1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.48 0.0
0.53 0.04 0.02 0.24 0.42 0.1 0.25 0.1 0.25 0.21 0.63 0.33 0.02 0.17 0.46 0.11 0.08 0.2 0.43 0.02 0.2 0.18 1.0 0.4 0.57 0.47
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.07 0.09 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 1.0 0.09 0.02 0.04
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.07 0.0 1.0 0.07 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.06 0.0 0.01 0.0 0.06 0.08 0.0 1.0 0.0 0.01 0.01
0.12 0.03 0.08 0.07 0.2 0.02 0.07 0.09 0.12 0.02 0.09 0.05 0.13 0.07 0.1 0.0 0.07 0.18 0.04 0.0 0.13 0.15 1.0 0.34 0.37 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 1.0 0.0 0.05 0.06
0.23 0.18 0.14 0.41 0.29 0.12 0.34 0.3 0.32 0.12 0.2 0.15 0.22 0.27 0.23 0.12 0.11 0.32 0.19 0.1 0.27 0.35 1.0 0.26 0.65 0.17
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 1.0 0.39 0.25 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.32 0.08 0.08 0.18 0.12 0.0 0.2 0.21 0.2 0.08 0.19 0.15 0.12 0.14 0.11 0.0 0.1 0.24 0.06 0.03 0.07 0.05 1.0 0.19 0.59 0.42
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0 0.03 0.21 0.18 0.02 0.03 0.13 0.0 1.0 0.09 0.06 0.04
0.15 0.12 0.08 0.05 0.03 0.02 0.03 0.09 0.05 0.11 0.05 0.05 0.02 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.09 0.06 1.0 0.35 0.14 0.15
0.04 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.11 0.01 0.1 0.0 0.01 0.04 1.0 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.06 0.25 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.23 0.11 0.0 0.13 0.05 0.04 0.11 0.02 1.0 0.03 0.01 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.02 0.02 0.04
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.06 0.0 0.0
0.02 0.03 0.07 0.09 0.01 0.19 0.03 0.11 0.06 0.13 0.14 0.12 0.0 0.03 0.04 0.01 0.0 0.14 0.07 0.0 0.07 0.16 1.0 0.06 0.03 0.1
0.33 0.3 0.24 0.32 0.35 0.18 0.34 0.4 0.44 0.42 0.43 0.31 0.45 0.26 0.18 0.14 0.21 0.3 0.15 0.2 0.08 0.36 1.0 0.28 0.83 0.54
0.11 0.13 0.18 0.11 0.13 0.06 0.04 0.06 0.06 0.06 0.08 0.08 0.08 0.13 0.09 0.14 0.24 0.08 0.14 0.09 0.08 0.02 1.0 0.13 0.17 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.76 0.51 0.38 0.45 0.31 0.23 0.35 0.36 0.34 0.45 0.6 0.82 0.83 0.44 0.39 0.56 0.38 0.46 0.49 0.24 0.2 0.28 1.0 0.6 0.65 0.74
0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.24 0.0 1.0 0.08 0.03 0.07
0.16 0.12 0.07 0.21 0.15 0.27 0.2 0.11 0.04 0.04 0.07 0.28 0.02 0.0 0.07 0.02 0.02 0.04 0.07 0.0 0.01 0.02 1.0 0.0 0.01 0.08
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.05 0.07 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.06 0.02 0.0 0.03 0.09 0.03 0.01 0.04 1.0 0.14 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.09 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.07 0.07 0.13 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.15 0.0 0.0 0.18 0.07 0.13 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.04 0.1 0.09 0.02 0.08 0.02 0.0 0.06 0.02 0.03 0.0 0.02 0.03 0.03 1.0 0.03 0.11 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.2 0.09 0.04 0.33 0.21 0.19 0.25 0.09 0.19 0.05 0.0 0.0 0.08 0.09 0.0 0.16 0.05 0.04 0.0 0.45 1.0 0.0 0.53 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.13 0.03 0.0 0.0 0.03 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.02 0.0 0.03 0.06 0.03 0.0 0.03 0.06 0.05 0.11 0.03 0.05 0.0 0.03 0.03 0.03 0.05 0.02 0.0 0.03 0.4 1.0 0.17 0.26 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.17 0.0 0.0
1.0 0.5 0.32 0.38 0.31 0.28 0.41 0.56 0.51 0.53 0.7 0.72 0.8 0.33 0.36 0.41 0.3 0.49 0.43 0.28 0.16 0.42 0.7 0.45 0.67 0.54
0.27 0.12 0.07 0.21 0.21 0.06 0.02 0.14 0.15 0.17 0.33 0.22 0.18 0.01 0.06 0.08 0.0 0.08 0.01 0.07 0.05 0.39 1.0 0.61 0.64 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.12 1.0 0.11 0.14 0.15
0.07 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.07 0.09 0.0 0.0 0.16 0.24 1.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 1.0 0.0 0.13 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)