0 0.35 0.25 0.2
0.98 0.92 0.82 0.74 0.82 0.95 0.77 0.76 0.64 0.65 0.7 0.75 0.72 0.64 0.7 0.65 0.73 0.54 0.62 0.68 0.79 0.57 1.0 0.97 0.54 0.6
0.76 0.57 0.67 0.81 0.62 0.57 0.73 0.82 0.45 0.39 0.39 0.42 0.87 0.35 0.41 0.53 0.35 0.41 0.45 0.47 0.34 0.51 1.0 0.45 0.58 0.71
0.09 0.24 0.3 0.38 0.41 0.49 0.46 0.4 0.36 0.37 0.3 0.2 0.13 0.48 0.37 0.47 0.43 0.48 0.42 0.38 0.19 0.35 1.0 0.41 0.71 0.62
0.66 0.7 0.7 0.87 0.88 0.68 0.88 0.74 0.73 0.75 0.76 0.55 0.3 0.35 0.5 0.51 0.45 0.78 0.78 0.52 0.1 0.23 0.93 1.0 0.85 0.76
0.49 0.56 0.65 0.73 0.77 0.6 0.58 0.56 0.64 0.78 0.92 1.0 0.57 0.41 0.49 0.86 0.57 0.9 0.81 0.7 0.27 0.61 0.93 0.93 0.63 0.6
0.48 0.5 0.41 0.52 0.69 0.7 0.7 0.66 0.79 0.78 0.65 0.67 0.53 0.39 0.58 0.52 0.32 0.77 0.7 0.49 0.27 0.45 1.0 0.41 0.54 0.58
0.07 0.15 0.29 0.3 0.31 0.41 0.56 0.65 0.77 0.85 0.87 0.65 0.09 0.46 0.3 0.39 0.44 0.76 0.71 0.65 0.84 0.59 1.0 0.81 0.86 0.83

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)