Heatmap: Cluster_189 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.26 0.3 0.4 0.49 0.45 0.4 0.42 0.44 0.43 0.45 0.51 0.42 0.18 0.2 0.3 0.42 0.32 0.43 0.37 0.35 0.04 0.32 1.0 0.35 0.52 0.39
0.01 0.02 0.21 0.43 0.34 0.51 0.31 0.37 0.39 0.38 0.48 0.21 0.02 0.53 0.09 0.28 0.05 0.19 0.33 0.24 0.06 0.23 1.0 0.48 0.52 0.61
0.39 0.5 0.45 0.6 0.57 0.69 0.71 0.73 0.74 0.64 0.69 0.6 0.43 0.6 0.44 0.62 0.54 0.71 0.47 0.42 0.22 0.72 1.0 0.59 0.93 0.69
0.04 0.15 0.15 0.18 0.27 0.21 0.16 0.12 0.12 0.14 0.14 0.09 0.02 0.3 0.17 0.26 0.2 0.29 0.24 0.25 0.09 0.15 1.0 0.37 0.33 0.49
0.07 0.17 0.22 0.19 0.28 0.33 0.32 0.31 0.34 0.34 0.34 0.23 0.05 0.35 0.32 0.37 0.3 0.33 0.35 0.3 0.09 0.53 1.0 0.6 0.49 0.42
0.18 0.0 0.03 0.13 0.04 0.12 0.07 0.02 0.15 0.15 0.2 0.11 0.03 0.0 0.11 0.05 0.0 0.21 0.06 0.0 0.06 0.08 1.0 0.16 0.14 0.26
0.01 0.02 0.07 0.07 0.14 0.1 0.21 0.17 0.22 0.11 0.22 0.12 0.04 0.15 0.22 0.15 0.22 0.37 0.17 0.28 0.07 0.16 1.0 0.39 0.78 0.36
0.18 0.19 0.21 0.33 0.28 0.2 0.42 0.55 0.6 0.56 0.5 0.32 0.17 0.46 0.41 0.56 0.42 0.65 0.38 0.38 0.11 0.68 1.0 0.53 0.58 0.46
0.56 0.41 0.38 0.47 0.4 0.36 0.54 0.63 0.59 0.76 0.77 0.66 0.57 0.64 0.45 0.72 0.49 0.56 0.38 0.47 0.32 0.37 1.0 0.55 0.81 0.64
0.09 0.21 0.22 0.32 0.29 0.34 0.54 0.52 0.7 0.59 0.62 0.43 0.11 0.61 0.53 0.69 0.47 0.61 0.37 0.33 0.28 0.4 1.0 0.59 0.59 0.53
0.11 0.3 0.35 0.33 0.22 0.11 0.17 0.21 0.21 0.26 0.23 0.22 0.12 0.39 0.36 0.35 0.24 0.44 0.41 0.31 0.13 0.16 1.0 0.43 0.36 0.54
0.24 0.37 0.2 0.13 0.09 0.08 0.21 0.32 0.31 0.46 0.51 0.4 0.22 0.28 0.22 0.18 0.32 0.43 0.41 0.3 0.04 0.21 1.0 0.8 0.47 0.35
0.15 0.14 0.14 0.23 0.25 0.19 0.37 0.36 0.3 0.33 0.31 0.25 0.11 0.39 0.31 0.57 0.3 0.75 0.55 0.43 0.19 0.61 1.0 0.46 0.59 0.56
0.02 0.08 0.02 0.03 0.08 0.12 0.1 0.09 0.18 0.15 0.27 0.26 0.1 0.11 0.07 0.42 0.19 0.37 0.24 0.23 0.27 0.07 1.0 0.36 0.28 0.35
0.16 0.18 0.16 0.17 0.24 0.17 0.25 0.22 0.16 0.22 0.18 0.23 0.14 0.31 0.36 0.3 0.18 0.3 0.48 0.21 0.18 0.3 1.0 0.58 0.39 0.32
0.42 0.32 0.3 0.38 0.37 0.26 0.35 0.49 0.42 0.55 0.7 0.61 0.63 0.58 0.25 0.34 0.17 0.25 0.26 0.18 0.49 0.29 0.95 0.52 1.0 0.69
0.14 0.19 0.18 0.35 0.38 0.25 0.41 0.38 0.37 0.25 0.28 0.23 0.14 0.41 0.52 0.41 0.2 0.4 0.3 0.2 0.19 0.62 1.0 0.46 0.49 0.45
0.0 0.0 0.01 0.03 0.07 0.05 0.02 0.02 0.16 0.21 0.28 0.16 0.0 0.04 0.06 0.02 0.02 0.13 0.03 0.04 0.04 0.03 1.0 0.3 0.21 0.42
0.44 0.46 0.45 0.59 0.68 0.56 0.72 0.76 0.65 0.74 0.77 0.71 0.45 0.52 0.54 0.55 0.47 0.94 0.68 0.54 0.17 0.91 1.0 0.81 0.8 0.65
0.2 0.28 0.31 0.36 0.36 0.29 0.38 0.44 0.36 0.37 0.35 0.29 0.14 0.51 0.46 0.49 0.42 0.71 0.48 0.38 0.19 0.6 1.0 0.39 0.61 0.53
0.06 0.08 0.27 0.41 0.48 0.44 0.36 0.37 0.39 0.41 0.43 0.4 0.07 0.33 0.26 0.33 0.31 0.41 0.28 0.27 0.25 0.37 1.0 0.71 0.48 0.47
0.17 0.2 0.23 0.22 0.23 0.21 0.2 0.2 0.24 0.25 0.3 0.39 0.18 0.15 0.15 0.51 0.19 0.37 0.25 0.24 0.36 0.2 1.0 0.5 0.37 0.38
0.24 0.32 0.23 0.3 0.26 0.31 0.48 0.43 0.52 0.47 0.44 0.37 0.23 0.44 0.41 0.55 0.45 0.41 0.47 0.27 0.05 0.43 1.0 0.58 0.63 0.52
0.29 0.31 0.19 0.25 0.34 0.28 0.33 0.33 0.41 0.4 0.39 0.38 0.23 0.28 0.32 0.3 0.2 0.44 0.39 0.29 0.13 0.31 1.0 0.75 0.57 0.46
0.29 0.14 0.16 0.26 0.24 0.31 0.45 0.49 0.37 0.6 0.52 0.53 0.47 0.57 0.2 0.38 0.25 0.38 0.17 0.22 0.35 0.29 1.0 0.42 0.57 0.47
0.11 0.26 0.19 0.2 0.27 0.27 0.26 0.24 0.28 0.33 0.29 0.23 0.14 0.18 0.24 0.17 0.24 0.31 0.34 0.34 0.22 0.04 1.0 0.6 0.4 0.35
0.18 0.23 0.22 0.23 0.29 0.3 0.35 0.27 0.32 0.37 0.36 0.34 0.17 0.33 0.34 0.28 0.33 0.39 0.42 0.27 0.12 0.17 1.0 0.67 0.55 0.48
0.3 0.38 0.33 0.43 0.44 0.37 0.42 0.43 0.44 0.4 0.41 0.34 0.21 0.38 0.47 0.38 0.34 0.47 0.48 0.29 0.19 0.43 1.0 0.31 0.44 0.49
0.02 0.04 0.1 0.09 0.1 0.11 0.23 0.18 0.34 0.42 0.41 0.37 0.04 0.32 0.31 0.24 0.19 0.21 0.15 0.23 0.1 0.2 1.0 0.12 0.63 0.39
0.23 0.37 0.5 0.6 0.64 0.67 0.71 0.64 0.71 0.65 0.61 0.65 0.27 0.56 0.55 0.49 0.41 0.59 0.45 0.46 0.29 0.54 1.0 0.6 0.84 0.79
0.27 0.26 0.14 0.21 0.15 0.28 0.29 0.43 0.4 0.43 0.53 0.39 0.15 0.28 0.19 0.27 0.35 0.57 0.45 0.34 0.13 0.15 1.0 0.46 0.25 0.34
0.44 0.41 0.33 0.55 0.62 0.46 0.58 0.64 0.67 0.64 0.7 0.54 0.41 0.61 0.56 0.64 0.6 0.85 0.61 0.35 0.3 0.94 1.0 0.82 0.76 0.6
0.24 0.16 0.14 0.17 0.17 0.2 0.32 0.35 0.4 0.42 0.44 0.56 0.19 0.28 0.15 0.2 0.17 0.4 0.3 0.21 0.05 0.28 1.0 0.76 0.65 0.33
0.04 0.14 0.18 0.42 0.36 0.35 0.49 0.58 0.66 0.51 0.41 0.34 0.05 0.57 0.24 0.54 0.38 0.61 0.27 0.24 0.08 0.72 0.99 0.29 1.0 0.54
0.33 0.34 0.27 0.35 0.4 0.36 0.39 0.46 0.67 0.64 0.71 0.51 0.3 0.64 0.43 0.67 0.41 0.35 0.37 0.36 0.4 0.63 1.0 0.48 0.66 0.66
0.35 0.29 0.17 0.23 0.25 0.31 0.44 0.42 0.41 0.37 0.48 0.4 0.28 0.74 0.34 0.27 0.28 0.47 0.52 0.22 0.1 0.52 1.0 0.79 0.65 0.56
0.08 0.13 0.14 0.24 0.28 0.26 0.34 0.41 0.39 0.37 0.45 0.34 0.13 0.53 0.13 0.33 0.1 0.34 0.28 0.25 0.07 0.11 1.0 0.41 0.59 0.41
0.29 0.33 0.3 0.33 0.36 0.36 0.37 0.36 0.35 0.31 0.25 0.22 0.22 0.41 0.53 0.46 0.47 0.48 0.49 0.35 0.23 0.48 1.0 0.44 0.44 0.39
0.17 0.24 0.21 0.27 0.31 0.3 0.4 0.48 0.5 0.54 0.55 0.49 0.17 0.4 0.28 0.44 0.28 0.78 0.59 0.31 0.29 0.66 1.0 0.66 0.76 0.61
0.31 0.3 0.29 0.4 0.32 0.26 0.42 0.43 0.56 0.58 0.65 0.56 0.31 0.35 0.31 0.4 0.29 0.6 0.43 0.46 0.06 0.42 1.0 0.53 0.53 0.49
0.33 0.33 0.22 0.57 0.45 0.32 0.59 0.58 0.7 0.74 0.9 0.95 0.37 0.61 0.42 0.6 0.4 0.39 0.25 0.32 0.4 0.48 1.0 0.43 0.78 0.59
0.11 0.15 0.13 0.29 0.28 0.33 0.37 0.37 0.52 0.55 0.54 0.5 0.1 0.41 0.17 0.41 0.23 0.49 0.15 0.19 0.2 0.62 1.0 0.44 0.82 0.56
0.19 0.25 0.22 0.31 0.34 0.28 0.5 0.54 0.58 0.57 0.55 0.41 0.16 0.55 0.36 0.6 0.44 0.63 0.36 0.3 0.17 0.49 1.0 0.59 0.7 0.5
0.41 0.28 0.33 0.42 0.41 0.37 0.53 0.58 0.62 0.71 0.65 0.61 0.52 0.92 0.52 0.82 0.45 0.66 0.44 0.45 0.38 0.68 1.0 0.59 0.88 0.78
0.76 0.44 0.21 0.15 0.16 0.35 0.74 0.76 0.79 0.82 0.82 0.9 0.57 0.82 0.4 0.5 0.56 0.49 0.42 0.44 0.3 0.55 1.0 0.81 0.99 0.66
0.24 0.25 0.25 0.29 0.19 0.16 0.26 0.31 0.34 0.3 0.39 0.43 0.22 0.21 0.37 0.37 0.26 0.46 0.45 0.26 0.09 0.17 1.0 0.6 0.24 0.28
0.17 0.21 0.21 0.38 0.37 0.2 0.29 0.32 0.37 0.4 0.5 0.42 0.21 0.49 0.24 0.35 0.37 0.66 0.3 0.24 0.16 0.47 1.0 0.52 0.53 0.49
0.21 0.27 0.25 0.3 0.3 0.25 0.35 0.41 0.46 0.49 0.48 0.41 0.2 0.42 0.33 0.53 0.35 0.62 0.42 0.31 0.13 0.49 1.0 0.47 0.62 0.47
0.28 0.27 0.23 0.31 0.31 0.3 0.43 0.55 0.5 0.55 0.53 0.56 0.42 0.51 0.4 0.53 0.35 0.53 0.41 0.38 0.31 0.3 1.0 0.62 0.53 0.43
0.28 0.31 0.37 0.38 0.42 0.45 0.44 0.43 0.5 0.56 0.54 0.5 0.3 0.49 0.44 0.43 0.38 0.47 0.52 0.39 0.13 0.42 1.0 0.52 0.54 0.48
0.12 0.19 0.08 0.18 0.13 0.11 0.22 0.23 0.27 0.32 0.34 0.33 0.03 0.13 0.15 0.07 0.11 0.4 0.27 0.15 0.08 0.03 1.0 0.38 0.39 0.27
0.24 0.24 0.18 0.25 0.26 0.22 0.39 0.37 0.34 0.36 0.45 0.39 0.18 0.21 0.25 0.27 0.25 0.38 0.39 0.28 0.06 0.17 1.0 0.61 0.5 0.37
0.32 0.25 0.3 0.44 0.48 0.47 0.51 0.47 0.44 0.5 0.51 0.47 0.31 0.54 0.37 0.47 0.23 0.6 0.38 0.41 0.1 0.67 1.0 0.73 0.77 0.61
0.04 0.15 0.24 0.31 0.25 0.18 0.3 0.27 0.22 0.33 0.26 0.27 0.04 0.36 0.31 0.37 0.23 0.5 0.34 0.22 0.27 0.4 1.0 0.49 0.48 0.47
0.28 0.22 0.18 0.37 0.38 0.29 0.44 0.43 0.58 0.59 0.63 0.53 0.28 0.42 0.25 0.38 0.29 0.54 0.37 0.31 0.11 0.43 1.0 0.48 0.62 0.55
0.17 0.27 0.27 0.23 0.2 0.22 0.27 0.27 0.3 0.33 0.34 0.36 0.17 0.28 0.34 0.31 0.33 0.32 0.37 0.36 0.13 0.23 1.0 0.46 0.28 0.39
0.1 0.05 0.03 0.09 0.11 0.06 0.07 0.09 0.1 0.1 0.12 0.08 0.1 0.12 0.29 0.23 0.13 0.39 0.45 0.18 0.12 0.26 1.0 0.56 0.28 0.32
0.25 0.27 0.27 0.24 0.23 0.24 0.37 0.34 0.33 0.32 0.27 0.29 0.21 0.32 0.37 0.39 0.38 0.36 0.39 0.36 0.19 0.18 1.0 0.37 0.37 0.31
0.25 0.18 0.17 0.36 0.36 0.34 0.45 0.47 0.6 0.51 0.57 0.42 0.24 0.35 0.27 0.41 0.26 0.53 0.36 0.25 0.18 0.56 1.0 0.5 0.57 0.39
0.04 0.17 0.27 0.4 0.45 0.42 0.45 0.37 0.58 0.54 0.48 0.46 0.06 0.47 0.33 0.27 0.28 0.33 0.27 0.29 0.12 0.22 1.0 0.34 0.5 0.48
0.15 0.22 0.26 0.52 0.45 0.4 0.64 0.68 0.75 0.66 0.65 0.53 0.19 0.53 0.35 0.77 0.49 0.56 0.4 0.35 0.2 0.76 1.0 0.57 0.98 0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)