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Heatmap: Cluster_11 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.23 -0.58 -0.18 -0.21 -0.39 -0.78 -0.05 0.2 0.2 0.44 0.71 0.48 -0.06 0.24 -0.02 0.57 0.29 -0.27 -0.7 -0.22 -0.65 0.05 -0.05 0.01 -0.18 0.1
-0.24 -0.37 -0.49 -0.3 -0.24 -1.08 0.04 0.15 0.42 0.52 0.75 0.5 0.15 0.16 -0.14 0.68 0.17 -0.04 -0.28 -0.23 -0.64 -0.25 -0.04 -0.47 -0.1 -0.14
-0.12 -0.55 -0.22 0.02 0.02 -0.65 -0.15 -0.01 -0.56 -0.24 -0.02 0.23 0.27 0.84 -0.14 0.63 -0.02 -0.01 -0.3 -0.42 -0.42 0.45 -0.18 -0.08 0.27 0.21
0.11 -0.4 -0.11 0.11 0.06 -0.29 -0.26 -0.11 -0.45 -0.12 0.07 0.3 0.41 0.76 -0.2 0.52 -0.23 -0.29 -0.15 -0.62 -0.52 0.4 -0.38 -0.06 0.22 0.18
- - - - - - - - - - - - - 1.89 - 0.49 - - - 0.52 - 0.21 3.07 1.21 0.96 2.5
-1.09 -0.14 0.22 0.11 -0.42 -1.74 -0.48 -0.17 -0.26 0.01 0.21 -0.24 -0.56 0.49 0.11 0.85 0.04 0.86 0.44 0.18 -2.67 -0.13 0.98 -0.62 -0.28 0.11
-0.19 0.26 -0.34 -0.17 -0.07 -0.71 0.11 0.23 -0.32 0.44 0.3 -0.01 -0.36 0.08 -0.25 0.05 -0.69 0.06 -0.19 -0.63 -1.02 0.41 0.74 0.42 0.29 0.13
-0.17 0.31 -0.21 -0.14 -0.13 -0.85 0.01 0.18 -0.44 0.26 0.25 -0.07 -0.42 0.45 -0.1 0.38 -0.23 0.42 0.08 -0.42 -1.13 0.09 0.54 -0.02 0.06 0.1
-0.69 -0.42 -0.17 -0.18 -0.75 -0.8 -0.54 -0.01 -0.61 0.03 0.49 -0.54 -0.51 0.4 0.19 0.39 -0.29 0.68 0.14 -0.13 -0.76 0.59 0.97 -0.39 0.4 0.25
0.14 0.2 -0.27 -0.51 -1.41 -1.74 -0.37 -0.18 -0.53 -0.14 -0.09 -0.03 -0.19 0.67 0.11 0.85 0.36 0.51 0.42 0.12 -1.72 -0.28 0.73 0.38 -0.01 -0.35
-2.54 -3.96 -1.56 -0.41 0.41 0.66 1.0 0.69 0.8 0.88 0.82 0.36 -1.76 0.48 -0.16 0.56 -0.31 -0.78 -0.58 -0.33 -0.26 -0.34 0.02 -0.9 -0.4 -0.56
0.01 -0.23 -0.16 0.05 0.04 -0.4 0.06 0.13 -0.02 0.47 0.68 0.58 0.1 0.15 -0.39 -0.11 -0.91 -0.62 -0.39 -0.76 -0.29 0.27 0.7 -0.16 0.21 -0.5
0.14 -0.26 -0.39 0.09 -0.02 -0.59 0.23 0.37 0.03 0.29 0.65 0.53 0.04 0.35 -0.27 0.08 -0.21 -0.57 -0.23 -0.68 -2.19 -0.08 0.65 -0.17 0.3 -0.31
-0.27 -0.6 -0.41 -0.3 -0.87 -0.98 -0.16 -0.05 -0.46 -0.08 0.01 0.28 -0.51 0.68 0.26 0.67 0.34 0.14 0.29 -0.1 -2.25 0.35 0.64 0.59 0.22 -0.3
-0.36 -0.38 -0.56 -0.2 -0.72 -0.97 0.06 0.22 -0.25 -0.38 -0.14 0.2 -0.35 0.91 0.52 0.71 0.69 0.16 0.27 0.21 -2.33 -0.03 0.17 0.18 -0.08 -0.51
-0.67 -0.43 -0.53 -0.24 -1.03 -1.64 -0.23 -0.18 -0.67 -0.51 -0.1 0.03 -1.06 0.79 0.68 0.84 0.5 -0.06 0.2 0.01 -2.13 0.48 1.04 -0.52 1.12 -0.84
-2.63 -5.69 -5.43 -2.95 -1.46 -0.92 -0.05 -0.58 -0.14 0.45 0.49 0.13 -2.03 0.5 0.93 0.53 -0.99 -1.2 -1.02 -1.07 -1.23 -0.47 2.0 1.31 0.98 0.88
-0.5 -0.66 -0.82 -0.75 -0.62 -1.17 -0.29 -0.26 -0.39 -0.66 -0.04 0.03 -1.05 -0.01 -0.29 0.22 0.06 0.4 0.0 -0.33 -2.42 1.2 1.71 0.04 0.81 0.29
0.14 -0.33 -0.78 -1.32 -1.07 -1.91 -1.31 -0.59 -1.13 -0.13 0.23 0.34 -0.92 0.53 -0.19 0.58 0.53 0.37 0.29 -0.55 -2.73 1.19 1.44 -0.07 0.45 0.09
0.3 0.18 -0.18 -0.39 -0.63 -1.24 -0.58 -0.06 -0.53 0.26 0.72 0.67 0.15 0.42 -0.11 0.3 0.16 -0.23 0.02 -0.63 -3.32 0.23 1.09 -0.55 0.09 -0.35
-0.14 -0.77 -0.64 -0.31 -0.16 -0.45 0.03 0.07 0.03 0.17 0.3 0.3 0.19 0.51 -0.06 0.6 -0.03 -0.05 -0.38 -0.33 -0.1 0.33 -0.06 0.05 -0.02 0.03
-0.94 -0.7 -0.14 0.18 0.38 0.21 0.75 0.6 0.81 0.72 0.51 0.22 -1.11 0.14 -0.39 0.2 -0.22 -0.11 -0.5 -0.47 -0.83 -0.23 -0.23 -0.41 -0.4 -0.48
0.06 -0.4 -0.58 0.11 -0.35 -0.72 -0.23 0.01 -0.15 0.01 0.35 0.26 0.17 0.22 -0.47 -0.47 -0.37 -0.68 -0.51 -0.68 -0.74 0.12 1.19 0.74 0.57 0.34
0.2 -0.44 -0.47 -0.34 -0.5 -1.17 -0.72 -0.3 -0.69 -0.27 0.16 0.18 0.08 0.63 -0.02 0.41 0.1 -0.39 -0.48 -0.62 -0.63 0.18 0.94 0.35 0.92 0.43
0.32 -0.29 -0.35 -0.12 -0.47 -1.19 -0.62 -0.24 -0.37 -0.22 0.15 0.19 0.23 0.52 -0.13 0.12 -0.19 -0.74 -0.81 -1.0 -0.59 0.41 1.12 0.21 0.9 0.43
-0.1 -0.94 -0.65 -0.57 -0.67 -1.49 -0.64 -0.09 -1.03 -0.2 -0.01 -0.06 -0.64 0.74 -0.19 0.23 0.06 -0.38 -0.35 -0.79 -0.23 0.12 1.61 0.69 0.75 0.6
-0.26 -0.55 -0.42 -0.43 -0.67 -1.41 -0.59 -0.32 -0.69 -0.12 0.07 -0.06 -0.49 0.59 -0.14 0.07 -0.15 -0.46 -0.12 -0.37 -0.41 0.23 1.61 0.58 0.64 0.54
-0.19 -0.53 -0.21 -0.28 -0.75 -1.44 -0.44 -0.3 -0.55 -0.01 -0.15 -0.03 -0.41 0.59 0.1 0.26 -0.0 -0.65 -0.21 -0.37 -0.48 0.19 1.35 0.51 0.74 0.46
-1.02 -0.11 -0.17 -0.27 -0.66 -1.65 -1.06 -0.73 -1.01 -0.28 -0.17 -0.55 -0.81 0.69 -0.43 -0.14 -0.41 -0.42 -0.02 -0.18 -0.17 -0.02 1.64 0.69 1.24 0.82
-0.59 -1.68 -2.02 -1.71 -1.56 -2.08 -1.78 -1.59 -1.6 -0.9 -0.72 -1.24 -1.73 0.53 0.15 -0.14 -0.11 0.04 -1.23 -2.44 -1.12 1.55 2.82 -0.67 1.1 0.89
0.19 -0.99 -1.41 -1.95 -1.3 -1.85 -1.64 -0.9 -1.36 -0.39 -0.56 -0.65 -1.42 0.41 -0.27 -0.06 -0.17 -0.17 -0.49 -1.84 -1.14 1.28 2.64 0.02 0.98 0.42
0.64 -0.15 -1.0 -1.99 -0.53 -0.99 -0.87 -0.44 -1.26 0.06 -0.01 0.04 -1.02 0.44 -0.34 -0.51 0.2 -0.3 -0.25 -1.9 -1.39 0.17 2.48 -0.25 0.3 0.31
0.6 -0.63 -1.15 -1.58 -0.99 -1.28 -0.39 -0.44 -0.84 -0.89 -0.04 -0.53 -1.16 0.18 -0.26 -0.05 -0.4 -0.25 -0.67 -2.36 -1.13 1.45 2.14 0.39 0.61 0.71
0.39 -0.38 -0.89 -0.85 -0.56 -1.21 -0.5 -0.13 -0.93 0.19 -0.01 -0.06 -0.62 0.53 -0.37 -0.07 0.02 -0.55 -0.23 -1.47 -1.65 0.58 2.15 -0.11 0.63 0.06
0.51 -0.06 -0.27 0.02 -0.13 -0.51 0.37 0.48 -0.0 0.47 0.63 0.67 0.28 0.09 -0.54 -0.5 -0.44 -1.28 -0.5 -1.42 -2.5 0.18 1.31 -0.3 -0.29 -0.67
-0.45 -0.53 -0.69 -0.3 -0.33 -0.3 0.08 0.11 0.09 0.32 0.08 0.23 -0.24 0.44 0.05 0.64 0.02 0.14 -0.28 -0.05 -2.15 0.4 0.34 0.45 0.16 -0.22
-0.1 -0.4 -0.44 -0.09 0.23 0.28 0.51 0.36 0.29 0.4 0.45 0.27 -0.06 0.24 -0.08 0.35 -0.23 -0.54 -0.33 -0.61 -0.61 0.1 0.3 -0.4 -0.49 -0.62
-0.4 -1.29 -0.5 -0.16 0.24 -0.04 0.22 0.25 0.05 0.17 0.71 0.07 -0.57 0.52 -0.77 0.52 -0.25 0.3 -0.14 -0.88 -1.19 0.95 0.59 -0.48 -0.52 -0.1
0.4 -0.25 -0.38 -0.08 -0.11 -0.4 0.05 0.05 -0.04 0.18 0.55 0.56 0.38 0.2 -0.35 -0.04 -0.54 -0.46 -0.33 -0.81 -1.79 -0.24 0.58 0.53 0.3 0.06
0.23 -0.33 -0.63 -0.2 -0.25 -0.52 0.05 -0.13 -0.59 0.12 0.24 0.24 0.13 0.14 -0.54 0.18 -0.6 -0.3 -0.46 -0.75 -0.84 0.47 1.04 0.52 0.43 0.4
-1.18 -0.52 -0.56 -2.21 -4.08 -3.8 -1.88 -0.18 -0.09 0.41 0.83 0.53 -1.98 0.43 0.76 -0.07 -0.2 0.15 0.01 -0.57 -1.99 -1.17 1.61 0.75 0.96 0.93
0.02 -0.42 -0.47 -0.26 -0.34 -0.5 -0.11 -0.11 -0.31 -0.15 0.0 -0.03 0.31 0.77 0.09 0.54 0.27 -0.21 -0.23 -0.51 -0.37 0.21 0.13 0.04 0.37 0.26
-0.17 -0.41 -0.44 -0.53 -0.43 -0.76 0.02 0.26 0.17 0.56 0.77 0.39 -0.0 -0.16 -0.2 -0.16 0.08 -0.42 -0.05 -0.14 -2.82 -0.69 0.78 -0.1 0.74 0.44
-0.06 -0.41 -0.45 -0.82 -1.1 -1.29 0.17 0.53 0.02 0.71 0.63 0.12 -0.21 -0.71 -0.59 0.01 -0.08 -0.01 -0.26 -0.11 -2.29 -0.87 1.36 0.14 0.83 0.28
-0.17 -1.0 -0.44 0.2 0.41 0.04 -0.17 0.1 0.1 0.77 0.97 0.97 0.34 0.72 -1.41 -0.33 -0.61 -1.39 -1.26 -0.36 -0.42 -1.42 0.76 -1.02 -0.09 0.2
-0.26 -1.33 -0.55 -0.02 0.32 -0.48 -0.27 -0.13 -0.3 0.65 0.91 0.85 0.05 0.68 -1.44 -0.19 -0.51 -1.18 -1.43 -0.51 0.02 -1.04 1.15 -0.01 0.42 0.25
-0.59 -0.18 -0.45 -0.42 -0.65 -0.97 -0.01 0.35 0.1 0.46 0.8 0.56 -0.4 0.38 0.27 0.51 0.89 -0.37 -0.07 -0.49 -3.29 -0.75 0.74 -0.49 0.1 -0.4
0.15 -0.28 -0.76 -0.65 -0.67 -1.33 -0.72 -0.32 -0.84 -0.16 0.11 -0.03 -0.7 1.28 -0.38 0.5 0.58 -0.04 -0.1 -0.94 -2.18 0.33 1.33 -0.24 0.87 0.1
-0.01 -0.77 -0.81 -0.27 -0.75 -2.01 -0.65 -0.25 -1.27 -0.27 0.14 -0.29 -0.66 0.97 -0.45 0.36 0.15 0.1 -0.37 -0.85 -2.03 0.93 1.37 -0.17 1.07 0.77
0.5 -0.31 -0.31 -0.36 -0.41 -1.26 -0.64 0.02 -1.06 0.28 0.46 0.2 -0.4 1.08 -0.29 0.5 0.61 -0.1 -0.23 -0.92 -2.15 -0.22 0.78 -0.48 0.82 -0.12
0.25 -0.11 -0.3 -0.27 -0.43 -1.13 -0.46 -0.17 -0.55 -0.01 0.38 0.31 -0.17 1.22 -0.15 0.62 0.49 -0.36 -0.08 -0.57 -2.44 -0.12 0.88 -0.73 0.4 -0.16
0.27 -0.01 -0.16 0.02 -0.19 -0.85 -0.12 0.1 -0.14 0.21 0.53 0.55 0.09 0.85 -0.39 0.16 0.05 -0.89 -0.45 -0.87 -2.45 -0.21 0.66 -0.13 0.51 -0.11
0.0 -0.41 -0.17 -0.18 -0.23 -0.44 0.33 -0.15 -0.24 0.42 0.61 0.62 -0.08 0.05 -0.24 0.29 0.28 -0.68 -0.41 -0.3 -1.51 0.08 0.87 -0.56 0.39 -0.31
0.29 -0.32 -0.38 -0.22 -0.17 -0.6 0.01 0.1 -0.22 0.17 0.35 0.3 0.31 0.48 -0.08 0.53 0.14 -0.29 -0.25 -0.41 -0.93 -0.19 0.55 -0.11 0.22 -0.44
0.11 -0.6 -0.51 -0.67 -0.28 -0.89 -0.44 -0.04 -0.96 0.06 0.25 -0.03 -0.09 0.57 -0.26 0.73 0.29 0.19 -0.29 -0.36 -0.59 0.93 0.86 -0.11 0.31 -0.49
0.01 -0.44 -0.42 -0.21 -0.23 -0.75 -0.06 0.06 -0.14 0.25 0.41 0.38 0.15 0.35 -0.03 0.4 0.06 -0.12 -0.21 -0.48 -1.07 0.23 0.62 0.07 0.24 -0.28
-0.05 -1.38 -1.02 -0.97 -0.76 -1.4 -0.79 -0.21 -0.77 0.44 0.93 0.69 0.04 0.41 -1.07 0.11 0.84 -0.76 -0.67 -0.54 -2.05 0.17 1.23 0.63 0.72 0.34
-0.04 -2.89 -2.96 -1.44 -3.03 -3.07 -1.18 -0.05 -1.72 0.98 1.09 0.41 -0.37 0.08 0.28 0.12 -0.28 -1.47 -1.36 -2.35 -2.06 0.1 2.06 0.83 0.4 1.34
-0.08 -3.35 -2.43 -2.19 -2.14 -2.16 -1.06 -0.23 -1.72 0.38 1.1 0.64 -0.31 0.49 0.28 -0.62 -0.13 -1.58 -1.18 -1.76 -1.57 -0.63 2.05 1.2 0.75 1.2
-0.04 -0.49 -0.45 -0.71 -0.97 -1.03 -0.37 0.14 0.2 0.76 0.94 0.78 0.44 -0.09 0.25 0.24 0.25 -0.23 -0.42 -0.24 -1.29 -0.19 -0.35 0.1 0.17 0.05
-0.12 -0.51 -0.42 -0.16 -0.16 -0.39 -0.04 0.03 0.06 0.12 0.27 0.31 0.21 0.46 -0.21 0.57 -0.35 -0.41 -0.52 -0.75 -0.33 0.35 0.2 0.04 0.46 0.2
-0.25 -0.62 -0.5 -0.14 -0.23 -0.82 -0.07 0.06 -0.37 0.04 0.38 0.23 0.1 0.67 -0.17 0.8 -0.21 0.04 -0.45 -0.66 -0.22 0.44 0.12 0.15 0.21 0.13
0.24 -0.55 -0.94 -0.17 -0.43 -1.21 -0.67 -0.23 -0.3 0.09 0.38 0.38 0.32 0.11 0.06 -0.07 -0.62 -0.48 -1.31 -1.28 -0.69 0.46 1.3 0.01 1.09 0.58
0.05 -0.13 -0.15 -0.33 -0.68 -1.04 -0.71 -0.37 -0.48 -0.04 0.15 -0.16 -0.24 0.52 0.27 0.36 0.2 0.09 -0.06 0.19 -1.16 0.43 0.43 0.44 0.55 0.15
-0.14 -0.22 -0.05 0.02 0.04 0.16 0.48 0.45 0.22 0.05 0.21 0.11 -0.07 0.14 -0.25 -0.14 0.02 -0.15 0.04 -0.3 -0.61 -0.45 0.48 -0.27 -0.04 -0.39
-0.03 -0.06 -0.17 -0.08 -0.12 -0.77 -0.08 -0.11 -0.46 0.26 0.25 0.26 -0.22 0.42 0.1 0.35 0.35 -0.09 0.08 0.14 -1.73 -0.07 0.21 0.28 0.05 -0.05
-0.35 -0.5 -0.6 -0.38 -0.62 -1.27 -0.16 -0.33 -0.93 0.03 -0.15 -0.23 -0.9 0.31 0.02 0.18 0.18 0.32 0.06 -0.22 -1.47 1.04 0.96 0.33 0.98 0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.