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Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.7 -0.28 -0.54 -0.38 -0.11 -0.09 0.13 0.18 -0.03 -0.11 -0.35 -0.66 -0.84 0.65 0.24 -0.02 -0.25 0.43 0.06 -0.09 0.83 0.17 -0.88 -0.41 0.57 0.61
0.7 -0.33 -0.86 -0.02 -0.11 -0.48 -0.11 0.02 -0.06 0.11 0.44 0.35 0.12 0.3 -0.9 -0.69 -1.01 -0.22 -0.58 -0.8 0.49 -0.23 0.41 -0.04 0.64 0.68
0.16 -0.4 -0.58 -0.03 0.33 -0.16 0.27 0.46 0.21 -0.42 -0.02 0.74 -0.46 0.23 -1.21 -0.64 -1.72 -1.01 -1.33 -1.03 -2.58 1.24 0.7 0.04 0.6 0.87
-0.5 -0.51 -0.84 -0.53 -0.23 -0.17 0.54 0.79 0.87 0.77 0.4 -0.07 -0.56 -0.25 -0.91 -1.13 -0.51 0.19 -0.25 -0.0 -0.02 0.76 -0.48 -0.29 -0.01 0.28
-0.04 -0.2 -0.29 -0.07 0.05 -0.15 0.23 0.29 0.36 0.32 0.41 0.33 -0.25 -0.31 -0.62 -0.85 -0.58 -0.03 -0.22 -0.28 -0.18 0.59 -0.35 0.09 0.31 0.35
-0.08 -0.24 -0.02 0.03 0.06 -0.26 0.37 0.58 0.49 0.46 0.67 0.42 0.07 -0.45 -0.94 -0.88 -0.76 -0.25 -0.5 -0.44 -0.27 0.26 -0.28 0.04 0.12 0.17
-0.0 -0.03 0.18 0.41 0.18 -0.41 0.1 0.43 0.44 0.55 0.39 0.33 0.01 -1.0 -1.33 -0.36 -0.44 -0.29 -0.89 0.09 0.06 0.38 -0.3 -0.24 0.04 0.0
-0.45 -0.65 -0.49 0.06 0.02 -0.33 0.39 0.35 0.16 0.02 -0.18 -0.3 -0.48 -0.17 -0.37 0.13 -0.2 -0.05 -0.26 -0.12 -0.5 1.11 -0.21 0.03 0.78 0.18
-0.14 -0.12 0.07 0.16 0.02 -0.34 -0.21 -0.26 -0.17 0.08 0.17 0.12 0.14 0.28 -0.06 -0.06 -0.46 -0.06 -0.19 -0.7 -1.53 0.48 0.05 0.55 0.47 0.39
0.18 -0.43 -0.17 0.16 -0.03 -0.25 -0.1 0.33 -0.01 0.15 0.4 0.04 -0.19 0.25 -0.42 -0.3 -1.13 -0.84 -1.06 -0.53 0.21 0.72 0.06 0.27 0.27 0.67
-0.18 -0.16 0.11 0.52 0.21 0.07 0.68 0.62 0.21 0.22 0.4 0.38 0.6 -1.32 -1.76 -0.63 -2.59 -1.07 -1.42 -1.96 -0.11 0.75 0.39 -0.19 0.39 0.24
-1.22 -0.2 -0.27 -0.1 0.13 0.09 0.37 0.46 0.75 0.54 0.48 0.26 -1.15 -0.07 -0.21 -0.54 -0.33 0.37 -0.23 -0.3 -0.56 0.63 -1.24 0.25 0.04 -0.34
0.38 -0.12 -0.28 0.19 0.23 0.11 -0.26 0.03 -0.47 -0.07 -0.12 -0.03 0.5 -0.38 -0.12 0.14 -0.29 -0.37 -0.3 -0.93 0.32 0.38 -0.25 0.0 0.62 0.13
0.1 -0.26 -0.59 0.25 0.48 -0.0 0.29 0.26 0.35 0.26 0.6 0.28 -0.26 -0.81 -1.2 -0.71 -0.64 -0.22 -0.74 -0.64 -0.18 0.15 0.63 0.93 -0.04 -0.7
-2.06 -0.76 -0.57 0.09 0.27 0.14 0.51 0.37 0.48 0.47 0.37 0.24 -1.67 0.22 -0.21 0.31 -0.38 -0.16 -0.42 -0.51 0.14 0.13 0.21 0.13 0.07 -0.06
-0.53 -1.88 -1.47 -1.08 -0.44 -0.29 -0.39 0.04 1.21 1.16 0.91 0.78 -0.66 -0.96 -1.81 -0.89 -0.85 0.23 -0.06 0.0 -0.87 1.16 -1.02 -0.17 0.81 0.2
-0.08 -0.29 -1.28 -0.44 -0.28 -0.83 0.47 0.63 1.12 0.88 0.73 0.66 -0.23 -0.66 -1.34 -1.91 -1.73 0.05 -0.59 -1.4 -0.34 0.83 -1.35 -0.11 1.1 -0.06
-1.19 -2.52 -1.62 -0.59 -0.25 0.33 0.38 0.42 1.39 1.28 0.79 0.66 -1.29 -0.8 -2.0 -0.98 -0.18 0.22 -0.37 -0.18 -2.27 0.83 0.26 -0.51 0.4 -0.57
0.54 -0.62 -1.61 0.93 0.36 -0.49 -0.04 -0.04 0.43 0.21 0.99 1.0 -0.1 -1.34 -0.63 -0.44 -1.16 -2.17 -1.92 -0.52 0.28 0.09 0.5 -0.63 0.56 0.09
-0.19 -0.42 -0.16 0.24 0.33 0.35 0.61 0.76 0.6 0.73 0.49 0.08 -0.81 -0.32 -0.61 -0.31 -1.22 -0.66 -0.62 -0.66 -0.46 0.29 -0.25 -0.37 0.22 0.0
-1.52 -0.97 -0.85 0.23 0.28 0.25 0.55 0.55 0.72 0.44 0.51 0.11 -1.46 -0.11 -1.0 -0.04 -0.39 -0.11 -0.71 -0.59 0.24 0.2 0.49 0.55 -0.23 -0.33
-0.23 -0.28 -0.58 -0.32 -0.07 0.18 0.23 0.19 0.21 -0.18 -0.21 -0.56 -0.4 -0.04 -0.41 -0.32 -0.52 0.26 -0.16 -0.41 0.22 0.9 -0.66 0.24 0.62 0.74
-1.03 -0.56 -0.25 0.3 0.35 0.18 0.28 0.44 0.68 0.45 0.61 0.6 -0.73 -0.76 -1.09 -0.63 -1.02 -0.45 -0.65 -0.63 1.22 -0.2 -0.35 0.11 0.14 -0.35
-1.4 -0.32 -0.11 0.29 0.17 -0.2 -0.03 0.01 -0.23 -0.51 -0.6 -0.83 -1.64 -0.18 0.32 0.19 -0.23 0.46 0.22 -0.84 -0.12 1.1 0.57 -0.21 0.73 0.36
-1.61 -0.77 -0.59 -0.02 0.2 -0.6 -0.29 -0.17 -0.17 0.14 0.23 -0.14 -1.04 0.3 0.53 0.42 -0.73 -0.33 -0.1 -1.1 0.16 1.14 0.23 0.28 0.39 0.63
-0.05 0.14 -0.41 -0.08 -0.19 -0.28 0.0 0.25 0.51 0.33 0.56 0.39 -0.19 -0.15 -0.83 -1.1 -0.82 -0.12 -0.16 -0.98 -0.35 0.59 0.11 0.34 0.36 0.33
-2.81 -2.58 -1.02 0.28 0.35 -0.05 0.45 0.51 0.58 0.67 0.68 0.15 -3.06 -0.53 -0.78 -0.65 -0.49 0.18 -0.43 -0.32 0.54 0.42 0.1 0.29 0.53 0.27
0.07 0.01 -0.3 -0.03 -0.03 -0.26 0.2 0.46 0.8 0.69 0.75 0.4 0.02 -0.42 -0.63 -1.07 -0.47 -0.03 -0.01 -0.12 -1.75 0.51 -1.49 -0.04 0.02 -0.18
-0.07 -0.73 -0.22 0.09 0.29 0.19 0.24 0.17 -0.04 0.18 -0.02 0.34 0.01 -0.03 -0.58 -0.04 -0.35 -0.42 -0.2 -0.69 -0.53 0.51 0.1 0.13 0.41 0.3
-0.76 -1.15 -0.52 0.59 0.18 -0.03 -0.24 0.32 -0.28 0.45 1.34 1.46 0.37 -0.82 -6.82 -3.01 -3.43 -5.02 -4.12 -2.05 2.3 -4.08 0.3 -1.06 0.18 -0.26
-1.39 -0.44 -0.39 0.57 0.08 -0.3 0.53 0.54 0.18 0.27 0.27 0.05 -0.17 -1.17 -1.54 -0.79 -0.85 -1.54 -1.83 -1.12 1.29 -0.02 0.49 -0.74 1.02 0.94
0.54 -0.33 -0.32 -0.17 -0.23 -0.52 -0.22 -0.11 -0.27 -0.0 -0.04 0.26 0.77 -0.06 -0.23 -0.03 -0.52 -0.11 -0.39 -0.31 -0.39 0.25 0.22 0.02 0.53 0.54
-0.43 -0.14 -0.52 -0.49 -0.21 -0.3 0.2 0.13 0.47 0.57 0.41 0.27 -0.44 0.18 -0.19 -0.32 -0.05 0.3 0.1 0.15 -0.31 0.29 -0.7 0.26 -0.4 0.12
0.01 -0.79 -1.25 0.58 0.2 -0.79 0.14 -0.12 0.3 -0.18 0.8 0.77 0.23 -0.7 -0.48 -0.9 -1.26 -0.97 -1.15 -1.0 0.36 0.47 0.65 0.8 0.44 -0.09
-0.54 -0.25 -0.07 0.07 0.14 -0.47 -0.44 -0.34 -0.36 -0.14 -0.12 -0.19 -0.51 0.05 -0.38 0.53 0.22 0.04 0.14 -0.74 -0.1 1.32 -2.34 -0.09 0.57 0.81
-0.69 -0.65 -0.29 -0.1 -0.25 -0.72 -0.65 0.16 0.22 0.78 0.52 0.72 -0.81 -1.04 -0.25 -0.85 -1.7 -1.2 -0.35 -2.68 1.99 1.11 0.14 -1.0 0.26 -0.41
-0.5 -0.27 -0.37 0.07 0.1 -0.0 0.41 0.47 0.72 0.81 0.8 0.48 -0.32 -0.88 -1.37 -0.7 -1.89 -1.0 -1.49 -1.8 1.39 0.74 -0.13 -0.45 -0.15 -0.51
-2.11 -0.89 -0.45 0.51 0.32 -0.42 -0.07 0.1 0.09 0.6 0.83 0.83 -0.9 -0.8 -1.51 -1.36 -0.83 -0.59 -1.03 -0.81 0.93 0.51 0.84 0.25 0.33 0.29
0.96 -1.96 -1.49 0.06 0.14 -0.1 0.1 0.47 -0.19 0.55 0.72 0.14 0.28 0.18 -1.59 0.27 -2.09 -2.58 -2.0 -2.17 0.66 -0.48 0.26 -0.22 1.04 0.7
-0.07 -0.64 -0.73 0.01 0.26 0.02 -0.23 0.1 0.55 0.58 1.03 0.37 -0.52 -1.21 -1.21 -0.95 -1.56 0.34 -0.16 -0.4 0.06 0.46 0.62 0.06 0.03 -0.0
-0.01 -0.34 -0.26 0.48 0.57 0.31 0.28 0.68 0.57 0.56 0.58 0.37 -0.14 -1.08 -1.57 -0.98 -1.26 -0.85 -0.93 -0.93 -0.36 0.27 0.38 -0.03 0.24 0.01
-0.18 -0.02 -0.01 0.47 0.39 -0.08 0.45 0.59 0.36 0.42 0.45 0.22 -0.3 -0.57 -0.98 -0.51 -0.64 -0.31 -0.73 -0.3 -0.53 0.25 -0.21 -0.14 0.36 -0.04
0.25 -0.12 -0.35 0.11 0.02 -0.25 0.09 0.21 0.09 0.24 0.33 0.07 0.24 -0.29 -0.72 -0.31 -0.7 -0.44 -0.35 -0.77 0.16 0.53 0.18 -0.25 0.69 0.18
-0.53 -0.72 -0.47 0.04 0.21 0.01 0.16 0.24 0.37 0.33 0.36 0.26 -0.21 -0.08 -0.31 0.26 -0.56 -0.21 -0.07 -0.77 -0.08 0.48 0.24 0.2 -0.06 -0.1
-1.09 -0.94 -0.81 -0.8 -0.47 -0.54 -0.25 0.07 0.21 0.23 0.05 -0.3 -1.1 1.27 -0.02 0.12 -0.09 0.37 -0.36 -0.86 1.3 0.57 -0.75 0.23 -0.37 0.47
-0.26 -0.37 -0.09 0.08 0.07 0.08 0.3 0.2 0.25 0.2 0.2 0.27 0.14 -0.07 -0.76 -0.15 -0.39 -0.35 -0.29 -0.45 -0.11 0.52 -0.14 0.01 0.13 0.29
-0.26 -0.11 0.07 0.33 0.44 0.28 0.34 0.34 0.25 0.18 0.24 0.2 -0.14 -0.02 -0.43 -0.48 -0.24 -0.59 -0.21 -0.61 -0.36 0.35 -0.22 -0.61 0.3 -0.0
0.05 -0.59 -1.2 -0.78 -0.65 -0.82 0.01 0.34 0.38 0.54 0.51 0.21 0.13 0.65 -0.28 -0.63 -0.55 -0.37 -0.82 -0.68 0.27 1.22 -0.27 -0.36 0.42 0.29
-1.1 -0.85 -0.51 0.29 0.18 0.04 0.61 0.5 0.2 0.59 0.46 0.45 -0.33 -0.5 -1.17 -0.84 -0.7 -1.01 -0.91 -0.61 0.98 0.31 -0.03 -0.48 0.63 0.38
-1.09 -0.82 -0.33 0.23 0.12 -0.21 0.62 0.6 0.12 0.34 0.4 0.38 -0.33 -0.22 -0.7 -0.28 -0.23 -1.03 -1.13 -0.47 1.05 0.27 -0.85 -0.39 0.59 0.4
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-0.45 -0.42 -0.34 0.5 0.12 -0.18 0.1 0.59 0.47 0.16 0.21 -0.11 -0.49 -0.16 -0.87 0.21 -0.96 0.13 -1.09 -1.26 -0.17 0.46 0.16 0.47 0.63 0.1
-1.1 -1.39 -1.13 -0.52 -0.32 -0.4 0.48 0.45 0.31 -0.06 -0.35 -1.06 -1.5 -0.16 -0.96 -0.43 -0.2 0.47 0.05 0.05 0.18 1.47 -0.64 -0.49 1.22 0.85
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0.28 -0.45 -0.8 0.38 0.41 -0.14 -0.03 0.12 0.28 0.28 0.77 0.66 0.4 -1.09 -1.58 -1.4 -1.58 -1.13 -1.6 -1.64 0.12 0.63 0.57 0.97 0.14 0.07
-1.47 -0.3 0.26 0.31 0.12 0.1 0.14 0.29 -0.09 -0.42 -0.15 -0.37 -1.57 -0.01 0.05 -0.06 -0.53 0.22 0.14 -0.6 -0.06 1.09 -0.02 -0.52 0.53 0.46
-0.28 -0.11 -0.37 -0.28 -0.26 -0.48 0.05 0.15 0.4 0.7 0.63 0.46 -0.2 0.05 -0.63 -0.54 0.04 0.12 -0.4 -0.18 1.01 0.16 -0.87 -0.37 -0.32 -0.25
0.26 -1.57 -1.32 1.04 0.18 -1.44 0.28 -0.16 0.73 0.36 0.9 0.97 0.55 -0.12 -0.29 -0.0 -0.61 -0.7 -0.97 -0.34 -0.01 -0.35 -1.1 -1.07 0.63 -0.73
-0.33 -0.31 -0.32 0.24 0.14 0.07 0.33 0.28 -0.9 -0.4 -0.11 -0.29 0.52 -0.58 -0.96 -1.37 -1.32 -1.28 -1.53 -0.92 1.0 0.5 1.25 0.19 0.63 0.67
0.36 -0.17 -0.48 0.51 0.46 0.03 0.51 0.65 0.52 0.47 0.66 0.24 0.22 -0.65 -1.27 -0.85 -1.51 -0.58 -0.94 -1.75 0.04 0.59 -0.32 0.1 -0.17 -0.29
0.21 -0.1 -0.1 0.12 -0.29 -0.9 -0.34 -0.1 -0.06 0.2 0.24 0.21 0.33 -0.0 -0.53 0.28 -0.49 0.1 0.07 -0.37 -1.01 0.48 0.11 -0.07 0.34 0.49
0.09 -1.07 -0.78 0.21 -0.14 -1.17 -0.66 -0.59 -0.43 0.31 1.0 0.82 -0.11 -1.37 -1.25 -0.67 -1.81 -0.96 -1.05 -1.26 1.15 0.03 0.78 0.8 0.61 1.02
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-2.79 -2.52 -4.77 -3.99 -0.47 -0.31 -0.14 0.08 1.34 1.45 1.03 0.79 -1.63 -1.01 -2.61 -1.4 -1.52 0.69 -0.52 -0.14 -0.17 0.76 0.69 0.23 0.27 0.63
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.