Heatmap: Cluster_218 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.0 0.52 0.47 0.46 0.52 0.53 0.79 0.77 0.56 0.58 0.5 0.36 0.77 0.34 0.21 0.23 0.34 0.68 0.5 0.43 0.03 0.21 0.35 0.51 0.55 0.58
1.0 0.88 0.58 0.56 0.53 0.45 0.44 0.44 0.52 0.56 0.68 0.73 0.67 0.23 0.27 0.17 0.4 0.57 0.48 0.51 0.1 0.73 0.65 0.76 0.61 0.55
0.87 1.0 0.98 0.89 0.8 0.58 0.69 0.8 0.74 0.61 0.66 0.61 0.82 0.44 0.68 0.42 0.51 0.92 0.77 0.69 0.17 0.89 0.35 0.55 0.64 0.73
0.93 1.0 0.93 0.77 0.57 0.37 0.35 0.4 0.43 0.5 0.63 0.81 0.86 0.33 0.19 0.29 0.37 0.28 0.24 0.41 0.05 0.57 0.22 0.7 0.57 0.46
0.56 0.53 0.53 0.65 0.7 0.63 0.75 0.79 0.71 0.62 0.62 0.53 0.54 0.36 0.6 0.43 0.52 0.92 0.71 0.58 0.03 1.0 0.33 0.34 0.43 0.38
0.8 1.0 0.82 0.71 0.49 0.37 0.41 0.51 0.59 0.63 0.74 0.81 0.72 0.5 0.44 0.86 0.5 0.56 0.55 0.5 0.18 0.74 0.57 0.66 0.49 0.45
0.62 0.89 0.51 0.41 0.37 0.32 0.3 0.29 0.37 0.41 0.4 0.35 0.38 0.22 0.3 0.17 0.38 0.58 0.45 0.42 0.12 1.0 0.76 0.53 0.65 0.4
0.79 1.0 0.74 0.55 0.36 0.27 0.32 0.44 0.55 0.63 0.81 0.94 0.52 0.28 0.32 0.26 0.46 0.53 0.42 0.47 0.22 0.77 0.59 0.99 0.53 0.43
0.85 0.8 0.74 0.79 0.79 0.69 0.74 0.65 0.6 0.57 0.46 0.61 0.81 0.72 0.49 0.69 0.45 0.78 0.74 0.55 0.15 1.0 0.52 0.93 0.85 0.95
0.34 0.27 0.29 1.0 0.54 0.24 0.18 0.16 0.17 0.27 0.17 0.3 0.26 0.04 0.05 0.12 0.19 0.19 0.1 0.23 0.1 0.78 0.04 0.05 0.43 0.51
0.81 0.69 0.74 0.74 0.68 0.48 0.61 0.68 0.5 0.68 0.64 0.66 0.78 0.45 0.37 0.46 0.58 0.77 0.82 0.69 0.07 1.0 0.34 0.72 0.67 0.89
0.94 1.0 0.97 0.95 0.71 0.39 0.35 0.39 0.03 0.09 0.11 0.16 0.95 0.03 0.02 0.04 0.02 0.02 0.05 0.24 0.09 0.69 0.02 0.14 0.55 0.43
0.61 1.0 0.87 0.82 0.89 0.76 0.8 0.83 0.87 0.96 0.83 0.86 0.52 0.38 0.45 0.47 0.7 0.98 0.9 0.77 0.03 0.87 0.51 0.57 0.93 0.65
0.48 0.53 0.39 0.66 0.69 0.62 0.75 0.94 0.77 0.68 0.5 0.31 0.27 0.16 0.26 0.23 0.31 1.0 0.59 0.5 0.04 0.57 0.43 0.43 0.88 0.44
0.83 0.43 0.34 0.64 0.4 0.43 0.21 0.39 0.41 0.85 0.53 0.81 0.72 0.26 0.15 0.19 0.26 0.28 0.23 0.43 0.04 0.37 0.43 0.46 0.75 1.0
0.97 0.93 0.64 0.42 0.3 0.31 0.48 0.67 0.62 0.7 0.65 0.65 0.8 0.35 0.29 0.46 0.47 0.72 0.61 0.58 0.2 0.89 0.37 0.97 1.0 0.48
0.8 0.72 0.64 0.68 0.65 0.53 0.61 0.73 0.49 0.64 0.69 0.7 0.64 0.65 0.53 0.29 0.54 0.68 1.0 0.59 0.07 0.67 0.31 0.47 0.5 0.78
0.82 0.63 0.6 0.69 0.8 0.52 0.69 0.64 0.49 0.66 0.55 0.63 0.73 0.85 0.46 0.49 0.57 0.95 1.0 0.74 0.13 0.59 0.34 0.92 0.74 0.95
1.0 0.78 0.51 0.57 0.5 0.47 0.79 0.9 0.86 0.85 0.88 0.68 0.68 0.43 0.38 0.24 0.5 0.67 0.62 0.62 0.1 0.52 0.24 0.5 0.82 0.67
0.88 0.63 0.41 0.36 0.29 0.3 0.4 0.57 0.57 0.61 0.66 0.65 0.68 0.13 0.39 0.15 0.43 0.5 0.54 0.47 0.03 1.0 0.36 0.58 0.82 0.72
0.85 0.76 0.49 0.59 0.72 0.73 0.87 0.85 0.66 0.63 0.57 0.55 0.8 0.31 0.34 0.28 0.29 1.0 0.57 0.35 0.13 0.76 0.56 0.6 0.98 0.48
0.82 0.95 0.66 0.65 0.75 0.86 0.78 0.88 0.95 0.91 0.86 0.83 0.75 0.53 0.77 0.54 0.66 1.0 0.86 0.7 0.1 0.65 0.28 0.55 0.71 0.68
0.72 0.64 0.56 0.59 0.74 0.76 0.8 0.86 0.83 0.73 0.68 0.62 0.63 0.55 0.6 0.58 0.55 1.0 0.81 0.62 0.11 0.77 0.56 0.61 0.59 0.44
0.43 0.48 0.51 0.65 0.75 0.77 0.84 0.65 0.51 0.44 0.38 0.43 0.45 0.35 0.27 0.32 0.38 0.92 0.66 0.7 0.07 1.0 0.19 0.15 0.3 0.32
0.48 0.36 0.35 0.3 0.34 0.32 0.21 0.24 0.15 0.24 0.2 0.24 0.32 0.42 0.18 0.1 0.25 0.59 0.51 0.26 0.1 0.78 0.39 0.75 0.72 1.0
0.83 0.98 0.71 0.6 0.41 0.25 0.36 0.48 0.49 0.59 0.64 0.71 0.56 0.43 0.31 0.33 0.52 0.7 0.61 0.58 0.04 1.0 0.3 0.7 0.7 0.73
0.78 0.69 0.61 0.78 0.79 0.67 0.74 0.75 0.7 0.72 0.68 0.55 0.57 0.26 0.5 0.31 0.53 1.0 0.77 0.68 0.05 0.8 0.37 0.44 0.69 0.59
0.47 0.55 0.62 0.87 1.0 0.71 0.82 0.83 0.76 0.7 0.62 0.57 0.26 0.42 0.47 0.46 0.44 0.85 0.7 0.47 0.35 0.74 0.46 0.84 0.71 0.59
0.55 0.46 0.32 0.31 0.26 0.25 0.27 0.29 0.35 0.5 0.54 0.56 0.77 0.29 0.19 0.21 0.32 0.54 0.44 0.34 0.16 0.62 0.16 1.0 0.58 0.49
1.0 0.51 0.35 0.31 0.12 0.16 0.49 0.75 0.54 0.51 0.51 0.27 0.6 0.1 0.17 0.09 0.15 0.67 0.37 0.32 0.0 0.2 0.17 0.28 0.83 0.34
0.62 0.49 0.41 0.47 0.54 0.49 0.69 0.79 0.57 0.67 0.65 0.47 0.64 0.29 0.36 0.33 0.32 0.8 0.54 0.41 0.06 0.61 0.33 1.0 0.61 0.39
0.8 0.7 0.61 0.63 0.52 0.36 0.49 0.52 0.46 0.58 0.59 0.56 0.52 0.2 0.41 0.21 0.4 0.72 0.6 0.61 0.01 1.0 0.13 0.43 0.53 0.45
0.8 0.8 0.94 0.97 0.97 1.0 0.75 0.69 0.64 0.53 0.53 0.64 0.74 0.48 0.53 0.47 0.53 0.65 0.66 0.54 0.12 0.93 0.4 0.44 0.81 0.73
0.83 0.59 0.7 0.77 0.62 0.59 0.5 0.53 0.67 0.83 0.83 0.96 0.76 0.25 0.26 0.17 0.42 0.43 0.49 0.81 0.11 0.89 0.95 1.0 0.84 0.92
0.82 0.64 0.59 0.58 0.95 1.0 0.71 0.47 0.47 0.34 0.3 0.35 0.9 0.4 0.56 0.49 0.57 0.52 0.79 0.34 0.06 0.95 0.36 0.2 0.76 0.43
0.64 0.49 0.55 0.59 0.58 0.45 0.67 0.7 0.58 0.71 0.71 0.83 0.75 0.59 0.4 0.5 0.56 1.0 0.73 0.67 0.07 0.9 0.35 0.36 0.78 0.9
0.26 0.65 0.5 0.94 0.88 0.53 0.58 0.9 0.81 0.72 0.85 0.47 0.1 0.16 0.17 0.15 0.35 0.97 0.76 0.61 0.12 0.28 0.17 1.0 1.0 0.36
0.99 0.68 0.61 0.53 0.49 0.67 0.66 0.87 0.72 0.67 0.78 0.65 1.0 0.48 0.5 0.5 0.44 0.54 0.44 0.49 0.09 0.97 0.55 0.69 0.91 0.86
0.69 0.55 0.6 0.74 0.75 0.64 0.66 0.63 0.77 0.59 0.7 0.59 0.53 0.14 0.17 0.15 0.16 0.29 0.22 0.48 0.3 0.65 0.79 0.56 0.92 1.0
0.2 0.29 0.37 0.49 0.63 0.72 1.0 0.73 0.79 0.51 0.36 0.29 0.17 0.25 0.32 0.4 0.44 0.92 0.64 0.38 0.1 0.42 0.36 0.4 0.42 0.35
1.0 0.99 0.8 0.79 0.6 0.35 0.33 0.38 0.32 0.36 0.46 0.54 0.77 0.26 0.27 0.23 0.35 0.39 0.3 0.42 0.28 0.61 0.33 0.51 0.53 0.5
0.7 0.63 0.65 0.71 0.81 0.84 1.0 0.89 0.92 0.86 0.83 0.64 0.67 0.45 0.63 0.62 0.62 1.0 0.84 0.64 0.27 0.61 0.52 0.44 0.46 0.46
0.64 0.48 0.45 0.49 0.59 0.62 0.67 0.65 0.53 0.5 0.42 0.38 0.62 0.23 0.43 0.33 0.49 1.0 0.71 0.62 0.05 0.7 0.31 0.3 0.57 0.38
0.46 0.35 0.37 0.44 0.49 0.34 0.5 0.49 0.51 0.47 0.52 0.41 0.53 0.54 0.54 0.47 0.36 0.6 0.43 0.39 0.06 0.62 0.55 1.0 0.58 0.39
0.47 0.39 0.34 0.43 0.36 0.3 0.31 0.36 0.34 0.36 0.36 0.41 0.45 0.29 0.34 0.32 0.32 0.58 1.0 0.27 0.06 0.34 0.21 0.26 0.35 0.42
0.9 0.86 0.8 0.77 0.51 0.43 0.7 0.86 0.82 0.7 0.72 0.75 0.63 0.66 0.62 0.56 0.61 0.82 0.96 0.63 0.08 0.56 0.63 0.59 1.0 1.0
0.89 1.0 0.68 0.6 0.49 0.38 0.42 0.44 0.46 0.49 0.62 0.66 0.65 0.26 0.33 0.2 0.39 0.4 0.37 0.47 0.05 0.84 0.33 0.62 0.64 0.48
0.29 0.6 0.64 0.84 0.84 0.64 0.71 0.77 0.7 0.65 0.6 0.52 0.23 0.38 0.53 0.49 0.5 0.9 0.69 0.46 0.04 1.0 0.29 0.38 0.56 0.47
0.41 0.29 0.63 1.0 0.65 0.38 0.47 0.65 0.69 0.72 0.75 0.62 0.3 0.22 0.11 0.22 0.18 0.29 0.28 0.44 0.07 0.86 0.85 0.54 0.85 0.66
0.68 0.4 0.46 0.67 0.51 0.46 0.65 0.91 0.76 0.59 0.73 0.71 0.82 0.42 0.2 0.49 0.24 1.0 0.45 0.32 0.2 0.92 0.67 0.52 0.91 0.48
0.81 0.65 0.61 0.59 0.76 0.66 0.77 0.72 0.78 0.9 0.94 0.88 0.8 0.44 0.54 0.3 0.48 0.57 0.55 0.64 0.32 1.0 0.65 0.75 0.75 0.82
0.66 0.8 0.82 0.88 0.66 0.58 0.59 0.61 0.55 0.55 0.58 0.63 0.84 0.39 0.44 0.4 0.49 0.56 0.58 0.35 0.18 1.0 0.42 0.45 0.59 0.63
1.0 0.64 0.52 0.65 0.48 0.18 0.21 0.36 0.19 0.23 0.36 0.44 0.66 0.05 0.13 0.04 0.15 0.28 0.28 0.25 0.02 0.51 0.05 0.5 0.49 0.64
0.7 0.83 0.88 0.83 0.91 0.76 0.78 0.72 0.64 0.75 0.62 0.64 0.56 0.49 0.65 0.46 0.5 1.0 0.96 0.61 0.05 0.35 0.22 0.29 0.28 0.57
0.76 0.81 0.96 0.99 0.92 0.68 0.98 0.95 0.68 0.81 0.77 0.73 0.62 0.51 0.71 0.52 0.53 1.0 0.82 0.58 0.05 0.37 0.3 0.27 0.34 0.52
0.6 0.68 0.7 0.72 0.83 0.79 0.88 0.75 0.79 0.79 0.64 0.62 0.61 0.52 0.59 0.7 0.57 1.0 0.85 0.59 0.07 0.9 0.2 0.32 0.34 0.42
1.0 0.61 0.55 0.59 0.45 0.43 0.42 0.55 0.6 0.66 0.67 0.65 0.73 0.28 0.37 0.39 0.25 0.75 0.38 0.23 0.04 0.23 0.16 0.24 0.85 0.83
0.94 0.81 0.53 0.81 0.57 0.42 0.47 0.59 0.74 0.66 0.77 0.65 0.81 0.38 0.39 0.44 0.27 0.98 0.46 0.25 0.09 0.73 0.18 0.54 1.0 0.95
0.79 0.81 0.64 0.85 0.66 0.44 0.38 0.45 0.43 0.51 0.59 0.63 0.43 0.21 0.15 0.19 0.31 0.73 0.43 0.41 0.01 0.91 0.18 0.3 1.0 0.71
0.51 0.14 0.23 0.37 0.39 0.56 0.78 0.68 0.38 0.41 0.58 0.39 0.26 0.11 0.13 0.0 0.0 0.53 0.13 0.2 0.0 1.0 0.06 0.59 0.75 0.36
1.0 0.75 0.6 0.54 0.51 0.48 0.62 0.73 0.69 0.65 0.77 0.65 0.73 0.39 0.54 0.35 0.44 0.71 0.71 0.56 0.09 0.81 0.36 0.57 0.89 0.7
0.46 0.76 0.57 0.83 0.5 0.43 0.44 0.49 0.45 0.57 0.55 0.44 0.27 0.28 0.38 0.29 0.45 0.55 0.51 0.39 0.02 0.04 0.38 0.72 1.0 0.4
0.67 0.92 0.67 0.6 0.64 0.5 0.6 0.58 0.62 0.67 0.57 0.54 0.48 0.37 0.44 0.4 0.42 1.0 0.76 0.63 0.0 0.9 0.21 0.27 0.35 0.26
0.34 0.41 0.47 0.59 0.51 0.51 0.74 0.55 0.64 0.79 0.64 0.57 0.41 0.66 0.85 0.55 0.47 1.0 0.89 0.59 0.06 0.58 0.06 0.28 0.54 0.58
0.52 0.48 0.56 0.71 0.81 0.8 0.7 0.75 0.89 0.91 0.86 0.71 0.63 0.69 0.75 0.53 0.42 1.0 0.94 0.52 0.07 0.79 0.1 0.3 0.67 0.82
0.69 0.88 0.72 0.69 0.57 0.58 0.55 0.58 0.56 0.56 0.55 0.59 0.67 0.05 0.09 0.08 0.29 0.82 0.42 0.55 0.07 0.65 0.1 0.32 1.0 0.44
0.59 0.51 0.54 0.81 0.81 0.56 0.47 0.44 0.35 0.31 0.4 0.37 0.63 0.25 0.23 0.6 0.21 0.38 0.32 0.21 0.11 1.0 0.41 0.15 0.58 0.51
0.36 0.34 0.31 0.37 0.59 0.5 0.58 0.56 0.44 0.52 0.56 0.43 0.5 0.54 0.43 0.55 0.59 0.78 0.59 0.43 0.1 0.46 0.42 1.0 0.6 0.31
0.41 0.42 0.36 0.55 0.73 0.67 0.81 0.81 0.7 0.67 0.56 0.35 0.4 0.13 0.25 0.17 0.31 1.0 0.58 0.46 0.01 0.43 0.19 0.21 0.53 0.31
0.77 0.73 0.54 0.61 0.53 0.37 0.45 0.62 0.63 0.6 0.67 0.62 0.78 0.29 0.28 0.3 0.3 0.94 0.51 0.44 0.35 1.0 0.69 0.71 0.77 0.54
0.39 0.46 0.48 0.66 0.49 0.31 0.29 0.34 0.43 0.36 0.49 0.48 0.4 0.43 0.31 0.2 0.24 0.56 0.39 0.35 0.1 1.0 0.24 0.46 0.68 0.58
0.88 0.72 0.73 0.85 0.74 0.67 0.64 0.66 0.52 0.45 0.49 0.45 0.76 0.44 0.43 0.51 0.44 0.78 0.82 0.45 0.05 1.0 0.43 0.41 0.73 0.81
0.87 0.42 0.28 0.17 0.26 0.16 0.49 0.57 0.42 0.42 0.44 0.38 0.78 0.17 0.2 0.09 0.18 0.55 0.39 0.21 0.01 0.2 0.07 0.1 1.0 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)