Heatmap: Cluster_181 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.43 0.35 0.36 0.44 0.41 0.25 0.46 0.45 0.51 0.71 0.61 0.65 0.42 0.63 0.52 0.8 0.64 0.53 0.43 0.48 0.46 0.76 0.96 1.0 0.79 0.83
0.53 0.36 0.39 0.5 0.44 0.33 0.58 0.56 0.77 0.81 0.88 0.75 0.46 0.54 0.51 0.72 0.55 0.5 0.42 0.48 0.55 0.95 0.9 0.82 1.0 0.92
0.53 0.48 0.43 0.54 0.49 0.43 0.5 0.58 0.58 0.65 0.74 0.69 0.62 0.63 0.53 0.54 0.41 0.5 0.38 0.47 0.41 1.0 0.65 0.59 0.63 0.65
0.59 0.51 0.31 0.38 0.26 0.22 0.32 0.33 0.33 0.38 0.43 0.45 0.63 0.29 0.2 0.92 0.24 0.43 0.24 0.19 0.05 0.49 0.58 0.3 1.0 0.59
0.45 0.25 0.29 0.37 0.36 0.27 0.38 0.41 0.32 0.36 0.42 0.43 0.49 0.56 0.3 1.0 0.33 0.43 0.29 0.24 0.25 1.0 0.41 0.45 0.64 0.48
0.07 0.1 0.14 0.23 0.27 0.26 0.37 0.39 0.42 0.47 0.49 0.42 0.1 0.4 0.2 0.32 0.24 0.26 0.22 0.19 0.42 0.77 1.0 0.52 0.51 0.43
0.55 0.32 0.26 0.28 0.31 0.29 0.47 0.52 0.54 0.57 0.68 0.52 0.55 0.55 0.29 0.46 0.29 0.53 0.36 0.28 0.25 0.77 1.0 0.58 0.68 0.58
0.39 0.26 0.28 0.44 0.43 0.32 0.42 0.37 0.26 0.24 0.24 0.24 0.38 0.32 0.25 1.0 0.37 0.4 0.29 0.29 0.12 0.62 0.41 0.28 0.59 0.4
0.54 0.48 0.4 0.55 0.54 0.42 0.56 0.59 0.58 0.71 0.8 0.76 0.62 0.76 0.53 0.7 0.46 0.54 0.5 0.32 0.44 0.91 1.0 0.76 0.93 0.7
0.4 0.44 0.47 0.61 0.64 0.52 0.68 0.74 0.66 0.66 0.74 0.7 0.49 0.74 0.54 0.68 0.55 0.6 0.47 0.39 0.42 1.0 0.85 0.64 0.95 0.78
0.26 0.25 0.29 0.45 0.46 0.43 0.53 0.48 0.63 0.57 0.56 0.54 0.24 0.55 0.38 0.56 0.46 0.56 0.41 0.34 0.49 1.0 0.98 0.66 0.76 0.62
0.61 0.43 0.46 0.54 0.57 0.47 0.61 0.66 0.58 0.58 0.67 0.64 0.67 0.62 0.63 0.86 0.43 0.74 0.5 0.37 0.46 0.87 1.0 0.72 0.67 0.66
0.51 0.33 0.47 0.5 0.51 0.44 0.64 0.63 0.68 0.71 0.89 1.0 0.66 0.64 0.33 0.7 0.41 0.53 0.41 0.56 0.22 0.82 0.92 0.69 0.78 0.75
0.18 0.11 0.12 0.16 0.08 0.09 0.17 0.1 0.15 0.11 0.12 0.11 0.07 0.34 0.14 0.19 0.17 0.17 0.17 0.09 0.21 0.12 1.0 0.23 0.35 0.51
0.4 0.32 0.37 0.43 0.42 0.39 0.4 0.42 0.45 0.48 0.54 0.57 0.38 0.26 0.23 0.81 0.28 0.34 0.23 0.25 0.14 1.0 0.46 0.49 0.55 0.5
0.33 0.28 0.31 0.42 0.47 0.4 0.63 0.69 0.52 0.59 0.59 0.54 0.49 0.44 0.36 0.56 0.35 0.37 0.35 0.29 0.13 1.0 0.74 0.34 0.65 0.47
0.24 0.19 0.16 0.32 0.33 0.28 0.25 0.32 0.26 0.29 0.27 0.24 0.11 0.36 0.3 0.56 0.48 0.59 0.54 0.35 0.12 0.19 1.0 0.54 0.61 0.58
0.52 0.37 0.29 0.28 0.11 0.1 0.16 0.2 0.11 0.11 0.17 0.19 0.32 0.33 0.15 0.48 0.14 0.27 0.2 0.08 0.02 0.16 0.35 0.12 1.0 0.41
0.57 0.58 0.42 0.45 0.13 0.11 0.09 0.35 0.15 0.21 0.17 0.29 0.65 0.26 0.03 0.54 0.12 0.17 0.08 0.06 0.01 0.15 0.37 0.1 1.0 0.35
0.54 0.29 0.3 0.46 0.29 0.21 0.34 0.23 0.46 0.23 0.29 0.33 0.48 0.96 0.45 0.68 0.15 0.29 0.33 0.23 0.24 0.47 1.0 0.44 0.7 0.63
0.37 0.32 0.3 0.38 0.38 0.32 0.4 0.39 0.32 0.37 0.4 0.38 0.45 0.63 0.52 0.64 0.29 0.47 0.44 0.23 0.33 0.45 1.0 0.56 0.66 0.45
0.19 0.17 0.21 0.32 0.37 0.28 0.37 0.44 0.33 0.43 0.56 0.51 0.24 0.75 0.37 0.63 0.4 0.37 0.28 0.22 0.35 0.87 0.9 0.61 1.0 0.76
0.22 0.17 0.12 0.2 0.1 0.06 0.12 0.17 0.19 0.26 0.42 0.33 0.24 0.87 0.26 0.39 0.22 0.24 0.2 0.14 0.23 0.63 1.0 0.41 0.92 0.44
0.56 0.43 0.46 0.54 0.51 0.44 0.67 0.7 0.72 0.66 0.73 0.7 0.53 0.79 0.48 0.64 0.42 0.53 0.44 0.39 0.31 1.0 0.89 0.66 0.59 0.71
0.35 0.28 0.31 0.43 0.43 0.38 0.49 0.52 0.5 0.56 0.6 0.65 0.46 0.65 0.37 0.55 0.41 0.49 0.34 0.32 0.29 1.0 0.39 0.53 0.51 0.49
0.22 0.23 0.23 0.36 0.4 0.35 0.38 0.39 0.44 0.45 0.46 0.39 0.2 0.5 0.45 0.47 0.32 0.36 0.3 0.25 0.19 0.96 1.0 0.61 0.7 0.58
0.52 0.36 0.27 0.26 0.24 0.26 0.34 0.44 0.41 0.45 0.34 0.35 0.36 0.53 0.26 0.42 0.46 0.51 0.46 0.39 0.21 0.27 1.0 0.36 0.74 0.55
0.19 0.23 0.24 0.2 0.19 0.12 0.22 0.18 0.16 0.3 0.29 0.28 0.23 0.52 0.31 0.33 0.26 0.26 0.27 0.25 0.28 0.37 1.0 0.28 0.51 0.61
0.29 0.3 0.23 0.4 0.39 0.29 0.44 0.47 0.47 0.59 0.61 0.7 0.3 0.55 0.34 0.51 0.35 0.47 0.35 0.3 0.47 0.74 1.0 0.74 0.79 0.75
0.49 0.37 0.39 0.47 0.39 0.3 0.43 0.5 0.4 0.39 0.4 0.38 0.54 0.42 0.3 1.0 0.25 0.32 0.26 0.22 0.11 0.73 0.35 0.28 0.77 0.54
0.26 0.29 0.3 0.28 0.23 0.16 0.25 0.24 0.18 0.27 0.15 0.19 0.29 0.39 0.27 1.0 0.25 0.57 0.18 0.15 0.17 0.77 0.3 0.25 0.84 0.56
0.23 0.21 0.22 0.32 0.39 0.36 0.43 0.43 0.55 0.57 0.59 0.56 0.32 0.49 0.38 0.42 0.35 0.34 0.34 0.29 0.34 1.0 0.94 0.92 0.68 0.57
0.19 0.18 0.18 0.3 0.4 0.4 0.58 0.51 0.65 0.56 0.61 0.53 0.21 0.45 0.32 0.49 0.36 0.52 0.38 0.36 0.58 1.0 0.84 0.59 0.61 0.49
0.17 0.09 0.16 0.2 0.18 0.12 0.26 0.32 0.33 0.36 0.37 0.4 0.11 0.38 0.22 0.31 0.29 0.35 0.29 0.25 0.2 1.0 0.76 0.67 0.51 0.43
0.19 0.29 0.3 0.41 0.42 0.29 0.42 0.42 0.42 0.47 0.55 0.48 0.18 0.41 0.27 0.4 0.3 0.39 0.38 0.34 0.15 0.94 1.0 0.49 0.58 0.5
0.25 0.19 0.19 0.3 0.3 0.31 0.35 0.35 0.37 0.38 0.38 0.52 0.33 0.72 0.42 0.61 0.32 0.45 0.29 0.29 0.48 0.53 1.0 0.35 0.55 0.49
0.41 0.29 0.38 0.44 0.52 0.42 0.63 0.61 0.76 0.71 0.68 0.88 0.49 0.81 0.42 0.65 0.38 0.6 0.4 0.31 0.44 0.98 0.98 0.69 1.0 0.97
0.41 0.29 0.34 0.46 0.47 0.38 0.47 0.45 0.47 0.56 0.58 0.56 0.43 0.75 0.46 0.67 0.48 0.51 0.4 0.42 0.36 1.0 0.87 0.79 0.73 0.65
0.51 0.35 0.37 0.41 0.38 0.26 0.47 0.58 0.42 0.52 0.57 0.62 0.6 0.56 0.42 0.66 0.42 0.4 0.33 0.41 0.25 1.0 0.6 0.56 0.63 0.47
0.65 0.46 0.47 0.54 0.47 0.35 0.51 0.59 0.52 0.58 0.65 0.67 0.71 0.73 0.51 0.7 0.47 0.57 0.49 0.42 0.34 1.0 0.91 0.68 0.73 0.72
0.36 0.26 0.26 0.36 0.42 0.33 0.41 0.42 0.45 0.56 0.63 0.64 0.43 0.46 0.37 0.54 0.5 0.31 0.24 0.24 0.27 1.0 0.64 0.65 0.55 0.5
0.38 0.22 0.19 0.25 0.28 0.12 0.2 0.28 0.27 0.33 0.31 0.26 0.26 0.91 0.27 0.59 0.24 0.46 0.44 0.3 0.46 0.34 1.0 0.48 0.43 0.46
0.24 0.33 0.4 0.52 0.48 0.3 0.45 0.5 0.46 0.55 0.58 0.54 0.2 0.58 0.5 0.55 0.35 0.49 0.33 0.33 0.41 0.96 1.0 0.73 0.91 0.65
0.23 0.34 0.38 0.5 0.48 0.39 0.47 0.46 0.53 0.54 0.59 0.52 0.2 0.53 0.46 0.46 0.3 0.37 0.28 0.24 0.37 0.89 1.0 0.61 0.7 0.57
0.43 0.34 0.41 0.51 0.44 0.4 0.59 0.63 0.52 0.58 0.64 0.51 0.49 0.52 0.38 0.35 0.45 0.35 0.29 0.36 0.26 1.0 0.63 0.39 0.49 0.51
0.19 0.25 0.24 0.28 0.33 0.35 0.34 0.34 0.48 0.48 0.54 0.51 0.21 0.4 0.28 0.3 0.25 0.37 0.28 0.21 0.21 0.79 1.0 0.68 0.68 0.52
0.19 0.18 0.19 0.2 0.17 0.18 0.28 0.25 0.31 0.5 0.51 0.52 0.22 0.63 0.52 0.6 0.27 0.42 0.36 0.29 0.24 1.0 0.82 0.73 0.77 0.44
0.02 0.13 0.2 0.3 0.4 0.33 0.29 0.23 0.32 0.37 0.37 0.37 0.02 0.48 0.32 0.36 0.35 0.27 0.17 0.23 0.23 1.0 0.8 0.64 0.43 0.59
0.42 0.11 0.08 0.12 0.21 0.17 0.22 0.24 0.28 0.37 0.48 0.4 0.39 0.79 0.24 0.43 0.21 0.33 0.26 0.17 0.16 0.81 1.0 0.39 0.99 0.68

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)