Heatmap: Cluster_89 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.37 0.35 0.33 0.33 0.35 0.36 0.38 0.35 0.3 0.31 0.32 0.36 0.33 0.32 0.36 0.35 0.28 0.38 0.38 0.36 0.14 0.45 0.44 1.0 0.71 0.62
0.04 0.01 0.01 0.02 0.02 0.04 0.06 0.04 0.1 0.1 0.12 0.08 0.04 0.03 0.33 0.07 0.63 0.09 0.09 0.03 0.27 0.35 0.39 0.92 0.99 1.0
0.0 0.33 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.14 0.05 0.09 0.14 0.05 0.11 0.06 0.0 0.11 0.0 0.17 0.35 0.26 0.07 0.0 0.66 1.0 0.06 0.48
0.14 0.0 0.2 0.17 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.16 0.11 0.0
0.15 0.17 0.26 0.35 0.14 0.11 0.17 0.33 0.11 0.17 0.2 0.25 0.18 0.15 1.0 0.06 0.26 0.24 0.02 0.09 0.53 0.11 0.12 0.78 0.8 0.74
0.22 0.28 0.34 0.55 0.35 0.18 0.25 0.54 0.2 0.24 0.39 0.41 0.34 0.22 0.38 0.06 0.4 0.35 0.03 0.14 0.54 0.11 0.14 0.71 0.76 1.0
0.2 0.27 0.36 0.3 0.3 0.24 0.24 0.29 0.27 0.45 0.54 0.61 0.28 0.4 0.28 0.15 0.54 0.91 0.09 0.29 0.19 0.09 0.18 1.0 0.81 0.92
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.04 0.01 0.01 0.18 0.0 0.29 0.05 0.06 0.01 0.3 0.35 0.71 1.0 0.23 0.42
0.09 0.14 0.2 0.3 0.38 0.26 0.31 0.31 0.48 0.72 0.81 0.62 0.13 0.25 0.99 0.32 0.64 0.86 0.99 0.94 0.12 0.77 0.37 1.0 0.66 0.78
0.09 0.05 0.06 0.07 0.1 0.05 0.05 0.06 0.09 0.07 0.18 0.13 0.12 0.01 0.06 0.01 0.21 0.68 0.25 0.27 0.26 0.39 0.47 0.36 0.4 1.0
0.04 0.04 0.06 0.07 0.05 0.04 0.04 0.06 0.1 0.2 0.25 0.21 0.05 0.01 0.38 0.01 0.66 0.4 0.61 0.46 0.07 0.24 0.28 0.87 0.64 1.0
0.04 0.11 0.14 0.14 0.11 0.1 0.1 0.12 0.21 0.48 0.51 0.46 0.06 0.02 0.44 0.02 0.93 0.34 0.43 0.48 0.2 0.26 0.46 1.0 0.94 0.93
0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.07 0.98 0.1 0.05 0.21 0.9 0.75 1.0 0.69 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.09 1.0 0.11 0.05 0.01 0.31 0.16 0.37 0.41 0.57
0.05 0.07 0.07 0.21 0.11 0.0 0.0 0.28 0.0 0.13 0.26 0.43 0.15 0.16 0.24 0.0 0.16 0.34 0.43 0.17 0.07 0.05 0.96 1.0 0.08 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.04 0.03 0.04 0.69 0.51 0.23 0.03 0.07 0.17 0.21 0.33 0.27 1.0
0.65 0.55 0.58 0.36 0.3 0.33 0.34 0.46 0.28 0.24 0.38 0.37 0.3 0.28 0.43 0.39 0.23 1.0 0.62 0.33 0.22 0.44 0.65 0.87 0.81 0.79
0.19 0.18 0.18 0.3 0.32 0.35 0.27 0.3 0.33 0.34 0.31 0.34 0.31 0.44 0.46 0.53 0.3 0.53 0.52 0.24 0.25 0.39 0.45 0.67 1.0 0.82
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.38 0.1 0.36 0.02 0.22 0.46 0.41 0.75 1.0
0.23 0.1 0.2 0.22 0.26 0.18 0.32 0.2 0.15 0.11 0.26 0.16 0.13 0.25 0.09 0.06 0.04 0.09 0.19 0.05 0.37 0.31 0.36 0.93 0.86 1.0
0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.07 0.01 0.04 0.1 0.09 0.06 0.2 0.84 0.36 0.38 0.39 1.0
0.15 0.0 0.0 0.01 0.01 0.07 0.06 0.02 0.16 0.48 0.58 0.82 0.08 0.0 0.03 0.02 0.27 0.22 0.05 0.1 0.37 0.13 0.26 1.0 0.15 0.28
0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06 0.03 0.02 0.17 0.31 0.43 0.57 0.53 1.0
0.56 0.48 0.33 0.51 0.36 0.63 0.64 0.62 0.49 0.47 0.46 0.45 0.35 0.49 0.41 0.61 0.4 0.76 0.67 0.59 0.32 0.34 0.58 0.75 1.0 0.85
0.02 0.06 0.07 0.06 0.12 0.02 0.06 0.06 0.11 0.16 0.08 0.07 0.01 0.15 0.09 0.09 0.39 0.72 0.36 0.34 0.23 0.1 0.28 1.0 0.63 0.97
0.05 0.05 0.0 0.02 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.09 0.04 0.01 0.04 0.01 0.1 0.06 0.22 0.2 0.11 0.09 0.1 1.0 0.99 0.06 0.13
0.04 0.02 0.05 0.06 0.03 0.03 0.04 0.08 0.11 0.17 0.18 0.17 0.07 0.01 0.07 0.0 0.3 0.33 0.24 0.14 0.03 0.34 0.2 0.43 0.79 1.0
0.45 0.55 0.59 0.35 0.3 0.28 0.31 0.28 0.22 0.27 0.23 0.19 0.37 0.41 0.42 0.51 0.4 0.6 0.49 0.53 0.35 0.4 0.49 0.55 0.69 1.0
0.3 0.34 0.28 0.24 0.16 0.14 0.16 0.15 0.13 0.13 0.12 0.14 0.29 0.27 0.34 0.34 0.35 0.73 0.61 0.55 0.32 0.25 0.59 0.54 0.75 1.0
0.25 0.14 0.13 0.24 0.26 0.2 0.16 0.22 0.3 0.4 0.56 0.52 0.27 0.1 0.25 0.59 0.5 0.1 0.13 0.19 0.25 0.74 0.03 1.0 0.51 0.76
0.11 0.08 0.1 0.12 0.18 0.18 0.13 0.1 0.17 0.26 0.35 0.32 0.19 0.22 0.19 0.54 0.68 0.38 0.25 0.45 0.36 0.24 0.32 1.0 0.47 0.68
0.48 0.48 0.55 0.19 0.14 0.46 0.37 0.35 0.26 0.46 0.45 0.55 0.45 0.23 0.47 0.34 0.71 1.0 0.66 0.33 0.12 0.4 0.55 0.59 0.73 0.63
0.2 0.11 0.14 0.24 0.18 0.21 0.2 0.17 0.18 0.15 0.27 0.11 0.15 0.26 0.18 0.34 0.27 0.38 0.43 0.17 0.16 0.36 0.45 1.0 0.6 0.71
0.41 0.4 0.47 0.51 0.47 0.38 0.35 0.36 0.39 0.45 0.47 0.51 0.35 0.37 0.47 0.54 0.45 0.61 0.72 0.78 0.35 0.59 0.43 0.83 0.65 1.0
0.08 0.03 0.08 0.14 0.06 0.11 0.02 0.07 0.05 0.06 0.19 0.11 0.05 0.01 0.06 0.08 0.06 0.31 0.07 0.08 0.07 0.02 0.39 1.0 0.02 0.12
0.6 0.42 0.26 0.47 0.39 0.18 0.27 0.48 0.27 0.46 0.65 0.45 0.38 0.41 0.31 0.38 0.27 1.0 0.41 0.4 0.17 0.4 0.48 0.69 0.73 0.74
0.15 0.33 0.3 0.33 0.3 0.38 0.56 0.68 0.62 0.67 0.54 0.48 0.16 0.24 0.45 0.28 0.85 0.9 0.84 0.77 0.27 0.35 0.38 0.52 1.0 0.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.03 0.0 0.02 0.01 0.0 0.12 0.07 0.03 0.06 0.16 0.1 0.13 1.0 0.16 0.31
0.1 0.05 0.04 0.05 0.08 0.09 0.09 0.07 0.1 0.21 0.21 0.19 0.09 0.07 0.09 0.07 0.67 1.0 0.29 0.85 0.5 0.21 0.74 0.79 0.5 0.48
0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.04 0.02 0.01 0.01 0.04 0.01 0.49 0.19 0.07 0.01 0.02 0.32 0.01 0.64 0.59 1.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.06 0.04 0.0 0.02 0.02 0.01 0.46 0.22 0.04 0.01 0.03 0.4 0.03 0.7 0.73 1.0
0.05 0.01 0.01 0.02 0.04 0.08 0.09 0.05 0.07 0.18 0.18 0.17 0.07 0.03 0.15 0.03 0.81 0.28 0.04 0.04 0.3 0.21 0.05 0.95 0.67 1.0
0.04 0.07 0.15 0.07 0.12 0.1 0.15 0.16 0.09 0.13 0.12 0.15 0.15 0.08 0.15 0.1 0.09 0.14 0.13 0.04 0.25 0.42 0.36 0.46 1.0 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.02 0.01 0.0 0.1 0.33 0.41 1.0 0.4 0.52
0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.12 0.28 1.0 0.62 0.51 0.17 0.0 0.17 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.12 0.54 0.11 0.25
0.0 0.0 0.03 0.0 0.11 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.03 0.12 0.07 0.31 0.64 0.42 0.12 0.27 0.0 0.02 0.0 1.0 0.31 0.86
0.06 0.12 0.15 0.21 0.22 0.23 0.38 0.43 0.33 0.35 0.29 0.21 0.08 0.18 1.0 0.33 0.68 0.59 0.78 0.64 0.14 0.18 0.39 0.73 0.54 0.45
0.07 0.04 0.06 0.04 0.05 0.06 0.15 0.27 0.26 0.36 0.32 0.19 0.12 0.07 0.3 0.04 0.68 0.74 1.0 0.64 0.01 0.11 0.2 0.17 0.71 0.47
0.16 0.04 0.23 0.05 0.02 0.07 0.23 0.53 0.35 0.55 0.59 0.35 0.24 0.05 0.46 0.05 1.0 0.78 0.79 0.71 0.0 0.11 0.25 0.4 1.0 0.51
0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.04 0.17 0.26 0.23 0.22 0.22 0.19 0.09 0.1 0.42 0.02 0.86 0.64 1.0 0.7 0.0 0.11 0.2 0.23 0.72 0.62
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 1.0 0.03 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.07 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 1.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.06 0.2 0.02 0.01 0.12 0.32 0.0 0.14 0.8 1.0
0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.16 0.04 0.02 0.13 0.34 0.01 0.35 0.72 1.0
0.2 0.08 0.19 0.37 0.49 0.53 0.74 0.65 0.47 0.68 0.58 0.4 0.15 0.37 0.28 0.11 0.8 0.78 1.0 0.78 0.03 0.39 0.12 0.65 0.66 0.7
0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.07 0.05 0.04 0.07 0.13 0.13 0.09 0.01 0.22 0.44 0.09 1.0 0.5 0.54 0.42 0.2 0.2 0.15 0.8 0.41 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.33 0.0 0.0
0.0 0.0 0.73 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.18 0.19 0.0 0.0 0.12 0.0 0.14 0.72 1.0 0.0 0.0
0.24 0.21 0.31 0.14 0.2 0.12 0.11 0.18 0.09 0.11 0.07 0.19 0.33 0.28 0.41 0.3 0.41 0.9 0.4 0.82 0.27 0.17 1.0 0.31 0.29 0.32
0.24 0.43 0.31 0.28 0.39 0.15 0.25 0.24 0.31 0.4 0.26 0.45 0.41 0.24 0.28 0.07 0.34 1.0 0.48 0.39 0.19 0.53 0.47 0.25 0.62 0.82
0.85 0.37 0.24 0.23 0.17 0.13 0.36 0.31 0.49 0.9 1.0 0.88 0.61 0.32 0.08 0.11 0.26 0.07 0.19 0.25 0.24 0.17 0.23 0.86 0.47 0.8

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)