1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_50 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.51 - - 3.45 - 2.21 2.25 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.89 -1.14 -1.28 2.06 -1.38 2.08 1.15 -0.22 - 1.71 0.83 1.4 -0.88 -1.87 - - - - -1.35 - - - 1.18 - -1.96 -
- - - - - 2.69 - 4.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.88 - -1.73 -2.78 -2.84 -0.3 -1.01 - -1.1 1.94 1.53 1.06 0.87 -1.78 0.64 -1.8 - -0.37 -0.18 1.08 1.43 -2.06 0.06 -0.74 -3.35 1.11
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.97 - -1.11 - 0.88 0.13 1.49 2.13 1.07 1.0 0.96 2.16 -0.67 - - - 0.11 -1.85 - - 0.96 - - -1.21 - -
- - - - - - 3.79 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.49 2.37 1.46 0.82 2.71 0.69 0.73 - - 0.92 - - 0.0 -0.35 - - - - - - - -
1.74 - - - - - 2.24 3.02 1.82 0.62 -0.35 - 0.91 - - - - - - - 0.36 - - -0.38 - -
- - - - - - 2.69 2.9 - 2.57 2.62 - - - - - - - - - - - - - - -
-0.48 -1.41 -1.43 - - -0.41 2.89 2.33 2.49 1.26 1.02 -1.45 -0.88 - - - -2.32 - -2.56 - - - - - - -
- - - - - - 2.25 2.85 2.91 - 1.25 1.34 - 0.66 - - - - - - - - - - - -
-3.81 - -4.64 -3.92 -2.82 1.09 2.54 2.7 1.45 1.83 1.01 0.22 -0.54 -5.46 - -4.89 -2.64 -1.57 -2.91 -3.22 - - - - -3.49 -2.41
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.44 - - - - - - - - - 2.87 - - 2.97 - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.23 - - - - -1.21 2.23 2.79 1.14 0.98 2.94 - - - - - - - - -1.6 - - -1.88 - - 0.06
-0.52 -0.52 -0.43 - 0.53 - - 1.76 -0.53 1.81 2.27 1.02 - -0.25 -0.91 -0.77 - - - 0.12 - - 2.18 - -1.33 -
- - - - - - - 4.24 - - - - - - - - - - - - - 2.82 - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.49 -1.15 - -1.39 - 0.93 2.64 2.24 2.14 1.26 0.96 0.08 -1.15 - - -2.36 -2.11 -0.88 -1.35 -2.66 - -2.59 - - - -
1.23 1.37 - - - - 1.44 2.36 2.32 1.12 - 1.33 - - - - - - - - - - - - - 1.82
0.38 -1.1 -1.42 -1.57 -0.77 -0.34 1.65 2.13 1.75 1.11 0.96 1.15 0.46 -1.06 -1.74 -0.21 -1.31 -1.07 -1.27 -1.6 - -2.01 - - -4.32 -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.14 - - - - -1.64 2.47 2.19 2.43 1.47 0.09 0.8 - -2.06 -1.99 - - 0.3 -0.56 -0.98 - -2.29 -1.27 - - -
-0.99 -2.37 - - -2.72 0.58 2.08 2.68 1.87 1.86 0.16 0.81 0.49 - - -2.72 - -0.21 - -1.27 - - - - - -
-0.66 - - - - 0.58 2.69 2.81 2.16 0.85 0.76 -0.27 -1.48 -1.54 -2.46 -2.39 - -2.04 -2.73 - - - - - - -2.88
- - -0.44 - - - 2.46 2.77 2.18 1.56 -0.67 1.0 0.8 - - -0.78 - - - -1.0 - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.15 -0.14 -3.1 -3.2 -3.32 -1.74 1.91 2.76 2.15 1.68 1.21 0.53 0.07 - - - - - -2.01 - - - -4.6 -3.62 - -
-1.66 -4.93 - -2.01 -4.88 1.21 3.02 2.84 2.08 0.98 -0.31 -1.27 -1.95 - - -3.5 - - - - - - -5.73 - - -
0.04 - - - - 0.06 3.39 3.1 1.92 - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - -
-1.5 - - -1.55 1.04 1.26 -0.04 1.69 1.42 1.44 1.32 1.48 - -0.63 - - 0.08 - -1.99 -0.37 -1.32 - -1.01 0.56 -1.28 -1.05
- - - - - - 1.96 3.27 2.51 2.33 0.78 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.96 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.43 1.94 3.02 1.96 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.06 1.32 - -1.24 - 0.69 1.51 2.86 2.22 1.52 0.36 0.71 -1.3 - - - - - - - - - - - - -
- - -0.52 - 1.38 0.81 1.35 3.03 1.35 1.39 -0.59 - 0.67 - -0.77 -0.63 - 0.65 - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.71 -3.2 -2.11 -1.03 -2.63 1.22 2.36 2.64 2.01 0.88 0.74 0.08 0.16 - - - -3.11 -2.21 -1.41 -2.42 - - -3.71 - - -
- - - - - - 3.6 2.56 - 2.35 - 1.53 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.09 - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.63 3.75 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.2 3.24 2.95 1.45 0.55 - - - - - - - - - - - - - - -
0.71 - - - - - 1.17 3.76 0.84 - - 2.13 - - - - - 0.13 - - - - 0.34 - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.71 4.08 - - - - - - 1.35 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.69 - - - - - 3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.98 - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.87 - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.79 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.01 -2.46 -1.59 -1.04 0.85 0.64 -1.7 0.6 -0.04 1.84 1.55 1.56 0.69 0.23 0.04 -1.06 -2.48 -0.82 -1.72 -2.79 -0.47 - 0.09 -2.81 -1.74 0.51
- - - - - -0.15 - 3.32 - -0.21 - 0.93 2.6 - - - - 0.25 - - 1.22 - - 1.45 - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.81 3.42 2.89 -0.12 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.58 - 1.05 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.21 0.03 - 3.5 2.15 - 0.05 0.14 0.22 0.57 - - - - - - - -0.31 - - - 1.28 -
-0.54 0.52 -1.6 -0.23 -0.78 -0.7 1.19 1.71 1.7 0.87 0.96 1.27 0.89 - 0.86 -1.94 -2.63 -2.98 -2.0 -1.52 -3.82 -3.23 -2.49 -0.38 -1.88 -1.75
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.08 - - - - - 2.1 2.12 2.22 1.98 - 2.18 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.