1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_108 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- 1.51 0.63 - 1.91 - - 0.51 - - - - - 2.05 2.13 0.52 - -0.12 - 2.47 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.09 - 3.15 - 2.97 - 1.59 - - - - 1.0 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.84 -2.84 -3.31 -0.91 -1.85 -1.04 -1.17 -0.54 -0.4 0.82 0.59 0.54 -0.86 0.1 2.59 -0.73 1.6 -2.39 -2.53 -1.43 -2.81 -1.83 -3.82 0.58 0.62 1.02
- - - - - - - - - - 1.78 - - 2.93 - 2.98 - - - - 2.15 1.37 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 2.31 4.13 - 1.82 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 2.56 - - - 2.64 2.56 - - - - 3.0 -
- - - - 3.63 - - - - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 1.14 - - - - 3.61 1.33 1.39 - - - 2.25 - 0.81 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.6 - - - - - - 0.83 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.23 - 1.11 1.27 - - 2.09 2.66 1.15 - - - - - - - 0.57 2.26
1.37 - - - - - - - - - - - 2.28 2.22 1.3 1.28 - - - 2.88 - - 0.72 - - -
- - - - - - - - - - - 3.79 - - 3.6 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - 0.1 - - - 1.12 0.83 -0.0 -0.18 - -0.02 - - 1.62 1.55 - - -0.2 - 2.3 -0.38 0.79 - 1.67 -0.63
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.61 - -3.14 - - - - -2.31 - - - - -3.48 2.63 2.67 -3.48 2.69 - - - -1.81 - - -3.47 - -
- - - 2.0 - - - 1.26 1.03 - 1.98 - - - 2.79 - - - - - 2.43 - 0.38 - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.55 - 3.84 - - - - - - - - -
-0.42 0.15 -2.91 0.22 -1.75 0.31 0.0 -1.07 -0.31 -0.08 -0.03 -0.91 -0.36 0.28 0.75 0.54 0.21 1.58 0.76 0.6 -2.72 -0.49 -0.72 -1.06 0.67 -0.89
- 4.16 3.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - -0.26 - - 1.69 -0.0 - - - - 0.18 0.62 -0.3 - 1.6 1.79 -0.57 0.7 1.53 - - - 1.14 1.84
- - - - - - 0.78 - - - - - - 2.66 0.48 3.27 - - 2.79 - - - - - - -
0.49 - 1.1 - -0.97 -0.71 -0.26 0.68 - 1.58 0.94 -1.69 0.81 -0.5 - -0.82 -0.98 0.54 - -0.45 -3.72 -2.18 0.84 - 1.01 1.94
- - - 0.76 - - - - - - - 0.92 - - 1.55 2.79 - 1.75 0.45 0.48 0.84 - - - 0.19 1.81
0.19 -0.47 -1.4 -0.67 -0.6 0.0 -1.28 -0.73 -1.15 1.2 0.05 -0.09 0.9 0.76 -1.45 1.01 - 0.15 0.7 1.35 -2.19 -0.91 -1.86 - 1.3 0.03
1.0 - 2.34 - - - - - - - - 1.12 - 2.17 - - - 0.42 - 2.67 - - 1.68 - - 0.44
- - 1.79 - - - - - - - 2.72 - - - - 3.27 - 2.65 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.07 - - - - 1.02 1.21 - 2.05 0.89 1.02 - 1.44 1.84 - - - 0.26 - 0.92 - - - - - -
-1.38 -0.58 -0.68 0.84 0.12 -1.14 0.82 0.5 -0.75 -1.38 -1.4 -0.74 -1.69 0.64 0.41 0.3 0.74 1.16 -0.62 -0.49 0.23 -0.42 -3.51 -1.17 0.6 1.13
0.98 - 2.28 - - - - - - - - - - 1.12 - 2.22 - 0.54 - 2.71 - 1.03 - 1.18 - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 1.85 2.16 - - 3.97 - - - - - - - - 1.14 -
0.34 -0.34 -1.59 -0.57 -0.4 - -0.14 -0.64 -0.53 - 1.18 - -0.4 -0.44 0.16 1.3 - 1.85 1.45 0.89 -0.58 -1.85 - -0.69 -0.24 1.02
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.6 - - - - - - - - - - - - - - 3.8 - - - - - - - - - -
1.52 -0.16 - -0.22 - - - 1.59 1.28 - 0.67 - - - - - - - 2.02 1.85 - - -0.96 1.0 1.85 -0.87
- - - -0.98 -0.16 -0.8 -1.73 - -1.94 -0.44 0.87 2.17 1.22 - - 2.35 -0.15 0.02 - 0.05 - -0.25 -0.56 - -0.58 1.93
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.96 - 2.93 - - - - 1.47 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.12 - - - - - - - - - 3.1
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.93 - - 3.43 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.94 - - 2.7 - - - - 0.87 - - - - 3.83 - - - - - - 0.57 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - 1.95 - - 1.98 - - - - 1.77 - 3.15 - 1.19 - 1.85 - - - - - -
- 3.54 - - - - - - - - - - - - 3.15 - - - - - 2.46 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.46 - 3.02 - - - 2.79 -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.46 3.19 - 3.44 - - - 1.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.7 - - - - 3.7 - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.