Heatmap: Cluster_175 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.51 0.48 0.36 0.37 0.44 0.54 0.58 0.5 0.45 0.43 0.34 0.33 0.47 0.4 0.54 0.46 0.6 1.0 0.79 0.69 0.11 0.45 0.42 0.42 0.57 0.56
0.4 0.5 0.55 0.64 0.63 0.52 0.63 0.59 0.46 0.45 0.4 0.44 0.41 0.6 0.69 0.65 0.62 1.0 0.72 0.6 0.09 0.64 0.54 0.41 0.6 0.66
0.43 0.52 0.53 0.51 0.51 0.45 0.56 0.52 0.5 0.55 0.46 0.46 0.37 0.52 0.62 0.47 0.57 1.0 0.82 0.67 0.06 0.25 0.44 0.44 0.59 0.66
0.44 0.58 0.53 0.6 0.69 0.59 0.7 0.59 0.6 0.57 0.55 0.53 0.37 0.61 0.85 0.59 0.71 1.0 0.9 0.69 0.13 0.62 0.39 0.59 0.59 0.59
0.71 0.65 0.53 0.51 0.49 0.55 0.59 0.57 0.47 0.46 0.4 0.37 0.6 0.53 0.62 0.51 0.65 1.0 0.88 0.74 0.09 0.57 0.46 0.5 0.93 0.72
0.32 0.45 0.45 0.47 0.45 0.38 0.66 0.59 0.57 0.64 0.64 0.46 0.28 0.62 0.76 0.69 0.83 1.0 0.92 0.94 0.1 0.43 0.98 0.78 0.77 0.7
0.4 0.6 0.58 0.55 0.57 0.49 0.77 0.74 0.73 0.78 0.66 0.6 0.34 0.57 0.85 0.64 0.85 1.0 0.96 0.82 0.1 0.59 0.8 0.63 0.71 0.58
0.41 0.62 0.62 0.59 0.62 0.61 0.65 0.54 0.58 0.6 0.46 0.43 0.39 0.41 0.57 0.49 0.71 1.0 0.75 0.77 0.17 0.63 0.62 0.8 0.84 0.66
0.39 0.58 0.55 0.51 0.62 0.59 0.73 0.58 0.55 0.6 0.55 0.51 0.31 0.67 0.76 0.62 0.76 0.87 1.0 0.79 0.14 0.36 0.71 0.53 0.52 0.63
0.49 0.55 0.61 0.61 0.72 0.87 0.82 0.64 0.63 0.53 0.41 0.39 0.45 0.58 0.61 0.59 0.7 1.0 0.89 0.8 0.12 0.62 0.5 0.65 0.78 0.77
0.57 0.54 0.52 0.54 0.58 0.53 0.72 0.61 0.53 0.63 0.58 0.58 0.49 0.67 0.71 0.78 0.64 1.0 0.86 0.65 0.18 0.46 0.74 0.63 0.71 0.7
0.06 0.16 0.14 0.21 0.22 0.26 0.48 0.32 0.35 0.3 0.26 0.18 0.08 0.46 0.31 0.34 0.39 1.0 0.49 0.44 0.1 0.2 0.24 0.23 0.84 0.42
0.78 0.75 0.69 0.7 0.68 0.66 0.83 0.9 0.77 0.84 0.79 0.74 0.79 0.3 1.0 0.5 0.65 0.99 0.8 0.77 0.15 0.86 0.45 0.59 0.52 0.45
0.31 0.51 0.49 0.58 0.69 0.65 0.53 0.42 0.47 0.61 0.47 0.44 0.23 0.54 0.41 0.64 0.53 0.8 0.77 0.65 0.05 0.38 0.47 0.63 0.98 1.0
0.09 0.25 0.45 0.77 0.5 0.73 0.9 0.72 0.83 0.53 0.53 0.38 0.03 0.32 0.53 0.45 0.65 1.0 0.96 0.77 0.08 0.26 0.92 0.46 0.61 0.73
0.28 0.42 0.4 0.4 0.43 0.46 0.59 0.48 0.48 0.56 0.52 0.54 0.17 0.81 0.59 0.58 0.58 1.0 0.79 0.56 0.05 0.19 0.28 0.6 0.82 0.86
0.63 0.64 0.65 0.63 0.62 0.53 0.66 0.66 0.52 0.55 0.52 0.5 0.57 0.65 0.7 0.68 0.55 1.0 0.68 0.7 0.17 0.45 0.43 0.46 0.77 0.93
0.47 0.65 0.67 0.66 0.76 0.82 0.81 0.69 0.72 0.71 0.63 0.57 0.42 0.69 0.57 0.61 0.6 1.0 0.93 0.79 0.17 0.57 0.51 0.62 0.74 0.93
0.36 0.49 0.4 0.49 0.59 0.48 0.49 0.57 0.46 0.52 0.47 0.38 0.32 0.58 0.65 0.45 0.49 1.0 0.73 0.59 0.09 0.44 0.37 0.33 0.74 0.6
0.6 0.68 0.68 0.59 0.63 0.61 0.7 0.68 0.76 0.86 0.69 0.62 0.54 0.79 0.98 0.62 0.75 0.96 0.73 0.86 0.05 0.59 0.46 0.55 0.79 1.0
0.34 0.47 0.55 0.61 0.56 0.53 0.63 0.59 0.62 0.69 0.6 0.51 0.33 0.66 0.61 0.54 0.59 1.0 0.83 0.73 0.05 0.27 0.37 0.48 0.62 0.66
0.21 0.29 0.28 0.3 0.36 0.38 0.46 0.43 0.45 0.53 0.5 0.38 0.16 0.36 0.44 0.35 0.45 1.0 0.58 0.48 0.1 0.24 0.33 0.57 0.58 0.53
0.67 0.57 0.52 0.55 0.73 0.77 0.92 0.8 0.72 0.75 0.58 0.49 0.55 0.71 0.68 0.64 0.73 1.0 0.9 0.82 0.12 0.78 0.65 0.64 0.74 0.73
0.57 0.61 0.48 0.44 0.53 0.59 0.65 0.55 0.51 0.52 0.47 0.46 0.46 0.49 0.56 0.59 0.61 1.0 0.88 0.64 0.38 0.45 0.51 0.96 0.78 0.58
0.23 0.27 0.38 0.4 0.4 0.4 0.59 0.56 0.54 0.59 0.43 0.34 0.18 0.42 0.45 0.37 0.6 1.0 0.71 0.62 0.06 0.36 0.47 0.39 0.6 0.61
0.7 0.62 0.68 0.6 0.52 0.4 0.55 0.62 0.53 0.63 0.51 0.55 0.58 0.75 0.95 0.77 0.63 1.0 0.94 0.69 0.11 0.48 0.55 0.46 0.64 0.77
0.35 0.44 0.44 0.46 0.56 0.51 0.61 0.55 0.57 0.6 0.51 0.46 0.32 0.5 0.64 0.63 0.63 1.0 0.75 0.67 0.21 0.59 0.61 0.54 0.54 0.59
0.49 0.54 0.51 0.5 0.55 0.59 0.66 0.62 0.57 0.57 0.49 0.45 0.41 0.46 0.55 0.53 0.63 1.0 0.73 0.67 0.28 0.6 0.51 0.75 0.62 0.6
0.33 0.42 0.42 0.46 0.63 0.86 0.74 0.65 0.66 0.54 0.43 0.39 0.25 0.6 0.4 0.51 0.73 0.91 0.7 0.83 0.03 0.32 0.47 0.47 1.0 0.76
0.63 0.66 0.67 0.69 0.76 0.72 0.98 0.91 0.91 0.92 0.79 0.73 0.59 0.55 0.76 0.64 0.84 1.0 0.94 0.91 0.3 0.85 0.48 0.48 0.49 0.45
0.37 0.48 0.49 0.46 0.63 0.56 0.67 0.64 0.61 0.54 0.43 0.44 0.3 0.5 0.58 0.59 0.59 1.0 0.85 0.71 0.05 0.26 0.64 0.5 0.72 0.65
0.53 0.58 0.56 0.62 0.69 0.63 0.74 0.71 0.72 0.71 0.65 0.6 0.56 0.6 0.58 0.56 0.59 1.0 0.69 0.64 0.13 0.6 0.6 0.64 0.61 0.76
0.6 0.57 0.46 0.46 0.55 0.6 0.7 0.68 0.71 0.77 0.66 0.55 0.45 0.81 0.47 0.57 0.58 1.0 0.77 0.8 0.09 0.4 0.61 0.49 0.72 0.79
0.48 0.5 0.53 0.56 0.66 0.57 0.71 0.64 0.63 0.73 0.63 0.57 0.44 0.56 0.68 0.62 0.75 1.0 0.89 0.83 0.06 0.88 0.65 0.51 0.52 0.47
0.48 0.49 0.49 0.52 0.58 0.47 0.66 0.66 0.69 0.82 0.64 0.51 0.43 0.44 0.71 0.67 0.63 1.0 0.96 0.86 0.09 0.81 0.45 0.34 0.43 0.35
0.47 0.55 0.58 0.62 0.63 0.65 0.71 0.66 0.58 0.55 0.52 0.49 0.45 0.56 0.53 0.57 0.52 1.0 0.68 0.63 0.15 0.49 0.48 0.43 0.69 0.7
0.32 0.46 0.47 0.52 0.59 0.55 0.72 0.69 0.75 0.68 0.69 0.51 0.35 0.64 0.77 0.72 0.62 0.98 0.83 0.83 0.17 0.71 1.0 0.43 0.48 0.59
0.14 0.3 0.41 0.43 0.7 0.72 0.67 0.6 0.53 0.46 0.45 0.33 0.08 0.62 0.66 0.73 0.7 0.8 1.0 0.64 0.06 0.21 0.38 0.62 0.64 0.79
0.43 0.44 0.52 0.6 0.7 0.78 1.0 0.8 0.81 0.74 0.53 0.43 0.43 0.67 0.6 0.62 0.73 0.91 0.91 0.84 0.15 0.67 0.7 0.5 0.85 0.87
0.37 0.32 0.3 0.36 0.41 0.47 0.57 0.48 0.5 0.52 0.38 0.38 0.29 0.48 0.47 0.39 0.47 1.0 0.74 0.58 0.05 0.37 0.34 0.51 0.66 0.83
0.41 0.61 0.55 0.57 0.49 0.43 0.48 0.49 0.47 0.45 0.44 0.39 0.32 0.46 0.55 0.42 0.49 1.0 0.75 0.6 0.05 0.47 0.38 0.36 0.71 0.66
0.34 0.53 0.55 0.6 0.62 0.59 0.62 0.61 0.55 0.53 0.46 0.44 0.32 0.54 0.57 0.56 0.61 1.0 0.75 0.61 0.11 0.59 0.38 0.4 0.55 0.56
0.12 0.4 0.48 0.46 0.45 0.39 0.45 0.42 0.31 0.28 0.23 0.21 0.13 0.37 0.52 0.48 0.4 1.0 0.72 0.47 0.1 0.32 0.24 0.25 0.47 0.52
0.24 0.44 0.53 0.67 0.64 0.49 0.7 0.52 0.52 0.54 0.58 0.42 0.13 0.68 1.0 0.79 0.81 0.86 0.88 0.75 0.03 0.41 0.53 0.42 0.5 0.7
0.43 0.48 0.52 0.51 0.63 0.68 0.68 0.59 0.55 0.52 0.43 0.43 0.4 0.65 0.77 0.67 0.62 1.0 0.94 0.66 0.05 0.63 0.45 0.41 0.57 0.6
0.09 0.22 0.25 0.27 0.3 0.33 0.29 0.25 0.25 0.27 0.19 0.16 0.1 0.33 0.44 0.48 0.47 1.0 0.73 0.65 0.08 0.35 0.33 0.28 0.25 0.34
0.28 0.45 0.41 0.54 0.74 0.65 0.67 0.59 0.42 0.44 0.45 0.36 0.21 0.51 0.6 0.58 0.64 0.74 1.0 0.96 0.06 0.47 0.49 0.46 0.59 0.78
0.19 0.39 0.35 0.45 0.47 0.34 0.47 0.42 0.41 0.42 0.4 0.29 0.19 0.33 0.36 0.41 0.4 1.0 0.59 0.45 0.05 0.41 0.36 0.37 0.43 0.49
0.53 0.65 0.69 0.6 0.63 0.62 0.71 0.62 0.67 0.77 0.74 0.65 0.45 0.8 0.76 0.62 0.71 1.0 1.0 0.82 0.09 0.36 0.44 0.51 0.67 0.8
0.45 0.39 0.39 0.4 0.54 0.61 0.56 0.53 0.54 0.61 0.58 0.49 0.53 0.77 0.45 0.83 0.56 1.0 0.61 0.6 0.09 0.47 0.46 0.53 1.0 0.78
0.52 0.57 0.62 0.68 0.76 0.64 0.78 0.73 0.77 0.85 0.85 0.75 0.53 0.8 0.78 0.75 0.72 1.0 0.93 0.76 0.19 0.5 0.64 0.67 0.63 0.88
0.48 0.59 0.66 0.72 0.84 0.85 0.89 0.75 0.69 0.76 0.7 0.61 0.38 0.89 0.83 0.76 0.77 0.94 0.86 0.86 0.18 0.44 0.52 0.65 0.71 1.0
0.53 0.54 0.49 0.47 0.48 0.43 0.51 0.47 0.42 0.48 0.4 0.35 0.43 0.45 0.56 0.51 0.6 1.0 0.84 0.67 0.16 0.46 0.67 0.57 0.54 0.59
0.16 0.4 0.41 0.43 0.44 0.45 0.41 0.4 0.43 0.4 0.35 0.32 0.15 0.37 0.48 0.5 0.38 1.0 0.72 0.47 0.11 0.44 0.44 0.36 0.47 0.41
0.3 0.76 0.59 0.53 0.68 0.66 0.78 0.77 0.75 0.96 0.71 0.61 0.36 0.61 0.76 0.63 0.63 0.98 1.0 0.86 0.01 0.79 0.22 0.4 0.45 0.38
0.38 0.53 0.44 0.55 0.87 0.74 0.74 0.71 0.68 0.58 0.54 0.49 0.47 0.79 0.57 0.62 0.66 0.87 1.0 0.65 0.09 0.42 0.39 0.44 0.81 0.71

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)