Heatmap: Cluster_95 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.73 -0.59 -0.65 -0.88 -0.86 -1.49 -0.96 -0.19 -0.79 -0.1 0.42 0.53 0.91 -0.57 -0.13 0.05 -0.84 0.38 -0.31 -1.1 -1.76 -2.4 1.78 0.92 0.47 0.12
0.34 -0.94 -0.85 -1.07 -1.74 -2.21 -1.3 -0.52 0.25 0.83 1.23 1.36 0.8 -1.19 -2.31 -1.27 -0.68 -1.08 -2.76 -0.72 0.06 -0.57 1.15 0.9 0.36 0.97
1.15 0.2 0.4 0.31 -0.38 -1.04 -0.34 0.04 -0.85 -0.21 0.28 0.88 1.28 -1.23 -1.41 -0.61 -1.68 -0.26 -0.85 -1.69 -2.99 -1.31 0.66 0.19 1.18 0.16
1.24 0.94 0.53 -0.05 -1.03 -1.26 -0.76 -0.45 -0.33 -0.19 -0.16 0.21 1.1 -0.98 -0.43 -0.96 -0.43 -0.01 0.33 -0.22 -0.65 -0.57 -0.23 0.49 0.11 -0.09
0.54 1.15 0.41 -0.62 -2.66 -3.84 -1.6 -0.38 0.2 0.21 0.99 1.2 0.98 -1.74 -1.91 -2.06 -1.03 -0.36 -1.3 -0.88 -3.22 -1.5 0.97 0.55 1.27 0.18
0.6 0.34 0.47 0.47 0.43 0.31 0.37 0.33 0.13 0.06 0.0 0.02 0.47 -0.89 -0.75 -0.57 -0.33 -0.51 -0.4 -0.16 -2.97 0.2 0.24 -0.51 -0.11 -0.5
0.76 0.9 0.29 -0.46 -1.07 -0.92 -0.23 0.14 0.18 0.23 0.35 0.37 0.54 -0.17 -0.46 -0.58 -0.23 -0.37 -0.73 -0.32 -1.11 -1.02 0.58 0.07 0.38 0.1
0.91 -0.35 -0.35 -0.12 -0.44 -1.54 -0.77 -0.61 -0.51 0.47 0.9 1.16 0.7 0.28 -0.57 -0.59 -0.74 -1.13 -0.6 -0.58 -1.06 -0.74 0.54 0.59 0.44 0.21
0.42 0.19 0.25 0.31 0.16 0.2 0.15 0.27 0.07 -0.11 -0.06 0.18 0.2 -0.64 -0.24 -0.38 -0.32 -0.34 -0.13 0.12 -0.36 -1.18 0.19 0.47 -0.47 -0.01
1.17 -0.99 -2.24 -2.94 -3.3 -3.12 -1.27 -0.27 0.27 0.85 1.41 1.58 1.25 0.1 -2.11 -0.99 -1.63 -0.45 -1.24 -0.96 -2.52 -1.0 1.07 0.55 0.12 0.35
0.93 0.3 -0.24 -0.13 -0.24 -0.77 -0.1 0.16 0.39 0.13 0.48 0.74 0.53 -1.62 -0.76 -1.63 -1.34 -0.03 -0.88 -1.1 -3.45 0.27 1.27 0.37 0.39 -0.36
0.63 0.33 0.03 -0.04 0.06 0.21 0.1 0.13 0.1 0.24 0.35 0.54 0.54 -1.25 -1.16 -1.25 -0.32 -0.8 -0.83 -0.15 -1.26 -0.22 0.78 0.35 0.21 -0.23
1.79 0.36 0.12 -0.24 -1.11 -1.38 -0.71 -0.06 -2.44 -1.76 -0.89 -0.45 1.61 -0.42 -0.93 -1.28 -1.4 -1.08 -0.85 -0.7 -1.77 -0.98 1.03 -0.13 1.16 1.27
0.52 0.9 0.8 0.53 -0.18 -0.46 -0.07 0.13 -0.26 0.01 0.03 0.21 0.45 -1.1 -1.56 -2.06 -1.04 -1.0 -0.54 0.06 -2.77 -0.67 0.8 0.37 0.69 0.35
0.61 -0.72 -0.61 -0.52 -1.09 -1.62 -0.5 0.2 0.1 0.62 0.78 0.71 0.7 -0.23 -1.02 0.58 -0.35 -0.67 -0.71 -0.45 -0.81 -0.78 0.84 0.39 0.38 0.15
0.69 -0.64 -0.71 -0.39 -0.89 -1.41 -0.46 0.29 0.31 0.6 0.9 0.83 0.96 -0.58 -1.2 0.07 -0.78 -1.01 -0.87 -0.78 -0.93 -0.67 0.83 0.51 0.43 0.12
1.09 0.58 -0.15 -0.02 0.06 0.3 0.66 0.66 0.06 0.19 0.51 0.32 0.73 -2.51 -1.76 -2.38 -0.73 -0.56 -0.71 -0.51 -2.03 -1.24 0.83 -0.1 0.43 -0.87
0.7 0.26 0.07 0.05 -0.03 -0.02 0.3 0.37 0.2 0.16 0.26 0.23 0.73 -0.91 -0.84 -0.99 -0.67 -0.02 -0.4 -0.39 -1.11 -1.08 0.73 -0.33 0.42 -0.24
0.08 0.05 -0.37 -0.34 0.09 -0.3 -0.28 -0.34 -0.13 0.2 0.49 0.37 0.29 -0.69 -1.07 -0.85 -1.37 0.27 -0.7 -1.84 -0.15 -0.21 1.59 0.71 0.37 0.05
0.93 -0.1 -0.65 -0.48 -0.63 -0.95 -0.14 0.11 0.37 0.35 0.55 0.44 0.69 -1.02 -0.59 -1.14 -0.47 0.08 -0.33 -0.64 -1.37 0.23 0.92 0.39 0.31 -0.28
1.01 0.89 0.25 -0.4 -0.41 -0.2 0.15 0.27 0.2 0.39 0.37 0.34 0.77 -0.59 -1.22 -0.91 -0.35 -0.15 -0.25 0.01 -3.45 -1.27 0.63 -0.32 -0.15 -0.75
1.03 -0.21 -0.72 0.06 -0.26 -0.39 -0.02 0.61 0.19 0.1 0.68 0.46 1.01 -0.88 0.08 -0.44 -1.15 -0.28 -0.51 -0.17 -4.85 -2.54 1.08 -1.76 0.15 0.27
0.22 -0.04 -0.06 -0.08 -0.07 -1.35 -0.78 -0.26 -0.64 0.73 1.1 0.92 0.16 -0.93 -1.68 0.01 -0.4 -0.98 -1.46 -0.51 -1.48 0.2 0.63 0.61 0.91 0.15
1.39 0.24 -0.38 -1.21 -1.7 -1.69 -0.77 -0.24 0.14 0.38 0.77 1.0 1.01 -0.63 -0.36 -0.63 -0.6 -0.74 -0.83 -1.06 -1.07 -0.29 0.74 0.47 0.24 -0.11
1.68 0.7 0.39 0.36 -1.83 -3.0 -1.52 -0.06 -1.66 -1.29 -0.62 -0.73 1.37 -2.14 -2.44 -1.73 -2.36 -0.85 -1.81 -1.75 -1.06 -1.26 1.44 1.13 1.2 1.12
0.66 0.16 -0.25 0.16 -0.39 -1.02 -0.13 -0.08 -0.23 -0.03 0.22 0.51 0.66 -1.55 -1.96 -2.0 -1.57 -0.14 -1.25 -1.49 -0.68 1.2 0.52 0.56 1.25 0.2
1.11 0.17 0.03 -0.1 -0.34 -0.56 -0.16 -0.1 -0.2 -0.18 0.27 0.62 1.45 -2.18 -1.27 -1.78 -1.15 -0.32 -0.99 -1.08 0.04 -1.64 1.3 -0.21 0.4 0.09
0.77 -0.74 -0.49 -0.49 -0.3 -0.37 0.15 0.2 0.0 -0.11 0.36 0.85 0.96 -0.5 -0.92 -0.4 -0.56 -0.13 -0.43 -0.35 -1.57 0.22 0.36 -0.06 0.47 0.29
0.84 0.99 0.25 -0.31 -0.34 0.21 0.45 0.55 0.33 0.06 -0.11 -0.16 0.62 -0.72 -0.24 -1.09 -0.09 -0.21 -0.17 -0.09 -2.37 -0.75 0.46 -0.71 -0.11 -0.9
0.62 0.34 0.24 0.22 -0.28 -0.54 -0.26 -0.26 -0.73 -0.23 -0.01 0.62 0.65 -0.12 -0.94 -0.35 -1.19 -0.56 -0.15 -0.76 -0.64 -2.92 1.39 0.3 0.35 0.47
0.79 -0.04 -0.73 -0.36 -0.62 -1.07 -0.73 -0.68 0.41 0.21 0.48 0.43 1.42 -1.21 -0.68 -0.78 -0.56 -0.09 -0.15 -0.47 -1.49 0.13 0.66 0.51 0.49 -0.14
0.77 0.51 0.35 0.19 -0.28 -0.7 -0.44 0.05 -0.02 0.2 0.48 0.59 0.69 -1.12 -0.99 -1.37 -0.8 -0.81 -0.89 -0.13 -0.86 -1.28 1.2 0.55 -0.05 -0.06
0.86 0.23 -0.09 -0.08 -0.35 -0.88 -0.38 -0.2 -0.28 0.1 0.31 0.39 0.67 -0.94 -0.97 -1.11 0.21 -0.13 -0.54 -0.48 -2.32 0.49 0.79 0.44 0.43 0.16
0.74 0.27 -0.47 -1.23 -1.34 -0.71 -0.0 0.02 0.17 0.12 -0.0 -0.04 0.44 0.18 -0.62 -0.15 -0.13 0.03 -0.3 -0.07 -0.24 -0.78 0.54 0.15 0.66 0.54
-1.82 -2.65 -0.86 0.36 1.34 1.27 0.85 1.02 1.31 0.83 0.76 0.67 -1.77 -1.08 -1.76 -1.6 -1.38 -1.31 -0.13 -0.37 -2.78 -3.85 0.91 -1.05 -2.24 -0.37
0.73 0.76 0.07 -0.38 -1.07 -0.51 -0.27 0.18 0.33 0.15 0.39 0.72 0.65 -1.73 -2.46 -2.27 -1.6 -0.64 -1.66 -1.33 -0.97 0.36 0.79 1.02 0.96 -0.1
0.95 -0.38 -0.32 -0.17 -0.25 -0.42 -0.08 0.17 -0.28 -0.08 0.3 0.64 1.26 -0.53 -0.72 -0.59 -0.83 -0.42 -0.49 -0.77 -1.44 -1.25 0.92 0.07 0.61 0.22
0.89 1.16 1.0 0.43 -0.37 -0.51 -0.65 0.04 0.28 0.18 0.29 0.43 0.76 -2.42 -1.24 -2.28 -0.92 -0.06 -0.15 -0.02 -2.17 -0.13 0.29 0.01 -0.52 -0.83
0.67 0.53 0.22 0.2 -0.59 -0.89 -0.65 0.03 -0.15 -0.04 0.54 0.75 0.84 -1.45 -1.44 -0.97 -0.68 -0.93 -1.12 -0.91 -0.06 -1.01 1.56 0.18 0.4 -0.43
1.41 -0.2 -0.41 -0.35 -1.37 -2.01 -1.12 -0.69 -0.52 0.16 0.86 1.05 1.24 -1.21 -1.04 -1.26 -0.93 -0.13 -0.29 -0.77 -2.37 -2.83 1.14 0.79 0.83 -0.1
1.11 0.21 -0.28 -0.54 -1.03 -1.36 -0.38 0.04 -0.21 0.05 0.49 0.51 1.04 -1.27 -1.4 -0.98 -0.98 -0.18 -0.62 -0.75 -0.71 0.31 1.02 0.36 0.61 0.13
0.77 0.84 0.03 -0.71 -1.02 -0.25 0.09 0.27 0.45 0.28 0.39 0.56 0.74 -0.17 -1.18 -0.44 -0.34 -0.81 -0.8 -0.52 -1.57 -0.51 0.41 0.17 0.26 -0.24
0.61 1.05 0.68 0.12 -0.2 -0.29 -0.17 0.08 0.23 0.29 0.44 0.61 0.48 -0.91 -1.25 -1.37 -0.36 -0.52 -0.67 0.01 -3.84 -0.34 0.32 0.04 0.1 -0.37
0.52 0.59 0.68 0.3 -0.04 -0.02 -0.08 0.09 0.35 0.3 0.45 0.57 0.43 -1.64 -1.25 -1.34 -0.2 -0.56 -0.31 0.24 -0.44 -1.12 0.69 -0.12 -0.73 -0.87
0.73 1.2 0.65 -0.0 -0.65 -0.99 -0.6 -0.17 -0.07 0.02 0.33 0.66 0.3 -0.93 -0.71 -1.87 -0.47 -0.1 -0.5 -0.1 -0.94 -0.27 0.63 0.29 0.14 -0.29
0.73 -0.03 -0.45 -0.55 -0.21 0.13 0.44 0.52 0.53 0.26 0.36 0.29 0.27 -0.59 -0.58 -0.68 -0.21 -0.36 0.02 -0.19 -2.89 -1.03 0.67 -0.03 0.2 0.01
0.7 0.96 0.24 -0.5 -1.7 -1.89 -0.73 -0.01 0.17 0.36 0.74 0.75 0.32 -0.67 -0.52 -1.45 -0.74 -0.37 -0.72 -0.57 -1.81 -0.68 0.98 0.54 0.71 0.07
0.36 0.88 0.53 0.24 -0.06 -0.67 -0.91 -0.5 -0.19 -0.01 0.38 0.62 0.14 -0.77 -0.92 -1.23 -0.42 -0.55 -0.66 0.05 -0.7 -0.08 0.75 0.83 -0.05 -0.04
1.35 0.41 0.13 0.27 -0.63 -1.1 -0.32 0.34 -0.31 -0.46 0.26 0.47 1.24 -0.74 -1.23 -0.88 -1.81 -1.04 -1.54 -2.08 -1.73 -0.15 1.19 0.12 0.6 0.21
0.73 0.2 -0.37 -0.56 -0.22 0.11 0.31 0.3 0.14 0.35 0.32 0.31 0.75 -0.24 -0.64 -0.58 -0.06 -0.05 0.05 -0.21 -2.91 -2.51 0.74 -0.09 -0.17 0.01
0.64 0.21 0.11 -0.21 -0.68 -1.06 -0.72 -0.26 -0.04 0.2 0.18 0.54 0.74 -0.6 -0.43 -0.28 0.12 0.11 -0.19 0.16 -0.58 -0.39 0.13 0.12 0.13 0.4
1.18 0.55 -0.16 -0.91 -2.14 -2.53 -0.88 -0.08 -0.76 -0.14 0.62 1.03 1.59 -1.9 -1.76 -1.78 -1.92 -0.02 -0.49 -0.76 -3.26 -1.94 0.7 0.78 1.26 0.42
0.49 0.63 0.57 0.29 0.0 0.32 0.12 0.22 0.28 0.06 0.11 0.34 0.23 -0.71 -0.62 -0.73 -0.57 -0.72 -0.37 -0.29 -0.88 -0.33 0.75 -0.67 -0.16 -0.33
0.93 1.2 0.98 0.8 -0.53 -1.4 -0.58 -0.03 -0.68 -0.15 0.12 0.11 0.75 -0.52 -0.9 -0.98 -1.01 -0.78 -0.82 -0.72 -1.53 -1.09 0.34 -0.26 0.77 0.47
1.03 0.95 0.12 -0.34 -1.57 -1.43 -0.85 -0.17 -0.38 -0.28 -0.14 0.13 0.84 -0.19 -0.06 -0.45 -0.22 0.03 0.17 -0.48 -0.21 -1.28 0.49 -0.02 0.27 0.53
0.67 0.32 0.25 0.35 0.14 -0.18 -0.11 0.07 -0.15 -0.2 0.13 0.29 0.76 -0.26 -0.48 -0.32 -0.72 -0.46 -0.42 -0.7 -0.75 -0.94 0.79 -0.56 0.4 0.1
0.45 0.84 0.22 -0.46 -0.89 -1.05 -0.38 -0.08 0.07 0.2 0.45 0.66 0.09 -1.04 -0.74 -1.09 -0.2 -0.14 -0.21 -0.22 -0.88 -0.32 1.11 0.52 0.5 -0.73
0.7 0.03 -0.52 -0.3 -0.59 -0.52 -0.35 -0.05 0.26 0.13 0.35 0.54 0.66 0.17 0.09 0.01 -0.93 -0.37 -0.07 -0.8 -1.2 -1.3 0.59 0.18 0.53 0.24
1.22 0.72 -0.04 0.03 -0.26 -0.25 0.14 0.54 -0.14 -0.11 -0.04 -0.21 0.5 -2.46 -1.27 -2.41 -0.55 0.16 0.19 -0.16 -1.87 -0.88 0.86 0.53 0.22 -0.23
1.26 -0.42 -1.28 -0.92 -0.65 -0.63 0.47 0.73 0.45 0.36 0.72 0.21 0.96 -0.44 -0.95 -0.77 -1.01 -0.52 -0.85 -1.08 -2.41 -0.36 0.86 -0.27 0.65 -0.07
0.3 -0.19 -1.11 -0.02 -0.43 -0.3 -0.61 -0.74 -0.04 0.34 0.85 0.96 0.26 -1.4 -4.97 -1.8 -1.31 -0.43 -0.4 -1.46 -0.22 -1.6 1.83 0.91 0.47 0.56
0.71 -0.18 -0.27 -0.2 -1.19 -2.39 -1.12 -0.32 -0.24 0.79 1.25 1.27 1.35 0.03 -0.76 -0.6 -1.1 -1.19 -1.46 -1.31 -1.18 -1.58 0.79 0.48 -0.19 0.34
0.22 -1.04 -0.69 -0.42 -0.4 -0.78 -0.13 0.08 0.01 0.72 1.1 1.16 0.53 0.17 -1.02 -0.23 0.4 -1.4 -0.8 -0.56 -2.47 -0.42 0.66 0.31 0.07 -0.05
0.43 1.12 0.9 -0.01 -1.05 -1.38 -1.28 -0.77 -0.59 0.03 0.53 0.83 0.36 -0.29 -0.32 -0.37 -0.78 -0.21 -0.76 -0.92 0.16 -0.77 0.77 0.75 -0.62 -0.21
0.44 -1.82 -1.8 -1.1 -1.02 -1.13 -0.22 0.23 -0.15 1.01 1.39 1.19 0.4 0.03 0.44 -0.8 -0.23 -2.29 -1.31 -1.78 -2.42 -1.11 1.23 0.39 0.13 0.47
1.34 0.53 -0.44 -0.41 -0.4 -0.69 0.34 0.06 -0.08 -0.2 0.22 -0.26 0.98 -0.51 -0.51 -0.61 -1.06 -0.81 -0.77 -1.24 -2.21 -1.37 0.38 0.59 1.14 0.4
1.12 -0.28 -0.74 -0.77 -1.03 -1.0 -0.05 0.08 -0.38 0.54 0.71 1.02 1.19 0.18 -1.49 -0.39 -1.62 -1.3 -1.11 -1.24 -0.79 -1.22 0.97 0.33 0.53 0.14
0.95 0.44 0.25 -0.1 -0.85 -1.15 -0.9 -0.33 -0.18 0.16 0.6 0.51 0.83 -1.32 -1.16 -1.08 -0.62 0.29 -0.45 -0.18 -1.84 -0.02 0.8 0.11 0.73 -0.04
0.73 0.89 0.59 0.19 -0.38 -0.67 -0.57 -0.27 -0.19 -0.03 0.39 0.66 0.98 -0.77 -0.7 -0.61 -0.69 -0.62 -0.66 -0.67 -3.05 -1.5 0.91 0.12 0.71 -0.41
0.76 0.4 0.3 0.29 -0.01 0.31 0.05 0.15 0.1 -0.2 0.01 -0.0 0.41 -0.54 -0.39 -0.32 -0.31 -0.59 -0.37 -0.15 -2.27 -0.08 0.33 0.24 0.08 -0.24
-0.39 0.06 0.23 0.12 0.25 0.46 0.29 0.2 0.41 0.47 0.53 0.44 -0.27 -1.66 -1.17 -1.61 -0.12 -0.21 -0.06 0.32 -0.23 -0.43 0.6 0.3 -0.51 -0.9
-1.02 -0.58 0.15 0.51 0.88 0.89 0.4 0.17 0.65 0.62 0.36 0.67 -0.56 -2.15 -2.34 -1.85 -1.32 0.02 0.26 -0.0 -0.62 0.1 0.89 -0.99 -0.81 -0.85
0.77 0.62 0.46 0.29 -0.07 -0.17 -0.38 -0.12 -0.3 -0.46 -0.29 0.29 0.87 -0.24 -0.39 -0.29 -0.45 -0.05 -0.52 -0.43 -2.53 -1.04 0.02 0.33 0.33 0.58
0.86 -0.83 -1.06 -0.47 -0.24 -0.01 0.55 0.59 0.36 0.38 0.46 0.29 0.94 -0.6 -1.15 -1.87 -0.5 -0.53 -0.25 -0.23 -2.59 -0.74 0.72 0.41 0.35 0.04
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0.87 0.74 0.11 0.01 -0.04 0.17 0.24 0.22 0.09 -0.31 -0.16 0.04 0.66 -0.84 -0.74 -1.06 -0.67 -0.08 -0.16 -0.47 -3.36 -0.22 0.82 0.12 0.16 -0.24
0.37 -0.11 0.1 0.2 0.26 0.3 0.48 0.62 0.3 0.16 0.03 0.03 0.44 -1.36 -0.72 -1.08 -0.39 -0.04 -0.11 -0.02 -2.85 0.33 0.73 -0.98 0.02 -0.41
0.78 0.35 0.05 -0.43 -1.14 -0.73 0.53 0.75 0.49 0.43 0.51 0.49 0.79 -0.78 -1.18 -1.42 -1.01 -0.22 -0.26 -0.4 -4.16 -0.96 0.68 -0.34 0.58 -0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.