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Heatmap: Cluster_220 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.28 0.13 0.0 0.42 0.86 0.77 0.59 0.46 0.31 0.01 -0.02 -0.14 -0.08 -0.9 -0.78 -0.57 -0.44 -0.3 -0.14 -0.45 -3.87 0.44 -0.72 -0.71 0.25 0.07
-0.6 -0.1 0.05 0.63 0.51 0.11 0.39 0.75 0.4 -0.39 -0.16 -0.28 -0.94 -0.55 -0.38 -0.29 -0.72 0.51 -0.16 -0.73 -4.01 1.02 -0.53 -0.75 0.59 0.41
-1.45 -1.2 -0.17 0.34 0.23 0.15 0.86 0.76 0.63 -0.05 -0.67 -1.04 -1.92 -0.38 -0.18 0.4 0.17 0.53 0.18 -0.2 -2.43 0.27 -0.16 -0.1 0.59 0.14
-3.75 -2.33 -2.42 0.14 0.69 1.21 0.88 0.79 0.73 0.26 0.14 -0.33 -1.93 0.16 -0.86 0.45 -0.6 0.62 0.25 -0.44 -3.02 -0.4 0.19 -0.69 0.32 -0.2
0.41 0.48 0.49 0.49 0.18 -0.07 -0.04 0.17 -0.06 -0.01 0.11 0.47 0.4 -0.95 -0.34 -0.52 -0.71 -0.26 -0.74 -0.72 -3.44 -0.2 0.21 -0.46 0.76 0.41
-3.85 -0.68 -0.39 0.19 0.45 -0.35 -0.16 -0.02 0.41 0.57 0.74 0.19 -4.06 -0.41 -1.06 -0.7 0.06 -0.32 -0.32 -0.24 -3.62 0.88 -0.08 0.44 1.26 0.79
-1.23 -0.62 -0.4 0.72 0.86 0.55 0.96 0.73 0.47 -0.12 -0.41 -0.85 -2.94 -1.26 -0.72 -0.44 -0.67 0.05 -0.37 -0.5 -2.62 1.51 -1.5 -0.63 0.91 0.13
-1.99 -0.94 -0.22 0.18 0.26 0.26 0.79 0.49 0.42 -0.14 -0.31 -0.56 -2.39 -0.18 -0.04 0.06 -0.2 0.45 0.01 -0.43 -2.27 0.62 0.26 -0.26 0.78 0.48
-0.76 -0.32 -0.1 0.69 0.58 0.06 0.39 0.49 0.4 0.22 0.15 -0.15 -1.0 -0.79 -0.33 -0.54 0.12 0.21 -0.04 -0.18 -4.17 0.51 -0.74 -0.53 0.87 0.08
-0.87 -0.04 -0.23 0.4 0.49 0.12 0.5 0.65 0.46 0.25 0.09 -0.21 -1.26 -0.77 -0.45 -0.61 -0.09 0.38 0.27 0.03 -4.53 0.68 -0.17 -1.09 0.67 -0.15
-1.26 -0.07 0.16 0.4 0.41 0.19 0.38 0.47 0.52 0.1 -0.01 -0.19 -2.26 -1.32 -0.45 -0.9 0.0 0.54 0.06 0.61 -8.58 0.61 0.21 -0.5 0.41 0.04
0.0 -0.16 -0.26 0.11 0.35 0.1 0.24 0.22 -0.03 0.15 0.12 0.08 0.12 -0.42 -0.49 0.38 -0.87 0.18 -0.12 -0.86 -1.7 0.87 -0.72 -0.11 0.56 0.17
-0.44 -0.58 -0.4 -0.15 0.2 0.25 0.72 0.59 0.53 0.18 0.1 -0.22 -0.82 -0.18 -0.31 -0.03 -0.23 0.3 0.2 -0.14 -3.61 0.22 -0.0 -0.09 0.5 -0.03
0.19 -0.21 -0.62 0.29 0.14 0.12 0.55 0.8 0.64 0.26 0.04 -0.5 -0.79 -0.63 -1.05 -0.46 -0.84 0.04 -0.35 -0.45 -2.24 1.26 -0.47 -0.36 0.49 0.24
-0.42 -0.27 -0.41 0.28 0.42 0.01 0.22 0.05 0.44 0.31 0.59 0.02 -1.45 -0.44 -0.18 -0.43 -0.14 0.42 0.52 -0.06 -6.37 0.46 -0.65 0.12 0.29 0.12
-4.25 -1.6 -1.27 -0.16 0.57 0.6 1.05 0.79 0.93 0.21 -0.15 -0.35 -3.59 -0.84 -0.5 -0.56 -0.04 0.24 0.17 0.36 -2.5 0.4 0.61 0.35 0.18 -0.5
-1.0 -0.88 -0.84 -0.1 0.3 0.13 0.72 0.49 0.34 -0.18 -0.51 -1.16 -1.3 -0.31 -0.23 -0.02 0.03 0.24 -0.0 -0.28 -1.12 0.58 0.61 0.14 0.97 0.22
-1.88 -0.37 -0.08 0.45 0.68 0.82 0.61 0.7 0.46 0.3 -0.05 -0.44 -2.54 -0.53 -0.13 -0.19 -0.33 -0.02 0.02 -0.41 -1.99 0.05 0.48 -0.37 0.39 -0.23
-0.78 -0.29 -0.24 0.41 0.21 0.22 0.31 0.16 0.0 0.01 -0.36 -0.06 -0.87 0.04 0.07 -0.24 -0.92 0.37 0.4 -1.27 -1.49 0.76 0.3 0.15 0.56 0.14
-0.64 -0.36 -0.25 0.31 0.49 0.1 0.19 0.24 0.49 0.38 0.31 0.12 -1.28 0.05 0.1 -0.29 -0.34 0.51 0.41 -0.14 -5.15 -0.35 -0.05 0.11 0.15 -0.13
-3.45 -3.05 -0.69 -0.2 0.28 0.33 0.22 0.49 0.66 0.1 -0.2 -0.2 -3.49 -0.01 0.23 -0.37 -0.8 0.19 0.12 -0.73 -1.24 1.3 0.92 -1.1 1.08 0.1
-0.54 0.21 0.38 0.55 0.36 0.14 0.31 0.44 0.41 0.39 0.23 0.01 -0.34 -0.83 -0.27 -0.52 -0.28 0.23 -0.15 -0.16 -3.87 0.47 -0.12 -0.47 0.14 -0.45
-0.77 -0.46 -0.44 0.09 0.31 0.09 0.29 0.27 0.28 -0.07 0.06 -0.23 -0.94 -0.16 -0.1 -0.16 -0.37 0.24 0.19 -0.39 -1.13 0.37 0.57 0.02 0.55 0.35
-0.13 -0.26 -0.16 0.04 0.3 0.03 0.35 0.31 0.21 0.06 -0.04 -0.52 -0.35 -0.2 -0.72 -0.14 -0.36 -0.03 -0.13 -0.3 -1.51 1.06 -0.2 0.04 0.75 0.02
-0.36 0.08 0.03 0.62 0.76 0.27 0.37 0.27 0.28 -0.2 -0.11 -0.32 -1.45 -0.77 -0.34 -0.42 -0.32 0.38 0.13 -0.31 -4.34 0.18 0.51 -0.91 0.71 0.2
-1.1 -0.35 -0.29 0.27 0.3 0.28 0.34 0.3 0.51 -0.06 -0.05 -0.25 -1.22 0.04 0.15 0.27 -0.04 0.41 0.36 -0.24 -2.32 -0.12 -0.02 -0.29 0.49 0.1
-3.5 -2.76 -0.73 -0.2 -0.14 0.08 1.24 0.97 0.95 0.13 -0.41 -0.77 -3.09 -0.45 -0.71 0.28 0.01 0.29 -0.14 -0.1 -2.13 1.03 -0.51 -0.53 1.12 0.1
-0.25 -0.74 -0.46 0.38 0.78 0.85 0.95 0.73 0.1 -0.32 -0.24 -0.54 -0.79 -0.71 -0.55 -0.54 -0.47 -0.33 0.07 -0.31 -3.35 0.78 -0.15 -0.16 0.45 0.13
-0.43 -0.3 0.09 0.46 0.64 0.38 0.38 0.34 0.13 0.03 -0.01 -0.33 -0.45 -0.9 -0.4 -0.5 -0.56 0.5 -0.18 -0.22 -2.99 0.91 0.1 -0.58 0.63 -0.28
0.72 -0.17 -0.71 0.01 -0.08 -0.34 0.31 0.69 0.38 0.23 0.23 -0.34 0.24 -1.0 -1.26 -1.07 -0.84 -0.03 -0.34 -0.8 -2.81 1.26 -0.03 -0.06 0.84 0.11
-0.81 -0.32 -0.16 0.0 0.32 0.24 0.68 0.63 0.57 -0.18 -0.26 -0.56 -1.6 -0.65 -0.21 -0.04 -0.14 0.46 0.09 0.18 -1.81 0.65 0.08 0.22 0.08 -0.23
-1.21 -0.88 -0.6 0.49 0.64 0.77 0.94 0.8 0.36 -0.0 -0.18 -0.94 -1.43 -0.4 -0.98 -0.27 -0.63 -0.03 -0.34 -0.57 -3.6 0.79 0.21 -0.01 0.9 -0.08
-0.04 -0.56 -0.21 0.15 0.33 0.75 0.83 0.66 0.07 -0.33 -0.34 -0.13 0.17 -0.14 -0.48 0.18 -0.25 -0.04 0.15 -0.07 -2.12 0.22 -0.15 -0.73 -0.07 -0.14
-0.89 -0.1 0.2 0.81 0.6 -0.14 0.22 0.56 0.12 0.21 0.33 -0.09 -1.65 -0.65 -0.93 -0.74 -0.47 0.04 -0.25 -0.41 -5.15 0.65 -0.24 0.11 0.91 0.37
-0.79 -0.13 -0.03 0.07 0.35 0.47 0.11 -0.04 -0.12 -0.21 -0.47 -0.46 -1.07 -0.08 0.15 -0.02 -0.38 0.58 0.08 -0.58 -1.36 0.72 -0.38 0.11 0.86 0.4
-1.72 -0.73 -1.06 -0.49 0.51 1.34 1.25 1.33 -0.3 -0.63 -1.64 -2.33 -1.49 -0.34 -1.79 -1.32 -0.31 0.66 0.44 0.38 -2.71 0.81 0.48 -0.53 0.1 0.18
-3.36 -2.29 -0.66 0.57 1.0 0.65 0.34 0.16 0.33 0.33 -0.07 -0.27 -2.78 -0.19 -0.44 -0.1 -0.38 0.54 -0.06 -0.23 -2.77 0.26 0.55 -0.31 0.74 0.4
-3.13 -0.13 0.04 0.46 0.75 0.77 0.29 0.29 0.0 0.02 0.01 -0.51 -2.95 -0.46 -0.52 -0.42 -0.62 0.39 0.18 -0.33 -6.9 0.9 -0.31 -0.03 0.77 0.54
-1.52 -0.76 -0.81 -0.11 0.29 -0.19 0.66 0.57 0.74 -0.08 -0.01 -0.28 -1.31 -0.34 -0.15 -0.29 -0.14 -0.07 0.0 -0.28 -2.54 1.02 0.08 0.14 0.94 0.11
-0.9 -0.48 -0.16 0.4 0.5 0.38 0.69 0.54 0.27 -0.13 -0.27 -0.42 -1.39 -0.46 -0.37 -0.15 -0.06 0.51 0.16 -0.14 -2.07 0.33 0.04 -0.08 0.44 0.06
-0.01 -0.13 -0.16 0.49 0.7 0.55 0.64 0.59 -0.31 -0.09 -0.01 -0.24 -0.45 -0.58 -0.76 -0.53 -0.79 -0.32 -0.26 -0.33 -4.13 1.01 -0.74 -0.61 0.89 0.24
-0.43 -0.33 -0.59 0.03 0.21 0.51 0.57 0.37 0.37 0.03 -0.02 -0.19 -0.93 -0.47 -0.48 -0.36 -0.37 0.28 -0.22 -0.29 -3.67 0.99 0.57 0.16 0.42 -0.28
-0.39 -0.3 -0.16 0.32 0.75 0.37 0.54 0.34 0.07 0.12 -0.02 -0.15 -1.11 -0.14 -0.16 -0.29 0.0 0.0 -0.21 -0.44 -4.01 0.43 0.02 -0.02 0.57 -0.0
-2.45 -0.55 0.29 0.81 0.29 0.09 0.25 0.47 0.2 0.23 0.63 0.04 -2.86 -1.15 -0.98 -1.38 -0.59 -0.17 -0.23 0.01 - 0.79 -0.27 0.27 1.17 0.57
-1.01 -0.22 -0.44 0.43 0.74 0.76 0.69 0.38 0.15 -0.09 -0.07 -0.2 -1.15 -0.2 -0.33 0.15 -0.28 0.31 0.23 -0.08 -3.02 -0.11 0.37 -0.54 0.15 -0.23
-0.03 0.07 -0.01 0.7 0.78 0.5 0.15 0.26 0.1 0.03 0.19 0.39 0.12 -0.73 -1.03 -0.68 -0.53 -0.26 -0.38 -0.45 -3.64 0.32 -0.15 -0.2 0.35 0.21
-2.4 -0.76 -0.23 0.18 0.59 0.51 0.93 0.65 0.55 0.51 0.34 -0.46 -2.29 0.15 -0.15 -0.22 -0.71 -0.35 -0.46 -0.73 -1.06 0.17 0.38 -0.6 0.56 0.14
-0.62 -0.03 0.18 0.82 0.54 -0.18 -0.05 0.31 0.05 0.11 0.33 -0.05 -1.22 -0.12 -0.47 -0.36 -0.49 0.17 -0.29 -0.4 -4.92 0.7 -0.17 -0.3 0.71 0.4
-0.06 -0.28 -0.28 0.23 0.21 -0.08 0.4 0.64 0.27 0.23 0.04 -0.49 -0.45 -0.75 -0.76 -0.25 -0.18 0.17 -0.12 0.2 -2.31 0.71 0.0 -0.18 0.47 0.23
-1.95 -0.73 -0.53 -0.16 0.3 0.55 0.58 0.35 0.15 0.07 0.07 -0.3 -1.77 -0.33 -0.09 -0.17 -0.23 0.35 0.29 -0.33 -1.92 0.03 0.55 0.41 0.75 0.31
-4.04 -0.74 -0.38 0.32 0.55 0.35 0.43 0.23 0.55 0.19 -0.03 -0.63 -3.61 -0.55 -0.37 -0.43 -0.07 0.5 0.11 -0.14 -4.22 1.02 0.14 0.26 0.77 0.16
-0.33 0.2 -0.3 0.08 0.32 0.18 0.16 0.23 0.5 0.21 0.3 0.05 -0.3 -0.34 0.16 -0.58 -0.46 0.28 -0.11 -0.1 -3.91 0.85 -0.57 -0.36 0.24 -0.02
-0.12 -0.34 -0.4 0.23 0.49 0.5 0.62 0.74 0.17 -0.24 -0.08 -0.81 -0.6 -0.58 -0.82 -0.17 -0.38 0.06 0.01 -0.39 -1.03 0.43 -0.05 -0.03 0.62 0.22
-2.29 -0.18 -0.05 0.54 0.55 0.24 0.4 0.42 0.2 0.62 0.4 0.46 -2.19 -1.22 -0.92 -0.98 -0.08 0.29 0.19 0.21 -4.53 0.56 -0.26 -0.44 0.65 0.02
-5.31 -1.81 -0.73 0.27 0.46 -0.02 0.12 0.05 0.32 0.08 -0.15 -0.66 -4.54 0.1 0.12 0.11 -0.01 0.09 -0.09 -0.58 -2.5 1.4 0.15 0.48 1.11 0.18
-0.19 0.1 -0.19 0.26 0.5 0.15 0.33 0.38 0.28 0.2 0.09 -0.19 -0.75 -0.62 -0.13 -0.38 -0.15 0.43 0.13 0.09 -4.02 0.24 0.01 -0.13 0.28 -0.2
-1.3 -0.59 -0.99 -0.04 -0.02 -0.02 0.55 0.51 0.46 0.14 -0.05 -0.24 -1.44 -0.1 -0.51 -0.08 -0.75 0.46 0.22 -0.38 -2.62 -0.21 0.62 0.49 1.22 0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.