Heatmap: Cluster_213 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 1.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.37 0.54 0.0 0.48 0.0 1.0 0.52 0.0 0.0 0.43 0.0 0.49 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.92 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.97 0.17 0.15 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.1 0.05 0.0 0.09 0.92 1.0 0.68 0.75 0.09 0.26 0.58 0.21 0.26 0.16 0.0 0.05 0.29 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 1.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.19 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.49 0.0 0.31 0.67 0.0 0.14 0.13 1.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.92 0.0 0.0 0.91 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 1.0 0.0 0.42 0.44 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 0.36 0.19 0.0 0.4 0.09 0.0 0.49 0.0 0.37 1.0 0.99 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.07 0.24 0.0 0.0 0.64 0.0 0.25
0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.0 0.43 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.45 1.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.63 1.0 0.18 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.9 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.63 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.31 0.27 0.84 0.31 0.0 0.0 0.54 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43
0.0 0.0 0.0 0.46 0.13 0.0 0.14 0.45 0.0 0.27 0.14 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.59 0.11 0.0 0.0 0.0 0.35 0.27 0.41
0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.27 0.0 0.19 1.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.71 1.0 0.67 0.3 0.18 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 1.0 0.7 0.46 0.31 0.55 0.23 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.0 0.0 0.0 0.03 0.68 0.88 1.0 0.28 0.33 0.26 0.27 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.21 0.16 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.5 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.3 1.0 0.66 0.33 0.0 0.29 0.97 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.99 1.0 0.29 0.25 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.55 1.0 0.14 0.0 0.12 0.27 0.0 0.11 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.22 0.37 0.0 0.0 0.0 0.21 0.17 0.38 0.0 0.18 1.0 0.0 0.61 0.35 0.18 0.0 0.29 0.33 0.14 0.1 0.0 0.0 0.0 0.12 0.28
0.43 0.27 0.9 0.38 0.32 0.11 0.12 0.16 0.05 0.05 0.2 0.22 0.34 0.17 0.14 0.2 0.27 1.0 0.16 0.29 0.28 0.04 0.04 0.48 0.3 0.94
0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.92 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.59 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.38 0.06 0.11 0.0 0.17 0.07 0.11 0.1 0.1 0.25 1.0 0.71 0.42 0.05 0.0 0.0 0.18 0.14 0.08 0.0 0.12 0.1 0.0 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.99 1.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.38 0.0 0.65 0.37 0.0 0.77 0.6 1.0 0.6 0.95 0.34 0.0 0.82 0.27 0.96 0.0 0.19 0.0 0.26 0.0 0.79 0.0 0.0 0.2 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.63 0.43 0.3 0.43 0.42 0.38 0.56 0.67 0.47 0.5 0.52 0.52 0.68 0.17 0.2 0.16 0.24 0.76 0.57 0.34 0.41 0.26 0.41 0.54 0.51 1.0
0.0 0.34 0.0 0.33 0.0 0.0 0.36 0.0 0.34 0.0 0.3 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.33 0.0 0.0 0.32 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 1.0 0.47 0.14 0.22 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)