1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_109 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.24 0.0 0.29 0.11 0.0 0.29 0.0 1.0 0.0 0.04 0.12
0.21 0.0 0.0 0.36 0.08 0.0 0.0 0.28 0.17 0.0 0.17 0.28 0.32 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.27 0.0 1.0 0.75 0.11 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.07 0.0 0.17 0.23 0.16 0.35 0.31 0.81 0.3 0.38 0.69 0.15 0.0 0.2 0.23 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.18 1.0 0.25 0.21 0.28
0.2 0.11 0.06 0.04 0.05 0.07 0.11 0.07 0.11 0.27 0.22 0.2 0.08 0.12 0.1 0.08 0.1 0.21 0.12 0.1 0.15 0.03 1.0 0.24 0.06 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.16 0.0 0.4 0.25 1.0 0.16 0.1 0.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.26 0.13 1.0 0.0 0.2 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.01 0.01 0.05 0.05 0.04 0.03 0.13 0.04 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.06 0.07 0.12 0.13 0.01 1.0 0.04 0.19 0.28
0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.24 0.0 0.17 0.2 0.21 0.38 0.0 1.0 0.24 0.17 0.55
0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.11 0.0 1.0 0.1 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.05 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.07 0.0 0.0 1.0 0.12 0.81 0.23 0.33 0.24
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.21 0.14 0.06 0.28 0.2 0.14 0.4 0.08 1.0 0.37 0.11 0.14
0.29 0.12 0.06 0.19 0.21 0.13 0.13 0.13 0.31 0.38 0.56 0.47 0.24 0.1 0.11 0.08 0.07 0.22 0.13 0.13 0.44 0.06 1.0 0.83 0.24 0.25
0.19 0.11 0.2 0.19 0.11 0.23 0.26 0.19 0.24 0.0 0.3 0.26 0.06 0.17 0.16 0.17 0.14 0.36 0.44 0.16 1.0 0.25 0.77 0.42 0.46 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 0.2 0.13 0.15 0.21 0.22 0.22 0.23 0.3 0.21 0.21 0.2 0.23 0.21 0.16 0.2 0.15 0.24 0.26 0.15 0.16 0.11 1.0 0.37 0.45 0.24
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.32 0.02 1.0 0.21 0.01 0.18
0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.19 0.39 0.22 0.25 0.09
0.06 0.03 0.01 0.02 0.01 0.05 0.19 0.18 0.22 0.15 0.25 0.25 0.07 0.16 0.27 0.16 0.18 0.04 0.03 0.07 0.04 0.04 1.0 0.14 0.15 0.1
0.07 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.18 0.2 0.08 0.28 0.26 0.17 0.05 0.09 0.16 0.11 0.14 0.07 0.0 0.04 0.01 0.04 1.0 0.04 0.17 0.11
0.13 0.08 0.04 0.02 0.02 0.08 0.27 0.31 0.35 0.5 0.46 0.38 0.15 0.28 0.34 0.17 0.26 0.04 0.12 0.08 0.04 0.06 1.0 0.24 0.19 0.18
0.11 0.03 0.06 0.02 0.02 0.06 0.16 0.05 0.08 0.06 0.02 0.02 0.03 0.04 0.08 0.12 0.04 0.09 0.15 0.07 0.39 0.17 1.0 0.15 0.36 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 1.0 0.28 0.04 0.1
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.05 0.32 0.17 0.03 0.14 0.08 0.07 0.33 0.13 1.0 0.31 0.11 0.19
0.08 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.15 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.19 0.1 0.0 1.0 0.0 0.05 0.11
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.09 0.05 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.12 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.03 0.07 0.05 0.07 0.05 0.08 0.09 0.07 0.12 0.11 0.14 0.05 0.08 0.13 0.19 0.24 0.05 0.1 0.1 0.12 0.03 1.0 0.35 0.09 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.22 0.0 1.0 0.0 0.0 0.94
0.0 0.11 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.24 0.0 0.0 0.32 0.1 0.28 1.0 0.37 0.06 0.27
0.14 0.11 0.05 0.06 0.01 0.04 0.07 0.04 0.01 0.16 0.07 0.31 0.13 0.07 0.08 0.0 0.0 0.05 0.05 0.03 0.19 0.04 1.0 0.07 0.0 0.06
0.08 0.07 0.05 0.24 0.22 0.07 0.07 0.1 0.1 0.1 0.15 0.07 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.09 0.05 0.02 1.0 0.75 0.48 0.24 0.41 0.14
0.06 0.05 0.08 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.15 0.0 0.07 0.23 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.14 0.06 0.07 0.27 0.0 1.0 0.35 0.05 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.11 0.14 0.19 0.11 0.15 0.1 0.15 0.17 0.46 0.46 0.3 0.19 0.37 0.1 0.3 0.12 0.15 0.22 0.09 0.46 0.13 1.0 0.17 0.24 0.22
0.0 0.14 0.0 0.07 0.05 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.3 0.13 0.26 0.46 0.0 1.0 0.2 0.08 0.18
0.0 0.18 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 1.0 0.12 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.14 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 1.0 0.11 0.49 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.12 1.0 0.0 0.29 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.11 0.0 0.0 0.12 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.09 0.1 0.03 0.05 1.0 0.0 0.11 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.04 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.06 0.05 0.03 1.0 0.53 0.99 0.43 0.3 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)