Heatmap: Cluster_109 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1 0.0 0.12 0.04 0.0 0.12 0.0 0.4 0.0 0.01 0.05
0.05 0.0 0.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.04 0.07 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.25 0.19 0.03 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.28 0.05 0.0 0.12 0.15 0.11 0.24 0.21 0.55 0.2 0.25 0.47 0.1 0.0 0.13 0.16 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.12 0.67 0.17 0.14 0.19
2.14 1.23 0.64 0.48 0.59 0.78 1.22 0.73 1.19 2.92 2.35 2.19 0.9 1.34 1.04 0.81 1.08 2.29 1.32 1.07 1.59 0.28 10.73 2.61 0.64 0.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.16 0.1 0.41 0.07 0.04 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.04 0.29 0.0 0.06 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.09 0.05 0.03 0.02 0.25 0.22 0.17 0.15 0.57 0.18 0.09 0.02 0.02 0.09 0.1 0.02 0.08 0.29 0.33 0.55 0.59 0.07 4.56 0.18 0.89 1.27
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.02 0.03 0.0 0.08 0.02 0.01 0.05
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.0 0.35 0.03 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.06 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.09 0.0 0.0 1.28 0.16 1.03 0.3 0.43 0.31
0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.45 1.69 1.14 0.53 2.24 1.62 1.13 3.22 0.67 8.13 3.03 0.92 1.13
1.5 0.66 0.34 0.99 1.1 0.69 0.67 0.67 1.66 1.98 2.96 2.5 1.26 0.52 0.59 0.41 0.37 1.15 0.69 0.67 2.31 0.31 5.26 4.39 1.27 1.3
0.2 0.12 0.22 0.21 0.11 0.25 0.28 0.2 0.27 0.0 0.32 0.28 0.06 0.19 0.18 0.18 0.15 0.39 0.47 0.17 1.08 0.27 0.84 0.46 0.5 0.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.37 3.7 2.31 2.7 3.82 3.99 3.99 4.27 5.57 3.84 3.83 3.64 4.27 3.86 2.87 3.58 2.84 4.37 4.71 2.81 2.89 1.95 18.32 6.8 8.17 4.48
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.09 0.0 0.0 0.12 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.12 0.0 2.49 0.17 7.86 1.63 0.04 1.41
0.08 0.0 0.02 0.29 0.26 0.08 0.15 0.11 0.13 0.23 0.34 0.09 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.31 0.02 0.0 18.39 3.44 7.26 4.12 4.52 1.74
0.48 0.24 0.07 0.18 0.07 0.44 1.52 1.46 1.78 1.27 2.1 2.06 0.56 1.29 2.2 1.31 1.51 0.29 0.29 0.57 0.31 0.35 8.23 1.16 1.25 0.85
0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.15 0.16 0.07 0.23 0.21 0.14 0.04 0.08 0.13 0.09 0.11 0.06 0.0 0.03 0.01 0.04 0.82 0.03 0.14 0.09
2.9 1.74 0.85 0.4 0.48 1.65 5.95 6.76 7.52 10.89 9.89 8.16 3.27 6.07 7.34 3.77 5.57 0.97 2.51 1.64 0.78 1.34 21.69 5.19 4.01 3.84
0.86 0.28 0.48 0.16 0.13 0.47 1.3 0.36 0.62 0.46 0.19 0.16 0.28 0.28 0.65 0.94 0.28 0.7 1.22 0.54 3.1 1.35 8.01 1.21 2.91 1.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.68 0.19 0.03 0.07
0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.02 0.04 0.08 0.0 0.0 0.23 1.31 0.71 0.12 0.59 0.32 0.3 1.35 0.56 4.13 1.29 0.46 0.79
0.07 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.12 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.15 0.08 0.0 0.81 0.0 0.04 0.09
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.15 0.09 0.12 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.19 0.0 1.67 0.0 0.0 0.0
0.1 0.06 0.11 0.09 0.12 0.09 0.13 0.15 0.12 0.21 0.19 0.23 0.08 0.13 0.22 0.32 0.4 0.09 0.16 0.16 0.19 0.05 1.67 0.59 0.15 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05
0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.11 0.0 0.0 0.14 0.04 0.12 0.44 0.16 0.03 0.12
0.43 0.35 0.16 0.18 0.04 0.11 0.22 0.14 0.05 0.49 0.22 0.98 0.42 0.23 0.24 0.0 0.0 0.15 0.17 0.08 0.6 0.12 3.13 0.21 0.0 0.19
0.3 0.26 0.18 0.9 0.82 0.27 0.26 0.39 0.37 0.39 0.58 0.26 0.07 0.05 0.04 0.13 0.07 0.34 0.18 0.07 3.79 2.86 1.82 0.92 1.54 0.52
0.04 0.03 0.05 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.09 0.0 0.04 0.14 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.08 0.03 0.04 0.17 0.0 0.61 0.21 0.03 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.15 0.2 0.27 0.16 0.21 0.14 0.21 0.24 0.64 0.64 0.42 0.27 0.52 0.14 0.42 0.17 0.21 0.31 0.13 0.64 0.18 1.4 0.24 0.34 0.3
0.0 0.05 0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.1 0.04 0.09 0.16 0.0 0.34 0.07 0.03 0.06
0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.28 0.03 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.31 0.03 0.15 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.14 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.0 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.07 0.07 0.02 0.03 0.72 0.0 0.08 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.3 0.14 0.0 0.41 0.07 0.22 0.07 0.12 0.13 0.4 0.56 0.07 0.06 0.09 0.0 0.0 0.29 0.77 0.65 0.4 12.69 6.77 12.6 5.49 3.84 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)