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Heatmap: Cluster_80 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.34 -1.24 -0.8 -0.24 0.46 0.15 0.98 1.18 0.33 0.89 1.08 0.56 -0.21 0.28 -0.69 0.68 0.51 -0.49 -1.05 -1.56 -1.72 -1.75 -0.61 -1.1 -0.78 -1.38
-0.41 -1.33 -0.73 -0.3 0.2 0.29 1.09 1.11 0.64 1.01 1.01 0.6 0.08 0.28 -0.19 0.79 0.42 -0.92 -0.67 -1.05 -2.32 -2.47 -1.35 -1.97 -1.06 -1.69
0.99 -0.91 -2.42 -1.63 -0.93 0.15 0.68 0.89 0.76 1.1 1.24 0.76 1.11 -1.04 -2.86 -1.41 -2.14 -0.03 -1.23 -1.41 -0.52 -1.81 1.02 -0.11 -0.97 -1.33
0.93 -1.22 -2.04 -1.58 -1.0 0.46 0.73 0.93 1.01 1.11 1.24 0.84 1.4 -1.36 -2.22 -2.5 -2.82 -0.36 -1.41 -2.01 -0.12 -2.77 1.02 -0.48 -1.78 -2.11
-1.48 -1.01 -0.49 -0.81 0.12 0.26 0.78 0.66 0.82 1.03 0.94 1.47 0.77 -2.62 -1.46 -1.66 -1.11 -0.55 -0.79 -1.09 -3.26 -3.78 1.53 -2.17 -0.39 -0.01
-0.62 -0.65 -0.22 -0.0 0.07 0.21 0.48 0.5 0.74 0.48 0.21 0.04 -0.12 0.28 -0.19 0.36 -0.39 0.37 -0.25 -0.34 -3.1 0.62 -0.6 -0.81 -0.39 -0.03
1.13 -0.07 0.07 0.7 -0.75 -0.03 -0.36 0.16 -0.25 -0.31 0.76 0.76 0.57 -0.67 -2.2 -0.92 -2.37 -1.48 -0.91 -0.52 -0.73 -4.54 0.34 -0.03 1.48 0.46
0.11 0.01 0.07 0.16 0.13 0.13 0.39 0.45 0.33 0.31 0.26 0.27 0.3 0.17 0.1 0.35 0.06 -0.1 -0.08 0.02 -1.9 -0.34 -1.47 -0.77 -0.56 -0.62
0.27 0.11 -0.19 -0.19 0.03 -0.15 0.21 0.36 0.64 0.48 0.67 0.6 0.39 0.25 0.42 0.18 -0.88 -0.46 -0.63 -0.85 -2.88 -1.22 -0.65 0.06 0.01 -0.26
-1.81 - - 0.48 - -0.42 1.17 0.42 1.13 2.21 2.29 1.4 - -1.67 - - - -1.25 -1.86 0.13 - -0.17 -1.88 -0.02 0.2 -2.01
0.08 -1.11 -1.12 -1.35 -0.14 0.48 0.71 0.96 0.38 1.08 0.93 0.96 0.88 -0.28 -0.92 -1.16 -0.74 -0.6 -0.91 -1.03 -5.6 -2.99 0.8 -0.5 0.32 -0.49
-0.29 -0.41 0.16 0.09 0.63 0.19 0.47 0.36 0.67 0.53 0.59 0.58 0.13 0.3 -0.42 0.53 -0.31 -0.07 -0.3 -0.39 -3.59 -0.47 -0.41 -1.55 -1.89 -0.27
0.93 0.25 -0.11 -0.29 -0.03 -0.42 -0.15 -0.01 0.19 0.22 0.09 0.83 0.98 -0.18 -0.95 -0.76 -0.95 -0.23 -0.19 -0.57 -2.18 -2.97 -0.27 0.2 1.14 -0.02
0.12 -0.74 -1.04 -0.35 -0.12 -0.11 0.54 0.16 0.84 0.7 0.97 0.98 0.45 -0.58 -0.43 -0.27 -0.42 -0.17 -0.74 -1.5 -2.85 -0.0 -0.03 -0.42 0.33 -0.05
-0.32 -0.37 -0.25 -0.35 -0.03 0.0 0.23 0.25 0.44 0.61 0.53 0.62 -0.05 0.34 0.07 0.1 -0.19 -0.19 -0.56 -0.11 -1.28 -0.27 -0.03 -0.59 0.12 -0.12
-0.06 -1.13 -1.49 0.33 0.65 0.64 0.85 0.77 0.02 1.42 1.6 1.32 0.38 -1.19 - -1.65 -5.99 -2.91 -2.38 -1.83 -3.92 -3.88 1.83 -2.66 -2.18 -1.46
0.45 -0.81 -0.99 -0.14 0.27 0.44 0.2 0.77 0.46 1.81 1.88 1.65 -0.64 0.19 -2.67 -2.55 - -1.9 -2.02 -2.95 -3.02 - 1.26 -2.97 - -3.15
0.31 -1.83 -0.77 0.12 0.51 0.75 0.93 0.83 0.41 1.18 1.69 1.01 0.47 -1.2 -3.15 -3.02 -5.5 -2.4 -2.6 -1.09 - 0.83 0.9 -2.64 -3.2 -1.52
0.43 -1.51 -0.2 0.01 0.73 0.5 1.0 0.64 0.34 1.46 1.72 1.25 0.11 -0.85 -4.54 -1.94 -5.09 -2.1 -1.95 -1.33 -6.23 -3.19 1.21 -2.26 -2.61 -1.24
-0.05 0.37 0.62 0.51 0.33 0.24 0.5 0.68 0.56 0.43 0.19 -0.05 0.25 0.23 0.01 0.15 0.2 -0.43 -0.24 -0.01 -4.31 -0.75 -2.12 -2.01 -0.58 -1.33
0.62 -0.35 -0.95 -0.26 0.63 -0.74 0.08 0.33 0.57 1.16 1.3 0.88 0.73 -2.48 -1.26 -0.92 -1.14 -0.65 0.21 -0.73 -2.4 -0.82 0.07 0.08 -0.43 -0.74
0.35 0.56 0.19 0.24 -0.07 0.02 0.34 0.62 0.52 0.43 0.52 0.25 0.57 -0.27 -0.69 -0.24 -0.43 -0.16 -0.29 -0.79 -3.94 -0.07 -0.29 -0.81 -0.33 -0.43
0.35 -0.2 -0.58 -0.15 -0.23 -0.28 0.28 0.36 0.56 0.89 1.01 0.54 0.62 0.68 -0.34 0.07 -0.7 -0.83 -0.05 -0.53 -5.02 -0.62 -1.78 -0.64 0.12 -0.32
0.52 0.05 -1.08 -0.96 -0.1 0.12 0.69 1.01 0.47 0.82 1.21 0.9 0.86 -0.12 -0.67 -0.98 -0.63 -0.19 -0.8 -1.95 -3.48 -2.69 0.03 -1.05 -0.41 -0.26
0.4 -0.59 0.18 -0.01 0.44 -0.3 -0.13 0.04 0.25 0.52 0.73 0.87 0.53 0.28 -0.31 0.16 -0.2 -0.19 -0.25 -0.24 -1.84 -0.52 -0.41 -0.69 -2.24 0.11
0.0 0.04 -0.02 0.14 0.16 0.21 0.4 0.41 0.36 0.28 0.12 0.13 0.18 0.11 0.1 0.34 0.01 -0.14 -0.06 -0.01 -1.55 0.14 -1.4 -0.77 -0.3 -0.62
0.07 0.03 0.11 0.14 0.18 0.16 0.41 0.5 0.43 0.37 0.3 0.25 0.25 0.11 0.06 0.29 0.01 -0.26 0.09 -0.11 -1.88 -0.33 -1.68 -0.73 -0.64 -0.55
-1.13 0.15 0.69 0.96 0.31 -0.17 -0.08 0.56 0.05 0.57 1.07 0.74 0.08 0.73 -0.53 -0.08 -0.15 -1.99 -0.95 -0.5 -4.4 -4.12 -3.72 -1.43 0.82 0.0
-0.42 0.15 0.08 0.31 0.44 0.1 0.34 0.5 0.69 0.7 0.5 0.32 -0.05 0.56 -0.47 0.15 0.06 -0.05 -0.45 -0.12 -2.4 -2.11 -2.52 -1.13 0.15 -0.41
-0.28 -0.16 0.73 0.28 0.21 -0.26 0.18 -0.56 0.25 0.76 1.53 1.25 -0.18 0.62 -1.44 -2.01 -4.03 - -2.79 - -1.83 0.63 0.66 -0.81 0.08 0.22
-0.23 -0.18 0.21 0.51 0.67 0.58 0.4 0.19 0.28 0.31 0.43 0.38 0.08 0.46 -0.09 0.34 -0.32 -0.48 -0.44 0.11 -7.34 -0.91 -2.13 -1.86 -0.3 0.26
-0.33 0.71 0.71 0.57 0.5 0.41 0.77 0.88 0.69 0.29 -0.11 -0.57 -0.17 0.21 -0.39 0.37 -0.89 -0.3 -0.11 -0.05 -2.48 -0.55 -1.76 -1.64 -1.14 -1.16
-0.07 -0.62 -0.19 0.01 0.09 0.02 0.41 0.38 0.53 0.52 0.73 0.6 0.32 0.39 -0.16 0.21 -0.25 -0.18 -0.4 -0.57 -2.31 -0.33 -0.34 -0.32 -0.49 -0.58
0.16 -0.2 -0.1 0.13 0.06 0.24 -0.08 0.04 0.44 0.56 0.57 0.62 0.74 0.52 -0.05 0.23 -0.65 0.04 -0.07 -0.69 -2.77 -2.25 -0.86 -0.5 -0.39 0.11
0.29 -0.38 -0.54 -0.37 -0.18 -1.35 -0.18 -0.84 1.05 1.27 1.53 1.15 -0.11 0.21 -1.42 -0.08 -2.83 -3.44 -3.76 -2.9 -0.4 -1.45 0.92 0.9 -1.2 0.13
0.5 -0.12 -1.25 -0.78 -0.47 -0.04 0.87 0.91 0.37 0.7 0.86 0.6 0.82 -0.11 -1.55 -0.98 -0.85 -0.56 -0.83 -1.02 -2.48 -1.55 0.83 -0.07 0.33 -0.55
-0.38 -0.88 -0.3 -0.31 -0.71 -0.02 0.6 0.7 1.17 0.93 1.14 0.8 0.24 0.0 -0.25 -0.37 -0.64 -1.13 -0.26 -1.1 -2.31 -1.55 -0.24 0.21 -0.13 -0.8
0.06 0.06 0.1 0.19 0.15 0.1 0.38 0.49 0.38 0.35 0.37 0.39 0.29 0.25 0.08 0.33 -0.12 -0.41 -0.35 -0.1 -1.95 -0.37 -1.09 -0.64 -0.51 -0.59
-0.26 0.21 0.08 0.29 0.3 -0.02 0.4 0.41 0.3 0.45 0.49 0.38 -0.22 -0.44 -0.2 -0.0 -0.83 -0.03 0.01 -0.37 -1.77 -0.1 -0.21 0.23 -0.35 -0.47
0.5 -0.16 -0.57 0.07 0.04 -0.68 -0.21 0.22 0.54 0.87 1.13 0.86 0.59 -0.02 -0.02 -0.23 -0.29 -0.15 -0.02 -0.29 -1.72 -2.7 -0.27 -0.51 -1.16 -0.49
-0.27 -0.12 0.12 -0.02 0.39 0.17 0.61 0.5 0.3 0.39 0.43 0.31 0.08 0.72 0.24 0.49 -0.18 -0.78 -0.33 -0.64 -2.56 -0.18 -0.49 -1.18 -0.61 -0.66
0.51 -0.26 -0.21 -0.23 -0.18 -0.0 0.34 0.28 0.58 0.49 0.55 0.62 0.72 0.27 -0.45 -0.16 -0.71 -0.49 -0.77 -0.37 -1.33 -0.47 -0.21 -0.23 -0.43 0.01
-0.17 -0.49 -0.53 -0.35 -0.2 -0.14 0.46 0.37 0.53 0.63 0.6 0.63 0.21 0.09 -0.01 -0.05 -0.28 0.13 -0.16 -0.13 -3.09 0.32 -0.54 -0.66 -0.15 -0.08
0.46 -0.62 -0.22 -0.16 -0.1 -0.05 0.15 0.43 0.52 0.84 0.64 0.78 0.8 0.14 -0.22 0.15 -0.13 0.1 -0.48 -0.01 -4.26 -2.24 -0.22 -0.96 -0.8 -0.62
-0.67 -0.56 -0.03 0.01 0.24 -0.02 0.28 0.29 0.27 0.41 0.4 0.39 -0.09 -0.42 -0.29 0.93 -0.21 0.05 -0.39 -0.3 -3.35 -0.92 0.67 0.26 -0.31 -0.28
0.18 -0.1 -0.21 -0.02 0.1 -0.02 0.14 0.4 0.61 0.61 0.5 0.18 0.01 0.06 0.27 0.5 -0.3 0.41 -0.09 -0.73 -1.71 -0.35 -0.36 -0.32 -1.02 -1.08
0.55 0.02 -0.04 0.12 -0.26 -0.01 -0.02 0.28 0.12 0.57 0.24 0.34 0.33 -0.03 -0.82 -0.44 -1.17 0.23 -0.26 -1.11 -2.26 -2.12 0.17 -0.38 1.33 0.16
-0.69 -0.63 -0.18 -0.38 -0.61 -0.17 0.29 0.49 0.74 0.26 0.15 0.25 -0.44 0.31 0.11 0.32 -0.06 0.8 0.03 -0.2 -2.77 0.41 -0.02 -0.54 -0.41 -0.07
0.34 -0.34 -0.39 -0.46 -0.54 -0.43 0.09 0.28 0.25 0.45 0.66 0.22 0.23 0.16 -0.88 -0.02 -0.56 -0.12 -0.34 -0.31 -1.09 -2.04 0.81 0.5 0.21 0.5
0.24 -0.31 -0.7 0.26 0.0 0.07 0.47 0.35 0.44 0.26 0.56 0.78 0.75 0.53 0.07 0.61 -0.45 0.2 -0.54 -0.06 -2.79 -3.94 -0.42 -0.92 -1.56 -0.54
-0.69 -0.45 -0.15 0.37 0.53 0.36 0.6 0.44 0.38 0.49 0.74 0.73 0.18 -0.53 -0.69 0.73 -0.69 -0.2 -0.77 -0.65 -3.42 -0.15 -0.14 -0.68 -0.27 -0.62
-0.16 -0.48 -0.44 -0.19 0.13 0.25 0.34 0.44 0.46 0.29 0.45 0.53 0.11 0.6 -0.42 0.15 -0.37 -0.21 -0.7 -0.8 -1.75 -0.21 0.38 -0.23 -0.13 -0.08
-0.05 -0.64 -0.64 -0.12 -0.06 -0.17 0.34 0.24 0.47 0.41 0.55 0.68 0.5 0.19 -0.48 0.21 -0.65 0.03 -0.44 -0.89 -1.83 0.24 -0.16 0.24 -0.1 -0.11
-0.58 -0.38 -0.09 0.38 0.29 0.19 0.42 0.5 0.47 0.33 0.38 0.58 -0.2 -0.47 -0.62 0.71 -0.54 -0.1 -0.66 -0.75 -3.05 0.1 0.17 0.26 -0.38 -0.42
-0.09 -0.57 -0.36 -0.05 0.15 0.41 0.38 0.45 0.62 0.39 0.5 0.52 0.28 0.46 -0.51 -0.02 -0.69 -0.34 -0.58 -0.88 -1.78 -0.34 0.22 -0.13 -0.13 -0.19
-0.33 -0.17 -0.04 0.09 0.15 -0.15 0.23 0.55 0.26 1.0 1.14 0.81 0.26 0.24 0.34 -0.71 -1.41 0.5 -0.85 -0.01 -7.85 -2.32 -4.02 -1.33 0.45 -0.27
-0.43 -0.33 -0.3 -0.09 0.07 -0.66 -0.08 0.27 -0.29 0.79 0.85 0.53 -0.2 0.66 0.51 -0.4 -0.71 1.17 -0.4 0.44 -7.09 -2.02 -3.69 -1.62 0.87 -0.0
1.57 0.8 -1.0 0.91 -0.1 -0.59 -0.22 0.25 -0.83 -0.85 0.57 -0.96 0.42 0.47 -0.2 0.46 -0.42 -0.99 -0.98 -0.06 -1.85 -3.31 -0.44 -0.11 0.71 -0.37
0.28 -0.49 0.05 -0.12 0.17 -0.27 -0.03 -0.07 0.08 0.37 0.51 0.9 0.55 0.29 -0.42 0.45 -0.62 -0.08 0.17 -0.2 -1.52 -2.05 -0.78 -0.48 0.29 0.1
-0.51 -0.81 -0.56 -0.48 -0.11 0.14 0.47 0.42 0.45 0.8 0.65 0.56 0.05 0.33 -1.1 -0.67 -0.08 -0.08 -0.12 0.27 -1.09 -1.54 -0.1 0.02 -0.07 0.37
0.91 -0.24 -0.23 0.05 -0.33 -0.9 -0.38 -0.27 0.01 0.36 0.25 0.5 1.02 0.01 -0.24 0.06 -0.34 0.15 0.31 -0.15 -3.01 -1.64 0.15 0.06 0.44 -0.63
-0.14 -0.29 0.09 0.03 0.12 0.18 0.49 0.49 0.51 0.46 0.35 0.16 0.24 0.32 0.35 0.72 -0.11 -0.53 -0.37 0.16 -2.94 -0.08 -1.32 -1.38 -0.62 -0.69
-0.4 -0.55 -0.53 -0.28 -0.02 0.2 0.31 0.26 0.64 0.8 0.56 0.67 0.14 0.31 -0.09 0.16 -0.28 -0.33 -0.57 -0.01 -1.81 -0.91 -0.39 -0.2 -0.05 0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.