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Heatmap: Cluster_208 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-2.32 -0.8 -0.36 0.14 0.32 -0.02 0.42 0.42 0.58 0.75 0.53 0.33 -2.21 -0.32 -0.3 -0.01 -0.27 -0.0 -0.09 -0.1 -4.48 0.59 0.56 0.02 0.07 -0.07
-0.71 -1.3 -0.58 -0.03 0.19 0.14 0.7 0.72 0.5 0.73 0.84 0.63 -0.38 -0.83 -0.86 -0.36 -0.4 -0.22 -0.33 -0.54 -3.53 0.33 0.67 0.03 0.26 -0.98
-1.88 -0.63 -0.55 -0.02 0.33 0.3 0.34 0.35 0.27 0.41 0.7 0.59 -2.51 0.16 -0.39 -0.12 -0.43 -0.12 -0.66 -0.33 -3.52 0.85 0.89 -0.5 0.6 -0.54
-1.89 -1.96 -1.06 -0.65 -0.05 0.54 1.11 0.8 0.82 0.74 0.72 0.49 -1.76 -0.07 -0.55 -0.36 -0.12 0.09 -0.18 -0.11 -3.77 -0.48 -0.07 -0.42 0.58 0.08
-4.18 -2.99 -1.2 -0.44 0.09 0.37 0.36 0.53 1.03 0.83 0.86 0.54 -3.44 -1.61 -0.59 -1.3 -0.49 0.41 -0.09 -0.23 -0.54 -1.39 1.16 0.94 0.15 -0.29
-2.95 -1.92 -2.08 -1.76 -0.54 0.17 0.67 0.42 0.89 1.1 0.9 0.38 -3.46 0.13 -0.99 -0.11 -0.3 -0.42 -0.43 -0.13 -1.42 -0.27 1.26 0.5 0.44 -0.07
- - -3.62 -0.94 0.42 0.88 1.25 0.84 1.33 1.09 0.75 0.05 -4.85 -2.08 -0.87 -0.47 -0.4 -0.31 -0.74 -0.76 -2.07 -0.17 1.08 -0.53 0.62 -0.1
-2.64 -1.62 -1.36 -0.15 0.35 0.5 0.47 0.46 0.63 0.83 0.5 0.54 -2.95 -1.62 -0.04 -1.55 -0.73 0.4 -0.16 -0.77 - 0.09 1.56 -0.24 0.61 0.06
-1.78 -3.62 -3.16 -1.62 -0.54 0.55 0.89 0.87 1.13 0.88 0.78 0.44 -1.22 -0.32 -0.42 -0.99 -0.77 -0.33 -0.94 -1.23 -2.99 -0.22 1.3 0.18 0.98 -0.18
-0.86 -0.72 -0.9 -0.55 -0.05 0.45 0.63 0.67 0.61 0.36 0.21 -0.09 -0.88 0.08 -0.78 -0.48 0.21 0.54 0.17 -0.08 -3.12 -0.51 0.82 -0.26 0.46 -0.19
-0.82 -1.16 -0.72 -0.28 0.14 0.6 1.33 0.91 0.84 0.0 0.13 -0.13 -0.99 -0.86 -0.06 -0.17 -0.2 0.36 0.04 -0.28 -2.34 -0.04 0.39 0.15 -0.27 -1.26
-2.21 -1.53 -0.88 -0.24 -0.07 0.06 0.61 0.6 0.69 0.72 0.3 -0.16 -1.7 0.0 -0.27 0.1 -0.19 0.39 -0.06 -0.09 -0.96 0.55 0.79 -0.19 -0.09 -0.31
-4.05 -2.19 -0.94 -0.51 0.13 0.53 0.4 0.61 1.18 0.8 0.81 0.41 -3.86 -0.45 -0.13 -0.6 -1.45 -0.16 -0.28 -0.3 -3.17 0.02 1.2 0.58 0.01 -0.29
-2.69 -2.36 -1.83 -0.78 -0.49 -0.21 0.71 0.58 1.22 0.83 0.9 0.38 -2.09 -0.54 -0.5 -0.27 -0.3 0.7 -0.47 -0.49 -1.36 -1.67 1.32 0.7 0.01 -0.66
-0.23 -0.07 -0.44 -0.04 0.32 0.49 0.35 0.16 0.53 0.3 0.41 0.29 -0.53 -0.46 -0.24 -0.24 -0.38 -0.2 -0.06 -0.41 -1.56 0.36 0.81 0.05 -0.26 -0.98
-0.89 -0.53 -0.12 0.29 0.35 0.45 0.77 0.84 0.7 0.49 0.43 0.28 -0.55 -1.17 -1.2 -0.76 -0.8 -0.3 -0.89 -0.49 -3.7 -1.39 1.1 -0.27 0.73 0.03
-0.7 -0.99 -0.73 0.06 0.04 -0.16 0.55 0.59 0.87 0.54 0.33 0.37 -0.58 0.16 -0.35 0.08 -0.66 -0.04 -0.36 -0.8 -2.69 -0.57 0.79 -0.31 0.81 -0.32
-1.49 -3.21 -1.73 -0.87 -0.04 0.43 0.58 0.52 0.92 0.88 0.86 0.64 -0.7 -0.67 -0.71 -0.78 -0.7 -0.13 -0.47 -0.13 -1.66 -0.68 0.95 0.56 0.17 0.34
-0.8 -1.5 -1.43 -0.36 -0.43 -0.81 0.25 0.14 0.99 0.8 0.76 -0.07 -1.55 0.22 -0.14 0.48 -0.36 0.76 -0.21 -1.08 -1.13 -0.64 0.89 0.42 0.34 -0.39
-1.16 -0.61 -0.59 0.05 0.37 0.22 0.59 0.44 0.45 0.75 0.39 0.53 -1.28 -0.77 -0.52 -0.06 -0.31 -0.44 -0.62 -0.48 -1.57 0.55 0.9 -0.43 -0.03 0.18
-0.03 -0.76 -1.22 -0.66 -0.53 0.26 0.94 0.69 0.56 0.52 0.41 0.69 0.41 0.03 0.05 -0.19 -0.4 -0.54 -0.76 -0.55 -2.6 0.08 0.94 -0.92 -0.41 -0.51
-2.19 -3.65 -0.83 -0.36 0.01 0.24 0.2 -0.1 1.03 1.04 1.15 0.65 -1.73 -1.05 -1.05 -1.27 -1.23 -0.71 -0.88 -1.72 0.36 -1.23 1.87 0.69 0.16 -0.88
-1.94 -3.17 -1.45 -0.29 0.56 0.66 0.79 0.58 1.18 0.69 0.9 0.56 -2.48 -0.8 -0.66 -1.09 -0.43 -0.21 -0.24 -0.83 -2.1 -0.09 0.78 0.51 0.13 -0.64
0.02 -0.1 -0.18 -0.04 0.24 0.28 0.36 0.14 0.41 0.26 0.26 0.23 0.16 0.01 -0.13 -0.03 -0.07 -0.09 -0.17 -0.39 -2.4 -0.08 0.55 -0.06 -0.24 -0.81
-5.17 -3.3 -0.78 -0.03 0.49 0.58 0.83 0.6 0.97 0.92 0.58 0.35 -3.45 -0.33 -0.35 -0.38 -0.09 -0.06 0.09 0.38 -5.19 -2.89 -0.07 -0.06 0.61 0.26
-1.64 0.04 -0.1 0.33 0.08 0.16 0.27 0.68 0.69 0.59 0.66 0.39 -1.41 -0.18 0.01 -0.12 -0.35 -0.12 -0.07 -0.31 -4.66 -1.28 1.38 -0.63 -0.93 -0.69
-0.13 -0.45 -0.52 -0.09 0.44 0.47 0.74 0.65 0.46 0.26 0.37 0.06 -0.79 -0.65 -0.3 -0.26 -0.23 0.02 0.09 -0.43 -3.17 -0.02 0.41 0.13 0.11 -0.53
-1.87 -1.23 -0.99 -0.14 0.01 0.06 0.48 0.41 0.87 0.74 0.57 0.3 -1.5 0.17 -0.16 0.16 -0.22 0.4 -0.22 -0.34 -2.57 -0.33 1.01 -0.4 -0.08 -0.14
-0.49 -1.2 -0.9 0.3 -0.24 -0.03 0.22 0.52 0.72 0.7 0.53 0.12 -0.8 -0.49 -0.4 -0.23 -0.02 0.15 -0.12 -0.35 -1.89 -1.21 1.08 0.65 -0.31 -0.03
-4.86 -5.51 -2.93 -1.67 -0.46 0.35 0.88 0.51 0.89 0.88 0.67 0.16 -4.45 0.42 0.01 -0.14 0.38 0.22 0.01 0.14 -5.52 -0.9 0.77 0.14 0.61 0.13
-5.02 -3.34 -1.04 -0.41 0.11 -0.02 0.56 0.26 1.13 0.85 0.66 0.05 -4.28 -0.46 0.49 -0.08 0.45 0.03 0.15 0.23 -3.4 -0.15 0.65 -0.21 0.01 0.06
-1.55 -1.87 -1.33 -0.71 -0.04 0.54 0.7 0.73 1.11 0.88 0.73 0.4 -0.76 -1.22 -0.65 -1.65 -0.68 0.31 0.08 -0.06 -2.25 -1.71 1.08 0.21 0.39 -0.44
-2.53 -2.03 -1.11 -0.4 0.04 -0.07 0.23 0.44 0.98 1.07 1.3 0.9 -1.88 -0.88 1.0 -1.39 -0.7 -0.35 -0.42 -0.67 -3.26 -0.21 0.4 0.23 0.2 -0.17
-1.87 -3.92 -1.27 -0.38 0.11 0.23 0.6 0.84 1.0 0.83 0.53 0.31 -1.42 -0.56 -1.24 -0.06 -0.61 -0.07 -0.16 -0.26 -5.39 -1.02 1.5 -0.34 0.6 0.06
-0.66 -2.1 -1.76 -1.44 -0.12 0.73 0.73 0.81 0.83 0.6 0.41 0.17 -1.44 -0.53 -0.92 -1.5 -1.08 -0.3 -0.32 -1.13 -2.19 0.57 0.91 0.59 0.96 0.27
-4.64 -1.77 -0.88 -0.26 0.25 0.73 0.43 0.3 0.97 0.82 0.59 0.05 -4.62 -0.18 -0.65 -0.13 -0.08 0.11 -0.1 0.15 -3.72 0.41 0.59 0.22 -0.17 0.13
0.29 -0.11 -0.16 0.46 0.16 -0.18 0.55 0.86 0.43 0.22 0.02 -0.28 -0.24 -1.04 -0.7 -0.84 -0.67 -0.1 -0.05 -0.14 -3.16 -3.27 1.29 -0.25 0.41 0.27
-1.6 -1.06 -0.76 -0.36 0.24 0.55 0.6 0.66 0.86 0.5 0.51 0.24 -1.74 -0.71 -0.82 0.19 -0.78 -0.19 -0.28 -0.84 -1.35 -0.44 0.76 0.81 0.2 0.08
-1.34 -0.3 -1.34 0.69 0.4 0.24 0.71 0.69 0.97 0.62 0.69 0.2 -0.82 -0.12 -1.13 -0.39 -0.89 -0.81 -0.31 -1.15 -2.33 -1.66 0.61 -1.38 1.37 -0.55
-0.35 -0.52 -0.39 -0.42 0.25 0.39 0.53 0.27 0.57 0.1 0.47 0.39 -0.21 -0.66 -0.16 0.08 -0.46 -0.07 0.07 -0.38 -3.48 0.17 0.87 -0.11 -0.06 -0.44
-2.61 -0.95 -0.31 0.14 0.34 0.34 0.3 0.25 0.46 0.25 0.21 0.06 -2.39 0.02 0.08 0.06 -0.28 0.2 -0.01 -0.25 -1.25 0.78 0.75 -0.15 0.05 -0.26
-0.86 -1.71 -1.3 -0.37 0.01 0.17 0.47 0.27 0.78 0.7 0.45 0.43 -0.61 0.11 -0.35 0.38 -0.3 0.69 0.0 -0.36 -1.9 -0.54 0.81 0.17 -0.48 -0.72
-1.7 -1.58 -1.08 -0.82 -0.3 0.22 0.49 0.42 0.63 0.69 0.72 0.69 -1.38 0.14 -0.04 -0.13 -0.15 0.2 -0.11 -0.1 -2.48 -0.05 0.29 0.44 0.41 -0.26
-2.3 -0.82 -0.72 -0.09 0.35 0.21 0.32 0.31 0.68 0.58 0.65 0.09 -1.86 -0.35 -0.14 -0.36 -0.75 -0.27 -0.73 -1.3 -2.72 1.13 1.42 -0.42 0.21 -0.08
-0.98 -1.81 -1.04 -0.06 0.39 0.61 0.87 0.68 0.68 0.8 0.75 0.65 -0.64 -0.57 -1.38 -0.9 -1.2 0.24 -0.51 -0.22 -4.34 -0.15 -0.22 -0.06 0.78 0.03
-3.31 -3.87 -2.63 0.51 0.67 -0.34 -0.03 0.33 0.88 0.87 1.25 0.85 - -1.69 -1.55 -0.67 -0.79 0.76 -0.34 -1.38 -2.1 -1.27 1.67 -0.66 0.09 0.62
-2.52 -0.89 -0.39 -0.03 0.4 0.32 0.57 0.35 0.76 0.37 0.42 0.15 -2.88 -0.41 0.37 -0.02 0.23 0.28 0.04 0.13 -1.74 -1.49 0.16 0.05 0.39 -0.03
-1.22 -1.68 -0.86 -0.88 -0.03 -0.0 0.73 0.26 0.74 0.69 0.73 0.24 -1.44 0.01 0.01 -0.26 0.32 0.27 -0.42 0.24 -3.35 -0.48 0.58 0.54 -0.05 -0.15
-0.35 -0.77 -0.49 -0.07 0.2 0.09 0.43 0.53 0.36 0.56 0.52 0.04 -0.38 -0.15 -0.42 0.12 -0.28 -0.41 -0.6 -0.48 -2.53 0.32 0.44 0.11 0.52 -0.02
0.07 -0.36 -0.59 -0.37 0.33 0.5 0.36 0.2 -0.17 0.09 0.35 0.11 -0.06 -0.23 -0.19 -0.11 -0.5 0.07 -0.21 -0.49 -2.32 0.35 0.58 0.29 0.43 -0.26
-1.9 -0.7 0.01 0.1 0.53 0.17 -0.21 0.05 0.39 0.74 1.02 0.75 -1.91 0.06 0.46 0.07 -0.36 -0.07 -0.16 -0.31 -1.86 -2.84 0.2 0.18 -0.27 0.22
-0.85 -0.74 -0.67 -0.11 0.09 0.57 0.53 0.54 0.9 0.88 0.75 0.54 -0.4 -0.36 -1.08 -0.61 -0.43 -0.35 -0.47 -0.06 -2.2 0.09 -0.39 -0.63 0.42 0.12
-3.2 -2.42 -0.99 -0.3 0.17 0.2 0.43 0.41 0.8 0.94 0.87 0.41 -2.21 -1.22 0.61 -1.43 -0.41 0.11 -0.23 0.06 -1.52 -0.18 0.89 0.56 -0.12 -0.2
-3.31 -2.15 -0.61 -0.16 0.12 0.01 0.43 0.53 0.95 0.72 0.35 0.0 -3.69 0.61 -0.41 0.36 0.15 0.32 -0.54 0.08 -0.51 -1.27 1.26 -0.63 -0.61 -0.27
-1.08 -0.73 -0.63 0.33 0.11 -0.97 -0.04 0.02 0.41 0.65 1.0 0.62 -1.14 -0.06 -0.74 -0.21 -0.97 -0.14 -0.62 -0.81 -1.98 -2.04 1.21 1.32 0.09 0.17
-2.72 -1.69 -0.64 -0.23 0.07 0.16 0.34 0.15 0.44 0.65 0.55 0.42 -1.93 -0.03 0.04 -0.02 -0.09 0.21 0.05 0.05 -2.05 0.45 0.81 0.16 -0.13 -0.03
-0.81 -0.52 -0.05 -0.09 0.42 0.36 0.66 0.72 0.55 0.44 0.26 0.06 -0.93 -1.26 -1.2 -1.43 -0.95 -0.12 0.05 -0.26 -2.03 -0.72 1.39 -0.42 0.79 -0.16
-0.74 -1.52 -1.23 -0.85 -0.04 0.67 1.16 0.99 0.94 0.54 0.35 -0.24 -1.14 -0.47 -0.25 -0.6 -0.09 0.36 -0.11 -0.14 -3.2 -0.26 0.6 -0.18 0.06 -0.59
-3.81 -3.2 -1.89 -0.57 0.22 0.41 0.45 0.18 0.91 0.76 0.75 0.25 -3.9 0.18 -0.18 0.21 -0.19 0.43 0.16 0.05 -2.79 -0.19 0.48 0.7 -0.15 -0.16
-3.2 -0.45 -0.57 0.26 0.29 0.36 0.38 0.29 0.9 0.53 0.58 0.3 -3.33 -0.09 -0.06 -0.04 -0.39 0.25 0.25 -0.44 -2.27 -0.14 0.87 -0.32 -0.14 -0.47
-5.09 -1.41 -0.44 -0.32 0.14 0.52 0.27 0.14 0.64 0.69 0.83 0.86 -3.41 -0.84 -1.12 -0.14 -0.38 -0.49 -0.46 -0.38 -1.26 0.49 0.92 0.66 0.47 -0.38
-2.25 -1.65 -0.24 -0.01 0.5 0.74 0.69 0.28 1.06 0.57 0.48 0.12 -1.62 -0.68 -0.3 -0.76 -0.46 0.03 0.07 -0.07 -2.19 -0.41 1.16 -0.02 -0.47 -0.6
-2.33 -2.02 -0.32 0.17 0.21 0.2 0.35 0.57 0.87 0.62 0.54 0.3 -1.67 -0.05 -0.03 -0.17 -0.3 0.05 0.05 -0.37 -3.03 -0.39 1.12 -0.26 0.21 -0.57
-2.45 -0.69 -0.59 0.37 0.59 0.08 0.51 0.39 0.76 0.44 0.76 0.56 -2.96 -0.75 -0.63 -0.51 -0.97 0.11 -0.26 -0.58 -2.88 -0.64 1.32 0.0 0.44 -0.11
-0.81 -1.63 -0.7 -0.43 -0.08 -0.03 0.22 0.27 0.5 0.72 0.74 0.69 -0.56 0.12 -1.36 -0.19 -0.36 -0.61 -0.7 -0.05 -0.09 -0.85 1.28 0.67 -0.07 -0.7
-1.77 -0.2 -0.38 0.13 0.17 0.13 0.38 0.48 0.76 0.3 0.43 0.33 -1.89 -0.6 -0.53 -0.44 -0.37 -0.01 -0.14 -0.89 -0.61 -0.4 0.63 0.41 0.8 -0.13
-2.62 -3.02 -1.21 -0.47 -0.13 -0.26 0.34 0.51 0.79 0.8 0.86 0.39 -2.52 -0.37 -0.47 -0.3 -0.12 0.3 0.29 0.22 -2.27 0.41 0.7 0.11 0.36 -0.04
-2.35 -0.75 -1.43 -0.77 0.08 0.75 0.83 0.72 0.48 0.09 0.04 -0.53 -3.2 0.17 -0.12 0.06 0.3 0.3 0.04 -0.2 -2.75 -2.1 0.95 0.34 0.71 0.17
-2.11 -1.78 -1.29 -0.77 0.05 0.45 0.97 0.72 1.04 0.86 0.48 0.11 -2.51 -0.86 -0.64 -0.45 -0.41 0.24 -0.35 -0.18 -3.84 -0.04 0.76 0.54 0.39 -0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.